Summary page for 'GCDH' (ENSG00000105607) - Project: DLBCL_ABC_GCB
Basic Gene Stats
Species: Human
Gene Name: 'GCDH' (HUGO: GCDH)
ALEXA Gene ID: 3176 (ALEXA_hs_57_37b)
EnsEMBL Gene ID: ENSG00000105607
Entrez Gene Record(s): GCDH
Ensembl Gene Record: ENSG00000105607
Evidence: Known Gene
Gene Type: protein_coding
Location: chr19 13001974-13010782 (+): 19p13.2
Size (bp): 8809
Description: glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase [Source:HGNC Symbol;Acc:4189]
Data links for each library (displays expression data in UCSC Genome Browser)
Comparison: HS0932_vs_HS1181
ABC_RG049 (HS0932) has 2,428 total reads for 'GCDH'. UCSC data links: (C | P)
GCB_RG069 (HS1181) has 2,191 total reads for 'GCDH'. UCSC data links: (C | P)
Link to other genes in the same chromosome region as 'GCDH'
Features defined for this gene: 181
Gene: 1
Transcript: 5
ExonRegion: 15
Junction: 98
KnownJunction: 17
NovelJunction: 81
Boundary: 26
KnownBoundary: 2
NovelBoundary: 24
Intron: 14
ActiveIntronRegion: 7
SilentIntronRegion: 13
Intergenic: 1
ActiveIntergenicRegion: 1
SilentIntergenicRegion: 1
Summary of transcript specific features for 'GCDH' (ENSG00000105607)
ENST00000426001: | E8a_E9b |
ENST00000222214: | NA |
ENST00000421816: | E2a_E4a, E4a_E7a |
ENST00000457854: | E12a_E13b |
ENST00000422947: | E4a_E6a, ER6a, E6a_E7a |
Summary of known expressed features
Expressed above background
Library | Exon Regions (Expressed/Total) | Known Junctions (Expressed/Total) |
ABC_RG012: | 15/15 | 14/17 |
ABC_RG016: | 14/15 | 11/17 |
ABC_RG015: | 13/15 | 11/17 |
ABC_RG046: | 14/15 | 11/17 |
ABC_RG047: | 14/15 | 13/17 |
ABC_RG048: | 15/15 | 12/17 |
ABC_RG049: | 14/15 | 11/17 |
ABC_RG058: | 13/15 | 12/17 |
ABC_RG059: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG061: | 15/15 | 11/17 |
ABC_RG073: | 15/15 | 12/17 |
ABC_RG074: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG086: | 14/15 | 12/17 |
GCB_RG003: | 14/15 | 12/17 |
GCB_RG005: | 14/15 | 10/17 |
GCB_RG006: | 15/15 | 11/17 |
GCB_RG007: | 14/15 | 11/17 |
GCB_RG010: | 14/15 | 11/17 |
GCB_RG014: | 13/15 | 9/17 |
GCB_RG045: | 14/15 | 12/17 |
GCB_RG050: | 14/15 | 13/17 |
GCB_RG055: | 14/15 | 12/17 |
GCB_RG062: | 13/15 | 11/17 |
GCB_RG063: | 13/15 | 11/17 |
GCB_RG064: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG071: | 13/15 | 12/17 |
GCB_RG072: | 14/15 | 12/17 |
GCB_RG069: | 15/15 | 14/17 |
GCB_RG085: | 15/15 | 12/17 |
Detected at any level above 0
Library | Exon Regions (Detected/Total) | Known Junctions (Detected/Total) |
ABC_RG012: | 15/15 | 14/17 |
ABC_RG016: | 15/15 | 11/17 |
ABC_RG015: | 15/15 | 14/17 |
ABC_RG046: | 15/15 | 11/17 |
ABC_RG047: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG048: | 15/15 | 12/17 |
ABC_RG049: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG058: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG059: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG061: | 15/15 | 12/17 |
ABC_RG073: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG074: | 15/15 | 13/17 |
ABC_RG086: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG003: | 15/15 | 17/17 |
GCB_RG005: | 15/15 | 10/17 |
GCB_RG006: | 15/15 | 12/17 |
GCB_RG007: | 15/15 | 14/17 |
GCB_RG010: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG014: | 15/15 | 12/17 |
GCB_RG045: | 15/15 | 12/17 |
GCB_RG050: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG055: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG062: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG063: | 15/15 | 11/17 |
GCB_RG064: | 15/15 | 13/17 |
GCB_RG071: | 15/15 | 12/17 |
GCB_RG072: | 15/15 | 12/17 |
GCB_RG069: | 15/15 | 14/17 |
GCB_RG085: | 15/15 | 13/17 |
Normalized expression data for each known or novel expressed feature of 'GCDH'
The following table summarizes the expression values of all known features of the gene 'GCDH' in each library. Known features (i.e. those that correspond to one or more EnsEMBL transcripts) are included regardless of their expression level. Novel features are only reported in this table if they are expressed above the level of intergenic background noise. The 'FID' column reports the unique Feature ID for the gene, transcript, exon region, exon junction, etc. The 'Name' column reports the Feature Name for the feature (e.g. E5a_E6a is the name of an exon junction corresponding to the connection of exons 5 and 6). The 'Type' column reports the type of the feature and may be one of the following: Gene, Transcript, Exon Region, Known Junction, Novel Junction, Known Boundary, Novel Boundary, Silent or Active Intronic Regions, and Silent or Active Intergenic Regions (see our manuscript for more details). The 'Base Count' column reports the number of nucleotide bases for the feature followed by the percent of these that do NOT correspond to repeats and the percent that are known to be protein coding in one or more EnsEMBL transcripts. The 'Supporting ESTs/mRNAs' column reports the number of ESTs and mRNAs that when aligned to the human genome support the expression of a feature (i.e. the sequence alignment coordinates match an exon junction or boundaries of an exon, retained intron, etc.). The 'Conserved Species' column reports the number of 'other' species for which there was at least 1 supporting EST/mRNA alignment. Finally, the remaining columns report the log2 expression value for each feature in each library. Bold values indicate expression above background. Each expression value is also a hyperlink to a view of the feature's corresponding genomic region in the UCSC genome browser. Expression data will automatically be loaded as custom GFF and wiggle tracks.
