Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP5-1187M17.2	Gene	0	0.86	0.32	0.42	0.18	0.00	0.76	0.36	0.37	1.54	0.84	0.60	0.91	0.65	0.74	1.27	0.86	2.25	0.83	0.56	0.62	1.69	0.36	0.32	1.24	1.15	0.99	0.37	0.82	0.52
2	446537	Transcript	0	0.44	0.18	0.30	0.00	0.00	0.51	0.14	0.18	0.90	0.33	0.24	0.52	0.24	0.38	0.86	0.70	0.98	0.24	0.30	0.19	0.81	0.16	0.20	0.69	0.55	0.40	0.13	0.41	0.29
3	454019	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.20	0.55	0.94	0.77	0.80	0.42	0.25	0.00	0.27	4.06	0.84	0.35	0.90	1.08	0.00	0.00	0.93	0.31	1.02	0.20	0.88	0.22
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.31	0.00	0.26	0.34	0.00	0.00	0.75	0.56	0.00	0.38	0.58	0.30	0.00	0.00	0.77	0.70	0.00	0.67	1.11	1.09	0.28	0.63	0.42
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.01	1.13	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.89	9.70	15.52	0.00	0.00	18.72	2.52	7.17	21.90	20.97	13.25	15.09	9.74	23.86	7.77	17.67	29.67	24.53	8.09	8.02	10.63	16.00	11.57	8.55	18.75	10.86	14.81	6.47	12.18
8	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	32.87	14.50	0.00	0.00	18.88	5.32	2.49	21.32	16.70	13.00	30.24	12.83	18.68	16.14	31.06	26.70	13.87	8.09	30.68	29.12	37.14	11.82	27.34	20.84	59.56	9.49	21.75	17.60
10	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E3_Aa	NovelBoundary	0	13.04	22.20	76.36	29.55	0.00	49.69	15.39	27.72	47.41	85.16	58.14	42.77	43.34	36.14	19.93	42.07	84.23	50.86	16.18	27.54	90.17	67.72	55.36	70.22	54.25	35.36	35.24	22.96	73.42
12	ER3a	ExonRegion	0	2.48	0.00	0.95	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	1.46	1.26	0.00	2.32	0.38	1.18	2.83	3.64	4.34	1.12	1.85	0.80	0.83	0.49	0.52	4.97	1.66	1.82	0.00	2.36	1.17
13	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.07	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	4.31	0.00	2.13	9.97	7.42	7.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	5.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E4_Ab	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.02	1.64	3.01	0.00	0.00	2.17	0.00	6.12	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER4b	ExonRegion	0	5.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	1.43	0.92	0.00	0.79	0.00	0.58	0.00	0.85	2.70	2.46	0.00	3.51	5.46	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	1.17	0.00	0.00
18	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	1.52	1.52	0.00	4.46	0.00	2.08	0.00	0.00	9.45	4.62	8.09	0.00	6.06	0.00	0.00	5.26	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00
19	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix	Intron	0	1.49	0.45	1.16	0.00	0.68	0.19	0.00	1.02	2.30	0.90	0.91	3.51	0.40	1.79	3.57	2.24	5.90	1.92	1.55	1.15	1.39	0.38	0.50	2.24	1.29	0.76	0.13	1.13	1.99
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.49	0.45	1.16	0.00	0.68	0.19	0.00	1.03	2.30	0.90	0.91	3.51	0.41	1.79	3.57	2.24	5.91	1.92	1.55	1.15	1.39	0.38	0.50	2.24	1.29	0.76	0.13	1.13	2.00
22	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.14	0.00	0.00	1.14	0.00	2.46	8.37	11.02	6.15	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60	0.00	0.00	0.00	1.93	6.93
23	ER5a	ExonRegion	0	1.04	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	2.43	1.35	2.26	0.00	0.61	0.46	4.73	2.32	0.70	2.70	1.49	0.00	1.92	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63
24	E5_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	2.63	0.00	1.61	0.00	1.61	4.28	0.00	2.42	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	1.94	2.29	4.75
25	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix	Intron	0	1.26	1.52	1.04	1.17	0.32	1.53	0.40	0.48	2.86	3.17	1.13	2.44	0.51	1.49	2.74	3.61	5.32	1.76	2.19	0.09	3.87	0.65	0.24	2.46	0.98	1.18	0.42	1.07	2.78
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.31	1.69	1.01	1.37	0.37	1.63	0.39	0.49	3.03	3.08	1.27	2.76	0.55	1.52	3.20	3.97	5.31	2.00	2.32	0.11	3.94	0.62	0.18	2.55	0.78	1.20	0.49	1.16	2.79
