Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP3-476K8.1	Gene	0	3.72	2.84	0.81	3.43	0.47	1.86	0.78	0.53	2.92	5.71	1.61	1.13	1.25	1.87	4.89	1.37	6.76	7.27	6.78	1.06	2.89	1.04	1.22	3.32	2.76	2.73	0.71	1.41	0.13
2	423060	Transcript	0	1.59	1.54	0.31	2.51	0.15	0.97	0.32	0.17	1.56	2.89	0.91	0.53	0.50	0.98	2.76	0.83	2.98	3.57	4.38	0.51	1.81	0.39	0.61	1.84	1.22	1.32	0.44	0.45	0.04
3	ER1a	ExonRegion	0	5.58	1.90	1.45	3.11	1.06	1.49	1.31	1.20	2.59	7.21	0.77	1.87	2.11	2.35	7.01	1.46	9.44	10.14	5.55	1.20	1.55	1.93	1.18	2.84	3.74	5.12	0.00	3.18	0.29
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.89	7.66	2.77	31.49	0.00	3.72	0.00	0.00	1.46	1.88	0.00	1.23	4.94	1.02	0.00	0.00	4.88	14.64	0.00	0.00	3.69	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	16.82	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	3.95	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.51	0.00	8.09	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	7.34	0.51	1.39	4.65	0.00	5.35	0.37	3.07	3.27	7.62	0.88	1.65	0.90	3.22	5.02	3.94	10.50	6.60	5.91	1.79	4.88	0.33	2.18	1.59	2.38	0.15	1.19	3.92	0.62
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.24	0.00	2.65	0.00	0.76	0.91	2.39	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	3.06	2.17	3.21	4.09	0.68	0.70	0.00	1.24	1.20	0.37	0.00	0.00	0.35	0.34
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.25	0.66	1.80	5.94	0.00	6.15	0.48	3.75	3.97	9.16	1.14	2.14	1.16	3.86	6.49	4.21	12.95	7.60	6.46	2.11	6.11	0.43	2.45	1.71	2.97	0.19	1.53	4.97	0.70
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.78	3.78	1.30	0.00	0.00	5.14	0.00	2.24	3.26	15.38	0.00	3.07	3.95	6.71	0.00	3.82	22.31	9.25	0.00	3.56	9.59	0.00	4.04	0.00	1.82	2.15	0.00	6.69	1.68
11	ER2a	ExonRegion	0	3.56	6.03	0.70	3.87	0.00	4.06	0.00	0.00	4.90	6.75	4.01	0.78	1.35	2.30	0.00	1.05	8.67	8.05	8.04	1.16	3.68	0.80	2.27	6.31	4.78	0.00	3.09	0.00	0.00
12	E2_Da	NovelBoundary	0	18.40	4.75	1.22	10.14	0.00	10.97	2.69	7.27	2.62	12.38	3.10	0.00	4.11	4.92	9.97	9.18	10.47	9.25	0.00	3.23	15.40	0.00	4.92	0.00	1.78	0.00	0.00	2.29	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	5.87	2.85	2.07	3.97	0.32	3.32	1.51	3.42	5.73	6.68	2.06	2.19	1.01	3.07	6.48	4.10	12.84	6.84	4.06	2.32	5.62	1.06	1.24	6.10	2.75	1.95	0.24	3.14	1.68
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	6.17	1.82	0.60	1.72	0.00	1.65	1.69	4.86	2.22	5.02	1.29	1.92	0.39	2.50	5.64	2.38	8.24	7.47	4.60	2.65	5.65	0.65	1.30	1.55	1.37	1.32	0.00	2.54	0.48
16	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.34	4.83	3.90	4.56	0.52	6.62	1.82	3.33	7.17	7.68	3.66	2.60	1.99	3.58	8.20	5.79	18.85	8.22	3.62	1.69	7.26	1.34	1.23	5.06	3.38	2.33	0.19	4.38	1.97
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.61	2.07	1.69	5.01	0.38	1.99	1.17	2.56	6.97	7.04	1.39	2.07	0.70	3.07	5.78	3.99	11.45	5.45	4.04	2.57	4.43	1.12	1.21	9.82	3.19	2.08	0.43	2.62	2.24
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.77	0.00	2.17	0.00	0.00	9.48	0.00	0.00	5.66	5.35	2.72	1.14	4.90	0.95	17.34	0.00	14.72	4.62	0.00	0.00	10.79	0.00	0.00	28.41	0.00	2.19	1.99	13.66	3.40
19	ER3a	ExonRegion	0	0.11	0.00	0.00	10.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	3.68	0.00	1.09	0.02	1.60	8.30	2.18	0.09	5.08	11.55	0.00	2.36	0.00	0.03	1.82	0.00	4.15	0.00	0.00	0.00
20	E3_Da	NovelBoundary	0	8.20	13.48	0.00	9.49	0.00	1.65	2.40	7.27	7.55	2.04	4.84	5.60	6.02	0.00	26.31	6.73	14.54	23.25	16.18	0.00	5.74	0.00	2.27	5.98	0.00	5.66	0.00	5.80	1.45
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	2.93	0.90	1.15	0.00	0.00	0.00	0.72	7.35	0.00	0.00	4.86	15.27	1.58	1.14	0.00	0.00	3.43	1.14	0.00	0.00	1.30	0.00
23	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	2.98	0.91	1.15	0.00	0.00	0.00	0.73	7.47	0.00	0.00	4.94	15.52	1.61	1.15	0.00	0.00	3.48	1.13	0.00	0.00	1.32	0.00
24	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	6.43	1.80	1.61	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	12.27	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	5.26	0.00	2.19	0.00	0.00	2.44
25	ER4a	ExonRegion	0	1.90	2.86	0.00	0.00	0.00	1.22	0.89	0.00	2.48	2.56	1.58	0.00	0.00	0.60	3.99	1.10	2.65	1.71	5.55	1.22	5.06	0.00	0.80	1.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00