Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 C21orf62 Gene 0 0.53 0.00 0.07 1.49 0.00 0.74 0.50 0.23 0.14 1.20 0.05 2.61 0.11 0.11 0.38 1.13 0.87 0.17 0.13 0.80 0.71 0.37 0.00 0.71 0.53 0.72 0.15 1.15 0.06 2 490358 Transcript 0 0.00 0.00 0.24 0.66 0.00 0.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.00 0.00 0.00 0.23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 382373 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 487113 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 479548 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0.00 0.00 0.00 0.65 0.00 0.00 0.00 0.21 1.05 0.00 0.64 0.00 0.00 0.00 0.96 0.82 0.00 2.24 0.00 2.14 0.00 2.22 0.00 6 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.71 1.99 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.28 0.00 0.00 0.00 0.00 2.56 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 E1_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 10.78 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9 ER1b ExonRegion 0 1.71 0.00 1.12 7.31 0.00 0.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER1c ExonRegion 0 2.05 0.00 0.77 4.06 0.00 0.00 4.26 0.00 0.00 0.00 0.00 3.02 0.00 0.28 0.00 5.46 0.00 0.06 0.00 1.75 0.22 2.16 0.00 1.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 6.23 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.13 0.00 6.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.69 0.00 0.00 0.00 0.00 3.71 0.00 0.80 0.00 2.77 0.00 2.27 0.00 1.47 1.43 4.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1_Da NovelBoundary 0 2.42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 2.63 4.58 4.60 0.00 1.49 7.26 0.00 0.00 0.00 3.44 2.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.37 14 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 E1a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.01 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 2.99 0.00 0.00 9.89 1.75 0.00 17 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 2.59 0.00 0.71 0.00 0.00 1.54 0.00 0.00 0.00 0.03 0.07 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 1.75 0.90 1.98 0.00 0.00 0.00 18 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.64 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 0.00 0.00 3.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.20 0.00 0.00 0.00 0.00 1.39 19 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 E2a_E4b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 Ix Intron 0 0.66 0.33 0.34 0.49 0.17 0.65 0.55 0.44 1.03 1.28 0.24 2.77 0.22 0.61 2.00 1.65 5.02 0.13 0.22 1.50 2.18 0.55 0.43 2.34 0.15 0.75 0.93 1.05 0.20 23 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.98 0.55 0.57 0.82 0.28 0.95 0.92 0.53 1.41 1.90 0.20 4.10 0.37 0.80 2.74 1.97 7.44 0.22 0.37 2.05 3.19 0.52 0.73 3.21 0.25 0.99 1.57 1.12 0.27 24 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 4.85 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.82 1.96 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 11.47 9.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 4.38 0.00 0.00 1.49 25 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 0.62 3.14 0.00 1.91 0.00 0.00 0.00 2.89 2.45 0.00 3.96 0.00 6.41 0.00 6.67 0.00 26 E3_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 1.92 0.00 0.00 1.25 3.95 0.00 2.89 0.00 0.00 0.00 2.91 5.13 0.00 8.09 3.80 5.62 0.00 0.00 3.05 1.55 0.00 0.00 4.58 0.00 27 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 Ix Intron 0 0.55 0.69 0.41 0.92 0.06 1.50 0.66 0.30 1.34 1.85 0.18 2.47 0.20 0.65 1.33 1.51 5.29 0.46 1.26 2.10 1.77 0.48 0.38 1.20 0.53 0.97 0.45 0.30 0.88 29 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.55 0.69 0.41 0.92 0.06 1.50 0.66 0.30 1.34 1.85 0.18 2.47 0.20 0.65 1.33 1.51 5.29 0.46 1.26 2.10 1.77 0.48 0.38 1.20 0.53 0.97 0.45 0.30 0.88 30 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 1.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 1.11 0.00 0.00 0.00 0.02 1.69 0.00 2.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.99 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.85 0.76 2.23 0.55 2.28 0.00 0.40 0.00 0.00 2.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.98 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E4_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.91 8.17 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER4a ExonRegion 0 1.06 0.00 0.00 2.70 0.00 2.00 0.00 0.91 0.00 1.93 0.21 3.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 1.11 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 34 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 27.39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.03 1.52 4.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 35 ER4b ExonRegion 0 0.66 0.00 0.00 1.24 0.00 0.65 0.02 0.28 0.17 1.51 0.06 3.42 0.20 0.00 0.00 1.53 1.08 0.00 0.25 1.06 0.55 0.00 0.00 0.46 0.58 0.24 0.28 1.38 0.00 36 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.60 0.00 0.00 0.00 3.87 0.00 1.17 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 0.00 0.00 37 ER4c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 7.11 0.00 3.67 2.02 0.00 0.00 1.40 0.00 3.71 0.00 0.00 0.00 0.00 1.75 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.00 0.72 0.87 0.00 0.00 0.00 0.52 38 E4_Db KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 17.90 0.00 0.00 2.29 0.00 0.00 0.00 0.00 2.71 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.49 39 ER4d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.01 0.15 0.00 0.00 0.61 0.00 0.36 0.00 0.38 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 0.00 0.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.41 40 ER4e ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00