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.98	0.53	1.24	0.00	0.00	0.94	0.46	0.42	1.85	3.72	0.27	0.57	0.30	1.33	0.00	1.43	5.44	0.37	1.46	0.00	3.46	0.82	0.59	1.96	2.21	1.08	0.00	0.53	2.70
30	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.16	0.86	1.28	0.00	0.00	1.54	0.75	0.00	3.52	1.07	0.44	0.00	0.00	2.58	3.52	2.12	4.84	3.59	0.00	0.00	1.52	0.00	0.67	2.14	0.53	1.76	0.00	1.25	0.00
31	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.02	1.84	1.23	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	6.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	1.89	3.95	0.00	0.00	1.58
32	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.40	1.09	1.88	1.53	1.61	0.84	0.49	0.00	0.54	8.12	1.67	0.69	1.79	2.17	0.00	0.00	1.87	0.62	2.05	0.40	1.77	0.43
33	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.70	4.62	0.00	0.00	3.13	0.00	2.51	0.00	0.00	4.38	2.29	0.00	3.73
34	Ix	Intron	0	1.11	1.67	1.33	0.49	0.34	1.23	0.49	0.38	2.13	1.20	1.23	1.83	0.18	1.19	1.71	1.28	3.35	2.23	1.43	0.95	5.02	0.68	0.75	1.78	1.38	1.30	0.32	1.46	2.13
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.11	1.67	1.33	0.50	0.34	1.24	0.49	0.38	2.13	1.20	1.23	1.83	0.18	1.19	1.72	1.29	3.35	2.23	1.44	0.95	5.03	0.69	0.75	1.79	1.38	1.30	0.32	1.47	2.13
36	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.38	0.45	1.92	0.00	1.87	0.65	0.00	2.27	3.10	2.69	2.23	0.00	0.48	0.73	0.33	3.81	0.58	1.71	0.00	6.05	0.00	0.00	1.27	0.63	0.21	0.74	0.65	0.63
37	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.69	0.00	3.07	1.70	1.78	1.88	0.00	1.61	0.00	1.19	2.19	1.91	1.04	0.00	2.93	0.59	0.59	3.06	0.33	0.66	0.00	1.06	0.00
38	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.20	0.88	0.00	0.00	0.45	0.38	0.00	0.51	2.57	1.45	0.76	1.01	0.48	0.49	1.93	0.00	2.48	0.18	0.00	0.76	2.02	0.00	0.00	0.72	0.52	1.01	0.00	0.73	0.28
39	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	8.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.17	1.71	0.00
40	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	1.80	0.04	0.00	3.66	0.55	1.56	0.60	0.00	0.57	3.59	0.00	1.99	0.00	0.00	0.00	4.72	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	0.53	0.65
41	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	1.52	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	2.21	0.00	2.06	0.00	1.98	3.66
42	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	Ix	Intron	0	3.03	2.14	0.61	1.13	1.02	2.37	1.48	0.58	3.22	2.57	2.55	2.51	1.49	1.85	4.47	3.27	4.06	3.41	3.01	0.64	3.36	0.57	0.19	2.03	1.27	1.89	0.67	2.39	1.47
44	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.45	0.00	0.72	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.66	2.49	2.53	0.06	0.68	0.00	0.00	0.71	1.50	0.40	3.17	0.56	0.57	0.00	0.82	0.71
45	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.14	1.48	0.55	1.90	1.30	1.71	1.25	0.00	2.48	1.90	2.07	2.47	0.92	1.40	5.61	3.55	4.35	3.24	1.80	0.73	3.36	0.86	0.13	1.76	1.42	1.31	0.32	2.40	1.61
46	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	6.18	0.15	2.44	0.55	0.75	0.91	0.00	3.33	1.16	8.19	6.31	0.00	6.01	0.00	0.00	5.15	0.98	0.79	0.00	0.00	0.32
47	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.36	3.07	0.80	0.00	0.78	3.75	2.24	1.76	4.56	4.34	3.73	3.13	2.77	2.91	3.21	2.84	4.36	3.47	5.13	0.63	3.35	0.00	0.29	2.02	1.14	3.22	1.45	2.85	1.45
48	E8_Aa	NovelBoundary	0	2.54	3.68	2.44	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	1.40	3.44	1.36	4.19	1.59	1.13	0.00	3.52	7.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	5.44	3.49	1.89	5.67	2.29	1.35
49	ER8a	ExonRegion	0	2.32	1.99	1.81	0.00	0.00	1.91	1.23	1.99	4.48	1.53	1.10	2.76	1.50	1.88	2.99	1.15	2.74	1.24	1.48	1.28	2.65	0.56	1.68	1.99	2.87	1.46	1.13	1.01	0.93