Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C3orf24	Gene	0	0.65	0.46	0.20	0.65	0.44	0.25	0.61	0.45	0.98	0.70	0.11	0.76	0.45	0.29	1.95	0.30	1.04	0.17	0.97	0.23	0.73	0.44	0.27	0.46	0.30	0.86	0.06	0.89	0.18
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9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	1.03	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1_Ac	KnownBoundary	0	2.60	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2b	ExonRegion	0	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00
19	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.49	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.50	0.00
22	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER2e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E2c_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER2f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E2_Dd	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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31	E3_Da	NovelBoundary	0	2.71	0.00	0.00	0.00	6.93	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	Ix	Intron	0	0.99	2.08	1.54	3.31	0.00	1.27	2.79	1.02	2.22	2.80	0.11	3.01	0.42	0.54	1.70	1.31	3.30	0.92	4.42	0.51	1.45	0.33	0.17	2.58	0.79	0.87	0.00	1.20	0.12
33	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.99	2.08	1.54	3.31	0.00	1.27	2.79	1.02	2.22	2.80	0.11	3.02	0.42	0.54	1.70	1.31	3.31	0.92	4.43	0.51	1.45	0.33	0.17	2.59	0.79	0.87	0.00	1.20	0.12
34	Ix	Intron	0	1.61	1.04	0.90	0.77	1.57	1.11	1.62	1.68	3.01	3.41	0.83	3.71	0.07	0.66	2.87	2.95	1.28	2.40	2.92	0.74	2.37	0.10	0.00	0.69	1.30	0.51	0.20	0.70	0.29
35	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.40	0.00	1.55	0.00	0.00	2.09	0.00	2.63	3.06	1.60	2.80	4.51	0.00	1.98	6.12	2.22	0.89	4.24	7.03	0.00	3.66	0.00	0.00	1.72	2.22	0.48	0.00	1.23	0.00
36	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.07	3.16	1.59	2.34	4.79	2.48	1.32	1.86	5.03	4.15	0.00	6.42	0.00	0.92	5.65	4.18	2.25	3.89	3.23	1.35	4.37	0.00	0.00	0.69	1.64	1.18	0.00	0.81	0.22
37	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.62	0.57	1.55	3.10	0.73	1.71	0.40	0.28	1.69	2.84	0.92	1.18	0.00	0.00	1.75	0.00	0.00	0.00	1.32	0.48	0.00	1.00	0.00
38	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.08	0.00	0.63	0.00	0.00	0.17	2.54	1.85	2.05	3.27	1.20	2.33	0.00	0.40	0.69	2.19	0.75	1.46	3.22	0.69	0.90	0.23	0.00	0.81	0.90	0.00	0.46	0.41	0.50
39	Ix	Intron	0	1.57	2.30	1.34	3.35	1.63	0.55	2.96	1.35	1.05	3.56	0.71	2.02	0.43	1.21	1.23	2.10	1.99	2.44	4.69	1.47	3.80	0.72	0.24	1.29	0.95	0.42	0.00	1.20	0.98
40	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.58	2.31	1.34	3.35	1.63	0.55	2.96	1.35	1.05	3.57	0.72	2.02	0.43	1.21	1.23	2.11	2.00	2.45	4.70	1.47	3.81	0.72	0.24	1.29	0.96	0.42	0.00	1.20	0.98
41	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.07	3.44	0.00	0.00	1.96	2.46	2.49	1.46	1.60	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	2.75	1.04	0.00	8.09	3.56	3.65	0.00	0.00	2.81	1.82	1.80	0.00	0.00	0.00
42	ER4a	ExonRegion	0	3.60	0.00	0.00	4.02	0.00	0.00	4.52	3.10	0.63	1.62	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	1.39	0.84	0.00	0.00	0.00	2.40	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00
43	E4_Da	NovelBoundary	0	136.96	74.65	577.03	349.85	250.24	60.54	333.45	143.72	145.35	219.50	64.88	346.05	91.78	95.85	102.85	98.30	128.39	51.50	144.99	57.89	166.26	167.83	112.04	94.09	119.22	120.93	40.85	97.82	51.27
44	Ix	Intron	0	5.27	4.62	1.71	7.34	2.00	3.66	9.08	1.89	5.96	4.44	0.49	6.32	1.06	2.13	11.52	5.81	3.67	1.97	13.74	1.69	5.55	1.85	0.74	3.52	4.10	2.58	0.00	2.00	0.68
45	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.29	4.64	1.72	7.37	2.01	3.68	9.12	1.89	5.98	4.45	0.49	6.35	1.06	2.14	11.56	5.84	3.68	1.97	13.80	1.70	5.57	1.85	0.74	3.54	4.12	2.59	0.00	2.01	0.69
46	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	Ix	Intron	0	2.72	2.60	1.54	2.48	2.82	2.54	3.95	1.49	2.71	2.50	2.33	4.48	0.52	1.72	2.23	3.69	2.76	4.89	5.16	1.59	2.63	0.83	0.21	0.99	0.99	0.18	0.00	1.50	0.00
