Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-37C10.1	Gene	0	0.17	0.00	0.13	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.09	0.12	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.20	0.96	0.62	0.51	0.22	0.11	0.29	0.14	0.52	0.00	0.00	0.00	0.39	0.16
2	446261	Transcript	0	0.19	0.00	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.09	0.45	0.29	0.24	0.10	0.05	0.14	0.07	0.25	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08
3	ER1a	ExonRegion	0	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00	1.99	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00
7	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.84	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.72	3.96	1.12	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	1.08	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00
8	Ix	Intron	0	1.32	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	0.00	1.83	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.35	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.90	0.00	1.87	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	1.51	0.65	0.00	1.11	0.00	1.52	0.00	0.00	1.00	2.66	3.57	1.06	0.96	0.00	0.00	2.89	1.60	1.76	0.00	2.19	0.30
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	1.53	0.65	0.00	1.12	0.00	1.54	0.00	0.00	1.02	2.69	3.62	1.07	0.97	0.00	0.00	2.91	1.62	1.78	0.00	2.22	0.30
12	Ix	Intron	0	3.50	1.71	1.36	3.73	1.44	2.25	0.15	1.09	6.54	2.36	0.71	1.97	2.07	2.02	4.09	3.03	9.09	4.43	3.56	0.20	1.59	1.34	1.21	5.43	1.38	2.68	0.00	4.72	1.39
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.16	0.00	0.00	5.22	1.16	2.67	0.00	0.45	2.99	1.75	0.29	0.60	1.10	0.66	4.91	2.41	7.25	5.15	1.55	0.00	2.42	0.88	0.44	3.13	0.69	0.00	0.00	1.98	1.46
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.22	2.47	1.97	3.07	1.57	2.06	0.22	1.38	8.11	2.63	0.89	2.58	2.50	2.62	3.74	3.31	9.91	4.13	4.45	0.30	1.22	1.55	1.55	6.45	1.68	3.87	0.00	5.94	1.36
15	Ix	Intron	0	1.86	1.73	1.69	0.00	0.00	1.79	0.00	0.80	0.81	1.67	0.34	1.25	0.19	1.05	2.92	0.98	4.31	1.67	4.15	0.40	1.44	1.30	0.00	1.86	1.45	0.91	0.00	0.71	0.19
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.86	1.74	1.70	0.00	0.00	1.79	0.00	0.80	0.81	1.67	0.34	1.25	0.19	1.05	2.93	0.98	4.33	1.67	4.17	0.40	1.45	1.31	0.00	1.87	1.45	0.91	0.00	0.71	0.19
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.34	1.17	1.83	1.31	1.78	2.25	0.37	0.00	3.88	1.31	0.65	1.35	0.47	1.65	0.84	3.04	11.15	1.75	4.07	1.00	2.08	0.66	0.00	4.70	0.78	1.15	0.00	2.97	1.22
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	1.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	0.30	0.00	1.26	0.00
19	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.47	2.34	0.00	8.09	0.00	0.00	2.04	0.00	2.69	0.00	2.19	0.00	2.29	0.00
20	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.13	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.28	1.36	0.88	0.73	0.31	0.16	0.39	0.21	0.74	0.00	0.00	0.00	0.56	0.23