Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP4-620F22.1	Gene	0	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
2	437128	Transcript	0	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	221.43	1451.64	385.26	29.55	220.62	1040.57	150.36	54.15	1189.57	478.31	504.10	172.74	533.11	395.69	128.16	141.29	115.36	225.52	56.42	41.93	272.43	1002.68	75.70	540.43	197.57	124.71	163.95	14.51	85.60
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	15.58	25.97	2.32	0.00	1.69	24.59	2.44	0.21	12.62	12.41	2.06	2.03	2.35	10.20	9.39	6.61	3.36	6.19	4.79	0.16	7.08	3.02	0.63	22.84	3.88	1.54	0.00	0.47	1.16
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	17.59	28.65	1.97	0.00	1.26	23.39	1.56	0.00	13.24	10.23	0.31	2.62	0.98	10.32	16.97	5.75	3.07	7.94	4.11	0.00	8.70	4.71	1.40	25.91	4.42	1.94	0.00	0.42	2.18
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	15.02	25.24	2.42	0.00	1.82	24.96	2.70	0.27	12.45	13.06	2.57	1.86	2.75	10.18	7.20	6.86	3.45	5.69	4.99	0.21	6.62	2.53	0.40	21.98	3.73	1.43	0.00	0.49	0.86
9	Ix	Intron	0	6.24	12.60	0.56	0.00	0.00	8.92	0.67	0.00	3.26	0.72	0.69	0.87	0.32	3.38	1.99	2.21	0.37	1.79	2.39	0.00	1.66	0.60	0.00	2.51	0.83	0.39	0.76	0.00	0.39
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.23	7.98	0.02	0.00	0.00	3.44	0.00	0.00	1.89	2.53	0.00	0.74	0.04	4.64	4.28	6.89	0.00	1.36	0.00	0.00	1.01	1.28	0.00	5.05	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.70	13.31	1.29	0.00	0.00	12.66	1.95	0.00	4.41	0.34	1.06	0.57	0.84	4.39	3.46	1.23	0.00	1.38	2.83	0.00	1.36	0.80	0.00	3.42	1.23	1.35	3.25	0.00	0.60
12	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.52	13.26	0.45	0.00	0.00	8.88	0.44	0.00	3.20	0.52	0.72	0.98	0.23	2.91	1.22	1.70	0.54	1.98	2.69	0.00	1.86	0.43	0.00	1.84	0.69	0.20	0.22	0.00	0.40
13	Ix	Intron	0	4.11	11.18	1.07	0.00	0.00	6.59	0.32	0.00	3.59	2.08	0.00	0.49	0.00	1.44	0.00	1.98	0.24	1.95	2.04	1.20	4.10	0.86	0.00	1.03	0.91	0.00	0.00	0.00	0.53
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	1.60	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.52
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.33	11.93	1.14	0.00	0.00	7.03	0.34	0.00	3.83	2.22	0.00	0.53	0.00	1.50	0.00	2.12	0.25	2.08	2.18	1.28	4.35	0.83	0.00	1.10	0.97	0.00	0.00	0.00	0.54
16	Ix	Intron	0	24.94	13.66	1.62	0.00	0.95	9.07	1.17	0.00	6.96	2.52	2.31	0.36	0.38	1.49	0.89	2.75	0.58	1.12	1.24	0.00	2.21	0.35	0.35	3.75	1.11	1.83	0.00	0.00	1.04
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	25.12	13.77	1.63	0.00	0.95	9.14	1.18	0.00	7.01	2.53	2.33	0.36	0.38	1.50	0.90	2.77	0.58	1.13	1.25	0.00	2.23	0.35	0.35	3.78	1.12	1.84	0.00	0.00	1.05
18	Ix	Intron	0	15.62	24.54	2.15	0.44	0.60	27.35	1.73	0.23	12.94	7.25	3.13	1.02	0.87	5.61	2.70	4.78	3.02	5.13	5.28	0.17	5.15	1.88	0.00	4.21	2.01	0.96	0.45	0.00	0.90
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	15.66	24.60	2.16	0.44	0.60	27.42	1.73	0.23	12.97	7.27	3.14	1.02	0.87	5.63	2.71	4.79	3.02	5.14	5.29	0.17	5.16	1.88	0.00	4.22	2.02	0.96	0.45	0.00	0.90
20	Ix	Intron	0	2.41	6.40	1.20	0.00	2.50	7.73	1.03	0.00	1.54	2.66	0.61	0.00	0.73	1.71	0.94	0.69	0.46	1.18	0.98	0.00	1.17	0.37	0.00	0.66	1.17	0.32	0.00	0.33	0.00
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.42	6.42	1.20	0.00	2.51	7.76	1.03	0.00	1.55	2.67	0.61	0.00	0.73	1.72	0.95	0.69	0.46	1.19	0.98	0.00	1.17	0.37	0.00	0.66	1.17	0.32	0.00	0.33	0.00
22	E2_Aa	NovelBoundary	0	17.28	28.21	4.83	0.00	0.00	13.89	0.00	0.00	19.37	0.00	0.00	1.45	1.66	6.65	0.00	10.94	6.71	0.00	0.00	0.00	1.68	2.38	0.00	8.25	5.27	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00