Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 CTA-246H3.2 Gene 0 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.71 0.26 0.95 0.00 0.74 0.15 0.00 0.00 0.23 78.38 0.55 115.18 39.41 0.00 0.00 7.90 1.16 0.47 0.55 7.18 0.20 0.00 0.00 3.97 2 433457 Transcript 0 0.00 1.53 0.00 0.00 0.00 0.29 0.18 0.48 0.00 0.30 0.11 0.00 0.00 0.24 90.87 1.69 115.16 39.11 0.00 0.00 6.21 0.63 0.32 0.38 8.17 0.14 0.00 0.00 2.97 3 IG40 Intergenic 0 0.04 0.00 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.04 0.00 0.00 0.03 11.97 0.08 22.20 7.70 0.11 0.09 2.83 0.42 0.09 0.33 2.65 0.05 0.03 0.00 0.85 4 IG40_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 0.00 0.00 65.81 0.77 106.17 40.60 0.00 0.63 7.48 1.63 0.55 1.01 9.95 0.19 0.00 0.00 1.92 5 IG40_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 40.32 0.29 71.98 27.69 0.75 0.41 5.02 1.91 0.00 0.57 8.99 0.11 0.00 0.00 3.31 6 IG40_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 15.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 0.00 1.25 2.11 0.00 0.00 0.00 1.34 7 IG40_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 0.00 0.10 1.17 0.00 12.62 0.00 0.00 0.00 1.70 0.46 0.00 1.40 0.69 0.00 0.46 0.00 1.26 8 ER1a ExonRegion 0 0.00 1.56 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.89 0.00 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 51.04 0.00 107.17 31.16 0.00 0.00 5.88 0.87 0.00 0.00 2.76 0.00 0.00 0.00 3.23 9 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.00 28.34 0.00 3.53 15.88 0.00 0.00 3.73 0.00 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 0.00 0.04 11 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 8.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.46 0.00 0.00 0.00 4.88 0.00 0.00 0.00 5.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER2a ExonRegion 0 0.00 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 119.59 0.71 83.01 50.81 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 7.99 0.00 0.00 0.00 3.51 13 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 14.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 156.67 3.75 196.21 56.89 0.00 0.00 5.78 0.00 0.00 0.00 12.05 0.00 0.00 0.00 2.91 15 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 117.36 5.06 158.64 48.26 0.00 0.00 6.87 0.00 0.00 0.00 10.59 0.00 0.00 0.00 1.71 16 I3 Intron 0 0.24 1.37 1.38 0.61 0.00 0.66 0.11 0.58 1.15 1.07 0.20 0.70 0.22 0.24 7.28 0.99 26.64 6.68 0.00 0.00 3.57 0.72 0.21 0.86 3.01 0.36 0.00 0.00 0.95 17 I3_SR1 SilentIntronRegion 0 0.34 0.26 1.41 0.00 0.00 0.39 0.16 0.22 1.01 1.21 0.24 0.59 0.00 0.14 7.30 0.50 21.72 5.82 0.00 0.00 3.09 0.69 0.29 0.86 2.92 0.31 0.00 0.00 0.40 18 I3_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 4.56 1.28 2.74 0.00 1.67 0.00 1.70 1.11 0.92 0.15 1.10 0.82 0.63 8.26 2.21 41.61 9.09 0.00 0.00 5.42 1.02 0.00 0.55 3.24 0.50 0.00 0.00 2.21 19 I3_SR2 SilentIntronRegion 0 0.00 2.60 1.42 0.00 0.00 0.27 0.00 0.61 2.72 0.00 0.00 0.52 0.55 0.00 3.92 2.11 29.33 7.87 0.00 0.00 2.53 0.00 0.00 1.83 3.16 0.35 0.00 0.00 2.55 20 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 8.73 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 4.78 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 1.20 16.94 0.00 58.77 10.02 0.00 0.00 9.91 2.48 2.41 0.00 1.89 0.00 0.00 0.00 3.73 21 ER4a ExonRegion 0 0.00 5.19 0.00 0.00 0.00 0.75 1.08 1.98 0.00 0.78 0.64 0.00 0.00 0.00 100.58 0.61 145.90 47.54 0.00 0.00 17.15 2.90 1.94 2.31 15.63 0.84 0.00 0.00 6.44 22 IG41 Intergenic 0 0.58 1.98 3.75 0.00 0.44 1.85 0.81 1.32 2.27 1.17 0.37 0.58 0.58 0.47 12.07 0.89 11.51 7.06 0.14 0.37 3.14 0.49 0.16 0.87 3.08 1.06 0.00 0.37 1.32 23 IG41_SR1 SilentIntergenicRegion 0 0.58 1.99 3.77 0.00 0.44 1.86 0.82 1.33 2.28 1.17 0.38 0.58 0.58 0.47 12.12 0.89 11.57 7.09 0.14 0.37 3.15 0.49 0.16 0.87 3.09 1.06 0.00 0.37 1.33