Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GIPC2	Gene	0	0.69	3.18	1.03	1.93	2.07	2.22	2.20	0.38	1.37	3.00	2.43	1.24	1.52	0.91	10.99	1.85	1.67	0.84	1.56	1.52	1.12	0.79	2.09	116.66	1.32	1.31	3.76	3.79	0.99
2	476882	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	370759	Transcript	0	1.42	4.74	2.67	5.86	2.95	2.15	1.79	0.37	0.99	5.45	3.44	1.87	1.93	1.19	15.12	3.54	2.26	1.38	6.39	1.96	0.78	2.83	5.62	172.69	3.36	2.70	2.65	6.55	1.12
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	5.04	0.63	2.30	2.81	0.96	4.04	0.79	2.89	4.61	6.23	1.40	2.78	1.52	1.51	6.68	3.76	5.86	5.16	4.39	3.63	4.48	0.00	1.06	3.38	0.00	2.16	3.95	4.48	0.53
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.60	2.31	0.75	0.00	4.24	0.00	0.00	0.00	0.92	2.35	0.00	0.87	1.01	0.00	2.90	2.91	0.93	0.00	2.51	0.52	1.80	0.00	0.00	1.75	0.00	0.00	8.21	0.00	2.29
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.13	1.20	2.92	4.30	1.58	4.29	1.21	2.64	5.10	6.85	2.14	3.19	0.84	1.80	8.76	3.13	4.33	7.32	5.75	6.68	4.56	0.00	1.08	4.33	0.00	1.74	4.09	2.44	0.88
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	2.24	0.00	0.00	6.42	0.00	5.52	5.24	2.65	0.00	4.95	0.00	1.66	11.20	1.27	6.68	1.36	4.53	8.43	0.00	0.00	0.00	3.59	0.00	2.10	3.66	5.43	0.00
10	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.56	0.00	2.25	2.61	0.00	4.63	0.73	3.52	5.06	6.85	1.30	2.84	2.12	1.63	6.04	4.46	7.78	5.09	3.98	2.23	5.20	0.00	1.32	3.15	0.00	2.86	3.11	6.60	0.00
11	Ix	Intron	0	3.93	6.00	0.88	0.94	2.56	7.47	1.72	0.72	4.59	5.48	1.48	4.32	1.82	1.89	6.37	3.11	6.65	7.23	7.32	5.67	3.64	0.24	0.71	3.10	1.12	1.23	1.92	3.52	0.26
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.68	4.30	0.45	0.00	1.32	6.75	1.30	0.74	3.40	4.73	1.62	3.78	1.41	2.00	6.71	4.33	5.03	8.22	10.07	5.69	2.82	0.24	0.24	3.11	0.60	0.87	0.98	2.61	0.27
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.40	8.03	1.11	1.18	4.18	9.03	2.37	0.30	5.98	5.98	1.67	5.55	1.96	1.69	6.19	2.07	9.58	5.86	4.39	6.76	4.99	0.30	0.87	3.24	1.84	1.51	3.53	4.15	0.33
14	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.39	6.19	1.92	4.25	2.20	5.05	1.20	2.18	4.81	7.02	0.18	2.24	3.14	2.13	5.47	1.47	3.23	7.77	5.68	1.63	2.44	0.00	2.21	2.55	0.85	1.86	0.26	5.31	0.00
15	Ix	Intron	0	3.03	3.62	0.71	3.81	1.61	4.75	0.95	1.57	3.60	4.40	1.47	2.51	1.04	1.41	4.30	3.73	4.96	2.85	3.61	3.71	2.95	0.26	0.45	1.87	1.20	0.71	1.63	3.32	0.72
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.87	4.70	0.62	4.09	1.47	5.03	0.61	0.56	3.16	3.54	0.76	1.14	0.63	0.77	2.47	2.95	3.21	2.12	3.11	4.06	2.11	0.06	0.42	1.80	0.38	0.74	1.60	2.19	0.74
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.68	2.84	0.00	1.16	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.39	0.00	0.35	0.00	1.21	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	1.96	0.00	0.29	0.00	1.00	0.00
18	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.50	0.50	0.11	6.78	0.00	4.27	1.10	0.71	2.20	4.03	1.03	1.96	0.25	1.35	1.05	3.18	2.65	3.39	1.25	1.18	2.27	0.00	0.22	0.50	0.56	0.56	1.07	1.32	0.06
19	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.83	2.77	0.68	2.80	1.71	4.96	0.75	2.14	2.53	4.97	2.07	3.30	0.86	1.74	4.04	4.24	5.54	2.91	3.94	3.08	3.44	0.33	0.45	1.11	1.19	0.45	1.17	3.22	0.39
