Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C3orf39	Gene	0	1.84	6.20	7.93	2.60	20.82	5.07	2.00	3.73	5.01	9.74	1.96	3.36	3.46	6.66	2.33	5.18	8.67	5.42	2.75	3.48	3.30	9.65	8.43	112.30	9.21	86.37	6.86	114.67	16.47
2	344697	Transcript	0	1.81	2.39	3.00	0.00	8.58	3.59	4.07	0.20	0.00	3.06	0.00	0.00	1.12	1.12	4.64	5.81	4.93	2.82	4.05	2.12	0.26	6.11	2.44	53.61	1.37	39.57	1.51	24.67	7.32
3	441964	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	3.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.20	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	3.68	0.15	9.34	0.00	5.52	0.50
4	ER1a	ExonRegion	0	0.79	1.19	1.97	0.00	10.83	2.11	2.47	0.40	0.00	2.41	0.00	0.00	0.48	0.20	1.70	0.92	2.22	1.01	0.00	1.02	0.53	1.33	0.00	10.62	0.81	18.03	0.68	21.93	3.52
5	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.17	0.00	6.48	0.00	5.03	2.54	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	31.10	1.93	34.42	0.00	40.12	5.74
6	ER1b	ExonRegion	0	1.06	3.00	1.82	3.55	6.67	2.78	1.49	1.29	1.11	2.73	0.00	0.68	1.98	2.15	2.94	5.80	2.86	3.07	3.60	2.51	0.66	4.46	3.39	39.28	4.27	32.81	1.64	27.14	4.27
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.57	0.00	4.54	0.00
8	E1a_E3a	KnownJunction	0	2.83	3.59	4.04	0.00	6.34	5.06	5.66	0.00	0.00	3.71	0.00	0.00	1.75	2.04	7.57	10.71	7.63	4.62	8.09	3.23	0.00	10.89	4.88	96.60	1.93	61.11	2.34	27.41	11.13
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	12.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.05	0.60	11.99	0.00	10.34	0.00
11	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.92	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60	0.00	18.80	0.00	6.38	0.00
13	I2	Intron	0	0.00	0.00	0.08	0.00	0.46	0.42	0.00	0.09	0.13	0.24	0.19	0.00	0.00	0.13	0.22	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.04	0.65	0.00	2.57	0.00	3.00	0.00
14	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	3.14	0.00
15	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	3.44	0.00
16	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	2.04	0.00	3.37	0.00
17	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.07	0.00	0.19	0.28	0.22	0.42	0.00	0.00	0.05	0.47	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.09	0.44	0.00	2.97	0.00	2.82	0.00
18	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.13	0.00	0.00	0.15	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	2.48	0.00	2.77	0.00
19	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	1.23	0.00	2.06	0.00
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	14.44	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	24.05	0.00	29.52	0.00	5.93	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	2.04	6.98	8.98	2.78	23.17	5.62	2.11	4.24	5.76	10.99	2.27	3.86	3.90	7.61	2.47	5.68	9.79	6.04	3.02	3.86	3.76	10.90	9.62	127.39	10.40	96.88	7.84	129.76	18.67
22	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.82	2.01
23	IG6_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.70	0.00	0.00	0.00
24	IG6_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.71	0.00	3.94	0.00	0.00	0.00
25	IG6_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.08	0.07	0.07	0.34	0.05	0.00	0.00	0.64	0.00	0.33	0.18	0.00	0.13	0.16	0.31	0.00	0.50	0.81	0.06	10.86	0.00	0.35	0.00