Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC017076.3	Gene	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
2	414098	Transcript	0	1.38	2.70	1.89	0.00	2.46	2.76	4.94	0.54	5.67	2.08	1.42	2.89	2.05	2.92	3.56	0.43	9.22	0.24	0.00	1.87	2.55	0.88	0.80	0.37	2.39	1.47	2.86	2.32	2.13
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	9.67	15.03	13.25	0.00	17.24	19.30	34.61	3.78	39.71	14.58	7.43	20.21	14.36	20.47	24.91	2.98	58.95	0.00	0.00	13.07	16.24	6.13	5.61	2.57	16.75	10.26	20.03	14.47	14.92
5	E1a_E3a	NovelJunction	0	2.42	3.78	57.85	0.00	0.00	1.42	2.12	0.00	38.22	0.00	0.00	35.93	24.77	40.83	0.00	0.00	201.62	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	3.18	0.00	3.50	42.03
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.56	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00
8	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix	Intron	0	0.22	0.11	0.34	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.28	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.51	0.46	0.00	0.19	0.53	0.06	0.37	40.97	0.53	0.11	0.00	0.00	0.25
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.23	0.11	0.32	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.30	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.53	0.45	0.00	0.20	0.50	0.06	0.38	40.42	0.56	0.11	0.00	0.00	0.26
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	52.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I2	Intron	0	0.21	0.13	0.31	0.00	0.08	0.83	0.13	0.03	0.20	1.54	0.10	0.29	0.39	0.02	0.32	0.25	0.77	0.19	0.00	0.00	0.71	0.12	0.39	58.39	0.24	0.34	0.15	0.16	0.35
14	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.25	0.27	0.46	0.00	0.00	1.29	0.00	0.21	0.00	0.81	0.00	0.92	1.19	0.16	1.06	0.00	0.46	0.22	0.00	0.00	0.82	0.00	0.62	78.82	0.66	0.36	0.00	0.00	0.00
15	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.47	0.49	0.59	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.94	0.28	0.00	1.20	1.09	0.76	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	1.68	59.85	0.31	0.86	0.00	0.00	0.00
16	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.36	0.18	0.47	0.00	0.00	0.45	0.23	0.00	0.32	2.08	0.12	0.00	0.29	0.00	0.22	0.56	1.08	0.11	0.00	0.00	1.05	0.00	0.28	65.12	0.36	0.05	0.00	0.19	0.60
17	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.08	0.00	0.12	0.00	0.03	1.02	0.15	0.00	0.23	1.47	0.14	0.18	0.24	0.00	0.02	0.00	0.73	0.29	0.00	0.00	0.59	0.27	0.20	48.69	0.03	0.47	0.34	0.24	0.38
18	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	38.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	59.82	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71
20	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3_Da	NovelBoundary	0	12.09	14.83	205.70	32.35	11.49	33.99	13.67	6.02	106.04	34.79	20.85	115.09	44.36	72.61	15.55	22.34	271.62	0.00	0.00	16.29	38.23	20.61	10.98	35.47	38.34	33.77	27.09	49.78	127.07
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	28.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25
24	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.23	0.00	0.00	0.77	0.00	0.25	0.00	0.00	2.50	0.62	0.00	0.00	0.00	0.83	0.50	0.54	0.16	0.00	0.35	0.30	0.00	0.58	0.00	1.16	0.15	0.17	0.00	0.53	0.29
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix	Intron	0	1.04	0.00	1.02	1.74	1.19	6.01	0.49	0.67	1.70	10.52	5.35	1.80	0.00	9.61	0.00	23.68	1.27	0.70	6.98	9.66	0.52	5.47	0.00	3.92	3.47	11.64	0.00	10.89	4.14
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.22	0.00	3.49	1.44	0.00	0.00	0.00	5.27	1.19	0.00	0.00	1.13	0.00	7.85	0.00	2.59	2.49	0.00	0.00	2.79	0.00	5.92	1.43	8.41	0.00	1.39	3.96
28	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.19	0.00	1.53	2.65	1.55	6.38	0.58	1.02	2.13	10.54	5.03	2.13	0.00	9.75	0.00	25.71	1.27	0.52	6.95	10.77	0.75	7.15	0.00	4.35	3.73	12.71	0.00	12.35	5.29
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.79	2.02	0.00	1.12	10.83	11.11	2.47	0.00	15.12	0.00	32.90	1.00	0.00	13.58	13.12	1.43	3.31	0.00	2.15	4.29	5.76	0.00	13.04	3.13
30	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	5.93	0.28	0.00	1.03	11.55	6.59	1.30	0.00	10.63	0.00	21.49	1.52	0.85	7.61	8.67	0.02	2.14	0.00	2.71	3.20	10.16	0.00	9.12	1.54
31	Ix	Intron	0	0.34	0.51	0.05	0.23	0.00	1.39	0.19	0.06	0.46	2.05	0.19	0.04	0.00	3.43	0.00	4.76	0.90	0.06	0.61	1.69	0.23	0.40	0.00	0.82	0.23	1.29	0.00	1.55	0.78
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.34	0.51	0.05	0.23	0.00	1.39	0.19	0.06	0.46	2.05	0.19	0.04	0.00	3.44	0.00	4.76	0.90	0.06	0.61	1.70	0.23	0.40	0.00	0.82	0.23	1.29	0.00	1.55	0.78
33	Ix	Intron	0	1.01	1.52	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.29	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	2.23	0.23	0.91	0.00	2.60	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	2.31	0.42
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.02	1.53	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.29	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	2.24	0.24	0.91	0.00	2.61	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	2.32	0.42
35	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	2.04	8.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.38	0.00	3.14	6.14	0.00	0.00	0.00	0.00	6.05	0.00	2.20	0.00
36	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00