Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	CTA-246H3.3	Gene	0	0.00	0.31	0.00	0.00	0.27	0.08	0.56	0.10	0.06	0.40	0.13	0.00	0.07	0.05	77.66	0.71	57.22	70.07	0.18	1.19	17.51	54.22	3.83	1.08	30.63	4.03	0.00	0.00	7.51
2	382738	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.15	0.00	0.24	0.00	66.31	0.46	50.52	35.71	0.00	0.56	6.67	26.09	2.34	1.18	17.56	2.45	0.00	0.00	4.59
3	412472	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	IG39_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.62	0.00	1.89	3.17	0.00	0.00	0.02	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43
5	IG39_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	1.60	3.61	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01
6	IG39_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	3.61	4.37	0.00	0.00	2.85	2.02	0.00	2.15	0.80	0.00	0.00	0.00	2.95
7	IG39_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.78	0.00	2.67	1.53	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.22	2.46	0.00	0.00	0.00	1.91
8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	3.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ab	KnownBoundary	0	5.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	17.54	0.00	15.06	0.00	8.09	2.98	0.00	2.04	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	4.22	1.65
10	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.62	0.00	0.00	0.00	0.13	36.23	0.24	20.48	34.18	0.00	0.00	14.11	28.91	2.80	0.00	15.53	2.46	0.00	0.00	2.63
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.17	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	6.78	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.34	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	13.72	25.09	2.07	0.00	10.87	0.00	0.00	0.00	1.75
13	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	41.71	0.00	46.36	31.27	0.00	0.00	9.84	26.35	7.67	1.12	20.73	0.83	0.00	0.00	4.92
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.88	0.00	0.00	0.78	0.22	1.61	0.29	0.00	0.19	0.25	0.00	0.00	0.00	124.37	1.38	97.35	131.29	0.51	2.91	28.61	100.25	5.81	2.06	55.04	6.67	0.00	0.00	14.55
15	E2_Da	KnownBoundary	0	5.60	0.00	0.00	0.00	7.07	0.00	0.00	0.00	0.00	7.27	1.46	0.00	0.00	4.25	149.29	0.00	138.14	67.04	0.00	0.00	21.74	86.05	2.36	16.63	58.65	3.73	0.00	5.17	9.57
16	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.31	0.00	0.48	0.00	130.63	0.91	97.20	71.43	0.00	1.11	13.34	51.97	4.68	2.37	35.13	4.91	0.00	0.00	9.17
17	IG40	Intergenic	0	0.04	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.04	0.00	0.00	0.03	11.97	0.08	22.20	7.70	0.11	0.09	2.83	0.42	0.09	0.33	2.65	0.05	0.03	0.00	0.85
18	IG40_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	65.81	0.77	106.17	40.60	0.00	0.63	7.48	1.63	0.55	1.01	9.95	0.19	0.00	0.00	1.92
19	IG40_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	40.32	0.29	71.98	27.69	0.75	0.41	5.02	1.91	0.00	0.57	8.99	0.11	0.00	0.00	3.31
20	IG40_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	15.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	1.25	2.11	0.00	0.00	0.00	1.34
21	IG40_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.10	1.17	0.00	12.62	0.00	0.00	0.00	1.70	0.46	0.00	1.40	0.69	0.00	0.46	0.00	1.26