Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-57H12.1	Gene	0	5.60	6.20	1.83	0.00	0.00	5.29	0.28	0.25	2.54	3.18	1.64	1.86	0.36	5.85	4.05	8.92	10.26	10.20	0.88	3.79	1.37	0.25	0.00	1.18	4.32	2.16	0.25	2.91	0.46
2	444665	Transcript	0	2.30	2.55	0.75	0.00	0.00	2.17	0.11	0.10	1.05	1.30	0.67	0.78	0.15	2.40	1.66	3.67	4.22	4.19	0.36	1.58	0.56	0.10	0.00	0.49	1.78	0.89	0.10	1.20	0.19
3	IG50_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	7.31	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.12
4	IG50_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.76	1.63	0.00	0.32	0.52	1.17	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	1.29	0.00	0.39	2.27
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.76	4.53	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00
8	Ix	Intron	0	2.23	6.70	0.00	18.65	0.00	5.01	7.34	3.83	9.05	5.26	1.86	1.29	1.01	3.30	10.52	17.56	4.66	4.01	11.64	16.00	4.45	0.00	0.00	7.84	2.23	0.82	5.72	0.85	0.00
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.28	6.84	0.00	19.04	0.00	5.11	7.48	3.91	9.23	5.35	1.90	1.31	1.03	3.36	10.73	17.93	4.76	4.09	11.88	16.34	4.55	0.00	0.00	7.98	2.28	0.83	5.84	0.87	0.00
10	Ix	Intron	1	14.73	21.17	2.65	27.40	8.30	32.80	28.72	5.76	12.57	12.76	11.95	9.42	3.57	16.70	28.79	35.88	31.58	25.45	30.34	66.02	13.60	1.95	2.09	19.18	14.51	2.55	17.89	4.66	7.16
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	14.75	21.21	2.65	27.44	8.31	32.85	28.76	5.77	12.59	12.78	11.96	9.44	3.57	16.72	28.84	35.94	31.63	25.49	30.39	66.12	13.62	1.95	2.10	19.21	14.54	2.55	17.91	4.66	7.17
12	Ix	Intron	0	3.39	2.36	1.26	1.62	0.00	6.73	2.43	0.55	3.26	3.15	2.06	1.58	0.34	4.23	8.37	11.92	11.25	7.33	5.78	6.88	1.29	0.54	0.00	2.75	3.01	1.19	2.21	2.58	0.15
13	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	3.06	1.51	0.63	2.32	0.00	6.99	2.83	0.56	2.74	2.81	1.99	1.77	0.30	4.12	9.31	10.96	11.53	7.27	6.05	6.84	1.08	0.58	0.00	3.02	2.47	1.11	2.11	1.72	0.03
14	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.38	3.11	2.24	0.00	0.00	12.73	6.37	2.33	1.18	3.42	2.38	2.02	1.03	6.35	3.54	17.18	13.13	8.04	12.15	13.46	0.00	0.00	0.00	1.47	5.57	3.72	6.17	7.46	1.34
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.77	0.00	2.24	0.00	0.00	9.62	6.05	1.84	2.18	2.89	2.17	2.47	0.00	6.03	5.60	21.14	13.73	2.73	8.25	12.73	0.00	0.00	0.00	4.43	8.16	3.14	6.46	10.83	1.34
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.56	4.99	2.86	0.00	0.00	5.03	0.42	0.18	5.16	4.19	2.25	0.90	0.40	4.13	6.69	13.18	10.05	7.99	4.03	5.67	2.22	0.56	0.00	2.03	3.77	0.90	1.59	3.62	0.24
17	E2_Aa	NovelBoundary	0	6.02	9.50	1.32	0.00	0.00	12.20	0.00	0.00	5.48	3.71	3.92	3.07	1.40	5.81	0.00	29.76	10.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.50	8.94	0.00	0.00	1.71	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	6.90	7.64	2.26	0.00	0.00	6.52	0.34	0.31	3.14	3.91	2.02	2.28	0.44	7.21	4.99	11.00	12.65	12.57	1.08	4.65	1.69	0.31	0.00	1.46	5.32	2.66	0.31	3.59	0.57