Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 TUBA8 Gene 0 0.20 0.21 0.09 0.13 0.00 0.28 0.19 0.41 0.42 0.97 0.04 0.23 0.02 0.89 0.41 0.48 0.94 0.36 0.12 0.67 0.21 0.84 0.07 0.32 0.13 0.70 0.37 0.36 0.49 2 426208 Transcript 0 0.67 0.00 0.17 0.00 0.00 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.00 0.09 0.00 0.77 0.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 316027 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00 0.66 0.19 0.65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.17 0.38 4 330423 Transcript 0 0.71 1.89 0.00 0.00 0.00 0.67 0.79 1.48 0.41 7.58 0.04 0.75 0.00 5.28 1.74 1.42 1.63 0.68 0.00 4.50 3.82 7.88 0.11 1.43 0.57 9.22 1.51 1.26 2.14 5 416740 Transcript 0 0.01 0.01 0.46 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 1.03 1.21 0.00 0.12 0.05 0.58 1.52 0.69 0.45 0.75 0.44 0.02 0.01 0.03 0.00 0.01 0.56 0.04 0.00 0.01 0.01 6 430207 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 ER1a ExonRegion 0 1.33 0.00 0.35 0.00 0.00 0.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 0.00 0.19 0.00 1.54 0.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.29 0.00 9 E1a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.00 1.93 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.16 0.00 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 1.39 0.00 0.00 1.31 0.37 1.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.33 0.77 12 E2_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.59 0.00 5.45 0.00 0.00 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 2.48 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 1.32 13 ER2b ExonRegion 0 0.56 2.21 0.00 0.00 0.00 0.72 2.85 2.32 0.00 6.50 0.00 0.00 0.00 2.17 3.04 0.00 0.44 3.09 0.00 0.00 0.71 7.60 0.00 0.00 0.00 3.01 1.83 0.21 2.71 14 E2_Da NovelBoundary 0 2.18 7.85 0.00 0.00 0.00 1.96 2.75 0.00 0.00 11.38 0.00 0.00 0.00 5.07 9.77 0.00 1.01 4.62 0.00 0.00 0.00 12.59 0.00 2.51 1.70 10.86 0.00 1.89 4.49 15 E2a_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2b_E3b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.00 10.95 0.00 1.39 0.00 8.22 0.00 2.91 1.40 0.00 0.00 9.92 7.90 10.40 0.00 2.51 1.70 13.65 2.44 2.20 1.22 17 ER2c ExonRegion 0 2.14 5.66 0.00 0.00 0.00 1.28 2.36 1.84 0.00 11.10 0.00 0.85 0.00 6.26 5.21 0.61 1.14 1.88 0.00 2.62 3.30 12.74 0.00 1.04 0.00 13.60 1.45 1.01 4.03 18 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.58 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 2.83 2.77 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER3a ExonRegion 0 0.01 0.01 0.46 0.00 0.00 0.00 0.28 0.00 1.03 1.21 0.00 0.12 0.05 0.58 1.52 0.69 0.45 0.75 0.44 0.02 0.01 0.03 0.00 0.01 0.56 0.04 0.00 0.01 0.01 20 E3_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3b ExonRegion 0 0.58 1.33 0.00 0.00 0.00 0.32 0.94 0.91 0.06 3.22 0.00 1.67 0.22 3.16 1.19 1.05 2.10 1.40 0.73 3.42 1.19 4.36 0.00 0.84 0.38 4.23 0.26 1.68 0.93 22 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 0.00 0.13 24 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 3.88 0.00 0.00 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 1.54 1.94 5.12 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 2.48 0.00 0.00 3.67 0.00 6.11 0.00 0.00 25 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 E4b_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 1.09 0.00 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.43 3.23 0.00 0.40 0.00 1.67 0.74 1.02 1.44 1.24 0.00 0.18 0.48 0.00 0.00 0.69 0.63 0.49 0.00 0.16 0.00 30 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.61 0.90 0.34 0.00 0.82 0.79 0.19 0.00 2.26 3.53 0.00 1.07 0.55 0.96 1.53 0.64 1.24 1.34 1.21 0.14 0.88 0.44 0.00 1.02 0.49 0.15 0.69 0.41 0.38 31 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 4.29 0.00 1.12 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 1.44 0.00 1.24 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 2.73 0.00 0.00 0.86 1.80 0.00 3.23 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 32 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 4.29 0.00 1.12 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 0.00 2.17 0.00 1.24 0.00 0.57 0.00 0.00 0.88 2.05 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 4.30 0.00 1.57 0.00 1.63 0.00 33 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 5.53 6.22 1.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.22 0.00 1.24 0.00 1.34 0.00 0.00 1.42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 3.51 0.00 1.57 0.00 3.00 1.27 34 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 2.14 6.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.04 0.00 0.45 0.00 1.81 0.00 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.00 1.76 0.00 1.57 0.00 2.52 3.54 35 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 1.39 5.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.32 0.00 0.00 0.00 1.90 0.00 0.00 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 1.55 4.03 36 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 5.60 0.00 3.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 4.03 37 Ix_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 5.60 0.00 3.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 3.64 38 Ix_AR9 ActiveIntronRegion 0 3.12 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.05 0.00 0.54 1.90 0.00 1.21 0.00 0.00 0.00 1.06 3.12 0.00 1.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.36 39 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.07 0.00 0.62 0.00 0.93 0.22 0.32 0.00 0.77 0.00 0.00 0.60 0.36 0.00 0.65 0.00 0.33 0.00 0.34 0.12 0.44 0.85 0.00 0.01 40 E6_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.09 10.78 0.00 1.76 0.00 5.03 0.00 0.00 0.00 1.54 1.40 7.33 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 3.72 1.76 0.00 0.00 8.25 1.93 4.12 9.94 1.66 0.00 41 E6_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 10.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.27 0.00 0.00 0.00 1.97 0.00 2.91 1.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 7.07 0.00 1.37 0.00 3.62 0.71 4.33 0.00 1.24 0.00 4.35 0.00 0.00 4.07 0.00 0.00 2.81 0.00 0.00 0.00 4.16 1.33 1.31 7.33 0.00 2.68 43 E6_Dc KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER6c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 0.53 1.12 4.33 0.00 0.00 0.00 2.46 0.00 0.00 5.01 0.00 0.00 2.41 0.00 0.00 0.00 0.61 0.00 0.00 2.09 0.00 2.68 45 ER6d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.73 0.00 0.81 1.24 0.68 0.11 0.00 0.00 1.38 0.00 0.75 2.35 0.17 0.00 0.97 0.25 0.48 0.32 0.75 0.00 0.42 0.65 0.58 1.18 46 IG18_AR3 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 1.00 0.00 2.22 1.51 0.00 1.25 0.00 0.52 4.91 0.38 0.00 0.40 0.42 1.43 0.77 1.85 0.00 1.97 0.00 0.00 0.56 0.00 1.99 0.88 0.49 0.00 0.00 0.41