Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AL109761.3	Gene	0	4.57	0.72	0.94	19.33	18.68	2.32	3.85	1.65	5.23	1.78	0.94	3.53	0.00	2.39	21.69	9.92	0.50	1.98	5.38	0.00	4.35	6.68	4.67	4.59	5.14	6.18	3.50	10.99	3.68
2	428689	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	7.67	0.00	0.00	0.00	0.08	3.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50	4.66	0.89	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	2.65	1.19
3	454737	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.28	0.00	0.00	0.00	0.16	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.95	1.78	0.00	1.38	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	3.15	0.53
5	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.06	0.00	0.00	0.00	0.00	4.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	2.16	1.85
6	Ix	Intron	0	2.21	0.89	0.57	1.97	2.01	2.93	0.69	0.38	0.77	1.98	0.57	0.59	0.62	1.90	0.75	4.80	0.72	3.44	3.95	0.70	2.25	0.25	0.62	1.03	0.59	0.43	0.00	1.12	0.69
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.44	1.57	0.54	3.50	4.77	4.54	1.31	0.60	0.69	2.27	1.16	1.05	0.97	3.36	1.79	4.89	1.11	4.20	4.24	0.34	2.74	0.59	1.18	2.45	1.16	0.51	0.00	1.06	1.25
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.05	0.38	0.60	0.86	0.00	1.76	0.24	0.22	0.84	1.79	0.14	0.26	0.37	0.83	0.00	4.76	0.43	2.90	3.76	0.97	1.91	0.00	0.22	0.00	0.17	0.38	0.00	1.16	0.28
9	Ix	Intron	0	4.20	0.36	0.11	1.41	0.32	1.80	0.13	0.00	0.15	1.51	0.70	0.69	0.42	1.60	1.68	5.66	0.29	2.31	4.60	1.44	3.92	0.12	0.12	0.70	0.37	0.72	0.00	1.07	0.00
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.22	0.36	0.11	1.41	0.32	1.80	0.13	0.00	0.15	1.51	0.70	0.69	0.42	1.60	1.68	5.67	0.29	2.32	4.61	1.45	3.93	0.12	0.12	0.71	0.37	0.72	0.00	1.07	0.00
11	Ix	Intron	0	0.65	0.94	0.16	0.48	0.83	0.69	0.28	0.44	1.20	0.67	0.26	0.68	0.26	0.57	1.68	3.39	0.37	1.19	1.84	0.41	3.62	0.33	0.28	0.25	0.69	0.33	0.35	0.83	0.12
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.65	1.02	0.14	0.51	1.27	0.69	0.17	0.27	0.60	0.55	0.36	0.40	0.08	0.62	1.08	3.30	0.35	1.12	1.87	0.54	3.83	0.17	0.25	0.23	0.59	0.13	0.32	0.52	0.05
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.85	0.27	0.00	2.78	0.00	0.00	0.95	0.34	0.98	0.05	0.00	0.87	0.00	0.86	0.00	4.05	0.70	1.11	3.02	0.00	2.47	0.00	0.00	1.02	2.17	0.65	0.00	1.40	0.00
14	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.83	0.00	0.00	1.39	0.00	0.53	0.00	0.36	1.06	0.28	0.92	1.20	0.00	0.79	0.00	4.18	0.58	1.39	0.62	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00	0.63	0.00
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.45	0.72	0.30	0.43	0.44	0.95	0.72	0.72	2.15	1.14	0.14	1.44	0.27	0.72	3.57	4.12	0.40	1.65	2.16	0.40	3.67	0.92	0.43	0.45	0.90	0.80	0.55	1.75	0.23
16	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	1.40	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	2.96	0.00	2.03	4.53	0.00	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.50
17	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.75	0.60	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.34	1.91	0.45	0.00	0.33	0.48	0.17	2.25	2.22	0.48	0.76	2.47	0.00	4.32	0.00	0.19	0.00	0.67	0.02	0.00	0.61	0.37
18	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	5.76	0.00	2.49	7.98	2.00	0.00	0.00	0.00	1.13	9.97	3.67	0.00	4.62	0.00	0.00	13.32	2.48	0.00	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13
20	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.65	2.54	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	3.52	0.00	3.73	1.43	1.13	9.97	0.00	5.29	0.00	8.09	0.00	2.01	0.00	2.17	0.00	0.00	6.39	0.00	1.93	0.00
21	Ix	Intron	0	0.71	0.61	0.00	0.68	0.00	1.43	1.14	0.09	0.98	0.54	0.11	0.67	0.00	0.64	1.74	7.36	0.07	1.15	2.41	1.17	6.45	0.17	0.09	1.01	0.34	0.07	0.00	0.61	0.09
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.55	0.66	0.00	0.73	0.00	1.48	1.24	0.09	1.06	0.52	0.12	0.67	0.00	0.69	1.42	7.37	0.08	1.04	2.13	1.27	6.51	0.18	0.09	1.10	0.37	0.08	0.00	0.50	0.10
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.73	0.00	0.00	5.47	7.36	0.00	2.48	5.68	0.00	5.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00
24	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	1.22	3.44	0.00	4.70	0.00	3.63	7.97	14.61	0.00	0.00	0.00	0.00	11.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.78	0.00
25	ER3a	ExonRegion	0	5.92	0.94	1.21	23.73	24.16	3.00	4.98	2.11	6.37	2.31	1.21	4.57	0.00	3.06	27.86	12.47	0.65	2.29	6.96	0.00	5.63	8.57	6.04	5.94	6.65	7.80	4.52	13.57	4.64