Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	CISH	Gene	0	9.05	38.05	26.76	2.72	4.34	33.26	4.10	7.95	43.52	32.02	6.51	8.94	12.41	11.29	6.22	25.26	20.06	17.78	3.16	3.97	9.53	22.41	6.22	23.18	8.93	30.94	4.71	7.53	15.33
2	348721	Transcript	0	3.08	10.52	5.08	0.00	0.00	5.06	0.00	0.00	1.54	4.91	0.10	3.18	1.93	1.46	0.00	3.67	1.92	4.87	1.36	2.28	3.75	1.24	0.90	2.57	0.87	0.84	1.86	1.26	1.71
3	443053	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	491847	Transcript	0	0.85	6.90	2.22	0.45	1.37	4.11	0.26	2.52	5.90	4.18	0.60	0.39	0.46	1.79	1.12	4.91	3.69	1.23	0.57	0.12	0.44	1.30	0.16	3.77	1.06	2.04	0.37	0.22	1.38
5	ER1a	ExonRegion	0	1.14	0.00	0.07	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.48	0.50	2.72	0.42	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	0.85
6	E1_Ab	KnownBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
7	E1_Ac	KnownBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	4.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.63
8	ER1b	ExonRegion	0	4.87	2.39	3.16	0.00	4.08	2.50	0.37	0.00	0.92	2.76	1.19	0.34	1.54	0.91	0.00	2.30	2.37	8.68	2.88	3.32	0.26	1.47	6.08	3.91	0.52	2.29	0.00	2.67	7.56
9	ER1c	ExonRegion	0	6.64	13.27	17.90	2.81	11.15	10.35	0.76	3.61	9.52	12.49	3.54	3.95	3.51	3.48	3.62	20.46	7.24	18.71	1.01	2.34	3.76	9.08	2.85	5.36	2.03	10.81	4.54	2.86	10.17
10	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E1d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E1e	KnownJunction	0	5.01	21.04	10.09	0.00	0.00	9.09	0.00	0.00	3.08	9.83	0.00	6.36	3.09	2.92	0.00	7.34	3.35	9.25	0.00	4.13	7.50	2.48	0.00	5.14	1.74	1.67	3.73	1.89	2.58
13	ER1d	ExonRegion	0	1.19	3.75	1.94	1.33	0.23	5.77	0.19	1.10	4.08	4.21	0.72	0.37	0.37	1.88	2.13	5.97	4.11	2.34	0.89	0.26	0.66	1.79	0.42	2.43	1.23	2.65	0.59	0.38	1.04
14	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.89	0.00	0.00	16.23	0.00	1.84	9.26	5.23	0.00	1.54	1.50	0.89	0.00	7.11	3.44	4.62	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	2.93	1.93	3.69	0.00	0.00	5.88
15	ER1e	ExonRegion	0	0.70	3.50	2.41	0.00	0.00	6.80	0.00	1.78	6.27	4.29	0.86	0.78	0.24	1.12	1.51	6.13	6.83	1.35	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.50	0.19	4.93	0.00	0.53	0.79
16	E1_Db	KnownBoundary	0	0.00	4.75	2.64	0.00	0.00	4.91	0.00	1.94	3.41	1.76	3.23	0.00	1.43	1.99	0.00	7.19	5.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.49	0.00	0.00	1.58
17	E1b_E1e	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER1f	ExonRegion	0	1.37	7.09	3.99	0.01	0.56	4.26	0.58	1.54	8.19	4.71	1.08	0.80	0.59	2.45	1.21	8.76	5.29	1.35	0.82	0.12	0.66	0.92	0.05	3.88	1.23	3.20	0.53	0.28	1.09
19	E1_Ae	KnownBoundary	0	2.71	0.00	2.34	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	3.20	6.51	0.00	0.00	0.00	3.30	8.97	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	6.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER1g	ExonRegion	0	27.25	59.04	50.47	1.83	7.34	73.66	4.80	12.89	38.68	62.48	15.46	17.54	21.79	22.21	7.23	51.98	28.83	33.90	7.45	12.03	21.88	51.93	11.98	38.53	12.31	60.54	8.57	12.84	25.82
