Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LA16c-83F12.1	Gene	0	4.73	14.55	2.92	28.03	0.20	0.80	0.00	5.13	57.92	6.97	4.36	0.44	0.00	0.04	18.48	0.62	18.76	0.17	0.00	0.00	0.06	0.60	0.08	0.00	0.18	0.07	0.15	0.07	0.14
2	453395	Transcript	0	4.96	29.65	5.29	26.18	0.00	1.06	0.00	8.11	118.18	9.30	8.75	0.17	0.00	0.00	39.49	0.12	33.71	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.03
3	438574	Transcript	0	1.16	1.31	0.84	10.26	0.00	0.38	0.00	0.50	6.21	2.09	0.32	0.00	0.00	0.08	3.56	0.22	2.27	0.18	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00
4	425461	Transcript	0	0.29	0.00	0.80	25.16	0.00	0.19	0.00	1.01	0.91	1.19	0.00	0.47	0.00	0.00	0.69	0.51	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	0.12	0.00	0.20	0.11	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	15.01	48.02	7.75	57.96	0.00	1.04	0.00	7.04	171.05	17.45	15.99	0.70	0.00	0.00	24.50	0.47	52.69	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00
6	E1_Da	NovelBoundary	0	8.26	41.59	5.90	56.51	0.00	0.00	0.00	7.02	140.51	25.01	25.78	1.27	0.00	0.00	52.82	0.00	45.45	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	26.47	7.70	0.00	0.00	0.00	0.00	9.70	120.38	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	25.11	0.00	30.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1	Intron	0	5.91	25.06	2.52	9.88	0.00	0.22	0.00	4.07	98.05	13.10	6.71	0.12	0.00	0.00	17.95	0.27	32.40	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	14.61	30.88	0.00	13.23	0.00	0.00	0.00	3.20	110.79	22.07	15.08	0.02	0.00	0.00	9.55	1.10	33.84	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.27	57.27	1.36	20.84	0.00	0.40	0.00	2.73	202.86	15.79	12.24	0.35	0.00	0.00	27.09	0.59	50.94	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.00
12	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	6.95	14.31	2.93	5.20	0.00	0.42	0.00	5.98	68.69	15.92	7.30	0.00	0.00	0.00	19.13	0.00	23.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	7.88	9.77	5.36	4.32	0.00	0.32	0.00	8.58	64.12	16.04	4.59	0.00	0.00	0.00	20.54	0.00	47.26	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.77
14	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.72	3.18	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	3.36	13.08	4.46	0.78	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	7.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.07	3.63	4.16	4.81	0.00	0.00	0.00	3.06	25.77	7.83	0.04	0.00	0.00	0.00	15.86	0.00	16.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I1	Intron	0	1.88	8.65	0.98	4.97	0.00	0.60	0.00	0.74	29.27	6.64	3.17	0.16	0.00	0.00	6.38	0.00	11.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00
17	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.88	8.65	0.98	4.97	0.00	0.60	0.00	0.74	29.29	6.64	3.17	0.16	0.00	0.00	6.38	0.00	11.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00
18	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.78	30.93	0.00	9.06	0.00	0.00	0.00	0.00	26.49	20.29	0.00	0.00	0.00	0.00	32.49	0.00	29.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20
19	ER2a	ExonRegion	0	4.84	31.70	4.73	46.76	0.00	3.19	0.00	13.50	100.74	10.50	10.17	0.00	0.00	0.00	64.49	0.00	25.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12
20	E2_Da	NovelBoundary	0	2.42	14.54	0.00	0.00	0.00	3.84	0.00	0.00	60.27	10.91	7.62	0.00	0.00	1.04	9.97	0.00	40.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E6a	KnownJunction	0	0.00	12.41	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	80.55	7.35	8.83	0.00	0.00	0.00	43.85	0.00	26.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I2	Intron	0	3.17	9.98	2.21	6.42	0.27	0.51	0.10	1.24	29.89	6.70	2.47	0.56	0.00	0.29	2.85	0.56	12.26	0.08	0.28	0.08	0.07	0.03	0.09	0.05	0.06	0.20	0.35	0.04	0.17
23	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	3.04	11.80	1.63	6.97	0.25	0.36	0.13	0.90	35.27	6.38	2.98	0.25	0.00	0.15	2.77	0.30	12.98	0.07	0.18	0.03	0.05	0.03	0.05	0.00	0.05	0.09	0.09	0.02	0.20
24	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.46	1.86	7.24	8.42	0.00	1.95	0.00	1.32	25.50	10.76	1.08	2.78	0.00	4.02	0.00	6.26	18.14	0.00	1.71	0.00	0.00	1.33	0.00	1.06	1.05	1.13	4.35	1.08	0.00
25	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.61	6.83	5.29	7.65	0.00	1.33	0.00	3.85	31.07	9.96	0.83	2.53	0.00	1.77	4.93	1.28	12.81	0.00	1.32	0.38	0.39	0.00	0.25	0.44	0.24	1.67	4.42	0.29	0.00
