Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP5-1160K1.1	Gene	0	9.06	3.92	3.72	2.13	0.72	5.10	2.09	1.77	3.70	4.17	0.26	2.88	0.29	6.70	3.21	5.15	10.29	4.24	4.26	1.87	1.37	1.74	0.13	8.77	2.01	1.28	0.00	4.59	0.15
2	369843	Transcript	0	3.13	1.51	1.30	0.70	0.24	1.81	0.69	0.69	1.27	1.54	0.12	1.02	0.16	2.47	1.18	1.81	3.89	1.57	1.55	0.62	0.55	0.57	0.04	3.18	0.73	0.42	0.00	1.78	0.05
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.00	0.14	0.36	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	52.85	58.85	138.65	57.59	42.89	55.75	9.50	22.54	64.53	85.84	33.37	85.00	90.12	101.85	53.02	57.30	107.23	61.39	72.83	31.09	42.08	52.12	163.36	149.78	82.32	68.23	26.39	154.97	62.63
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	7.61	3.12	1.89	0.00	0.00	3.11	1.63	0.89	5.06	1.86	0.00	0.99	0.63	4.53	7.12	2.40	7.47	4.46	2.58	0.00	0.92	1.16	0.29	8.33	0.92	2.03	0.89	8.68	0.76
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.66	3.14	1.90	0.00	0.00	3.13	1.64	0.90	5.09	1.88	0.00	1.00	0.63	4.56	7.17	2.42	7.51	4.48	2.59	0.00	0.93	1.17	0.29	8.39	0.93	2.04	0.89	8.73	0.76
8	Ix	Intron	0	5.00	1.16	3.07	4.77	0.82	8.49	0.34	0.31	3.55	5.78	0.00	1.65	0.65	5.53	1.54	2.90	13.20	3.27	4.27	2.97	2.38	0.60	0.30	12.22	1.67	0.00	0.00	4.08	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.80	0.98	3.39	6.04	1.03	8.11	0.43	0.39	3.72	5.97	0.00	1.99	0.61	6.15	1.81	2.69	15.13	2.91	3.46	3.01	2.61	0.76	0.00	13.20	1.64	0.00	0.00	4.38	0.00
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.07	1.94	1.97	0.00	0.00	10.41	0.00	0.00	3.02	5.33	0.00	0.39	0.83	3.33	0.55	3.86	6.21	4.88	7.72	2.95	1.59	0.00	1.51	8.96	1.87	0.00	0.00	3.02	0.00
11	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.90	0.00	0.00	0.00	0.00	6.94	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	4.30	0.00	0.00	6.75	0.00	0.00	0.00	5.74	0.00	2.51	5.86	1.74	1.80	0.00	2.25	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	1.53	2.29	0.79	0.00	0.00	1.30	0.00	0.88	0.53	1.71	0.27	0.73	0.42	2.06	1.30	1.18	4.92	1.83	1.52	0.00	1.02	0.00	0.00	3.06	0.68	0.00	0.00	2.24	0.00
13	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.65	0.00	4.26	0.00	14.44	3.18	0.00	0.00	4.87	0.00	0.00	3.40	1.97	7.02	0.00	6.96	10.83	9.25	0.00	2.98	2.01	2.09	2.22	8.97	1.70	4.12	0.00	4.49	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	14.12	5.28	5.71	3.50	1.19	7.72	3.44	2.45	5.81	5.99	0.29	4.36	0.24	9.93	4.61	7.87	14.39	6.03	6.24	3.08	1.74	2.86	0.22	12.86	2.96	2.11	0.00	6.36	0.24