Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C3orf48	Gene	0	0.74	1.35	0.44	0.87	1.18	0.89	1.43	0.60	1.56	2.01	1.37	1.46	0.57	1.50	1.02	1.01	2.32	1.62	1.81	0.75	1.15	0.36	0.58	1.39	0.78	0.32	0.70	0.66	0.08
2	389050	Transcript	0	0.18	0.48	0.11	0.15	0.83	0.26	0.77	0.27	1.11	0.82	1.01	1.02	0.45	0.74	0.76	0.44	1.17	1.22	0.54	0.12	0.30	0.15	0.50	0.82	0.54	0.10	0.70	0.28	0.08
3	333083	Transcript	0	1.79	2.63	0.80	2.14	0.58	1.81	1.56	0.77	1.21	3.27	1.21	1.03	0.42	2.29	0.88	1.44	3.65	2.43	3.81	1.71	2.21	0.64	0.32	1.54	0.77	0.66	0.11	0.97	0.00
4	461033	Transcript	0	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ac	KnownBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	5.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1c	ExonRegion	0	0.79	0.00	0.82	0.00	0.00	0.34	0.99	0.00	0.83	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.95	0.00	0.68	1.05	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	6.80	0.00	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	0.99	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	0.07	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.19	0.18	0.05	0.28	0.00	0.12	0.00	0.04	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00
14	E2_Da	KnownBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2b	ExonRegion	0	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	1.93	1.18	0.00	2.77	2.81	3.09	0.79	2.89	0.79	0.48	2.32	0.48	0.90	0.54	3.38	0.00	0.00	0.78	0.00	2.08	0.00	1.17	1.18	0.31	0.68	0.91	0.15	0.63
19	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	4.26	0.00	0.00	0.00	0.91	1.57	0.00	0.99	0.78	0.32	2.92	2.59	0.00	2.29	1.68	0.00	2.60	1.61	0.00	1.55	0.49	0.00	3.18	0.00	0.85	0.00	0.44	0.29
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.75	1.54	0.00	7.37	1.92	0.00	0.00	0.00	1.76	2.78	3.58	0.00	2.26	0.00	3.52	1.40	0.00	0.00	0.00	1.93	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	0.00	1.43	0.32	0.46	2.48	0.79	2.30	0.82	3.34	2.47	3.02	3.06	1.35	2.21	2.27	1.33	2.75	2.11	1.62	0.35	0.91	0.46	1.49	2.46	1.63	0.30	2.09	0.83	0.25
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	13.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	5.99	0.00	1.02	9.97	0.00	1.15	10.79	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.43	0.00	2.53	0.00	0.00
23	E4_Aa	NovelBoundary	0	141.74	549.22	71.46	250.20	373.29	375.85	279.27	58.08	628.48	499.08	331.66	431.26	503.94	217.69	220.05	251.99	240.96	254.68	267.05	120.82	473.78	83.52	157.45	276.65	220.04	125.44	349.47	107.07	573.58
24	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E4_Da	NovelBoundary	0	135.25	580.64	28.60	138.47	232.70	289.52	264.22	44.79	494.76	369.78	172.85	312.95	280.10	213.66	197.73	251.15	132.08	248.13	226.14	125.29	401.83	126.45	126.42	258.58	213.33	45.45	154.76	82.00	194.15
26	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix	Intron	0	6.14	8.05	2.31	4.29	2.16	5.51	5.14	1.39	7.70	11.16	4.37	5.12	2.01	6.85	6.83	6.60	13.53	9.42	8.15	4.49	6.35	1.55	0.71	7.34	5.02	2.29	0.86	2.67	2.80
28	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.24	7.02	3.32	0.00	2.26	5.52	5.48	2.39	15.13	11.00	3.79	8.11	3.80	6.20	11.81	8.14	13.82	3.42	5.80	4.34	8.74	0.84	0.00	13.26	5.73	3.30	0.53	0.93	1.60
29	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.92	6.62	2.73	4.43	2.77	5.26	6.38	2.20	8.67	11.40	4.36	5.91	2.74	7.60	7.14	7.15	14.86	9.19	5.94	3.41	5.42	2.79	1.02	8.97	6.55	2.79	1.45	3.09	2.78
30	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.09	9.87	1.69	4.65	1.45	5.82	3.70	0.33	5.65	10.96	4.47	3.83	0.93	6.09	5.85	5.79	11.99	10.50	11.04	5.77	7.14	0.21	0.43	4.71	3.18	1.59	0.22	2.43	2.99
31	E5_Aa	NovelBoundary	0	7.67	16.87	2.29	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	3.11	12.54	2.72	16.69	4.52	3.92	19.73	3.37	12.61	18.49	16.18	7.86	10.99	7.15	0.00	2.33	1.86	4.12	0.00	0.00	1.65
32	ER5a	ExonRegion	0	7.15	10.53	3.19	8.54	2.33	7.19	6.25	3.07	4.80	13.07	4.82	4.09	1.70	9.16	3.51	5.75	14.59	9.71	15.23	6.86	8.84	2.58	1.29	6.15	3.07	2.62	0.44	3.88	0.00