Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-447D11.1	Gene	0	3.72	3.10	4.77	3.95	1.69	2.49	2.43	1.17	3.25	3.62	1.62	4.82	1.41	3.08	20.95	7.11	5.02	13.57	4.49	12.54	5.17	2.46	3.24	2.85	3.14	2.33	3.43	3.44	2.67
2	429315	Transcript	0	2.63	2.28	2.71	2.60	0.88	1.83	1.55	0.89	2.13	2.34	1.02	2.76	0.89	1.81	10.73	4.04	2.95	10.26	3.80	7.49	3.64	1.32	1.73	1.63	1.80	1.38	2.67	2.03	1.91
3	IG7	Intergenic	0	5.96	1.92	3.42	7.17	0.42	1.31	1.49	0.72	1.68	2.95	1.03	3.19	0.48	1.97	12.58	6.83	6.04	21.81	2.78	4.44	2.73	2.66	2.28	0.47	1.43	1.30	2.15	1.98	3.08
4	IG7_SR1	SilentIntergenicRegion	0	1.27	0.69	1.23	4.25	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.31	0.03	0.60	0.57	0.40	1.63	2.55	1.20	10.06	1.89	0.82	1.27	1.60	1.07	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.64
5	IG7_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	11.89	3.60	7.44	16.17	1.22	2.41	3.53	1.61	3.24	5.59	2.37	7.86	1.13	4.02	26.45	15.32	11.59	48.62	3.20	9.88	4.48	5.44	5.66	0.81	2.50	2.66	2.98	5.05	7.87
6	IG7_SR2	SilentIntergenicRegion	0	3.32	1.14	1.32	1.88	0.00	0.60	0.53	0.32	1.12	1.64	0.42	0.75	0.00	1.03	6.36	2.27	3.69	6.86	2.79	1.79	1.99	1.09	0.32	0.38	1.00	0.75	2.24	0.46	0.52
7	ER1a	ExonRegion	0	11.44	8.36	1.36	4.42	3.99	5.30	2.48	4.90	7.50	8.82	3.15	4.40	3.01	6.08	29.01	9.06	3.97	9.26	6.54	5.36	11.66	3.68	6.97	3.94	8.41	10.44	2.99	13.77	4.05
8	E1_Da	NovelBoundary	0	253.46	242.76	511.50	262.07	174.34	327.20	241.96	268.24	618.49	426.10	267.79	305.11	452.35	432.03	398.04	305.23	792.66	4.50	0.00	97.17	357.99	318.69	305.89	381.92	290.16	488.41	288.99	512.13	372.36
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I1	Intron	0	4.02	1.80	0.96	2.17	0.74	1.42	1.16	0.39	1.70	1.92	0.32	2.95	0.12	0.95	7.91	1.48	2.85	10.39	3.97	1.92	3.37	0.82	0.55	0.98	0.69	0.86	0.44	0.39	0.91
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	6.30	2.08	0.78	2.35	0.49	0.89	1.11	0.41	0.97	2.10	0.53	4.26	0.00	1.15	7.67	2.85	3.34	11.93	3.31	2.24	3.83	1.07	0.54	0.80	0.31	0.88	0.00	0.36	0.60
12	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.69	1.52	1.94	0.70	0.53	1.73	1.89	0.62	1.95	2.03	0.20	2.18	0.00	1.19	9.12	1.04	3.54	10.20	5.40	1.68	3.53	0.97	1.22	0.36	0.55	0.92	1.86	0.83	1.41
13	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.29	0.61	4.49	3.57	0.00	1.25	0.00	1.07	0.00	6.48	0.00	3.14	0.00	1.81	19.93	0.00	1.07	15.04	4.95	3.73	0.73	3.44	0.00	0.90	3.62	1.50	0.00	0.99	0.34
14	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.95	1.71	0.45	2.59	1.15	1.84	0.95	0.22	2.48	1.37	0.19	1.91	0.31	0.55	6.79	0.34	2.13	8.53	3.95	1.59	2.99	0.30	0.29	1.47	0.96	0.77	0.29	0.19	1.05
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	4.75	0.00	0.00	1.54	1.43	0.00	26.51	0.00	4.66	13.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.30	0.00	1.49
16	ER2a	ExonRegion	0	19.60	19.52	10.47	9.62	5.46	9.54	11.69	2.88	12.03	16.46	7.45	15.70	7.36	5.88	48.46	21.06	18.35	71.28	24.28	24.21	22.90	10.46	9.26	4.81	5.47	3.23	24.08	5.53	10.94
17	E2_Da	NovelBoundary	0	22.95	23.46	18.51	19.20	14.00	8.71	30.15	2.54	38.04	38.11	7.43	15.81	15.22	3.94	23.72	19.97	16.34	36.99	40.46	16.04	27.19	6.27	4.28	8.02	10.76	4.98	24.85	3.86	18.98
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	2.29	1.97	1.12	2.24	0.44	0.98	1.71	0.98	3.29	2.44	0.74	2.14	0.52	1.21	20.11	2.07	4.19	8.87	3.98	3.09	3.68	0.88	0.56	1.25	1.53	1.40	1.22	1.23	2.26
21	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.45	0.68	0.00	0.00	0.49	2.03	0.00	0.00	2.30	2.13	0.00	1.82	1.64	0.00	6.25	1.08	1.26	2.30	0.00	0.58	2.40	0.38	0.76	0.91	0.56	0.44	0.00	0.00	0.70
22	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	7.66	0.39	0.66	0.00	0.42	1.43	2.82	0.00	0.94	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	4.86	0.00	11.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.75	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.01	0.00	4.92	0.00	0.00	0.00	0.00	4.36	0.00
