Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	FLRT3	Gene	0	0.21	0.00	0.03	0.00	29.52	0.34	0.44	4.36	0.41	0.44	0.28	0.11	0.00	0.10	0.18	0.00	2.23	0.04	0.06	1.58	0.43	0.04	1.15	0.36	0.03	0.00	0.13	0.11	0.32
2	341420	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	15.39	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	462077	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.90	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00
4	378053	Transcript	0	1.36	0.00	0.00	0.00	0.02	0.98	0.00	2.12	0.00	1.02	0.00	0.09	0.00	0.50	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	2.39	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	15.77	0.00	0.00	0.92	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1c	ExonRegion	0	0.69	0.00	0.00	0.00	25.10	0.49	0.00	6.42	1.83	0.92	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	1.38	0.53	0.00	1.68	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.97	3.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1a_E3a	KnownJunction	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	4.23	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	4.78	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	18.15	0.00	0.00	4.64	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00
11	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	25.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.90	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00
14	E2_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	17.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	0.00	0.00
15	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00
16	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER3a	ExonRegion	0	0.27	0.00	0.05	0.00	40.17	0.46	0.63	5.70	0.47	0.59	0.41	0.11	0.00	0.11	0.26	0.00	3.20	0.06	0.09	2.19	0.58	0.05	1.56	0.51	0.04	0.00	0.18	0.14	0.42
18	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00