Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AP000695.1	Gene	0	3.15	2.33	0.00	0.00	0.00	0.12	0.52	0.24	0.53	0.19	0.05	0.67	0.11	1.11	1.47	0.43	0.19	4.18	0.28	0.48	4.93	1.09	1.96	11.92	1.36	0.00	0.79	0.28	1.85
2	428667	Transcript	0	2.07	2.21	0.00	0.00	0.00	0.11	1.01	0.00	0.38	0.27	0.22	0.78	0.24	0.63	1.11	0.00	0.18	4.90	0.10	0.51	4.62	0.47	1.69	10.14	1.46	0.00	0.00	0.25	2.21
3	454980	Transcript	0	1.18	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.20	0.87	0.16	0.00	0.07	0.00	0.50	0.30	0.27	0.00	0.00	0.00	0.30	0.55	1.09	0.50	9.36	0.31	0.00	0.50	0.00	0.37
4	ER1a	ExonRegion	0	4.96	6.25	0.00	0.00	0.00	0.00	2.78	0.00	1.15	0.80	0.66	1.40	0.72	1.51	0.00	0.00	0.54	7.48	0.30	1.53	5.05	1.00	3.38	20.55	4.04	0.00	0.00	0.00	2.32
5	E1_Ab	KnownBoundary	0	7.43	14.54	0.00	0.00	0.00	0.00	5.03	0.00	5.24	0.00	0.00	1.66	0.00	5.78	0.00	6.73	3.13	0.00	0.00	0.00	7.22	0.00	6.35	37.21	3.86	0.00	0.00	0.00	8.32
6	ER1b	ExonRegion	0	8.74	7.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.51	1.68	0.00	0.00	1.00	0.36	2.98	0.00	1.37	0.96	5.84	1.61	0.76	5.30	0.00	4.30	28.55	4.30	0.00	2.52	0.00	5.78
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.26	0.00	0.00	0.00	0.00	3.04
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	2.36	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.41	0.46	0.32	0.00	0.14	0.00	1.00	0.60	0.55	0.00	0.00	0.00	0.61	1.10	2.18	1.00	10.47	0.63	0.00	1.01	0.00	0.75
11	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	17.94	0.00	0.00	13.74	0.00	0.00	11.35	0.00	2.12	10.05	3.71	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.63	0.55	0.00	0.00	0.00	0.23	1.02	0.00	0.47	0.24	0.00	1.25	0.00	1.91	2.79	0.00	1.26	3.59	0.00	0.00	6.77	1.22	1.53	17.12	2.66	0.00	5.59	0.83	1.93
13	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.50	0.15	0.04	0.50	0.00	0.10	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.25	0.26	0.06	0.07	0.50	0.00	0.00	2.41	0.21	0.13	0.71	0.13	0.00	0.09	0.23	0.08
14	Ix	Intron	0	0.51	0.06	0.00	22.21	0.04	0.64	4.23	0.23	1.08	0.91	0.13	0.70	0.02	0.09	14.47	0.08	0.01	33.19	2.10	0.03	19.37	0.45	5.29	0.99	0.15	0.02	1.96	2.35	0.20
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	4.06	0.73	0.00	0.28	0.94	0.00	3.12	0.00	0.32	2.14	1.17	0.00	1.61	0.48	2.83
16	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	21.83	0.00	0.00	3.58	1.40	1.13	0.73	0.00	1.10	0.00	0.00	39.18	0.00	0.00	15.64	3.24	0.00	13.75	1.37	1.38	0.00	0.00	0.00	0.46	0.83	0.00
17	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	68.27	0.00	1.44	10.56	0.51	6.32	2.56	0.11	2.25	0.00	0.08	43.26	0.46	0.00	68.20	4.61	0.00	42.62	1.33	7.99	1.39	0.26	0.00	2.87	5.84	0.00
18	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.45	0.06	0.00	48.20	0.00	1.21	7.02	0.41	1.51	1.61	0.14	1.05	0.05	0.00	22.75	0.10	0.03	74.08	5.18	0.16	39.48	0.56	9.45	0.46	0.06	0.00	5.57	5.14	0.04
19	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.40	0.00	0.00	64.39	0.00	1.88	15.74	1.02	1.86	2.52	0.34	1.82	0.00	0.00	25.09	0.00	0.00	141.70	4.27	0.00	61.86	2.56	31.30	0.26	0.00	0.35	7.29	7.54	0.00
20	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.46	0.00	0.00	60.45	0.00	1.31	13.87	0.55	2.14	2.48	0.94	1.12	0.00	0.00	24.61	0.00	0.00	92.19	5.73	0.00	52.76	1.18	17.33	0.18	0.06	0.13	2.68	5.16	0.00
