Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-17E13.1	Gene	0	0.17	0.00	0.14	0.58	0.39	0.00	0.00	0.30	0.23	0.23	0.10	0.15	0.00	0.00	0.37	0.00	0.48	0.31	0.52	0.00	0.12	0.15	0.15	0.17	0.00	0.38	0.44	0.53	0.00
2	449696	Transcript	0	0.15	0.00	0.12	0.49	0.33	0.00	0.00	0.25	0.20	0.20	0.08	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.41	0.18	0.30	0.00	0.10	0.12	0.12	0.15	0.00	0.32	0.38	0.45	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	190.58	63.50	69.91	193.69	109.05	119.32	221.71	71.07	111.30	122.31	372.59	104.00	161.48	109.05	164.04	126.68	165.24	50.73	177.14	100.81	72.36	77.20	109.63	80.27	60.12	84.54	113.56	81.15	76.72
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.26	1.89	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	1.08	0.00	1.69	0.00	0.73	0.00	0.53	0.00	1.45	0.00	2.26	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.46	2.19	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	1.25	0.00	1.96	0.00	0.84	0.00	0.62	0.00	1.69	0.00	2.62	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.88	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	5.15	0.00	3.59	0.00
9	ER2a	ExonRegion	0	0.74	0.00	0.58	2.47	1.62	0.00	0.00	1.27	0.95	1.00	0.41	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	2.06	0.66	1.10	0.00	0.49	0.62	0.62	0.74	0.00	1.62	1.89	2.25	0.00
10	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	3.56	0.00	2.20	0.00
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.79	1.19	0.00	0.00	1.80	0.51	0.00	1.36	1.65	1.60	3.96	0.46	0.00	0.76	1.70	0.00	2.71	1.42	1.18	0.00	0.53	0.00	1.34	0.79	0.46	2.27	0.68	3.53	0.74
13	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.53	0.00	0.00	3.32	0.18	0.00	0.00	0.00	0.96	0.41	0.31	0.00	0.23	0.00	3.75	0.09	0.25	0.00	1.87	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	1.09	0.00
14	Ix	Intron	0	0.95	2.72	0.30	1.90	1.29	1.76	0.53	0.16	3.31	2.48	2.10	0.98	0.54	2.70	0.81	2.52	7.18	1.03	3.10	0.45	1.45	0.00	0.16	1.52	0.38	0.35	0.08	0.65	0.35
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.23	3.05	0.48	1.55	2.11	2.18	0.87	0.26	4.51	3.74	2.74	1.33	0.74	3.35	1.33	3.03	10.41	1.27	4.37	0.34	1.85	0.00	0.13	2.48	0.62	0.57	0.13	0.82	0.58
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	9.96	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.78	9.97	6.79	0.00	0.00	0.00	0.00	8.70	7.14	4.85	5.33	0.42	0.00	4.60	6.90	0.00	1.11	6.39	3.31	0.00	1.68	0.00	0.00	0.26	3.40	0.59	0.00
18	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.59	2.54	6.92	0.49	0.00	0.00	0.00	0.51	7.17	0.65	0.46	0.80	3.89	1.76	2.11	0.00	0.00	0.00	1.01	1.92	0.64	0.00	0.51	0.00	0.00	2.31	0.71
19	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.60	2.57	7.02	0.49	0.00	0.00	0.00	0.52	7.27	0.66	0.47	0.81	3.94	1.78	2.14	0.00	0.00	0.00	1.02	1.94	0.64	0.00	0.51	0.00	0.00	2.34	0.72
20	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	15.23	18.16	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	5.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	3.46	0.00
21	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.63	0.63	0.54	1.17	0.75	0.45	0.07	0.18	1.39	0.85	2.57	0.26	0.27	1.44	0.54	0.75	1.87	1.04	1.29	0.27	0.82	0.00	0.29	0.18	0.37	0.47	0.00	1.04	0.22
22	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.18	0.00	0.00	0.00	11.05	0.53	0.99	0.00	2.07	1.43	8.58	0.00	0.69	9.82	0.00	1.85	4.87	0.00	2.78	0.00	1.84	0.96	0.96	0.69	0.76	3.00	0.00	0.39	0.00
23	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.34	0.00	0.00	0.00	2.22	0.17	0.07	0.00	1.50	0.09	1.67	0.00	0.00	0.35	0.00	0.90	5.07	0.88	1.45	0.00	0.65	0.00	0.00	1.84	0.00	1.64	0.00	5.14	0.00
24	Ix	Intron	0	0.41	2.15	0.16	0.68	1.86	1.70	0.00	0.35	0.00	1.51	3.28	0.00	0.00	1.12	0.00	1.89	1.14	1.28	1.82	0.52	1.76	0.34	0.34	0.20	0.14	0.00	0.00	0.31	0.00
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.41	2.15	0.16	0.68	1.86	1.70	0.00	0.35	0.00	1.51	3.29	0.00	0.00	1.12	0.00	1.89	1.14	1.29	1.83	0.53	1.77	0.34	0.34	0.21	0.14	0.00	0.00	0.31	0.00
26	Ix	Intron	0	5.74	8.69	1.43	5.72	11.13	8.38	1.95	1.68	6.01	4.94	14.51	5.20	1.47	8.32	5.18	25.32	34.02	4.94	4.55	3.93	3.33	0.21	1.65	2.82	1.55	1.25	0.21	2.60	2.47
27	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.75	8.70	1.43	5.73	11.14	8.39	1.95	1.68	6.01	4.94	14.53	5.20	1.47	8.32	5.19	25.35	34.06	4.95	4.56	3.93	3.34	0.21	1.65	2.82	1.55	1.25	0.21	2.60	2.48
28	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.50	4.14	0.97	30.28	2.55	2.95	5.25	7.03	6.34	3.68	11.24	6.04	8.40	5.08	7.52	4.19	7.27	4.00	9.07	32.42	4.08	5.06	3.66	5.98	2.07	7.83	1.49	5.38	0.81
29	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.05	0.17	2.96	0.00	4.68	2.50	0.95	3.18	1.04	3.44	1.33	0.80	2.19	6.64	1.28	4.53	0.20	6.60	9.13	0.59	0.37	0.00	5.55	0.15	0.97	0.19	0.68	1.86
30	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.41	1.64	0.00	0.00	0.93	0.00	1.70	26.65	1.97	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.23
31	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.24	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00