20	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.83	4.18	0.38	2.44	2.22	4.86	0.69	2.19	8.01	4.97	0.97	2.52	3.38	1.97	7.08	5.41	7.38	4.75	6.17	8.22	4.81	0.00	0.00	5.08	2.03	0.71	3.33	6.54	0.68
21	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	2.52	5.67	1.80	7.72	1.91	3.23	3.16	1.80	7.19	4.10	1.51	3.20	1.59	1.28	10.45	2.67	6.72	3.05	2.81	3.36	2.09	0.88	1.06	3.58	3.36	2.00	2.87	5.58	2.61
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.88	4.32	1.16	6.28	2.04	3.64	1.29	2.43	12.05	3.23	1.04	1.61	1.30	1.50	6.26	5.33	5.83	2.74	6.39	4.11	2.80	0.94	0.79	2.90	1.45	1.03	1.16	2.96	0.96
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.87	11.35	0.16	1.94	3.19	5.54	2.87	1.09	10.02	3.49	2.57	4.51	1.33	2.36	11.74	4.05	11.70	3.84	5.73	1.61	2.10	1.00	0.63	2.04	0.39	0.48	1.40	3.98	0.77
24	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.77	0.75	1.21	0.00	3.98	0.64	0.59	2.56	0.28	0.40	0.83	0.00	0.40	6.23	2.52	2.43	0.65	1.71	2.33	3.11	0.00	0.61	1.09	0.79	0.44	1.50	0.55	0.00
25	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.49	0.42	0.63	0.52	0.35	2.66	0.01	0.38	1.22	1.67	0.52	1.29	0.49	0.36	2.52	2.57	2.30	0.99	1.29	1.31	1.49	0.20	0.00	0.31	0.85	0.48	0.21	0.41	0.29
26	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.90	0.00	4.42	0.00	0.29	0.00	0.92	0.66	3.32	0.00	0.00	2.40	1.65	1.85	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.15	0.34	0.00	3.72	0.50	3.94	0.05	0.00	0.75	1.19	0.09	0.82	0.00	0.56	0.00	5.18	1.80	0.40	0.33	2.19	1.52	0.19	0.00	0.28	0.73	0.18	0.00	0.00	0.00
28	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	1.43	10.47	1.13	8.75	2.60	4.03	1.79	0.82	5.62	0.77	0.53	0.44	1.09	1.69	7.75	7.64	2.98	2.46	5.29	10.51	2.04	12.17	0.16	4.40	2.03	0.56	0.00	2.39	0.36
29	Ix_SR6	SilentIntronRegion	0	2.56	1.11	2.07	0.00	0.00	1.28	0.00	0.84	0.19	0.00	0.00	0.89	0.00	0.82	5.97	5.82	0.84	2.88	5.88	0.21	0.63	0.00	0.00	0.92	0.68	0.00	2.62	1.31	0.00
30	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	3.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	2.69	2.13	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.84	5.28	0.00	0.00	0.00	2.27	1.40	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.26	1.22	0.00	0.50	0.00	0.20	1.77	2.88	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	1.91	0.00
32	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.19	2.69	0.57	1.00	0.68	1.42	0.28	0.02	0.00	1.35	0.17	0.39	0.27	0.40	0.77	1.49	3.48	0.46	1.08	4.98	1.61	0.31	0.37	1.39	0.33	0.66	0.00	1.10	0.00
33	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.49	2.25	0.30	1.68	1.52	1.38	0.47	0.52	2.17	1.06	0.37	0.58	0.17	0.81	2.30	1.80	1.70	1.06	2.16	4.83	1.06	0.14	0.24	1.25	0.65	0.45	0.14	0.55	0.19
34	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.28	4.50	0.43	3.05	1.25	7.35	2.40	0.78	6.47	3.80	2.32	1.83	3.02	2.57	11.16	2.32	1.52	3.49	3.80	6.53	7.40	0.61	4.00	22.85	0.97	0.53	8.41	0.42	2.89
35	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.43	5.73	0.45	1.24	0.32	3.21	1.25	2.19	0.68	2.33	1.27	1.63	0.94	1.50	3.09	0.99	1.89	1.79	1.01	0.99	2.59	0.24	1.55	10.95	2.56	0.76	2.39	0.76	0.75
