Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GHRLOS	Gene	0	11.62	21.62	13.64	0.84	8.54	8.17	18.92	6.44	8.72	13.63	6.24	9.30	6.68	14.45	19.43	26.82	20.88	10.31	17.32	6.04	11.47	3.15	4.01	15.17	10.66	11.27	5.12	12.07	5.85
2	439539	Transcript	0	4.69	20.70	6.63	0.18	5.60	2.70	14.68	3.24	2.80	6.67	3.50	5.29	5.09	7.67	12.24	22.87	11.81	5.24	11.93	2.98	6.99	1.05	1.28	5.56	8.76	5.32	4.19	7.22	3.56
3	ER1a	ExonRegion	0	0.52	14.88	0.68	0.00	0.00	0.02	3.42	0.14	0.00	4.55	0.38	0.00	1.65	1.83	2.38	7.44	3.90	1.86	3.70	0.00	7.72	0.00	1.40	0.03	4.14	0.48	0.00	0.05	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	17.34	8.63	15.15	0.00	0.00	11.32	8.12	13.44	9.29	10.75	3.16	5.15	0.00	15.24	8.37	14.38	12.67	27.74	24.28	11.99	1.89	16.19	6.55	8.85	43.19	18.58	12.97	15.32	25.68
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.77	35.00	3.31	0.00	6.78	0.00	8.07	0.00	0.00	5.51	1.61	2.59	5.00	4.25	9.97	29.15	5.78	9.25	8.09	0.00	6.38	0.00	0.00	0.00	5.46	4.38	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00
7	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	Ix	Intron	0	1.90	3.00	3.46	2.12	0.48	4.20	0.80	1.27	2.65	5.27	2.23	3.16	0.26	2.81	1.99	6.72	4.57	4.62	4.73	1.36	5.07	1.07	1.61	2.76	2.96	1.09	2.17	2.09	1.71
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.19	0.64	1.92	0.00	1.35	2.29	0.56	0.10	0.62	2.06	0.00	1.71	0.00	1.42	1.52	2.90	0.08	3.20	2.68	2.29	1.64	1.00	1.00	1.19	1.99	0.46	0.15	1.36	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.31	4.33	4.34	3.31	0.00	5.30	0.93	1.93	3.80	7.09	3.48	3.99	0.40	3.60	2.27	8.88	7.09	5.44	5.89	0.85	7.00	1.11	1.96	3.65	3.52	1.44	3.30	2.51	2.68
11	Ix	Intron	0	5.59	4.58	5.55	0.00	0.00	3.59	0.96	1.31	1.87	5.48	0.00	4.82	0.62	5.05	3.70	8.83	6.02	7.31	4.55	1.96	3.38	1.71	1.72	5.10	4.41	3.73	0.00	2.32	1.59
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.65	4.63	5.61	0.00	0.00	3.62	0.97	1.32	1.88	5.53	0.00	4.86	0.62	5.09	3.73	8.91	6.08	7.38	4.59	1.98	3.42	1.73	1.73	5.15	4.45	3.76	0.00	2.34	1.61
13	Ix	Intron	0	2.51	11.33	0.98	0.00	0.00	7.25	4.73	0.00	1.32	1.69	2.09	1.45	1.90	1.32	2.70	4.36	4.38	7.91	5.62	3.23	2.51	0.00	0.00	2.52	0.84	5.53	0.00	0.96	3.15
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.57	11.59	1.00	0.00	0.00	7.42	4.84	0.00	1.35	1.72	2.14	1.48	1.94	1.36	2.77	4.47	4.45	8.09	5.75	3.31	2.57	0.00	0.00	2.58	0.86	5.62	0.00	0.98	3.22
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	18.71	11.54	0.00	0.00	8.90	2.92	4.88	7.58	11.02	0.00	4.13	1.37	7.95	16.94	16.91	24.72	14.64	8.09	0.00	2.05	0.00	0.00	6.04	8.64	5.66	0.00	0.00	1.55
16	ER2a	ExonRegion	0	5.86	21.93	3.40	0.00	7.99	3.11	21.85	4.44	2.64	8.17	2.70	2.76	6.09	8.98	20.01	25.16	9.38	6.06	14.44	5.91	4.45	0.00	0.00	7.28	19.19	5.18	16.48	5.39	4.40
17	E2_Da	NovelBoundary	0	10.44	13.67	5.90	0.00	0.00	12.09	2.92	2.19	5.73	8.87	0.00	0.00	1.21	9.13	28.50	10.48	6.93	9.76	0.00	4.13	7.86	0.00	0.00	5.86	6.63	3.78	6.31	1.71	5.18
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	17.06	1.02	0.00	5.89	0.00	15.62	4.73	1.46	2.00	4.78	4.31	7.04	10.06	16.94	14.31	13.57	0.00	16.18	0.00	7.54	0.00	0.00	3.05	3.52	1.76	0.00	4.18	4.69
19	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix	Intron	0	4.57	3.99	7.36	0.00	2.08	6.25	1.72	2.09	5.98	4.72	0.85	3.06	1.10	5.27	13.45	9.07	6.79	9.49	6.35	3.52	2.43	1.79	0.26	3.06	7.51	4.02	1.30	3.01	5.23
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.13	2.99	9.01	0.00	2.72	6.42	2.24	2.05	7.21	5.64	0.44	3.67	1.08	5.72	16.70	9.99	8.31	10.18	7.74	4.60	2.41	1.34	0.34	3.19	7.43	3.79	1.70	3.63	6.34
