Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 GRHL3 Gene 0 0.24 0.94 6.73 1.39 0.14 0.29 0.00 0.18 0.49 0.86 0.16 0.14 0.15 0.49 4.98 3.50 0.21 9.61 0.13 0.30 0.12 0.35 0.70 0.21 0.51 1.11 0.71 0.07 13.14 2 342072 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 361548 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 350501 Transcript 0 0.18 0.55 0.43 1.23 0.00 0.24 0.00 0.00 0.14 0.12 0.00 0.21 0.00 0.23 0.47 0.00 0.26 1.65 0.00 0.00 0.12 0.00 0.46 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.11 5 356046 Transcript 0 0.00 0.31 0.00 0.68 0.00 0.00 0.00 0.17 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.14 0.73 0.00 0.26 0.00 0.17 0.00 0.00 0.14 0.15 0.00 0.00 1.50 6 236255 Transcript 0 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 0.79 0.00 0.00 0.73 0.94 0.00 0.00 0.42 0.30 6.61 3.21 0.00 2.50 1.04 0.00 0.93 0.59 0.00 3.52 3.26 0.00 3.59 0.53 1.09 7 374413 Transcript 0 0.00 0.04 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.20 0.00 0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 8 461318 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 9 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.27 10 E1_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 3.09 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10.60 11 ER1b ExonRegion 0 1.55 0.00 1.73 7.78 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.68 0.00 9.23 0.00 1.00 0.00 1.96 0.05 0.00 0.52 1.71 0.68 0.59 8.41 12 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.19 0.00 0.00 1.68 13 E1a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 7.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.34 0.00 19.14 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.14 0.00 11.26 14 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 5.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.06 0.00 19.10 0.00 0.00 0.00 0.00 1.81 0.00 0.00 0.00 7.33 0.00 10.74 15 ER1d ExonRegion 0 0.00 0.92 0.00 2.04 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 2.20 0.00 0.79 0.00 0.51 0.00 0.00 0.41 0.45 0.00 0.00 1.25 16 E1_Db NovelBoundary 0 2.83 0.00 1.22 28.90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E1b_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.24 18 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 1.68 3.89 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.23 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 0.48 0.00 0.00 0.00 0.47 19 I1 Intron 0 1.23 0.74 5.07 13.53 1.68 1.10 2.19 1.05 1.09 3.22 0.61 0.35 0.63 0.65 1.16 2.72 1.45 6.81 1.10 0.47 0.57 1.44 1.96 0.86 1.14 1.53 0.31 0.56 1.15 20 I1_AR1 ActiveIntronRegion 0 1.34 0.60 5.53 12.99 1.83 1.20 2.39 1.15 1.12 3.42 0.59 0.38 0.69 0.65 1.26 2.97 1.58 6.71 1.20 0.52 0.62 1.46 1.92 0.94 1.07 1.67 0.23 0.61 1.17 21 I1_SR1 SilentIntronRegion 0 0.00 2.22 0.00 19.76 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 1.00 0.80 0.00 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 7.97 0.00 0.00 0.00 1.24 2.49 0.00 1.97 0.00 1.26 0.00 0.93 22 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 10.91 37.75 0.00 1.76 0.00 0.00 2.74 5.71 0.00 1.54 0.00 2.37 8.37 10.71 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 2.04 2.51 0.00 0.00 1.59 0.00 2.20 0.00 23 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.47 1.89 0.00 0.00 0.85 0.59 13.21 6.42 0.00 5.00 2.09 0.00 1.87 1.18 0.00 7.03 6.52 0.00 7.19 1.07 2.19 24 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 11.09 50.47 11.35 9.02 5.49 0.00 5.02 8.67 2.97 1.60 4.65 2.39 0.00 11.09 3.04 9.25 0.00 3.72 1.56 4.96 0.00 3.05 3.86 3.86 12.67 0.00 1.32 25 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.12 7.96 0.00 1.33 0.00 0.00 0.00 0.60 1.97 0.65 0.00 0.00 0.37 1.26 6.28 0.00 14.58 0.87 1.67 0.00 0.26 0.44 0.00 0.01 0.43 1.41 0.00 13.22 27 E3a_E4b KnownJunction 0 0.00 3.68 5.56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.89 0.00 14.26 0.00 4.05 0.00 2.48 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14.72 28 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.04 0.