Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LHX8	Gene	0	0.09	0.13	0.00	0.00	86.25	0.06	0.21	0.00	0.36	0.03	0.00	3.39	0.05	0.08	27.33	11.00	4.23	3.59	0.00	0.00	5.12	0.00	0.53	0.00	2.56	154.21	0.08	4.79	0.00
2	294638	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00
3	356261	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	132.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	6.80	5.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	55.70	0.00	1.54	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.03	0.00	0.00	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	6.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	30.86	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.45	3.66	0.08	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	20.51	0.00	0.00	0.00
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.45	3.67	0.08	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	20.52	0.00	0.00	0.00
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	12.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.70	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.79	7.41	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.46	64.24	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	129.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	27.59	0.00	6.87	0.00
14	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	208.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	5.83	11.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	64.42	0.00	0.78	0.00
15	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	56.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	46.99	0.00	2.29	0.00
16	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	12.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	37.08	0.00	0.00	0.00
17	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	33.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	8.05	1.22	0.31	1.13	0.00	0.00	0.39	0.00	1.02	0.00	1.54	78.60	0.00	4.65	0.00
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	17.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.31	0.00	0.00	24.91	5.51	1.31	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	139.64	0.00	5.84	0.00
19	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00
20	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.83	0.00	0.00	0.00
21	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	53.69	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	3.24	0.00	0.29	19.88	7.59	1.16	5.37	0.00	0.00	0.46	0.00	1.19	0.00	3.20	156.24	0.00	6.19	0.00
22	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.70	0.00	2.29	0.00
23	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	145.16	0.00	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00	6.93	0.00	0.00	41.86	3.44	3.51	19.01	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00	198.95	0.00	7.41	0.00
24	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
25	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	202.77	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	29.89	12.90	2.91	5.82	0.00	0.00	5.31	0.00	1.35	0.00	5.72	237.69	0.00	4.85	0.00
26	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00
27	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	218.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.01	0.00	0.00	9.97	7.27	2.97	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	1.92	0.00	9.02	241.35	0.00	7.73	0.00
28	E6a_E8a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.79	0.00	0.00	0.00
29	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	151.48	0.32	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	6.51	0.00	0.21	30.99	18.23	4.02	6.83	0.00	0.00	6.83	0.00	1.32	0.00	6.80	299.45	0.25	10.64	0.00
30	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	308.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.81	0.00	0.00	16.14	3.60	10.13	9.25	0.00	0.00	10.63	0.00	0.00	0.00	5.53	275.38	2.53	0.00	0.00
31	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	194.47	0.67	0.99	0.00	1.19	0.71	0.00	11.24	0.49	0.50	56.81	20.22	13.91	5.51	0.00	0.00	17.43	0.00	1.77	0.00	5.31	513.65	0.37	17.04	0.00
32	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	176.55	0.00	0.00	0.00	4.63	0.00	0.00	10.33	1.37	0.84	33.69	37.71	13.55	5.39	0.00	0.00	14.80	0.00	0.00	0.00	10.34	687.23	0.00	18.92	0.00
33	E8a_E10a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.01	0.00	0.00	0.00
34	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	144.10	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	5.72	0.16	0.42	34.13	19.67	11.63	3.70	0.00	0.00	9.14	0.00	0.96	0.00	6.89	507.26	0.84	9.49	0.00
35	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	109.94	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	5.66	0.00	1.02	82.32	7.50	11.82	4.62	0.00	0.00	7.30	0.00	0.00	0.00	3.49	521.62	0.00	10.60	0.00
36	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	206.08	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	6.73	0.36	0.00	30.47	24.08	10.36	5.34	0.00	0.00	12.77	0.00	0.50	0.00	6.29	439.45	0.07	13.34	0.00
37	E10_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	22.62	0.00	0.00	0.00
38	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	271.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.05	0.00	0.00	35.88	19.81	13.39	0.00	0.00	0.00	9.71	0.00	0.00	0.00	3.60	632.00	0.00	8.85	0.00
39	I10	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	5.35	2.48	0.34	0.65	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.57	12.79	0.00	0.18	0.00
40	I10_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	3.04	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	5.35	2.49	0.34	0.65	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.57	12.81	0.00	0.18	0.00
41	E11_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	17.74	2.75	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	40.60	0.00	0.00	0.00
42	ER11a	ExonRegion	0	0.31	0.46	0.00	0.00	74.76	0.00	0.14	0.00	0.49	0.00	0.00	3.58	0.00	0.00	52.07	14.79	5.44	5.17	0.00	0.00	7.28	0.00	0.26	0.00	1.45	83.06	0.00	3.05	0.00