36	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.60	3.31	0.24	3.41	0.00	3.05	0.75	1.82	1.00	2.78	0.99	0.62	0.46	1.08	5.62	2.79	2.71	2.76	1.91	2.11	4.13	0.00	1.28	16.12	2.22	1.92	4.97	0.46	3.85
37	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.66	2.78	0.40	1.37	0.93	2.12	0.57	0.52	2.16	2.09	0.76	0.51	0.77	1.29	7.42	1.48	0.96	1.13	1.06	2.26	3.62	0.51	0.77	8.53	1.70	0.82	2.65	0.54	1.33
38	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	4.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.43	1.66	0.46	0.00	0.51	0.00	0.00	0.95	1.14	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	5.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.21	0.32	0.17	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.14	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.36	2.81	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00
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42	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.06	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	1.40	0.00	4.27	1.27	0.00	0.00	0.00	3.82	1.37	0.00	0.00	4.13	1.93	0.00	2.31	63.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	E2a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	4.38	1.89	8.67	0.00
45	ER3a	ExonRegion	0	0.59	4.95	3.51	2.44	1.34	3.13	1.97	0.00	1.87	4.15	4.38	1.75	2.41	1.12	15.18	1.73	3.09	1.39	3.09	2.27	1.04	0.70	4.29	153.71	2.44	3.45	16.87	4.02	0.00
46	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	9.50	0.97	21.57	0.00	3.34	4.81	0.00	1.40	7.75	5.44	3.22	2.83	0.00	24.72	0.00	0.97	4.62	8.09	0.00	2.05	2.48	4.53	148.52	4.81	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E3a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.95	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	ER5a	ExonRegion	0	2.42	8.78	2.11	7.60	1.02	3.75	1.57	1.01	1.37	6.41	2.97	2.69	1.53	1.42	11.60	1.62	2.89	2.37	4.30	0.78	0.40	3.38	5.68	168.85	3.70	2.28	6.72	4.79	0.76
52	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	3.59	3.76	0.00	6.48	1.46	2.75	0.00	1.16	9.03	1.61	1.23	0.00	3.50	35.28	3.44	0.00	0.00	16.18	0.00	0.00	8.46	2.51	223.17	1.93	1.67	7.60	3.68	0.00
53	ER6a	ExonRegion	0	2.00	7.40	6.07	1.37	0.61	2.71	0.64	0.05	1.09	6.58	3.14	2.64	1.44	1.88	18.53	4.54	2.97	0.33	4.36	2.05	0.68	2.80	9.02	210.19	3.67	8.12	6.45	13.73	3.25
54	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	E6a_E7a	KnownJunction	0	6.02	8.14	1.97	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	5.35	7.43	3.61	3.06	1.13	17.94	7.50	6.39	4.62	16.18	4.13	0.00	4.57	13.94	212.05	11.44	5.75	0.00	9.12	1.68
56	E6a_E8a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER7a	ExonRegion	0	2.72	6.69	3.26	4.01	3.89	0.65	2.38	2.29	0.22	11.94	4.02	2.16	4.31	1.80	14.27	4.60	4.03	0.77	4.64	1.10	0.89	3.43	8.93	274.82	4.88	7.72	2.28	16.40	0.92
58	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.67	9.92	14.44	5.06	2.40	0.00	0.00	3.95	2.53	0.00	3.89	1.11	15.95	7.27	2.23	0.00	8.09	3.39	0.00	2.24	7.24	275.15	1.86	0.00	0.00	13.25	3.10
59	ER8a	ExonRegion	0	0.53	3.03	0.57	1.62	2.50	2.48	2.63	0.39	1.62	2.81	2.62	1.16	1.59	0.96	12.38	1.96	1.69	0.86	1.28	1.42	1.33	0.57	1.61	121.26	1.14	0.84	3.40	3.57	1.13