Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC026202.2	Gene	0	3.90	2.20	3.30	45.16	14.08	2.19	28.45	1.54	4.00	4.05	2.53	0.52	1.77	2.78	6.48	21.15	10.08	12.28	5.82	11.36	2.60	8.35	3.98	11.10	8.68	11.69	8.90	14.97	3.20
2	439325	Transcript	0	2.74	0.97	1.29	55.72	16.25	1.66	21.63	1.32	2.27	3.49	1.45	0.48	1.00	2.69	7.98	20.21	8.65	11.87	4.24	10.81	1.78	9.64	2.59	7.77	6.34	8.64	2.78	12.05	2.29
3	ER1a	ExonRegion	0	6.30	3.07	5.61	54.48	17.93	3.18	37.99	2.12	4.91	4.45	3.46	0.00	2.36	3.09	6.24	25.52	13.01	15.73	6.49	11.81	3.20	9.69	5.89	13.29	11.07	15.08	14.70	20.16	4.47
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.34	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	3.98	4.40	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	7.37	0.00	2.17	183.99	58.06	5.29	36.05	4.38	0.00	8.91	1.42	0.00	1.56	5.10	18.94	45.52	19.00	23.12	0.00	27.37	3.49	29.27	4.48	10.71	11.02	19.74	0.00	33.29	5.28
6	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.08	3.34	0.00	1.00	0.00	6.43	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	1.94	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	2.02	3.66	0.33	101.71	27.17	2.39	27.33	2.72	3.66	4.48	1.33	0.66	1.21	5.16	13.75	32.15	10.48	20.19	5.50	14.15	3.73	17.99	3.62	11.93	13.40	17.48	3.18	22.62	3.26
8	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.09	10.78	0.00	1.96	5.32	0.00	1.13	1.92	0.00	2.35	0.00	0.97	7.77	16.91	2.34	4.62	0.00	7.28	0.00	0.00	4.63	3.05	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.54	0.00	0.00	20.28	7.37	0.00	12.87	0.00	2.44	0.00	1.46	0.00	0.00	1.82	0.00	3.67	4.68	13.87	0.00	3.47	0.00	2.19	2.51	0.00	4.28	2.15	0.00	1.66	1.42
10	I2	Intron	0	1.49	1.42	0.79	2.79	2.11	1.72	2.86	0.36	2.84	2.25	1.39	1.60	0.48	1.49	1.75	5.15	3.37	4.83	2.67	1.73	3.36	0.98	1.06	2.52	1.99	1.12	1.94	2.75	0.80
11	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.83	2.09	1.52	0.64	2.86	2.78	4.14	0.47	5.07	3.74	2.86	2.80	0.55	2.22	2.39	8.41	5.84	5.38	3.06	4.01	4.65	1.95	1.82	4.29	3.21	1.82	3.51	4.93	1.57
12	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	1.20	0.00	0.89	6.67	3.81	10.43	3.91	0.00	1.95	5.14	1.09	2.22	0.00	2.56	0.00	10.50	2.92	7.87	1.20	0.00	6.42	0.85	1.28	7.47	4.16	0.00	0.00	0.00	0.95
13	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.72	0.54	1.86	3.60	3.09	3.84	2.72	0.00	1.89	3.84	1.27	1.51	0.65	1.99	0.00	5.07	3.64	7.31	3.21	0.46	4.25	0.60	1.81	3.22	2.03	0.26	2.45	3.82	1.57
14	Ix	Intron	0	3.62	3.12	2.01	2.55	1.95	4.00	3.50	1.39	4.11	5.91	1.35	2.58	0.89	3.01	3.98	6.01	6.60	11.19	6.61	2.40	5.52	0.84	1.09	3.40	2.26	1.82	1.71	2.36	1.07
15	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.77	5.66	2.06	1.26	1.72	3.38	4.96	0.65	5.32	5.34	0.21	3.47	0.00	2.71	1.78	8.05	7.88	12.31	7.87	3.88	4.77	1.27	2.23	7.19	4.78	1.93	1.29	3.16	1.18
16	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.82	3.01	3.52	4.18	2.44	4.33	2.86	3.07	5.60	8.67	2.48	3.19	1.62	4.41	5.23	6.71	9.90	14.36	6.52	1.84	5.12	1.35	1.96	6.17	2.68	4.13	3.90	3.40	2.56
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.68	3.56	0.89	1.40	0.95	1.13	3.15	0.72	3.08	3.10	0.47	0.97	0.76	1.76	4.06	4.23	3.32	7.41	3.43	1.08	2.20	0.35	0.00	1.09	0.71	1.06	0.52	0.96	0.00
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.39	2.43	1.44	2.27	1.99	4.66	3.55	0.83	3.24	5.22	1.24	2.40	0.76	2.63	3.86	5.54	5.26	10.08	7.07	2.63	6.70	0.57	0.57	1.46	1.74	0.71	0.91	1.92	0.48
19	Ix	Intron	0	0.68	2.05	0.00	0.00	14.01	9.64	6.43	1.17	3.76	3.68	2.28	1.58	0.00	3.75	1.47	6.90	0.48	14.74	19.35	4.15	8.64	0.00	0.00	2.06	0.91	0.50	0.00	1.04	1.49
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.41	3.28	0.00	0.00	10.06	8.58	2.68	1.31	3.01	3.91	1.92	0.93	0.00	2.20	2.35	3.59	0.33	9.42	18.37	2.89	5.99	0.00	0.00	1.31	0.91	0.80	0.00	0.46	0.79