24	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.44	0.08	0.00	0.14	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	7.51	0.08	1.55	3.09	1.31	0.00	2.28	0.06	0.07	1.13	0.00	0.03	0.23	0.00	0.00
25	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.19	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	33.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.08	2.16	0.00
26	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.12	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix	Intron	0	0.00	0.57	0.20	1.76	0.00	0.34	0.00	0.00	1.99	1.06	0.15	0.53	0.48	0.11	13.73	0.00	1.83	0.71	0.00	0.68	1.05	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	1.00	0.74
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.57	0.21	1.77	0.00	0.34	0.00	0.00	2.00	1.07	0.15	0.53	0.48	0.11	13.80	0.00	1.84	0.71	0.00	0.68	1.05	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	1.00	0.74
29	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	6.98	1.37	0.00	0.00	1.84	0.00	2.19	11.91	7.55	12.18	6.87	9.08	1.06	0.00	0.00	4.86	4.62	0.00	3.89	3.57	4.28	4.78	0.00	0.00	0.00	4.47	0.00	1.82
30	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.49	3.37	0.33	3.92	1.93	1.58	0.11	0.00	0.00	1.07	0.06	0.75	0.00	0.00	0.66
31	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	1.96	2.35	0.00	1.83	1.96	0.00	1.42	3.25	1.09	9.57	3.52	3.20	0.00	0.00	11.25	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	13.57	0.00	0.00
32	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	1.06	0.00	0.00	4.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E5_Aa	NovelBoundary	0	5.13	11.92	0.00	0.00	6.19	6.94	0.00	10.20	7.92	5.27	0.00	7.44	2.64	6.03	0.00	9.33	15.28	4.62	0.00	3.56	15.16	4.42	0.00	12.50	4.89	7.47	0.00	3.68	6.60
34	ER5a	ExonRegion	0	1.32	0.00	2.12	4.41	0.00	1.93	0.62	0.54	0.69	2.22	0.73	4.93	0.00	1.95	19.50	4.77	1.64	12.18	3.93	12.80	3.88	0.00	1.11	1.98	0.84	0.97	0.00	3.00	4.74
35	E5_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	6.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.84	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	1.33	4.62	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	0.84	7.57	2.91	0.86	0.00	0.00	3.14	3.05	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	7.60	0.00	0.00
38	ER6a	ExonRegion	0	0.38	1.42	4.20	1.41	0.45	0.53	0.84	0.65	2.06	0.76	1.26	3.86	0.23	3.21	14.32	4.13	3.66	5.99	1.12	13.72	2.20	0.79	2.86	2.36	2.83	0.83	1.35	1.86	2.27
39	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	1.57	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	3.38	5.39	0.00	11.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.04
40	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	6.58	9.27	0.00	0.00	2.46	2.09	1.16	0.00	0.00	2.98	0.00	2.13	0.00	0.00	2.05	5.39	0.00	18.28	1.89	0.00	0.00	3.05	3.26	0.00	4.67	0.00	1.29
41	Ix	Intron	0	0.18	0.27	1.41	0.60	0.00	1.27	1.53	1.39	0.33	1.34	1.10	2.08	0.11	1.18	3.18	2.51	2.26	3.81	1.08	2.95	1.56	0.46	0.61	1.63	0.60	0.00	1.08	1.78	1.30
42	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.31	1.43	0.00	0.95	1.91	1.34	0.33	0.02	0.95	1.32	0.00	1.04	1.93	4.76	2.05	4.22	0.78	3.86	2.25	1.07	0.36	2.58	0.86	0.00	1.10	1.84	1.07
43	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.31	0.47	1.49	0.00	0.00	1.52	1.25	1.45	0.33	2.30	1.22	2.65	0.19	1.29	4.11	0.87	2.43	3.53	1.30	2.30	1.06	0.00	0.79	0.94	0.42	0.00	1.07	1.75	1.47
44	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.43	4.05	0.67	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.87	0.58	1.20	3.48	0.26	0.91	5.93	0.00	1.09	1.95	1.29	0.00	1.40	0.00	1.09	0.43	1.32	0.32	0.00	0.70	1.08
45	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.48	1.76	2.75	0.00	3.11	3.64	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER7a	ExonRegion	0	1.42	0.37	5.88	4.67	1.61	1.89	2.03	0.52	1.97	2.12	0.67	4.02	0.89	2.43	20.21	6.66	4.46	8.52	2.27	13.24	2.47	2.22	2.22	2.90	2.53	1.64	1.44	2.16	0.93