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.20 0.00 0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 29 E4_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 ER4b ExonRegion 0 1.69 3.34 4.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.02 0.00 0.00 0.00 1.37 3.86 0.54 0.85 13.96 0.00 2.81 0.00 0.68 1.39 0.00 0.02 1.29 0.81 0.00 11.97 31 E4_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 4.85 7.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.71 0.00 0.00 0.00 0.00 2.15 0.00 0.00 1.24 4.62 0.00 2.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.38 5.96 0.00 20.83 33 ER5a ExonRegion 0 1.03 2.18 7.50 0.00 0.72 0.06 0.00 0.54 0.17 1.35 0.70 0.08 0.00 1.06 3.53 3.71 0.29 15.78 0.47 0.58 0.42 1.33 0.02 0.00 0.84 3.16 0.67 0.00 16.34 34 E5a_E6a KnownJunction 0 2.48 0.00 10.29 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 1.63 0.00 1.37 0.00 2.91 0.00 23.12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.79 0.00 0.00 15.95 35 ER6a ExonRegion 0 1.16 1.60 10.25 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.53 0.62 0.58 0.89 0.00 1.16 11.50 3.80 0.00 13.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4.74 0.00 0.00 22.74 36 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 9.50 9.69 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 1.46 0.00 0.00 1.04 7.77 14.00 0.00 9.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13.57 37 ER7a ExonRegion 0 0.00 1.37 7.91 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.00 0.12 0.61 0.00 0.09 6.98 3.12 0.00 12.92 0.00 0.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12.30 38 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 5.06 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7.77 2.98 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.78 39 ER8a ExonRegion 0 0.00 1.91 13.08 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.66 0.00 0.56 0.00 0.97 5.85 5.29 0.00 8.38 0.00 0.13 0.00 0.00 1.00 0.00 1.02 2.55 0.03 0.00 17.68 40 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 4.46 15.05 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 17.54 0.00 0.00 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 1.93 8.63 0.00 0.00 13.11 41 ER9a ExonRegion 0 0.00 1.90 13.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.21 0.78 0.00 0.00 0.00 1.82 12.91 2.18 0.00 12.84 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 0.42 2.05 0.94 0.00 16.19 42 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 4.85 4.96 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.86 16.94 3.29 0.00 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18.52 43 ER10a ExonRegion 0 0.00 2.14 8.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.87 2.92 3.74 0.00 7.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 23.17 44 E10_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 12.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6.43 0.00 13.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.02 26.74 45 ER10b ExonRegion 0 0.00 1.98 11.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.66 1.30 0.06 0.00 0.59 1.00 5.40 5.02 0.00 8.57 0.00 0.00 0.00 0.00 2.32 0.61 0.03 1.42 0.76 0.00 16.11 46 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 4.75 13.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 9.97 9.10 0.00 9.25 0.00 0.00 0.00 0.00 1.92 2.99 0.00 0.00 0.00 0.00 12.81 47 ER11a ExonRegion 0 0.00 1.33 13.27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 0.68 0.00 2.09 0.94 1.77 3.40 0.00 13.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.52 0.89 0.00 0.09 1.05 20.56 48 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 18.