Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	IGLL1	Gene	0	0.18	0.66	0.14	0.00	0.00	0.40	0.99	0.00	0.69	1.66	0.05	0.30	1.20	0.20	0.19	0.18	3.44	2.15	0.79	0.00	0.00	1.26	0.59	1.24	0.35	0.00	0.00	7.24	0.14
2	431576	Transcript	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.47	0.85	1.42	1.82	0.00	0.47	0.47	0.00	6.11	0.00	12.16	0.00	0.00	0.00	2.29	0.83	0.01	1.77	3.44	0.73	0.00	0.00	0.00
3	330377	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.40	0.00
4	438703	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	249053	Transcript	0	0.00	0.00	5.56	0.00	12.97	0.00	5.21	0.00	1.74	0.00	1.33	5.30	0.00	0.00	0.00	0.00	11.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.47
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	5.47	0.00	0.00	1.40	0.00	18.34	0.00	31.11	0.00	0.00	0.00	6.86	2.48	0.00	5.32	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	2.89	5.47	0.00	1.42	1.40	0.00	18.34	0.00	36.47	0.00	0.00	0.00	6.86	2.48	0.00	5.32	9.66	2.19	0.00	0.00	0.00
9	Ix	Intron	0	1.04	1.08	1.06	0.00	1.09	0.67	0.38	0.14	2.89	2.48	0.04	0.69	0.41	1.64	6.28	2.66	9.04	0.94	0.95	0.77	0.53	0.81	0.14	3.54	1.44	1.06	0.00	2.07	1.35
10	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.18	1.38	0.89	0.00	1.34	1.13	1.00	0.00	1.59	0.59	0.00	0.50	0.62	1.74	3.76	1.02	8.58	1.58	1.75	0.92	0.59	0.74	0.00	2.49	1.29	0.00	0.00	1.96	1.19
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.15	1.13	1.11	0.00	1.17	0.57	0.17	0.22	3.33	3.36	0.07	0.73	0.30	1.86	7.45	3.32	8.84	0.67	0.76	0.82	0.51	0.97	0.22	4.18	1.60	1.50	0.00	2.16	1.30
12	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.50	0.00	0.00	0.17	0.35	0.00	2.80	1.84	10.56	0.74	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.30	1.95
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.99	2.61	0.00	1.12	0.59	0.00	6.44	3.36	11.85	0.87	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	2.91	0.65	1.42	0.00	2.13	2.17
14	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.62	0.00	9.74	1.98	1.23	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00
16	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.63	0.00
17	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.01	0.00
18	ER2c	ExonRegion	0	0.00	1.29	0.04	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	1.50	0.00	0.04	0.78	0.00	0.15	0.50	0.62	0.20	0.64	0.00	0.00	0.57	0.78	0.43	0.00	0.00	0.00	7.95	0.00
19	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00
20	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E3c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.16	0.00
22	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.56	0.00	12.97	0.00	5.21	0.00	1.74	0.00	1.33	5.30	0.00	0.00	0.00	0.00	11.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.47
23	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E3_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER3b	ExonRegion	0	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	1.81	0.00	2.86	0.00	0.00	3.80	0.00
27	ER3c	ExonRegion	0	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	1.32	3.38	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.19	0.90	0.00	0.00	0.00	1.40	0.90	1.59	0.94	0.00	0.00	11.28	0.00
28	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	2.87	1.93	0.00	0.00	20.26	0.00
29	ER4a	ExonRegion	0	0.31	1.20	0.35	0.00	0.00	1.21	2.03	0.00	0.85	3.85	0.16	1.40	2.58	0.64	0.90	0.42	17.54	10.58	2.63	0.00	0.00	3.28	1.18	3.35	0.49	0.00	0.00	13.63	0.35
30	E4_Da	KnownBoundary	0	115.49	403.22	893.05	2059.86	698.10	180.75	4544.00	972.28	550.34	3946.22	313.06	10290.35	30588.38	344.98	186.56	315.71	2144.32	823.24	161.40	2599.32	89.89	794.55	3951.84	878.45	360.70	134.19	9868.93	340.04	2756.03
31	ER4b	ExonRegion	0	0.19	0.96	0.00	0.00	0.00	0.36	1.47	0.00	1.36	1.03	0.10	0.26	2.18	0.47	0.00	0.00	1.15	0.90	1.01	0.00	0.00	1.92	0.72	2.13	0.60	0.00	0.00	9.87	0.39
32	ER4c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00