Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-108M9.2	Gene	0	0.07	0.00	0.06	0.49	0.00	0.38	0.07	0.22	0.36	0.25	0.10	0.16	0.20	0.33	1.85	0.55	1.90	0.53	0.44	0.00	0.17	0.84	1.71	4.63	0.52	0.22	0.00	1.18	0.75
2	438002	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.09	0.11	0.83	0.34	0.75	0.41	0.31	0.00	0.11	0.38	1.06	2.35	0.33	0.18	0.00	0.44	0.13
3	451828	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.57	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.79	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58
4	453554	Transcript	0	0.15	0.00	0.23	0.50	0.00	0.00	0.14	0.26	1.06	0.30	0.33	0.52	0.00	0.41	1.42	0.35	2.72	0.00	0.22	0.00	0.30	0.13	0.38	0.75	0.50	0.00	0.00	1.03	0.61
5	457856	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.18	0.21	1.66	0.69	1.51	0.82	0.62	0.00	0.22	0.77	2.12	4.71	0.67	0.37	0.00	0.89	0.26
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	3.78	11.54	0.00	0.00	5.68	5.72	2.49	8.83	9.47	1.52	3.04	4.68	12.70	38.07	10.40	14.90	0.00	0.00	0.00	3.73	6.13	11.72	26.08	7.24	8.33	2.09	0.00	7.10
8	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.90	0.00	5.60	0.00	1.00	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	3.55	10.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	2.44	0.00	0.39	0.00	3.26	3.06	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	4.82	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00
11	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	16.15	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.28	0.20	0.00	0.13	1.46	0.37	0.00	0.00	0.00	1.32	0.98	2.90	0.42	0.12	0.00	1.05	0.64
14	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00
15	ER1e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	3.28	0.95
16	E1_Db	KnownBoundary	0	5.01	0.00	11.44	0.00	0.00	3.26	0.00	10.30	10.23	8.59	5.73	1.39	9.43	9.75	24.91	13.00	27.44	0.00	0.00	0.00	4.85	23.63	18.81	10.47	9.62	1.76	0.00	10.06	7.96
17	E1b_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER1f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04
19	E1_Dc	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E1c_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER1g	ExonRegion	0	0.30	0.00	0.47	1.00	0.00	0.00	0.28	0.52	2.11	0.61	0.67	1.03	0.00	0.82	2.83	0.70	5.44	0.00	0.45	0.00	0.60	0.25	0.76	1.51	1.00	0.00	0.00	2.06	1.22
22	E1d_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	9.49	0.00	0.00	0.00	0.00	3.78	0.00	0.00	3.73	0.00	1.26	7.77	0.00	17.29	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	5.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	1.14	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17
25	ER2b	ExonRegion	0	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.32	1.45	0.89	0.23	0.19	0.27	0.00	0.68	5.78	1.07	0.98	0.00	0.80	0.00	0.00	1.45	2.72	12.56	0.00	0.25	0.00	1.81	2.59
26	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	4.06	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	9.35	7.51	0.00	2.83	1.72	2.22	7.77	0.00	16.57	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	10.59	0.00	3.99	0.00	0.00	1.55
27	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	2.92	0.00	13.58	3.91	0.00	1.54	1.59	3.35	0.00	0.00	10.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.43	8.85	1.86	2.15	0.00	2.29	6.90
28	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	16.80	0.00	3.01	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	5.42	10.76	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24
29	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	5.92	0.00	0.34	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	4.70	5.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65
30	ER2e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00