Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AP000355.1	Gene	0	2.31	1.27	1.07	1.84	0.25	3.21	1.19	2.26	2.89	2.22	3.69	2.74	1.18	6.76	4.83	4.76	5.32	4.89	0.82	3.29	1.32	1.80	1.95	1.82	4.51	4.03	1.69	9.52	0.74
2	326341	Transcript	0	1.07	0.51	0.48	0.82	0.15	2.35	0.57	1.21	1.31	0.95	2.68	1.56	0.65	3.15	2.12	2.54	2.84	1.99	0.35	1.52	0.73	1.13	1.00	0.72	2.02	1.99	1.27	6.33	0.35
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.41	0.10	0.00	2.25	0.07	0.02	0.03	0.85	1.29	0.10	1.09	0.00	0.43	1.42	2.21	4.43	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	11.59	66.86	0.00	15.96	7.95	11.99	4.26	1.92	23.69	20.00	4.20	8.15	25.91	3.82	7.47	0.00	8.09	17.53	0.00	8.41	18.32	2.51	5.19	8.63	14.26	21.93	1.58
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	1.11	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.23	0.46	1.20	1.03	0.70	2.96	0.00	0.53	2.66	2.28	2.05	1.15	1.02	5.07	5.14	1.07	3.00	2.54	0.46	2.38	0.61	0.00	1.04	2.78	4.31	1.81	0.26	4.45	0.00
7	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	1.10	0.00	3.47	1.43	0.73	0.00	0.54	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	3.43	0.00	0.00	1.96	0.00
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	1.35	0.00	1.77	3.65	2.78	3.28	0.00	2.11	3.97	3.70	0.00	1.15	0.15	0.00	4.67	0.48	0.00	1.06	3.29	6.90	0.47	0.00	2.95	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.02	0.76	1.46	1.70	1.16	3.91	0.00	0.00	3.49	1.71	2.01	1.61	1.17	7.17	6.28	1.77	4.67	4.15	0.76	2.77	0.90	0.00	1.46	3.27	4.06	2.87	0.43	5.85	0.00
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.25	4.85	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	0.00	7.40	0.00	0.00	13.71	18.34	7.65	5.20	9.25	8.09	0.00	0.00	4.96	0.00	5.86	3.22	6.31	0.00	43.36	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	3.28	0.85	1.28	2.20	0.75	3.81	0.62	0.42	3.69	2.21	4.89	3.62	2.03	6.91	5.35	6.09	7.30	3.61	0.73	2.83	0.66	1.22	1.66	1.15	4.71	4.25	3.65	14.38	1.18
12	E2_Da	NovelBoundary	0	10.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	2.89	0.00	2.78	0.00	0.00	5.38	0.00	5.97	2.61	4.62	0.00	0.00	0.00	1.90	2.51	0.00	0.00	3.43	0.00	8.31	5.08
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.60	0.00	1.99	0.00	0.00	4.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00
14	Ix	Intron	0	2.67	3.00	1.60	4.12	0.00	1.19	1.35	2.29	1.94	1.38	6.16	2.48	1.30	5.90	4.51	7.72	4.58	4.28	1.53	1.70	0.14	2.25	1.04	0.41	3.56	6.33	0.35	8.75	1.03
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.71	3.08	1.61	4.23	0.00	1.18	1.39	2.35	1.99	1.39	6.30	2.54	1.33	6.01	4.53	7.86	4.69	4.39	1.57	1.74	0.14	2.30	1.07	0.42	3.65	6.49	0.36	8.97	1.04
16	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	0.00	5.43	8.04	1.27	0.00	3.74	9.97	11.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	12.54	0.00
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.36	0.00	1.73	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	1.44	0.76	0.00	0.00	1.48	4.07	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37
18	ER3a	ExonRegion	0	2.08	1.71	1.11	1.90	0.00	3.33	1.60	3.66	2.84	2.55	3.54	2.56	0.80	7.65	5.24	4.36	4.94	6.34	0.99	3.91	1.70	2.39	2.24	2.47	4.99	4.28	0.49	7.47	0.59