Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-43E13.1	Gene	0	3.45	1.30	2.69	5.05	7.86	3.60	5.88	2.59	2.93	2.90	0.72	1.86	2.02	3.05	5.37	6.32	3.60	3.94	4.50	24.33	1.72	3.26	2.73	2.16	3.59	3.00	1.11	4.92	1.48
2	437898	Transcript	0	8.44	3.26	5.33	11.45	14.18	4.60	11.44	5.68	4.31	4.97	1.62	2.25	3.79	6.40	11.76	10.84	6.23	7.53	6.19	45.27	1.01	6.61	5.11	2.44	2.58	4.82	2.20	12.15	2.91
3	IG4	Intergenic	0	4.39	0.73	2.66	14.69	3.34	1.25	9.18	2.52	2.05	2.63	1.08	4.07	0.74	3.29	1.05	9.60	4.42	6.29	2.91	13.63	0.32	2.05	6.18	0.98	1.63	6.08	0.83	6.31	2.13
4	IG4_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	IG4_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	5.57	1.05	3.80	20.96	4.76	1.79	13.04	3.59	2.91	3.73	1.55	5.81	1.05	4.63	1.50	13.70	6.20	8.97	4.15	19.44	0.46	2.93	8.53	1.40	2.32	8.68	1.19	8.99	3.03
6	ER1a	ExonRegion	0	13.81	4.79	4.56	23.80	21.78	8.95	25.42	13.32	7.98	4.80	1.27	2.24	5.24	6.50	14.81	13.73	5.59	15.54	6.21	50.59	1.23	9.41	8.98	2.37	2.54	10.23	6.15	30.28	4.28
7	E1_Da	NovelBoundary	0	59.58	4.85	14.03	116.04	56.89	60.05	61.68	90.28	16.96	29.72	0.00	5.30	7.99	40.86	71.95	40.39	44.25	29.28	0.00	15.05	12.31	23.73	4.58	15.97	22.77	0.00	0.00	23.90	4.99
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	9.44	4.17	8.99	7.98	14.74	1.96	5.61	2.54	2.68	7.47	2.94	2.68	4.52	10.10	16.34	13.46	9.75	4.62	8.09	64.34	0.00	7.97	4.43	2.81	1.48	2.19	0.00	4.58	3.33
9	I1	Intron	0	10.48	15.01	4.01	16.84	7.52	15.12	18.63	12.53	15.97	13.23	5.68	7.04	5.72	12.58	19.21	14.18	23.20	11.95	12.26	10.84	9.47	2.10	2.46	12.04	6.31	3.98	3.64	10.57	3.09
10	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	15.10	18.34	4.22	22.94	10.03	19.06	27.30	18.42	17.94	15.60	4.82	7.96	5.36	16.94	26.25	19.38	31.29	16.92	15.17	14.54	9.80	2.43	2.14	12.47	6.33	3.26	3.27	10.97	2.42
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.24	2.43	2.14	0.00	0.79	5.45	3.50	0.00	7.61	4.23	1.16	5.79	0.30	3.54	2.48	4.23	13.36	1.12	6.33	1.09	4.00	0.00	0.23	5.30	2.19	0.11	2.41	1.80	1.86
12	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.39	5.88	1.22	2.46	1.98	6.30	1.21	0.47	5.22	4.95	4.20	2.97	3.33	3.80	1.73	3.25	7.81	1.54	4.27	3.07	3.90	1.38	1.39	5.85	5.56	1.47	1.41	4.59	1.57
13	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.37	5.36	2.36	9.19	3.74	9.16	2.32	2.12	11.42	7.77	4.11	7.10	5.14	5.26	7.46	7.31	6.31	3.00	7.78	3.79	6.58	1.39	1.85	10.20	2.75	5.24	1.17	6.06	3.76
14	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	3.70	20.63	9.61	10.30	4.91	11.06	8.11	5.55	27.20	18.67	17.28	7.62	14.32	6.69	15.74	5.60	12.87	6.73	11.47	7.87	21.09	2.33	7.79	23.18	12.53	12.87	13.16	25.06	9.98
15	Ix	Intron	0	3.58	1.68	1.78	2.18	0.74	2.92	1.22	1.68	1.96	3.50	3.25	1.88	0.79	2.41	0.00	1.88	8.84	4.73	2.91	1.25	2.17	1.09	0.27	2.94	4.77	2.15	1.95	3.95	0.20
