Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C2orf48	Gene	0	3.00	3.14	0.40	1.35	4.86	3.59	2.87	1.53	7.03	2.87	2.11	2.31	0.99	3.71	4.11	2.55	1.97	5.25	18.90	0.70	3.06	1.36	1.31	1.56	1.65	2.28	1.43	1.75	1.04
2	381786	Transcript	0	6.29	2.04	1.06	2.64	4.95	3.72	3.31	3.46	3.93	6.30	1.75	4.17	1.58	5.43	1.40	1.54	3.86	15.16	16.33	0.39	4.30	2.77	2.40	1.32	1.83	2.86	0.88	1.67	1.24
3	IG48_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.91	0.00	1.23	0.00	1.83	0.00	0.00
4	IG48_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.38	0.00	1.43	0.00	1.79	0.00	0.00
5	IG48_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.74	0.55	0.96	0.41	1.68	2.74	1.27	3.89	4.44	2.67	0.61	1.45	1.59	2.22	0.79	1.70	0.60	3.10	5.85	0.00	2.68	0.93	5.38	0.86	1.63	4.31	1.99	0.28	0.38
6	ER1a	ExonRegion	0	0.89	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.44	0.61	0.00	0.01	0.00	0.20	0.00	0.54	0.01	1.13	0.63	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.66	0.00	0.03
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
9	ER2a	ExonRegion	0	15.51	10.80	2.14	6.08	8.63	9.89	7.28	7.64	11.08	19.63	4.09	8.69	2.10	13.44	2.33	3.63	8.24	27.91	39.48	0.00	10.82	4.85	6.91	3.26	4.46	12.93	1.99	4.47	6.90
10	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	16.16	0.00	3.94	10.14	13.56	8.44	8.07	8.86	3.35	16.02	1.42	11.60	2.87	12.61	0.00	0.00	9.25	46.88	16.18	0.00	9.43	9.14	4.14	0.00	3.79	1.97	0.00	2.29	0.00
12	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.44	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER3a	ExonRegion	0	9.53	0.03	1.03	0.97	7.20	3.94	4.88	6.82	4.49	6.04	4.61	7.00	5.36	7.25	2.31	3.89	6.99	27.72	21.28	2.00	6.60	4.31	4.90	4.53	2.91	2.44	0.00	3.14	0.94
15	E3_Da	NovelBoundary	0	14.04	0.00	1.54	0.00	6.78	3.18	2.92	4.63	0.00	9.51	0.00	1.30	1.62	0.00	0.00	5.97	5.54	18.49	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	1.82	16.48	0.00	1.84	1.88
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	1.10	0.00	16.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I3	Intron	0	3.47	2.19	0.40	0.65	2.71	1.73	1.21	1.65	2.06	3.32	0.88	2.53	1.34	1.36	0.71	1.13	2.10	8.01	2.82	0.27	5.41	0.71	0.49	0.61	0.79	1.90	1.20	0.48	0.76
18	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	2.35	2.27	0.26	0.75	1.78	1.17	1.11	1.29	0.55	3.12	0.84	2.49	0.85	1.23	1.29	1.18	2.53	9.32	1.63	0.25	3.17	1.20	0.19	0.79	1.11	1.39	0.48	0.17	0.21
19	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.47	0.77	0.56	0.00	4.88	2.08	2.10	1.54	2.11	4.94	0.78	4.38	1.49	1.42	0.00	0.00	2.50	9.58	1.14	0.31	5.69	0.84	0.00	0.24	0.48	2.10	1.41	0.00	0.00
20	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	2.89	1.19	2.68	7.79	0.91	0.00	0.00	2.00	15.47	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00
21	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	5.01	1.69	0.14	1.17	3.29	1.52	0.74	1.66	1.69	5.40	1.21	2.88	0.77	1.70	0.00	0.61	1.86	9.25	3.40	0.00	7.52	0.15	0.30	0.70	0.47	3.26	2.84	0.27	0.71
22	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	6.23	0.90	1.13	1.21	2.38	1.91	0.94	3.41	3.01	3.37	0.91	2.91	1.53	2.26	1.56	1.25	2.52	13.83	3.77	0.70	5.38	1.06	0.76	0.73	0.96	1.54	0.46	1.10	0.56
23	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	2.39	3.11	0.28	0.40	2.59	1.96	1.29	1.28	2.67	2.30	0.80	1.84	1.66	1.01	0.54	1.53	1.71	4.55	3.39	0.23	5.85	0.50	0.76	0.54	0.76	1.80	1.23	0.64	1.32
24	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.78	0.39	0.46	1.74	0.00	0.98	0.73	0.98	1.65	1.05	0.36	0.83	2.14	0.72	0.56	2.86	0.54	4.28	3.58	0.00	1.90	0.44	0.00	1.48	0.00	0.76	0.00	0.20	0.05
25	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.72	1.94	0.29	1.44	0.98	1.12	1.22	3.26	2.53	0.73	0.18	1.79	1.81	1.27	0.46	1.62	1.20	7.20	3.78	1.11	4.30	2.18	0.55	1.15	0.58	1.42	0.00	1.15	1.17
26	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	4.12	0.00	0.00	9.10	1.44	0.00	0.00	0.00	1.54	11.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.82	0.00	0.00	4.98	1.77	0.00	0.00	9.15	1.44	0.00	0.00	0.00	1.04	11.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I3_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.04	0.52	0.00	0.00	1.22	1.12	0.98	0.00	3.44	1.65	0.39	1.10	0.21	0.50	1.71	0.00	0.24	1.25	3.63	0.00	0.88	0.59	0.59	0.00	0.00	0.26	0.30	0.26	0.00
29	I3_SR6	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I3_AR9	ActiveIntronRegion	0	1.38	2.95	0.19	0.00	1.79	1.60	0.81	0.00	4.19	1.16	1.67	1.29	0.31	2.42	1.62	0.00	2.12	1.42	11.71	0.00	1.53	0.14	0.73	0.69	1.15	0.38	0.29	1.01	0.86
31	I3_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.62	0.00	0.72	0.00	1.08	1.38	1.44	0.53	4.19	1.66	0.17	0.18	0.11	0.84	1.99	0.00	1.57	0.28	6.45	1.58	0.61	0.00	0.26	0.00	0.00	1.35	1.32	0.00	0.19
32	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.64	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	1.13	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER4a	ExonRegion	0	1.93	3.43	0.30	1.29	5.28	3.77	2.91	0.93	8.16	1.82	2.14	1.87	0.72	3.36	5.15	2.72	1.45	2.46	20.58	0.77	2.67	1.11	0.85	1.47	1.65	1.76	1.65	1.76	0.82
34	IG49_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.46	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	IG49_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.46	0.00	0.00	3.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	IG49_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.71	3.21	0.92	0.62	2.46	0.52	2.82	0.64	0.37	0.00	0.00	0.99	1.27	2.11	0.86	0.76	0.00	1.23	0.00	0.18	1.38	1.39	2.47	1.28	1.21	0.47	0.00	2.65