Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-456N14.1	Gene	0	0.59	0.71	0.92	0.79	3.49	1.08	0.25	0.28	0.22	1.97	0.20	0.50	0.05	1.08	0.47	3.83	0.92	1.79	0.44	0.29	1.59	0.17	0.22	1.48	0.73	0.52	0.13	0.36	0.38
2	488720	Transcript	0	0.37	0.60	0.68	0.52	2.89	0.87	0.11	0.40	0.38	1.55	0.12	0.34	0.13	0.86	0.64	2.78	1.17	1.24	0.67	0.35	1.32	0.38	0.25	2.65	0.54	0.71	0.07	0.35	0.20
3	472922	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	1.17	0.61	0.00	3.56	1.50	0.00	1.34	1.43	1.05	0.00	0.45	0.47	0.96	1.68	2.71	3.14	0.70	2.33	1.00	3.10	1.31	0.66	9.40	0.52	1.72	0.00	0.59	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	2.77	1.88	0.00	5.72	1.62	1.13	9.97	3.14	7.99	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	9.15	1.86	3.73	0.00	6.87	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	3.45	0.36	0.00	4.19	2.36	0.43	0.79	0.96	1.24	0.00	0.27	0.28	1.16	0.00	4.10	0.96	0.41	0.00	0.59	2.14	0.77	0.00	5.53	0.61	0.67	0.39	0.70	0.43
8	Ix	Intron	0	0.62	1.10	1.15	0.52	3.37	0.80	0.00	0.73	0.53	2.04	0.22	0.49	0.00	0.79	1.87	2.29	1.79	2.38	0.58	0.24	1.24	0.39	0.33	2.97	0.31	0.23	0.33	0.30	0.56
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.86	1.92	1.05	0.00	3.89	2.03	0.00	0.99	0.49	1.36	0.00	0.51	0.00	0.97	1.86	2.00	1.74	3.19	0.86	0.00	1.37	1.46	0.49	3.66	0.00	0.42	1.15	0.82	0.51
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.40	0.40	1.51	0.90	3.09	0.43	0.00	0.58	0.62	2.36	0.22	0.54	0.00	0.80	2.37	2.87	1.90	1.75	0.60	0.42	1.06	0.00	0.34	3.15	0.54	0.20	0.04	0.13	0.64
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	6.07	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.82	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	0.70	1.23	1.28	1.82	3.13	0.77	0.00	0.00	0.29	1.68	0.23	0.14	0.17	1.19	1.28	3.26	0.88	2.66	0.20	0.35	1.11	0.23	0.34	1.50	1.00	0.20	0.00	0.10	0.14
13	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	1.87	0.00	1.04	0.00	6.27	0.00	4.62	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER2b	ExonRegion	0	1.36	0.00	1.11	1.59	3.36	0.37	0.00	0.00	0.00	1.17	0.26	0.59	0.00	0.82	1.22	4.89	0.00	2.05	0.83	1.22	1.16	0.00	0.80	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	1.23
15	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	7.77	3.82	0.00	4.62	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.67
16	E2a_E2c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2c	ExonRegion	0	0.71	0.50	0.64	0.00	4.46	1.29	0.40	0.48	0.00	4.04	0.24	0.78	0.00	1.49	0.25	4.98	1.03	1.95	0.39	0.42	0.67	0.36	0.12	1.56	0.19	1.35	0.00	0.65	0.47
18	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	5.52	0.00	0.00	0.00	9.15	0.00	1.54	0.00	2.42	0.00	0.00	1.40	4.62	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.63
19	ER2d	ExonRegion	0	0.32	2.73	0.80	0.00	2.94	2.85	1.21	0.56	0.50	3.05	0.41	1.39	0.00	1.85	0.00	5.91	1.03	3.41	0.00	0.17	3.82	0.00	0.00	1.93	0.85	0.24	0.00	0.25	0.18
20	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	1.46	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65
21	ER2e	ExonRegion	0	0.46	0.12	0.90	0.77	3.32	0.79	0.14	0.20	0.16	0.96	0.12	0.33	0.00	0.66	0.00	2.97	0.80	0.90	0.46	0.00	1.74	0.00	0.13	0.77	0.97	0.28	0.33	0.41	0.41