Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	CHCHD10	Gene	0	0.91	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.26	0.00	0.00	0.17	0.00	0.46	0.42	1.90	0.18	0.00	0.82	0.45	0.93	0.40	0.51	0.26	0.61	0.20	0.12	0.00	1.27	0.29
2	484558	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00
3	401675	Transcript	0	4.46	2.28	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	4.06	2.13	3.05	1.27	0.00	6.39	4.42	6.59	3.16	1.50	2.04	5.20	1.46	0.00	0.00	3.19	0.00
4	IG3	Intergenic	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.30	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.27	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.47	0.31	0.34	0.00	3.20	0.00
5	IG3_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.07	0.30	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.27	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.47	0.31	0.34	0.00	3.21	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.77	0.00
7	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.76	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix	Intron	0	2.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.28	0.36	0.00	0.30	0.64	1.45	1.14	0.61	1.84	1.42	1.57	7.39	0.70	1.33	0.45	3.71	0.35	1.16	0.00	3.21	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.28	0.36	0.00	0.31	0.64	1.46	1.14	0.61	1.85	1.43	1.58	7.42	0.71	1.34	0.45	3.73	0.35	1.17	0.00	3.23	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	1.73	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.56	2.77	0.08	0.00	0.09	0.08	2.16	0.25	0.42	0.54	1.48	0.55	0.00	0.00	1.40	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	5.01	4.56	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	4.74	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.94	2.05	2.19	2.27	6.10	1.82	0.00	0.00	4.09	0.00
13	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	40.70	5.34	3.19	9.11	1.55	10.37	12.01	7.90	9.31	6.77	1.99	6.71	3.55	28.51	29.96	9.49	36.64	15.99	20.81	35.58	15.64	6.87	2.87	16.92	8.52	12.11	1.89	33.54	2.07
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	30.25	3.10	0.03	18.80	0.00	7.66	5.30	1.21	10.11	6.19	3.16	3.78	1.71	8.06	9.76	8.32	13.77	9.05	16.81	14.29	7.29	4.48	0.15	11.43	3.02	14.64	0.00	22.08	1.04
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	49.63	7.02	3.60	9.10	1.11	13.58	14.21	9.92	11.48	8.35	2.18	8.93	4.28	36.09	37.08	12.05	49.18	19.27	26.57	44.83	20.61	9.46	3.68	21.54	11.27	15.60	2.70	43.36	2.42
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	17.62	1.06	2.75	7.08	3.21	1.81	7.30	3.63	2.95	2.38	1.17	1.01	1.92	11.48	14.24	2.45	5.89	8.24	5.26	14.00	3.29	0.00	1.19	4.95	1.88	1.55	0.00	8.05	1.32
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	72.20	9.31	1.05	10.78	0.00	6.98	7.78	6.72	13.61	3.87	1.30	2.98	1.56	21.18	8.37	7.11	22.33	9.25	32.37	48.38	10.71	4.52	2.41	15.13	7.05	6.31	2.04	40.89	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	3.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	2.10	6.11	2.53	0.00	12.78	8.85	5.24	4.28	0.82	1.81	4.30	1.10	0.00	0.00	2.30	0.00
20	ER3b	ExonRegion	0	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.80	0.87	4.23	0.36	0.00	1.30	0.77	0.54	0.71	1.13	0.17	0.13	0.00	0.00	0.00	0.62	0.69
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix	Intron	0	5.41	0.00	0.84	0.00	0.00	1.39	3.05	0.93	0.57	0.00	0.00	0.00	0.66	7.53	13.86	1.25	3.77	2.92	1.61	6.57	2.88	0.00	0.91	1.09	1.44	0.00	0.00	7.41	0.68
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.52	0.00	0.86	0.00	0.00	1.42	3.12	0.95	0.58	0.00	0.00	0.00	0.67	7.69	14.14	1.28	3.84	2.95	1.65	6.70	2.94	0.00	0.93	1.11	1.47	0.00	0.00	7.56	0.69
24	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.20	0.48	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.43	0.54