Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC022007.3	Gene	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00
2	475575	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.15	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.46	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	Ix	Intron	0	13.64	10.60	8.99	16.51	8.03	9.05	14.37	3.23	12.17	17.42	5.09	19.80	2.06	6.79	10.98	10.58	18.01	12.85	11.21	3.84	15.80	2.17	2.97	3.77	4.08	4.65	4.62	11.98	3.52
6	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.85	1.28	3.24	2.84	2.77	2.48	2.74	1.18	0.00	1.12	0.10	0.00	1.23	1.16	6.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.85	0.12	0.71	3.58	0.00	1.40	0.34
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.57	3.83	6.73	7.31	9.96	5.50	8.06	1.84	0.00	7.22	1.19	0.00	2.60	4.08	15.87	2.11	0.00	2.73	0.00	0.00	1.43	0.00	3.62	6.45	1.43	6.29	0.00	6.52	1.34
8	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	14.78	11.54	9.55	17.89	8.50	9.70	15.52	3.44	13.44	19.04	5.60	21.86	2.14	7.35	11.33	11.66	19.89	14.16	12.38	4.25	17.42	2.40	3.16	4.07	4.42	4.74	5.10	13.02	3.84
9	Ix	Intron	0	12.01	11.48	4.69	17.08	10.26	12.71	26.27	4.39	17.12	24.08	4.50	31.09	4.26	6.02	17.14	14.85	34.09	20.38	25.07	8.77	28.38	2.27	2.03	4.22	5.41	1.10	1.54	11.42	1.78
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	12.08	11.54	4.71	17.17	10.32	12.78	26.41	4.41	17.21	24.20	4.53	31.25	4.28	6.05	17.24	14.93	34.27	20.49	25.19	8.82	28.54	2.29	2.04	4.24	5.44	1.11	1.55	11.48	1.79
11	Ix	Intron	0	4.33	6.51	5.27	4.83	7.68	2.47	7.25	0.41	5.16	10.38	4.01	21.04	0.73	2.85	1.23	2.79	34.87	5.19	2.87	0.62	19.55	1.62	0.00	3.38	1.61	1.77	2.88	5.13	0.45
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.37	6.56	5.32	4.88	7.75	2.49	7.29	0.42	5.20	10.47	4.05	21.21	0.73	2.87	1.24	2.80	35.18	5.24	2.90	0.62	19.71	1.63	0.00	3.41	1.62	1.78	2.91	5.17	0.45
13	Ix	Intron	0	7.50	10.93	2.80	5.33	3.63	5.49	5.18	2.45	4.58	8.14	1.25	9.35	2.94	2.20	5.61	4.57	11.93	8.79	8.31	3.18	12.68	0.73	0.78	1.67	1.24	1.41	2.38	5.00	1.53
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.51	10.94	2.80	5.33	3.63	5.50	5.19	2.45	4.59	8.15	1.25	9.36	2.95	2.20	5.62	4.58	11.94	8.80	8.32	3.19	12.69	0.73	0.78	1.67	1.24	1.41	2.38	5.00	1.53
15	Ix	Intron	0	8.19	10.35	1.75	5.74	6.62	7.96	7.95	0.91	8.80	14.68	2.35	13.67	3.34	4.04	7.87	11.09	12.96	9.29	15.15	4.20	25.04	0.44	0.78	2.38	1.50	0.87	4.06	5.62	0.62
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	8.20	10.36	1.75	5.75	6.63	7.97	7.96	0.91	8.81	14.69	2.35	13.69	3.35	4.04	7.88	11.11	12.98	9.31	15.17	4.20	25.07	0.44	0.78	2.39	1.50	0.87	4.07	5.63	0.62
17	Ix	Intron	0	11.81	11.42	3.11	8.79	5.98	10.43	15.12	3.50	11.35	16.83	3.75	13.99	3.47	4.10	8.77	9.45	12.83	13.05	14.60	4.27	21.34	1.06	2.93	2.26	3.44	1.89	5.13	8.81	2.44
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	12.32	11.43	3.25	9.22	6.03	10.64	15.95	3.62	10.37	17.40	3.96	13.76	3.44	4.01	8.39	9.30	12.90	13.57	14.42	4.41	21.50	1.09	3.19	2.33	3.49	1.94	4.85	8.42	2.51
19	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.55	11.47	2.22	6.00	5.66	9.13	9.71	2.75	17.87	13.19	2.37	15.58	3.65	4.73	11.31	10.49	12.40	9.71	15.92	3.41	20.38	0.90	1.20	1.79	3.09	1.57	7.00	11.38	2.00
20	Ix	Intron	0	16.69	8.67	5.46	5.40	7.36	5.53	5.06	12.95	6.77	11.97	5.38	14.10	1.63	4.10	13.19	11.49	6.00	9.76	8.03	4.15	15.05	4.53	2.27	0.54	3.23	4.34	0.92	18.84	0.84
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	16.86	8.76	5.52	5.46	7.44	5.58	5.11	13.08	6.84	12.09	5.44	14.24	1.65	4.14	13.32	11.60	6.06	9.86	8.11	4.20	15.19	4.57	2.29	0.55	3.26	4.39	0.93	19.03	0.85
22	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00