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 0.00 0.00 9.25 0.00 0.00 0.00 2.38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25.62 49 ER12a ExonRegion 0 0.00 1.23 9.29 2.73 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.00 1.34 0.35 0.96 5.84 0.00 11.81 0.00 0.00 0.00 0.00 2.06 0.00 0.54 0.00 0.00 0.00 11.08 50 E12_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.12 0.00 7.97 10.48 0.00 13.87 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.82 0.00 0.00 0.00 7.96 52 ER12b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 1.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 53 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.37 0.00 0.00 2.45 0.00 3.04 7.74 0.00 8.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.00 0.00 11.47 54 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 8.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.67 0.00 5.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5.41 0.00 0.00 14.10 55 ER14a ExonRegion 0 0.00 1.85 10.11 8.22 0.00 0.36 0.00 0.00 0.00 3.36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.13 5.26 0.00 12.85 0.00 0.00 0.75 1.03 1.34 0.00 0.00 2.97 0.25 0.00 15.58 56 E14_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 9.47 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 0.00 1.72 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.52 0.00 4.62 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 3.43 0.00 0.00 16.70 58 ER15a ExonRegion 0 0.00 1.53 7.24 0.00 0.00 1.26 0.00 0.00 0.00 0.74 0.00 0.00 0.00 0.00 9.44 5.18 0.54 9.62 0.00 0.00 0.07 0.10 1.83 0.00 1.70 1.01 1.92 0.00 24.21 59 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 3.97 7.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16.74 2.83 3.83 27.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.93 0.00 0.00 33.44 60 ER16a ExonRegion 0 0.00 3.03 8.91 2.93 0.00 0.19 0.00 0.00 1.54 7.31 0.00 0.00 0.00 0.18 13.36 7.40 1.63 13.65 0.00 0.00 0.00 1.28 0.67 0.00 0.26 3.68 5.35 0.00 36.80 61 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 6.03 10.78 0.00 1.53 0.00 0.00 1.89 2.04 0.00 0.00 0.00 0.97 18.14 10.86 0.00 18.49 0.00 0.00 0.00 0.00 2.51 0.00 1.63 1.97 14.41 0.00 29.84 62 E16a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 63 ER17a ExonRegion 0 0.00 1.31 17.69 1.53 0.00 0.54 0.00 0.00 0.82 0.39 0.00 0.55 0.00 0.70 10.23 7.42 0.29 17.02 0.00 0.00 0.00 0.00 1.23 0.00 0.48 0.90 3.26 0.00 24.67 64 E17_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 14.18 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.95 1.56 0.00 0.00 0.00 0.00 24.72 6.50 7.99 18.49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 9.79 0.00 42.62 65 ER17b ExonRegion 0 0.00 0.02 8.38 1.76 0.00 0.76 0.00 0.34 0.94 0.79 0.15 0.11 0.00 0.39 8.77 3.94 0.24 10.92 0.00 0.00 0.00 0.11 1.11 0.13 0.35 0.97 0.37 0.00 18.70 66 ER17c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 67 Ix Intron 0 3.31 2.84 0.36 7.91 1.08 1.21 0.89 0.00 0.00 0.96 0.00 0.41 0.29 1.20 1.02 4.38 3.30 8.65 0.71 0.61 0.63 0.00 0.40 1.42 2.84 2.08 0.00 1.44 0.44 68 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 3.60 3.14 0.40 7.21 1.19 1.32 0.98 0.00 0.00 1.06 0.00 0.45 0.23 1.25 1.13 4.65 3.32 9.38 0.78 0.67 0.70 0.00 0.44 1.57 3.10 2.30 0.00 1.57 0.49 69 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.61 0.00 0.00 14.63 0.00 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 0.73 0.00 1.93 3.20 1.82 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.00 0.23 0.00 70 E18_Aa NovelBoundary 0 5.43 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.40 0.00 1.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3.05 1.78 1.80 0.00 0.00 0.00 71 ER18a ExonRegion 0 0.37 1.10 0.86 2.45 0.00 0.47 0.00 0.00 0.29 0.25 0.00 0.42 0.00 0.47 0.94 0.00 0.51 3.30 0.00 0.00 0.24 0.00 0.93 0.00 0.24 0.00 0.00 0.00 0.23