Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-108P2.1	Gene	0	0.34	1.19	0.18	0.76	0.26	0.65	0.85	0.78	1.06	2.82	0.44	0.32	0.10	0.57	0.49	2.83	1.42	0.20	0.84	0.15	0.45	0.19	0.28	1.59	0.83	0.33	0.39	0.26	0.11
2	450461	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	426999	Transcript	0	0.40	1.39	0.21	0.88	0.30	0.76	0.99	0.91	1.24	3.29	0.51	0.38	0.12	0.67	0.57	3.30	1.65	0.24	0.98	0.17	0.44	0.22	0.33	1.85	0.96	0.39	0.45	0.20	0.12
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.33	0.66	0.22	0.41	0.19	0.70	0.35	0.63	2.66	0.85	0.32	0.82	0.15	0.21	2.24	2.02	1.82	0.33	0.06	0.37	0.30	0.28	0.17	1.11	1.20	0.64	0.07	0.34	0.37
7	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.24	3.41	0.00	3.15	0.00	3.66	4.31	0.40	7.92	2.27	1.92	2.64	0.85	2.13	12.25	7.46	4.93	1.30	0.70	1.72	1.46	0.20	0.20	2.68	0.73	0.30	0.00	0.54	0.00
8	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	1.21	2.69	0.31	0.00	0.61	4.31	1.56	1.15	4.61	2.08	0.30	1.29	0.28	1.02	4.72	4.24	6.28	1.61	1.40	1.51	0.86	0.45	0.34	2.37	2.09	0.28	0.00	0.82	0.63
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.42	0.00	0.00	10.78	6.04	0.00	0.00	4.63	5.91	1.96	0.00	0.00	1.94	1.15	8.37	0.00	10.33	0.00	0.00	0.00	1.64	2.48	0.00	8.91	7.31	0.00	0.00	2.29	1.39
10	ER2a	ExonRegion	0	0.79	2.78	0.41	1.77	0.60	1.52	1.98	1.81	2.47	6.57	1.03	0.76	0.24	1.34	1.14	6.60	3.31	0.47	1.97	0.34	0.88	0.44	0.66	3.70	1.93	0.77	0.90	0.40	0.25
11	E2_Da	NovelBoundary	0	2.48	3.78	0.00	10.78	0.00	3.91	0.00	0.00	2.50	5.15	2.91	0.00	0.00	1.02	0.00	6.50	3.76	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I2	Intron	0	1.06	1.55	0.23	0.57	1.16	3.08	1.80	0.84	2.88	3.27	1.40	1.43	0.41	1.49	2.13	6.61	8.63	1.21	1.27	1.17	0.99	0.29	0.40	2.27	1.22	0.34	0.55	0.88	0.61
14	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.30	2.15	0.58	0.00	1.27	2.97	2.96	1.11	4.89	4.24	1.54	1.65	0.67	1.68	5.64	11.35	10.58	1.83	2.21	1.19	1.60	0.62	0.47	3.53	0.99	0.14	0.63	0.28	0.17
15	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.66	0.83	0.00	0.00	0.00	2.55	2.41	0.48	3.90	0.37	0.62	0.71	0.00	0.76	1.19	4.24	6.63	0.50	0.83	1.43	0.74	0.22	0.00	2.88	0.22	0.00	0.47	0.42	0.00
16	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.80	1.86	0.03	0.00	0.00	5.11	1.83	1.52	2.90	3.90	0.75	2.11	0.38	2.92	4.62	6.47	15.96	0.32	1.99	0.00	1.21	0.16	0.00	1.68	1.41	0.26	0.51	2.20	0.49
17	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.74	1.11	0.19	1.10	0.93	2.88	1.39	0.71	2.05	3.42	1.70	1.44	0.41	1.25	0.39	5.26	7.04	1.15	0.77	1.25	0.65	0.21	0.42	1.99	1.51	0.48	0.58	0.94	0.99
18	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.77	3.45	0.00	0.00	7.02	1.97	0.00	0.00	1.00	0.52	0.43	0.00	0.00	0.97	0.00	3.31	2.68	2.08	1.12	2.41	1.54	0.00	1.30	0.00	0.51	0.56	0.00	0.59	0.00
19	E3_Aa	NovelBoundary	0	106.76	63.89	7.28	144.30	42.15	74.89	40.34	37.82	12.85	31.88	19.93	31.20	6.62	73.58	44.85	102.81	109.60	83.99	89.02	52.43	32.49	0.00	6.70	59.70	32.62	3.60	49.90	29.25	14.59
20	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.42	0.00
21	E3_Da	KnownBoundary	0	11.09	3.49	4.41	81.32	46.86	13.16	19.17	0.00	1.55	25.49	12.43	4.52	1.40	13.09	34.68	27.77	57.58	38.53	89.02	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	9.28	0.00	11.98	27.32	7.82
22	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00