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.22	7.54	2.05	0.00	0.00	5.89	0.00	2.32	2.03	1.75	2.25	1.11	1.22	3.95	2.90	6.25	1.88	7.48	1.90	0.00	2.59	3.41	0.00	2.71	8.06	4.95	0.00	1.01	1.69
23	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	13.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.66	3.56	1.58	3.40	0.00	0.91	16.14	3.82	5.45	0.00	8.09	20.67	1.60	0.00	4.14	2.63	7.96	8.75	0.00	4.58	4.75
24	ER3a	ExonRegion	0	6.40	32.14	17.53	0.00	9.17	5.31	16.73	3.31	3.75	7.43	8.27	7.32	4.42	8.69	13.51	27.98	15.12	6.81	12.46	4.38	9.60	0.30	2.33	5.38	12.18	9.93	6.20	7.79	5.97
25	E3_Da	NovelBoundary	0	5.25	4.85	1.15	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	2.74	3.24	9.36	0.00	0.00	2.15	26.71	0.00	9.05	13.87	0.00	0.00	5.37	0.00	0.00	2.57	1.93	0.00	0.00	0.00	3.20
26	E3a_E4a	KnownJunction	0	2.30	4.36	5.23	0.00	0.00	0.00	16.13	1.84	0.00	2.04	0.00	8.40	3.50	1.84	0.00	27.16	9.18	0.00	8.09	3.39	0.00	2.43	0.00	2.69	6.82	1.97	2.53	17.75	3.20
27	Ix	Intron	0	6.06	3.91	6.90	0.27	2.00	7.36	1.05	1.71	4.67	6.61	1.46	3.81	1.85	4.98	5.37	5.90	9.05	6.20	4.99	2.68	3.98	1.34	1.55	4.24	6.97	3.86	0.61	1.76	5.10
28	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.36	10.27	8.10	0.00	1.17	4.64	0.48	0.00	4.16	5.21	2.25	1.96	1.71	5.57	5.73	5.89	8.60	9.66	9.18	2.44	2.26	0.00	1.30	4.12	4.80	3.76	0.44	1.29	7.58
29	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.84	3.44	8.05	0.46	2.42	8.06	0.77	1.63	4.64	7.83	1.66	4.88	1.98	5.90	5.61	6.23	10.89	6.76	4.17	2.71	3.46	1.63	1.91	4.80	7.00	5.41	0.87	2.02	3.78
30	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	8.57	3.28	4.49	0.00	9.96	5.50	0.00	3.68	2.43	2.17	2.38	1.24	0.00	3.93	4.67	2.53	4.67	3.18	4.53	0.47	5.23	1.80	3.62	0.36	12.86	0.00	3.66	3.26	5.37
31	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	5.49	1.29	4.00	0.00	1.61	8.31	2.15	3.30	5.52	5.42	0.59	2.87	1.88	2.91	5.24	5.67	5.96	3.29	4.94	3.18	6.63	1.70	0.96	3.55	8.77	0.52	0.11	1.58	7.51
32	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.60	0.00	0.85	0.00	0.00	1.28	1.30	0.00	2.11	0.03	0.00	0.09	0.25	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	0.04	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.31	0.00
33	Ix	Intron	0	5.19	5.51	8.10	2.04	0.00	7.44	2.87	0.52	4.32	4.94	1.70	3.87	0.00	4.78	2.10	11.01	5.95	4.39	1.37	5.50	3.25	4.88	3.09	2.76	7.53	5.15	3.14	1.63	8.49
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.22	5.54	8.14	2.05	0.00	7.48	2.89	0.53	4.34	4.96	1.70	3.89	0.00	4.81	2.11	11.08	5.99	4.42	1.37	5.53	3.27	4.91	3.11	2.77	7.56	5.18	3.15	1.63	8.54
35	Ix	Intron	0	2.31	2.53	3.94	0.00	0.00	4.85	0.99	0.36	1.65	3.96	1.05	1.39	0.51	3.24	3.06	6.30	1.46	1.51	1.25	0.54	1.68	1.77	0.53	1.90	1.54	2.16	0.00	1.60	3.35
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.32	2.54	3.95	0.00	0.00	4.87	0.99	0.36	1.65	3.98	1.05	1.40	0.51	3.25	3.07	6.32	1.47	1.52	1.26	0.54	1.69	1.77	0.53	1.91	1.55	2.17	0.00	1.61	3.36
37	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.30	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	3.05	5.71	4.02	0.00	0.00	1.17	0.00	10.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	1.93	2.19	0.00	0.00	0.00
38	ER4a	ExonRegion	0	14.96	19.50	15.25	1.25	9.40	10.46	20.92	8.23	11.76	16.98	6.77	11.66	7.93	18.08	22.90	28.89	25.71	12.71	20.51	7.19	13.23	4.65	5.22	20.46	10.00	13.56	4.09	15.36	6.64