21	E1_Dc	NovelBoundary	0	2.65	0.00	3.94	0.00	0.00	5.33	0.00	2.04	3.41	1.68	0.00	1.69	0.00	0.84	0.00	3.82	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
22	E1c_E2a	KnownJunction	0	26.96	43.92	103.85	8.41	6.78	96.84	13.79	27.17	44.83	64.03	37.23	18.73	32.16	41.88	0.00	62.73	55.98	61.39	7.87	12.40	13.88	57.76	9.06	80.75	33.26	56.69	10.98	19.77	40.67
23	I1	Intron	0	0.00	0.00	2.22	1.59	0.00	3.96	0.00	0.82	1.61	1.28	0.00	0.68	0.00	1.01	0.00	4.80	0.99	1.28	0.00	0.00	0.63	0.80	0.00	0.95	1.90	3.48	0.00	0.36	1.33
24	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	2.24	1.60	0.00	4.00	0.00	0.82	1.63	1.29	0.00	0.69	0.00	1.01	0.00	4.84	1.00	1.29	0.00	0.00	0.64	0.81	0.00	0.96	1.92	3.52	0.00	0.36	1.34
25	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	4.53	0.00	6.93	5.29	0.00	2.24	4.66	11.10	3.23	0.00	0.00	2.13	0.00	7.65	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	4.28	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	2.05
26	ER2a	ExonRegion	0	21.84	99.77	70.13	7.18	10.82	84.63	11.45	20.33	118.49	82.89	16.36	24.27	34.88	28.16	15.32	56.63	49.40	46.66	7.17	10.36	25.62	60.39	17.32	61.26	24.08	82.53	12.36	21.11	41.83
27	E2_Da	KnownBoundary	0	2.48	47.12	12.43	0.00	14.74	29.31	0.00	7.51	52.07	22.21	1.27	2.86	7.42	7.13	9.97	10.79	12.02	4.62	8.09	0.00	0.00	13.32	0.00	17.83	1.93	19.83	0.00	1.66	11.65
28	ER2b	ExonRegion	0	0.00	26.28	1.12	0.00	9.96	6.87	0.00	5.52	21.52	7.72	0.41	0.19	3.40	3.59	5.60	3.70	4.05	1.68	3.83	0.00	0.00	6.31	0.07	11.09	1.43	8.95	0.00	0.38	6.97
29	ER2c	ExonRegion	0	0.00	9.85	0.75	0.00	3.32	2.29	0.00	4.91	5.43	3.61	0.00	0.00	0.43	1.06	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	5.02	0.71	0.26	0.00	0.00	2.01
30	IG24_SR4	SilentIntergenicRegion	0	1.29	0.37	0.56	0.20	2.19	1.05	0.55	1.65	2.27	2.30	0.37	1.54	0.32	0.98	0.40	4.25	5.71	0.58	0.61	1.01	1.05	0.26	0.21	1.60	1.76	0.99	0.36	2.34	1.21
31	IG24_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	2.17	2.01	1.28	1.63	2.17	1.32	0.80	2.77	2.45	4.01	0.91	2.86	0.29	0.90	1.31	7.04	11.58	2.08	0.18	0.78	1.25	0.80	0.99	2.80	3.65	1.30	0.61	3.44	0.80
32	IG24_SR3	SilentIntergenicRegion	0	2.90	4.20	3.57	0.00	2.04	1.63	0.00	1.41	0.66	1.43	0.00	1.44	0.00	0.08	0.00	5.42	5.62	0.09	0.00	0.76	0.81	0.00	0.06	2.36	0.85	1.23	0.00	2.68	1.82
33	IG24_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.55	1.16	1.84	0.00	1.35	2.65	1.94	2.08	2.16	2.10	0.98	0.66	0.53	1.50	4.30	4.10	6.37	2.66	0.44	0.19	0.68	0.50	0.73	2.37	0.99	0.87	1.51	1.80	0.74
34	IG24_SR2	SilentIntergenicRegion	0	1.67	1.08	1.20	0.80	2.37	1.43	1.76	2.20	1.88	2.67	0.20	1.71	0.18	0.61	1.22	3.25	5.44	1.60	0.89	2.19	0.70	0.50	0.40	1.59	1.69	0.61	0.31	3.89	0.75
35	IG24_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.36	1.93	2.37	0.00	2.44	3.17	4.83	3.22	4.64	4.37	0.91	3.38	0.71	2.35	7.31	8.66	13.42	5.07	1.97	2.45	1.76	0.83	0.76	4.60	3.36	1.10	0.87	5.29	0.89
36	IG24_SR1	SilentIntergenicRegion	0	3.77	1.13	4.63	0.00	3.53	3.73	6.44	2.37	5.09	8.56	0.50	4.83	0.34	2.67	4.04	14.88	15.59	9.82	2.56	4.18	5.35	1.13	2.57	5.74	4.96	2.04	0.65	9.02	0.84