Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-168J18.1	Gene	0	2.28	1.18	1.10	1.58	1.07	1.21	0.81	0.27	1.48	2.23	0.09	1.58	0.24	0.42	0.88	1.81	3.89	1.99	0.59	0.71	0.73	0.13	0.46	1.03	1.10	0.69	0.20	1.14	0.27
2	467187	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	493616	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	472761	Transcript	0	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.00
5	481576	Transcript	0	2.22	1.19	1.12	1.32	1.27	1.18	1.02	0.26	1.30	2.08	0.10	1.99	0.28	0.61	0.64	3.05	4.20	1.99	0.57	0.56	0.72	0.00	0.58	0.99	1.24	0.58	0.17	1.07	0.34
6	IG48_SR6	SilentIntergenicRegion	0	2.17	0.91	1.42	0.00	0.00	0.47	0.34	0.42	2.53	1.53	0.07	0.73	0.29	0.53	2.67	1.37	2.53	1.33	0.36	0.38	1.33	0.00	0.31	0.98	0.32	0.53	0.10	1.42	0.23
7	IG48_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	1.52	1.65	0.77	0.00	0.00	0.70	0.00	0.63	2.74	2.28	0.00	0.21	0.22	0.64	0.00	0.00	1.30	0.32	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	1.29	0.24	0.54	0.00	1.28	0.00
8	IG48_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	1.02	0.00	1.12	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	2.41	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00
9	IG48_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00
10	IG48_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.88	0.00	0.69	0.00	0.00	0.35	0.00	0.00	1.46	2.26	0.24	0.00	0.00	0.29	1.04	0.00	2.69	0.88	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	1.88	0.17	0.32	0.00	0.41	0.00
11	IG48_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	0.48	0.10	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.62	0.46	2.24	0.38	0.14	0.51	0.40	1.50	0.28	1.60	1.28	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.46	0.23	0.35	0.00	0.98	0.00
12	IG48_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00
13	IG48_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.34	0.00	0.31	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.26	2.15	0.00	0.39	0.00	0.22	0.00	1.44	1.18	0.60	0.00	0.86	2.53	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16
14	IG48_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.64	0.71	0.55	0.52	0.35	0.61	0.66	0.25	2.74	2.28	0.44	0.78	0.61	0.50	1.88	0.71	4.34	0.90	0.23	0.45	1.24	0.48	0.22	2.33	0.91	1.02	0.25	1.04	0.43
15	IG48_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.22	1.98	0.47	0.00	1.38	0.31	0.00	0.18	1.46	0.81	0.00	0.43	0.09	0.13	0.80	1.09	2.11	0.94	0.71	0.00	0.60	0.42	0.00	1.21	0.20	0.79	0.00	3.46	0.00
16	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	1.11	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.89	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	1.99	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00
19	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER1c	ExonRegion	0	0.23	0.35	0.06	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.09	0.00
21	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER2a	ExonRegion	0	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.53	0.00
24	E2_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58
25	E3_Aa	NovelBoundary	0	34.21	25.21	16.10	0.00	0.00	7.75	36.05	24.53	22.87	12.98	12.62	16.32	8.53	12.47	0.00	14.92	31.13	13.87	8.09	24.23	9.83	28.30	4.73	22.91	20.00	8.37	4.57	20.44	7.10
26	ER3a	ExonRegion	0	0.00	1.07	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E3_Da	KnownBoundary	0	11.56	4.75	9.12	20.71	0.00	5.64	5.61	5.08	9.32	10.15	6.30	17.86	3.18	6.34	0.00	7.50	9.72	10.02	8.09	4.13	6.10	29.22	15.07	12.02	0.00	14.89	0.00	8.99	2.05
28	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E3_Db	NovelBoundary	0	88.48	29.47	46.09	29.55	13.26	12.05	30.04	23.24	24.70	47.85	11.58	31.96	19.55	12.90	34.08	57.68	46.39	43.02	24.28	15.55	17.21	41.03	25.81	28.11	23.53	24.03	23.90	49.69	13.83
31	Ix	Intron	0	4.22	1.40	2.53	0.00	0.74	1.04	2.44	3.90	0.76	3.28	0.18	1.21	0.00	0.55	2.36	0.00	5.42	1.55	1.93	0.30	1.08	0.00	0.00	1.30	1.31	1.19	0.00	1.97	0.00
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.28	1.42	2.57	0.00	0.75	1.06	2.48	3.96	0.77	3.33	0.18	1.23	0.00	0.56	2.40	0.00	5.50	1.58	1.96	0.30	1.10	0.00	0.00	1.32	1.33	1.21	0.00	2.00	0.00
33	Ix	Intron	0	5.47	0.00	0.36	0.00	1.04	0.00	0.86	0.78	0.48	1.84	0.76	1.18	0.00	0.77	0.98	1.43	5.39	2.05	2.04	2.34	0.91	0.00	0.77	0.46	1.82	1.00	0.00	4.50	0.00
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.51	0.00	0.36	0.00	1.05	0.00	0.86	0.79	0.48	1.86	0.77	1.19	0.00	0.77	0.99	1.45	5.44	2.06	2.05	2.36	0.92	0.00	0.77	0.46	1.83	1.01	0.00	4.54	0.00
35	Ix	Intron	0	6.17	0.41	2.14	1.38	2.50	2.38	1.42	1.06	1.97	3.51	0.69	2.40	0.00	1.36	0.30	2.06	8.02	3.08	3.48	0.25	3.29	0.35	0.35	3.44	3.02	1.11	0.00	3.13	0.09
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.36	0.00	1.77	0.00	1.34	1.41	2.12	0.92	2.88	4.05	1.07	3.01	0.00	1.53	0.69	0.75	5.68	1.74	3.36	0.30	2.64	0.27	0.54	1.94	2.21	1.89	0.00	1.72	0.00
37	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.80	0.72	2.42	2.41	3.38	3.11	0.90	1.17	1.30	3.13	0.40	1.97	0.00	1.24	0.00	3.05	9.80	4.09	3.57	0.22	3.78	0.40	0.20	4.57	3.64	0.53	0.00	4.19	0.15
38	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.30	9.11	4.39	0.00	0.00	3.91	0.00	2.39	4.32	0.00	0.00	5.66	0.00	0.89	0.00	3.67	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	5.46	1.63	0.00	0.00	1.42
39	ER4a	ExonRegion	0	4.44	2.38	2.24	2.64	2.53	2.36	2.04	0.52	2.59	4.15	0.20	3.98	0.57	0.62	1.28	3.57	8.07	3.99	1.15	1.13	1.45	0.00	1.17	1.98	2.48	1.16	0.34	2.14	0.68
40	E4_Ab	KnownBoundary	0	13.15	0.00	1.54	0.00	7.37	5.87	0.00	0.00	5.51	5.63	1.23	0.00	1.40	1.09	0.00	6.96	4.61	4.62	16.18	4.13	9.99	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	1.89	0.00
41	ER4b	ExonRegion	0	4.30	1.16	1.50	5.19	0.67	2.19	0.00	0.64	2.98	4.63	0.06	0.00	0.11	1.67	1.99	3.77	6.12	3.29	1.28	2.55	1.02	1.30	0.00	0.78	1.12	1.14	0.66	2.22	0.00
42	ER4c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	2.53	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00