26	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	8.22	3.28	7.85	0.00	0.00	0.00	0.00	5.52	44.38	10.83	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	12.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	6.32	5.56	6.31	13.58	0.00	1.80	0.45	1.90	42.10	10.20	1.37	1.78	0.00	0.22	6.89	2.44	21.86	0.43	0.71	0.00	0.31	0.00	0.80	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.43
28	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.66	12.55	3.61	6.69	0.00	1.41	0.00	2.83	41.38	9.73	2.56	2.19	0.00	0.77	5.62	0.92	17.20	0.28	0.93	0.40	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11
29	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	2.64	6.01	1.74	3.20	0.55	0.20	0.00	0.96	8.98	5.16	1.64	0.18	0.00	0.05	1.20	0.46	6.90	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12
30	E3_Aa	NovelBoundary	0	8.26	53.90	17.94	8.84	0.00	0.00	0.00	23.04	43.15	11.34	3.07	0.00	0.00	0.00	36.08	0.00	9.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER3a	ExonRegion	0	4.56	5.24	2.72	18.05	0.00	0.00	0.00	2.00	21.71	7.74	1.29	0.00	0.00	0.00	12.51	0.00	7.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E3_Da	NovelBoundary	0	27.02	12.89	3.31	69.67	0.00	0.00	0.00	4.58	72.96	5.71	7.97	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	34.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E3a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	I3	Intron	0	4.27	15.23	5.02	16.08	0.00	0.26	0.02	7.00	32.74	9.12	2.29	0.16	0.04	0.04	11.06	0.25	18.04	0.06	0.24	0.06	0.08	0.09	0.02	0.07	0.06	0.13	0.50	0.00	0.08
36	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	4.20	14.21	3.97	16.71	0.00	0.09	0.00	4.50	22.10	11.01	2.59	0.05	0.08	0.02	6.81	0.05	16.11	0.05	0.26	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.38	0.00	0.03
37	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.22	12.30	4.59	18.96	0.00	0.15	0.00	7.85	25.32	9.85	3.31	0.00	0.00	0.00	11.14	0.00	24.35	0.20	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00
38	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	9.42	25.15	8.42	16.13	0.00	0.59	0.22	19.13	71.11	8.97	2.30	0.59	0.00	0.00	21.56	0.99	30.87	0.00	0.34	0.00	0.00	0.39	0.19	0.23	0.00	0.17	0.39	0.00	0.00
39	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	3.25	16.47	7.91	14.78	0.00	0.83	0.00	10.16	58.07	6.74	1.95	0.45	0.00	0.19	21.83	0.71	19.10	0.12	0.39	0.00	0.00	0.33	0.00	0.26	0.35	0.19	1.44	0.00	0.40
40	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	1.25	2.04	0.00	1.75	0.00	1.24	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER4a	ExonRegion	0	0.06	0.00	0.62	2.94	0.00	1.54	0.00	0.00	1.69	0.60	0.00	0.00	0.00	0.34	1.72	0.89	1.81	0.72	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	5.90	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	6.67	1.88	0.00	0.00	0.00	1.29	8.37	0.00	12.29	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	20.28	0.00	0.00
43	E4a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.49	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	1.76	0.00	1.60	0.00	0.00	8.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	ER5a	ExonRegion	0	0.59	0.00	1.61	14.94	0.00	0.38	0.00	2.02	1.82	2.39	0.00	0.93	0.00	0.00	1.39	1.02	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.25	0.00	0.39	0.22	0.00	0.00	0.00
46	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	4.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	35.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	I5	Intron	0	0.32	0.48	0.25	2.16	0.00	0.21	0.00	0.28	2.82	0.54	0.00	0.37	0.00	0.07	1.87	0.00	1.46	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
49	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	4.77	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	0.42	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	I5_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.32	0.34	2.95	0.00	0.00	0.00	0.76	3.95	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	3.21	0.00	1.23	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00
52	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.23	5.39	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	3.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER6a	ExonRegion	0	3.39	9.83	1.31	25.21	0.00	0.22	0.00	11.34	67.20	7.41	1.17	0.00	0.00	0.00	42.61	0.79	27.76	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	1.01
54	E6_Da	KnownBoundary	0	0.00	9.02	1.40	21.57	0.00	3.38	0.00	2.09	41.96	2.04	1.42	0.00	0.00	0.00	47.84	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	ER6b	ExonRegion	0	1.72	5.54	0.22	30.98	1.96	0.82	0.00	5.77	34.78	1.97	0.35	0.00	0.00	0.00	23.64	0.00	12.11	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00