Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ZNF662	Gene	0	2.27	2.56	1.64	0.44	1.86	2.58	0.93	0.42	3.15	3.47	0.85	1.05	0.45	2.45	2.44	2.60	6.40	4.33	3.21	1.91	2.22	0.71	1.58	9.65	2.36	2.36	2.02	1.28	2.25
2	440367	Transcript	0	0.72	1.04	1.30	0.00	3.08	1.85	0.00	0.57	0.68	0.89	0.51	0.00	0.00	1.00	0.44	0.25	1.87	0.19	0.32	0.01	0.14	0.00	2.73	2.24	1.73	1.61	0.00	0.00	0.00
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4	429034	Transcript	0	1.68	2.23	2.04	0.65	1.47	1.85	1.22	0.93	2.47	2.35	1.45	1.11	0.86	1.80	2.08	1.34	5.93	4.97	3.37	2.22	2.16	0.85	0.93	5.29	1.63	2.85	2.37	1.67	1.77
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8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1_Ac	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	5.84	0.00	0.00	0.00
11	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	2.53	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER1d	ExonRegion	0	1.23	0.00	1.28	0.00	4.66	0.00	0.70	0.00	0.96	0.63	0.23	0.34	0.25	0.17	0.00	0.86	1.66	2.21	0.00	0.00	0.82	0.66	0.35	0.82	0.00	2.11	0.70	0.78	0.82
14	E1_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E1b_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	1.72	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.27	0.00	6.02	2.05
16	E2_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	1.76	0.00	3.50	1.35
17	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	1.44	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	1.48	0.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.07	0.00	3.26	1.34
18	ER2b	ExonRegion	0	0.43	1.43	0.73	0.00	8.53	3.62	0.00	0.00	1.63	1.44	0.53	0.15	0.00	0.80	0.00	2.51	2.37	2.80	2.36	1.22	0.00	1.60	2.59	0.95	0.02	2.20	0.67	0.74	0.47
19	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	4.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
20	E2a_E2c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.21	0.00	0.00	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E2d	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	13.12	0.00	0.00	0.00	2.86	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	6.71	0.00	0.00
22	ER2c	ExonRegion	0	0.45	0.52	0.27	0.00	0.00	0.75	1.28	0.00	1.16	1.13	0.28	0.20	0.00	1.32	0.56	1.14	2.25	1.81	0.14	1.06	0.11	0.29	0.15	1.24	1.24	0.75	0.00	0.22	0.93
23	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER2d	ExonRegion	0	2.86	3.28	0.00	0.00	3.32	5.50	0.00	0.00	0.37	3.85	0.79	0.00	0.00	0.00	16.80	2.53	3.01	0.00	13.58	2.81	0.00	0.00	0.60	2.15	0.00	1.57	1.83	1.63	0.00
26	ER2e	ExonRegion	0	3.93	2.41	1.74	0.00	4.23	5.64	0.00	0.64	1.37	2.98	0.79	0.00	1.10	0.88	4.85	1.86	3.06	4.91	8.07	0.19	3.28	0.00	2.41	5.09	0.48	1.86	3.30	0.35	5.44
27	E2_Db	KnownBoundary	0	5.31	0.00	2.77	0.00	0.00	1.50	0.00	2.54	1.25	3.36	1.33	0.00	0.00	2.28	0.00	3.06	4.10	0.00	8.09	0.00	1.85	0.00	1.87	6.10	1.93	1.93	0.00	0.00	4.75
28	ER2f	ExonRegion	0	1.38	2.67	3.07	0.00	0.00	1.92	0.00	1.04	1.25	2.59	0.40	0.00	0.00	2.62	0.00	1.96	4.14	0.00	1.71	0.00	0.40	0.00	2.35	1.79	1.97	0.74	0.00	0.00	2.71
29	E2c_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.96	0.00	0.00	3.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.48	0.00	3.79	1.80	0.00	0.00	0.00
30	E2c_E4a	KnownJunction	0	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22
31	E2c_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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34	ER3a	ExonRegion	0	0.59	0.55	1.98	0.00	1.56	2.28	0.00	0.34	0.56	1.05	0.95	0.00	0.00	2.02	2.20	1.24	2.00	0.96	1.60	0.06	0.71	0.00	2.73	3.54	1.36	2.13	0.00	0.00	0.00
35	E3a_E4a	KnownJunction	0	3.01	4.65	1.54	0.00	13.85	3.91	0.00	2.49	2.86	3.40	1.61	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	3.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.45	7.66	3.49	4.12	0.00	0.00	0.00
36	ER4a	ExonRegion	0	3.92	2.48	2.73	0.00	2.23	2.97	0.59	0.06	4.37	5.78	0.38	1.09	0.06	4.52	1.56	4.61	9.09	4.69	2.34	1.98	2.33	0.73	3.16	11.39	4.04	1.64	2.34	0.16	3.10
37	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	3.49	4.29	0.00	0.00	3.57	0.00	0.00	6.18	3.52	1.46	0.00	0.00	2.04	9.97	7.11	7.86	0.00	0.00	0.00	2.05	2.24	0.00	13.82	3.71	1.85	6.96	0.00	11.55
38	ER4b	ExonRegion	0	2.94	4.95	1.36	1.13	2.81	4.82	1.33	0.46	5.17	5.98	1.38	1.97	0.83	3.39	5.64	3.99	9.58	6.83	6.73	3.03	4.12	1.23	2.67	16.80	3.51	3.30	3.37	2.71	3.29
39	E4_Db	KnownBoundary	0	5.66	4.56	4.26	0.00	7.07	3.91	0.00	0.00	4.20	6.11	1.55	0.00	0.00	3.59	7.77	7.04	12.83	0.00	0.00	4.13	2.05	0.00	0.00	24.40	8.75	6.44	10.09	0.00	1.49
40	ER4c	ExonRegion	0	4.15	3.49	2.46	0.00	0.91	1.88	0.91	0.41	3.94	3.63	0.09	0.48	0.00	2.90	2.48	3.60	7.35	4.09	2.84	2.02	1.61	0.00	0.37	24.60	3.87	2.99	2.10	1.37	3.03
41	E4_Ab	KnownBoundary	0	2.24	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	1.56	0.00	1.60	0.00	0.95	0.00	0.00	7.29	0.00	0.00	0.00	4.89	0.00	1.97	15.49	5.61	0.00	0.00	2.29	2.05
42	ER4d	ExonRegion	0	2.93	1.63	1.62	0.00	0.00	4.17	0.00	0.63	4.14	1.98	0.51	1.99	0.00	2.47	0.00	3.15	8.95	1.70	0.00	1.34	4.24	0.14	1.04	18.39	1.65	4.20	0.98	0.22	4.12
43	E4_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	3.31	2.01	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88
44	E4_Dd	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	5.01	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	5.80	0.00	0.00	0.00	0.00	2.91
45	ER4e	ExonRegion	0	0.00	3.28	1.12	0.00	0.00	2.75	0.00	1.84	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.01	5.46	0.00	2.81	1.43	1.80	0.00	15.06	1.43	0.00	0.00	0.00	5.37
46	ER4f	ExonRegion	0	1.68	2.23	2.04	0.65	1.47	1.85	1.22	0.93	2.47	2.35	1.45	1.11	0.86	1.80	2.08	1.34	5.93	4.97	3.37	2.22	2.16	0.85	0.93	5.29	1.63	2.85	2.37	1.67	1.77