Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-755B10.1	Gene	0	0.30	2.26	0.70	1.00	0.00	2.12	1.41	0.00	1.65	1.21	0.00	0.52	0.91	1.14	3.60	0.70	2.93	0.63	3.13	0.77	4.20	0.76	0.00	3.01	1.60	0.44	0.26	2.06	1.40
2	470427	Transcript	0	0.12	0.93	0.29	0.41	0.00	0.87	0.58	0.00	0.68	0.50	0.00	0.21	0.39	0.47	1.48	0.29	1.20	0.26	1.29	0.32	1.73	0.31	0.00	1.64	0.67	0.18	0.11	0.85	0.58
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	16.40	45.66	68.44	34.30	54.38	35.87	133.60	19.06	23.87	129.50	57.35	87.05	27.74	73.58	7.77	48.27	58.41	22.86	72.38	38.46	58.48	18.96	36.44	42.23	26.82	33.47	32.95	28.44	42.36
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.91	2.74	0.36	0.51	1.04	3.41	4.00	1.17	4.96	3.99	1.43	1.05	1.06	1.60	5.07	2.84	2.75	1.23	9.50	1.45	2.53	0.13	0.64	3.05	1.32	1.00	1.95	1.50	0.14
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.86	3.81	0.22	0.00	0.00	3.54	3.47	0.92	6.63	4.31	1.62	1.30	0.76	1.24	6.74	2.84	3.56	1.01	11.42	1.38	3.82	0.00	0.24	3.35	1.81	0.83	1.44	1.34	0.00
8	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.94	1.52	0.52	1.13	2.30	3.30	4.70	1.46	3.03	3.66	1.22	0.76	1.43	2.05	3.17	2.89	1.79	1.51	7.00	1.52	0.99	0.28	1.14	2.71	0.74	1.21	2.59	1.66	0.31
9	Ix	Intron	0	1.14	3.44	0.00	0.00	3.91	4.04	2.15	0.00	4.34	2.31	0.00	0.33	0.00	0.73	5.16	2.46	1.59	1.54	5.97	0.74	2.29	0.00	0.00	2.30	0.38	0.00	0.00	0.44	0.36
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.16	3.48	0.00	0.00	3.95	4.08	2.18	0.00	4.39	2.34	0.00	0.33	0.00	0.73	5.22	2.49	1.61	1.56	6.03	0.74	2.31	0.00	0.00	2.32	0.39	0.00	0.00	0.44	0.36
11	Ix	Intron	0	0.42	1.49	0.16	0.00	0.00	2.02	2.17	0.72	1.16	1.56	0.12	1.51	0.82	0.40	1.98	0.42	1.61	0.38	3.76	1.01	2.24	0.18	0.35	1.27	0.56	0.46	0.36	0.32	0.20
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.42	1.50	0.16	0.00	0.00	2.03	2.18	0.73	1.16	1.56	0.12	1.52	0.83	0.40	1.99	0.42	1.61	0.38	3.77	1.01	2.25	0.18	0.36	1.27	0.56	0.46	0.36	0.32	0.20
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	3.85	0.08	0.00	1.80	0.45	0.16	0.00	0.00	0.94	0.00	3.36	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	1.53	4.88	0.94	1.83	0.91	4.43	2.77	1.19	5.03	5.44	1.37	2.53	0.88	1.82	3.65	3.41	3.98	1.54	6.29	1.25	6.10	0.37	0.31	1.83	1.02	0.53	0.87	1.69	0.78
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.00	4.64	0.97	2.23	1.52	4.88	3.58	1.64	6.27	5.20	1.06	1.37	1.03	1.65	3.07	3.24	3.85	2.23	8.66	2.29	6.08	0.32	0.32	2.10	0.95	0.28	1.14	1.52	0.77
16	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.82	7.66	1.40	2.57	0.00	3.79	1.45	1.32	4.23	5.88	1.42	3.98	1.09	2.66	6.05	5.18	4.29	1.88	6.50	0.99	4.27	0.43	0.00	1.55	2.40	0.38	0.00	3.51	1.76
17	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.76	4.25	0.78	1.28	0.70	4.27	2.52	0.79	4.28	5.51	1.61	3.03	0.69	1.71	3.42	3.02	4.00	0.89	4.33	0.49	6.67	0.39	0.39	1.69	0.66	0.79	0.92	1.28	0.50
18	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.78	6.04	0.00	0.00	0.00	1.55	3.24	0.00	1.87	0.00	1.37	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	0.00	0.00	1.75	0.00
19	ER2a	ExonRegion	0	0.37	2.78	0.87	1.24	0.00	2.61	1.74	0.00	2.03	1.50	0.00	0.64	1.11	1.41	4.44	0.86	3.61	0.78	3.87	0.95	5.18	0.93	0.00	3.35	1.97	0.54	0.32	2.54	1.73