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.59	1.69	1.78	2.18	0.74	2.93	1.23	1.68	1.97	3.51	3.26	1.88	0.79	2.42	0.00	1.89	8.86	4.74	2.92	1.26	2.17	1.10	0.28	2.95	4.78	2.15	1.95	3.97	0.20
17	Ix	Intron	0	4.65	4.12	1.81	3.89	0.00	1.49	2.19	3.50	2.74	3.92	2.58	2.18	0.00	3.32	5.72	5.20	1.62	1.57	0.00	0.54	3.10	0.98	0.49	1.17	1.55	0.85	0.99	1.33	0.00
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.69	4.17	1.83	3.93	0.00	1.51	2.21	3.53	2.77	3.95	2.61	2.19	0.00	3.36	5.78	5.25	1.64	1.58	0.00	0.54	3.13	0.99	0.50	1.18	1.57	0.86	1.00	1.34	0.00
19	Ix	Intron	0	2.61	1.65	0.64	0.00	1.25	2.73	0.78	0.83	2.70	2.41	1.60	1.62	0.62	0.76	1.94	2.02	2.39	1.67	2.46	1.82	2.84	0.69	0.35	1.79	0.37	0.20	0.47	1.88	1.16
20	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.62	1.66	0.65	0.00	1.26	2.74	0.78	0.83	2.71	2.41	1.61	1.63	0.63	0.76	1.95	2.03	2.40	1.67	2.46	1.83	2.84	0.70	0.35	1.80	0.37	0.20	0.47	1.89	1.16
21	Ix	Intron	0	5.75	4.10	1.46	3.13	3.65	2.57	4.27	7.58	8.07	6.57	3.86	1.96	0.65	2.37	3.56	1.97	5.03	4.34	5.58	9.08	4.71	4.95	3.95	1.88	1.43	2.16	0.91	7.42	0.00
22	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.97	1.49	2.06	2.21	1.50	2.33	1.86	1.70	4.66	6.45	0.92	1.52	0.40	1.33	4.40	0.00	2.99	1.78	4.92	4.55	4.84	1.11	0.84	1.33	0.22	1.45	0.56	2.51	0.00
23	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.22	5.81	1.33	2.08	6.23	2.85	7.39	13.20	11.16	9.35	5.99	2.36	0.72	3.89	2.71	3.81	8.09	9.26	7.13	15.27	4.32	9.19	5.85	2.03	1.14	2.76	1.75	12.75	0.00
24	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.76	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	1.06	1.01	0.00	0.00	0.00	4.52	0.39	0.00	0.00	0.00	2.16	0.00	0.00	2.50	0.33	0.00	0.00	0.00	2.95	0.00
25	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.61	2.46	0.00	2.74	0.00	0.00	1.26	1.15	3.09	0.00	0.15	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	1.07	4.96	0.00	0.54	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	5.57	9.32	0.93	9.62	5.14	3.78	4.84	12.41	12.66	2.13	9.40	2.12	1.43	2.28	1.10	3.52	4.74	0.00	5.36	7.30	7.46	6.51	9.63	3.74	6.99	2.97	0.00	11.53	0.00
27	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	6.20	2.77	0.00	4.81	0.66	1.92	1.49	6.69	6.92	0.65	1.13	3.97	0.89	0.91	9.73	1.47	2.48	0.00	4.17	8.21	4.65	2.37	3.38	2.26	2.14	3.35	0.00	0.51	0.00
28	Ix	Intron	0	5.52	7.19	2.58	3.69	1.68	3.07	6.58	6.32	9.64	4.46	4.09	3.18	1.56	3.11	4.41	1.89	11.03	4.63	4.39	9.54	2.94	7.12	4.35	7.39	2.45	2.97	5.35	12.04	1.83
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.56	7.24	2.60	3.72	1.69	3.09	6.62	6.37	9.70	4.49	4.11	3.20	1.57	3.13	4.44	1.90	11.10	4.66	4.42	9.60	2.96	7.17	4.38	7.44	2.47	2.99	5.38	12.12	1.85
