Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-96K19.1	Gene	0	1.67	5.59	1.01	2.32	4.33	4.64	1.66	1.83	3.71	4.99	1.21	2.08	2.18	4.46	7.54	5.40	3.84	2.23	3.45	2.65	5.46	1.13	1.56	5.16	4.54	3.84	10.65	2.22	3.28
2	440689	Transcript	0	0.81	2.59	0.47	1.19	2.09	2.22	1.95	0.85	2.66	2.41	0.56	1.63	1.01	2.58	3.50	2.54	2.74	1.03	1.60	1.23	2.53	0.52	0.73	4.23	2.71	2.95	4.95	1.03	1.52
3	IG12_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	3.77	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	4.94	10.08	1.05	2.15	5.71	2.39	32.25	8.73	0.00	1.69	0.00	0.00	1.23	1.59	3.15	7.57	5.00	0.00	14.49	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	2.26	7.78	1.41	3.02	5.88	6.33	1.91	2.55	4.99	6.78	1.68	2.78	3.04	5.98	10.50	7.44	5.09	3.10	4.81	3.69	7.60	1.57	2.18	7.04	6.21	5.27	14.84	3.09	4.57
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	6.83	1.30	1.39	1.40	5.38	0.00	0.00	5.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.62	1.52	0.00	10.88	4.58	1.45
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	2.56	0.00	0.00	1.81	0.00	1.17	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.26	1.63	3.39	0.00	0.00	0.00
7	I1	Intron	0	0.45	4.54	0.18	0.00	3.08	5.19	2.12	2.51	7.42	3.48	1.12	1.36	2.71	2.75	6.45	5.58	1.57	4.72	4.69	3.44	5.09	0.76	2.47	3.84	3.45	2.47	3.65	2.39	4.55
8	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.45	4.59	0.18	0.00	3.11	5.22	2.14	2.54	7.45	3.48	1.14	1.38	2.74	2.77	6.52	5.63	1.58	4.77	4.74	3.47	5.14	0.76	2.49	3.88	3.48	2.50	3.69	2.42	4.60
9	Ix	Intron	0	2.33	4.21	0.11	0.92	1.25	2.64	0.13	0.00	3.51	1.11	0.53	1.58	0.37	1.93	8.04	3.27	3.63	2.26	4.90	0.53	1.64	0.35	0.23	0.41	0.91	0.90	1.64	0.52	0.64
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.71	5.40	0.70	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	6.29	0.61	0.00	1.70	1.63	4.10	14.53	3.14	3.82	0.81	4.15	1.00	1.80	0.00	0.00	1.44	0.00	1.00	3.09	0.69	1.13
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.27	4.01	0.00	1.08	1.48	3.01	0.15	0.00	3.02	1.20	0.63	1.56	0.15	1.55	6.90	3.30	3.60	2.52	5.04	0.45	1.62	0.41	0.27	0.23	1.08	0.89	1.38	0.49	0.56
12	Ix	Intron	0	1.44	5.99	0.24	1.03	0.47	4.02	1.54	0.53	5.31	2.42	1.20	2.57	1.33	2.98	4.89	5.64	4.29	3.66	3.06	1.32	1.71	0.52	0.43	1.55	1.78	0.98	1.75	0.23	0.93
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.44	6.01	0.24	1.03	0.47	4.03	1.55	0.53	5.33	2.43	1.20	2.57	1.34	2.99	4.90	5.65	4.30	3.67	3.07	1.32	1.71	0.52	0.43	1.55	1.78	0.98	1.76	0.23	0.93
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	112.31	68.83	76.91	145.81	87.10	115.99	30.67	81.67	32.49	104.26	54.82	50.21	46.02	150.00	48.04	177.17	165.53	178.90	96.88	157.87	106.29	59.51	95.84	61.85	138.43	93.21	188.85	95.88	73.39
15	ER2a	ExonRegion	0	0.16	0.00	0.00	0.55	0.37	0.32	1.02	0.00	0.43	0.44	0.00	0.29	0.00	0.58	0.00	0.19	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.30	0.20	0.00	0.00	0.00