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	24.08	16.50	17.13	1.84	7.86	7.22	2.38	2.89	0.00	8.01	0.00	22.78	1.00	25.47	56.57	10.31	20.21	0.00	0.00	6.45	1.43	0.00	0.00	2.45	4.03
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.14	0.00	0.00	0.00	22.26	11.70	13.33	0.94	5.11	3.09	3.23	2.90	0.00	6.78	0.00	12.40	0.76	25.62	18.57	6.37	13.42	0.00	0.00	3.25	0.90	0.00	0.00	2.16	2.77
23	Ix	Intron	0	3.61	2.88	0.20	0.00	0.59	1.49	1.70	0.00	1.42	2.08	0.14	2.15	0.00	2.23	1.32	2.30	4.13	6.30	8.45	2.65	5.49	0.22	1.31	1.55	1.38	1.13	0.00	1.57	0.32
24	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.18	4.24	0.30	0.00	0.86	1.70	2.50	0.00	1.89	2.81	0.21	3.17	0.00	2.96	0.97	2.20	5.29	7.90	11.31	3.42	6.31	0.32	1.28	2.29	2.02	1.39	0.00	2.31	0.48
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.43	0.55	0.00	0.00	0.00	0.70	2.11	2.59	1.72	2.95	2.45	1.06	3.83	0.00	1.39	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00
26	Ix	Intron	0	1.12	2.93	0.00	0.00	1.91	2.50	1.84	0.96	2.47	1.88	0.15	1.84	0.00	2.00	0.00	3.23	2.14	5.64	9.14	1.23	2.78	0.23	0.00	0.28	0.37	0.00	0.00	0.64	0.78
27	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	1.33	0.00	0.00	6.31	4.19	0.84	0.00	1.12	1.85	0.00	0.56	0.00	2.47	0.00	1.89	1.31	4.56	12.37	0.00	3.21	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.47	3.45	0.00	0.00	0.84	2.11	2.16	1.26	2.94	1.98	0.20	2.23	0.00	1.91	0.00	3.58	2.41	6.07	8.75	1.60	2.78	0.31	0.00	0.32	0.48	0.00	0.00	0.84	1.03
29	Ix	Intron	0	16.12	9.90	5.87	3.14	5.51	10.25	4.04	2.08	7.02	11.94	2.09	4.75	1.54	8.84	8.63	12.02	11.41	36.19	20.02	6.98	11.08	0.90	0.57	4.72	5.19	1.48	2.87	4.29	2.01
30	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	16.21	9.94	5.90	3.16	5.54	10.31	4.06	2.09	7.07	12.02	2.10	4.78	1.55	8.90	8.69	12.10	11.47	36.40	20.13	7.01	11.14	0.91	0.57	4.75	5.23	1.49	2.87	4.32	2.02
31	Ix	Intron	0	0.44	1.14	0.23	1.08	0.12	0.50	0.83	0.12	1.94	1.54	0.50	1.00	0.57	0.26	1.64	0.46	1.88	0.55	1.12	0.42	2.82	0.43	0.33	1.08	0.40	0.67	0.86	1.18	0.74
32	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.53	4.97	0.21	4.45	0.61	2.05	0.64	0.00	0.61	1.45	0.00	1.64	0.61	0.11	1.14	0.00	2.40	0.48	1.98	1.20	4.30	0.22	0.00	0.80	0.18	0.20	3.41	1.18	1.33
33	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.25	0.61	0.28	0.83	0.00	0.48	0.62	0.09	1.90	2.11	0.64	0.97	0.62	0.22	1.28	0.37	1.47	0.46	0.64	0.39	2.84	0.51	0.48	1.27	0.33	0.54	0.36	1.31	0.63
34	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	1.01	7.76	5.50	2.78	2.47	2.60	1.53	6.67	0.00	3.60	0.00	0.86	0.00	5.37	0.39	0.00	2.77	1.02	0.41	0.13	2.56	3.58
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.15	2.07	0.34	0.49	0.33	0.19	1.44	0.32	6.82	1.65	0.69	0.91	0.99	0.53	6.44	0.75	3.11	0.98	0.60	0.75	2.99	0.96	0.61	1.69	0.43	1.28	2.24	2.05	1.66
36	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	1.76	0.00	1.87	0.00	0.00	18.34	3.82	4.66	4.62	0.00	0.00	5.25	2.48	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62
37	ER3a	ExonRegion	0	0.93	0.07	0.94	4.06	1.11	0.72	14.31	0.00	1.96	4.15	0.48	1.21	0.76	1.63	2.49	7.06	4.59	2.79	5.28	9.84	0.81	1.90	1.65	4.35	1.57	2.03	0.00	2.12	0.18
38	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.51	3.36	0.00	3.16	0.00	0.00	0.00	0.00	5.56	4.62	0.00	0.00	2.05	0.00	2.31	2.69	0.00	3.95	0.00	0.00	0.00
39	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	20.49	0.00	0.00	12.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	9.57	17.67	4.10	4.62	8.09	0.00	0.00	4.62	0.00	5.38	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00
40	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.46	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.79	0.00	0.00	5.18	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	13.72	0.00	0.00
41	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.04	2.09	0.05	9.94	0.00	2.91	2.43	2.04	1.51	1.11	0.91	4.89	9.91	4.71	2.75	4.34	9.02	1.22	1.86	0.00	8.69	3.01	4.04	1.57	2.67	1.43