30	Ix	Intron	0	2.15	5.51	1.42	5.54	1.51	3.29	3.27	1.99	5.20	7.03	5.15	2.76	0.55	2.86	5.69	3.92	5.76	5.21	5.92	3.23	4.19	0.98	0.98	4.65	2.43	1.70	1.13	5.79	0.72
31	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.33	4.05	2.23	3.89	0.00	3.73	4.37	4.00	8.56	9.96	7.01	2.33	0.88	2.08	10.72	5.68	4.84	7.24	5.20	4.60	4.60	1.47	1.87	2.33	2.26	0.00	1.99	7.08	0.00
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.09	6.12	1.10	6.22	2.12	3.13	2.84	1.20	3.87	5.89	4.42	2.94	0.42	3.19	3.69	3.23	6.16	4.42	6.24	2.69	4.04	0.78	0.63	5.60	2.51	2.39	0.79	5.31	1.01
33	Ix	Intron	0	2.70	0.73	1.05	0.00	0.00	0.43	1.27	0.00	1.59	4.55	1.87	0.58	0.00	2.28	0.00	0.78	1.41	0.61	0.00	0.87	2.69	1.70	2.28	1.35	0.45	0.49	0.00	4.11	0.42
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.72	0.74	1.07	0.00	0.00	0.44	1.29	0.00	1.61	4.60	1.90	0.59	0.00	2.31	0.00	0.79	1.43	0.61	0.00	0.88	2.73	1.72	2.31	1.37	0.46	0.50	0.00	4.16	0.43
35	Ix	Intron	0	2.22	0.74	0.64	1.10	0.56	1.63	2.63	0.56	3.05	3.32	1.50	1.37	0.40	1.78	3.91	1.68	3.14	1.33	2.08	2.22	2.62	0.62	0.76	2.31	1.86	2.47	0.14	3.06	0.61
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.45	0.61	1.06	1.37	0.93	1.84	2.95	0.23	3.46	3.81	1.82	1.84	0.41	1.86	5.03	1.49	4.06	1.47	2.64	2.48	3.35	0.80	1.26	2.88	2.19	2.50	0.23	4.14	0.85
37	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.05	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	1.12	2.89	1.19	0.96	0.00	2.72	9.96	2.53	6.01	1.52	0.00	8.43	6.66	0.00	0.00	2.15	1.43	0.35	0.00	4.35	0.00
38	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.75	0.95	0.00	0.71	0.00	1.32	2.18	1.09	2.46	2.58	1.03	0.65	0.38	1.65	2.10	1.98	1.69	1.11	1.26	1.71	1.43	0.35	0.00	1.44	1.37	2.47	0.00	1.38	0.26
39	Ix	Intron	0	0.61	2.17	0.48	0.00	0.69	0.98	0.00	0.52	3.03	2.26	1.35	0.96	1.84	1.03	3.65	2.37	4.03	0.87	0.91	0.67	2.23	0.26	0.77	2.75	1.02	0.89	1.56	2.78	0.86
40	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.61	2.18	0.48	0.00	0.70	0.98	0.00	0.53	3.04	2.27	1.36	0.97	1.85	1.04	3.67	2.38	4.05	0.87	0.91	0.68	2.24	0.26	0.77	2.77	1.02	0.90	1.57	2.79	0.86
41	Ix	Intron	0	1.63	1.53	1.11	1.36	0.93	2.49	0.96	2.80	3.73	4.95	2.15	2.52	0.43	2.45	4.45	4.35	5.68	1.68	3.04	2.10	2.71	1.72	0.00	0.82	1.90	0.75	0.52	3.26	0.00
42	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.64	1.54	1.12	1.37	0.93	2.49	0.96	2.81	3.75	4.96	2.16	2.53	0.43	2.46	4.47	4.37	5.70	1.69	3.05	2.11	2.72	1.72	0.00	0.82	1.91	0.75	0.52	3.27	0.00
43	E2_Aa	NovelBoundary	0	6.02	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	2.04	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	2.98	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	ER2a	ExonRegion	0	2.09	0.84	2.44	2.58	6.03	2.89	3.31	1.18	2.27	2.66	0.65	1.81	1.59	2.59	4.13	5.34	3.34	2.41	4.27	20.87	1.79	2.45	1.91	2.14	3.73	2.05	0.44	1.58	1.11