48	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.12	5.03	2.60	7.46	0.00	2.86	0.00	0.92	0.58	2.25	1.86	4.82	0.00	0.00	2.86	5.73	1.55	1.00	1.66	0.00	2.23	0.00	0.00	1.05	0.74	0.00	0.00	1.70	0.00
49	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.37	0.00	3.68	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	0.00	6.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.21	1.93	1.25	1.07	3.65	2.46	5.13	1.65	3.35	2.58	2.49	4.42	0.68	2.23	2.07	3.13	3.12	6.05	6.18	2.06	2.77	1.08	0.27	0.97	1.07	0.24	0.00	1.46	0.00
51	Ix	Intron	0	6.17	3.59	5.90	7.33	4.08	4.85	7.49	2.74	5.16	10.06	3.21	7.85	0.78	3.95	3.08	5.40	9.01	9.75	12.76	3.26	12.19	1.84	1.18	4.40	3.98	1.75	1.53	4.85	0.38
52	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.06	0.00	0.83	0.00	2.42	2.04	1.00	1.82	1.67	10.01	0.00	2.75	0.00	2.68	0.00	2.11	2.22	4.77	7.87	2.67	1.41	0.00	0.90	0.00	2.83	0.00	6.35	0.81	0.68
53	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.39	4.44	7.11	9.06	4.49	5.52	9.03	2.96	5.99	10.12	3.96	9.06	0.97	4.26	3.81	6.19	10.63	10.95	13.94	3.39	14.75	2.28	1.25	5.44	4.27	2.16	0.42	5.80	0.31
54	Ix	Intron	0	8.33	4.92	3.90	4.18	1.90	7.88	7.83	3.22	10.73	7.71	0.92	5.64	4.28	2.81	3.12	3.07	6.96	5.46	6.83	2.94	10.95	2.28	2.11	2.09	4.03	3.05	0.00	5.23	2.47
55	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	8.38	4.95	3.92	4.20	1.91	7.92	7.88	3.24	10.79	7.76	0.93	5.67	4.30	2.83	3.13	3.08	7.00	5.49	6.87	2.96	11.01	2.29	2.12	2.10	4.05	3.07	0.00	5.26	2.48
56	Ix	Intron	0	0.00	0.58	0.60	2.57	0.00	0.49	0.72	0.00	0.40	1.29	0.00	0.44	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	1.72	0.49	2.55	0.32	0.32	0.38	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00
57	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.58	0.60	2.58	0.00	0.50	0.73	0.00	0.40	1.30	0.00	0.45	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	1.73	0.50	2.57	0.32	0.33	0.39	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00
58	Ix	Intron	0	3.20	3.46	1.20	0.86	1.17	1.23	0.36	0.22	1.47	2.16	1.99	3.46	0.50	0.92	0.33	2.25	1.69	1.63	4.01	0.49	3.32	0.11	0.00	0.77	1.37	0.56	0.00	1.27	0.28
59	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.21	3.47	1.20	0.86	1.17	1.23	0.36	0.22	1.48	2.16	1.99	3.47	0.50	0.92	0.33	2.25	1.70	1.63	4.02	0.49	3.33	0.11	0.00	0.77	1.37	0.56	0.00	1.27	0.28
60	E6_Aa	NovelBoundary	0	179.32	108.29	267.51	300.67	142.36	156.96	519.11	157.81	95.04	319.96	195.85	369.72	113.05	103.18	53.22	116.51	132.22	190.72	372.03	84.02	393.20	124.46	197.05	68.67	134.98	183.76	267.02	99.21	63.62
61	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	2.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
62	E6a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
63	E7_Aa	NovelBoundary	0	182.74	96.08	315.17	223.46	196.74	127.11	270.51	68.63	67.97	174.44	108.76	214.39	70.66	99.13	66.97	79.56	82.77	174.92	250.64	76.83	329.03	115.56	138.54	60.89	84.11	81.88	168.72	71.40	45.56
64	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.99	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
66	E8_Aa	NovelBoundary	0	18.05	36.55	7.92	0.00	7.37	26.05	54.75	13.64	36.76	65.31	43.91	11.84	15.99	27.10	70.76	13.69	36.94	0.00	0.00	46.73	30.88	11.28	12.36	24.94	31.90	55.19	10.24	44.26	19.58
67	ER8a	ExonRegion	0	1.88	2.57	0.98	2.10	4.29	2.42	1.18	2.16	6.58	3.81	1.05	3.43	3.81	2.52	13.20	2.18	7.44	1.13	4.68	2.20	4.18	3.68	2.12	2.52	2.93	4.61	0.54	6.69	1.77
68	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
69	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	3.14	0.00	1.52	3.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	5.33	0.00	2.31	0.00	3.71	0.00	0.00	0.00	0.00
70	ER9a	ExonRegion	0	1.03	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	1.05	0.00	0.44	0.47	0.00	2.43	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
71	ER9b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00