21	Ix	Intron	0	0.10	0.00	0.01	3.75	0.00	0.21	0.86	0.02	0.26	0.53	0.02	0.13	0.01	0.01	2.92	0.00	0.04	5.91	0.70	0.00	7.20	0.21	0.73	0.13	0.06	0.00	0.32	0.70	0.02
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	8.76	0.00	0.00	1.32	0.00	0.37	0.14	0.22	0.00	0.00	0.00	5.24	0.00	0.00	5.34	0.60	0.00	7.03	0.84	0.51	0.00	0.00	0.00	0.51	1.22	0.00
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	9.44	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.90	0.00	0.00	4.79	0.00	0.00	8.56	0.00	0.93	1.24	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00
24	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.39	0.00	0.00	1.75	0.00	0.00	2.89	0.00	0.40	0.20	0.00	0.39	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	3.22	1.44	0.00	8.18	0.00	0.33	0.30	0.00	0.00	0.82	0.59	0.00
25	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.90	0.00	0.57	1.06	0.00	0.45	0.86	0.00	0.13	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	5.89	1.66	0.00	7.69	0.19	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00
26	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.10	0.00	0.01	3.32	0.00	0.23	0.71	0.02	0.24	0.59	0.02	0.13	0.02	0.01	2.58	0.00	0.05	6.20	0.62	0.00	7.04	0.19	0.78	0.08	0.07	0.00	0.31	0.69	0.03
27	Ix	Intron	0	0.29	0.04	0.00	8.96	0.12	0.80	2.69	0.14	0.36	1.07	0.12	0.63	0.00	0.02	6.09	0.00	0.00	11.30	1.94	0.00	9.94	0.60	2.37	0.37	0.05	0.00	0.86	1.07	0.10
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.62	0.00	0.00	8.09	0.86	1.36	1.38	0.00	0.72	0.89	0.25	0.48	0.00	0.18	5.18	0.00	0.00	14.06	1.70	0.00	9.80	1.17	4.02	0.21	0.00	0.00	1.07	0.35	0.26
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.89	0.22	0.00	27.86	0.06	2.16	7.50	0.00	0.41	1.55	0.31	1.06	0.00	0.00	13.18	0.00	0.00	18.33	5.84	0.00	17.13	2.40	5.25	1.48	0.30	0.00	3.79	2.22	0.18
30	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	19.89	0.00	0.75	8.37	0.00	0.94	1.91	0.00	2.59	0.00	0.00	14.51	0.00	0.00	18.56	6.13	0.00	23.49	0.00	4.96	0.00	0.00	0.00	0.13	3.52	0.00
31	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.39	0.00	0.65	2.08	0.43	0.18	1.37	0.00	0.80	0.00	0.00	4.31	0.00	0.00	8.86	1.20	0.00	7.65	0.08	1.70	0.10	0.00	0.00	0.15	1.08	0.13
32	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	1.48	0.00	0.47	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	7.63	0.00	0.00	8.44	0.00	0.44	0.37	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00
33	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.11	0.00	0.00	0.38	0.00	0.15	0.54	0.10	0.36	0.38	0.13	0.00	0.00	0.00	3.28	0.00	0.00	7.75	0.34	0.00	5.59	0.00	0.87	0.08	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00
34	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.22	0.00	0.00	9.17	0.00	0.00	7.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00
35	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	14.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER3a	ExonRegion	0	1.25	0.37	0.00	0.00	0.00	0.32	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.37	3.32	0.00	0.00	7.22	0.00	0.00	8.80	0.42	1.68	4.62	0.33	0.00	0.00	0.76	1.26