FID | Name | Type | Base Count (% unmasked | % coding) | Supporting Human ESTs/mRNAs | Conserved Species | ABC_RG012 Log2 Expression | ABC_RG016 Log2 Expression | ABC_RG015 Log2 Expression | ABC_RG046 Log2 Expression | ABC_RG047 Log2 Expression | ABC_RG048 Log2 Expression | ABC_RG049 Log2 Expression | ABC_RG058 Log2 Expression | ABC_RG059 Log2 Expression | ABC_RG061 Log2 Expression | ABC_RG073 Log2 Expression | ABC_RG074 Log2 Expression | ABC_RG086 Log2 Expression | GCB_RG003 Log2 Expression | GCB_RG005 Log2 Expression | GCB_RG006 Log2 Expression | GCB_RG007 Log2 Expression | GCB_RG010 Log2 Expression | GCB_RG014 Log2 Expression | GCB_RG045 Log2 Expression | GCB_RG050 Log2 Expression | GCB_RG055 Log2 Expression | GCB_RG062 Log2 Expression | GCB_RG063 Log2 Expression | GCB_RG064 Log2 Expression | GCB_RG071 Log2 Expression | GCB_RG072 Log2 Expression | GCB_RG069 Log2 Expression | GCB_RG085 Log2 Expression |
G3176 | GCDH | Gene | 1939 (94% | 76%) | N/A | N/A | 7.08 (C | P) | 6.24 (C | P) | 7.84 (C | P) | 7.75 (C | P) | 8.61 (C | P) | 6.38 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.68 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.58 (C | P) | 7.10 (C | P) | 7.69 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.36 (C | P) | 6.28 (C | P) | 6.67 (C | P) | 6.82 (C | P) | 6.18 (C | P) | 6.98 (C | P) | 5.99 (C | P) | 7.23 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.66 (C | P) | 6.57 (C | P) | 6.43 (C | P) |
T18998 | ENST00000426001 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.55 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.22 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.96 (C | P) | 0.00 (C | P) |
T18997 | ENST00000422947 | Transcript | 242 (26% | 100%) | N/A | N/A | 2.19 (C | P) | 2.23 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.02 (C | P) | 0.77 (C | P) | 1.84 (C | P) | 1.75 (C | P) | 1.31 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.41 (C | P) | 1.24 (C | P) | 1.75 (C | P) | 0.45 (C | P) | 2.40 (C | P) | 3.20 (C | P) | 1.61 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.20 (C | P) | 2.81 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.82 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.71 (C | P) | 0.89 (C | P) | 1.89 (C | P) | 0.61 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.43 (C | P) |
T18995 | ENST00000222214 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T18996 | ENST00000421816 | Transcript | 124 (100% | 100%) | N/A | N/A | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.78 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 0.00 (C | P) |
T18999 | ENST00000457854 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 3.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.53 (C | P) | 1.43 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.25 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.26 (C | P) | 2.75 (C | P) | 5.22 (C | P) | 3.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.52 (C | P) | 2.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.73 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.97 (C | P) | 1.79 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.50 (C | P) | 1.67 (C | P) | 3.73 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.50 (C | P) |
ER129231 | ER1a | ExonRegion | 43 (100% | 0%) | 52 | 1 | 6.00 (C | P) | 4.29 (C | P) | 6.69 (C | P) | 7.62 (C | P) | 8.77 (C | P) | 5.11 (C | P) | 5.28 (C | P) | 5.28 (C | P) | 4.91 (C | P) | 5.77 (C | P) | 5.40 (C | P) | 5.92 (C | P) | 6.01 (C | P) | 4.88 (C | P) | 3.05 (C | P) | 5.85 (C | P) | 5.97 (C | P) | 6.22 (C | P) | 4.64 (C | P) | 4.99 (C | P) | 4.41 (C | P) | 6.08 (C | P) | 6.33 (C | P) | 3.70 (C | P) | 4.59 (C | P) | 5.24 (C | P) | 5.23 (C | P) | 6.28 (C | P) | 4.67 (C | P) |
EB112343 | E1_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.04 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.64 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700387 | E1a_E2a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 110 | 2 | 7.69 (C | P) | 6.07 (C | P) | 7.97 (C | P) | 9.52 (C | P) | 10.56 (C | P) | 6.51 (C | P) | 6.87 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.48 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.52 (C | P) | 6.31 (C | P) | 5.08 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.30 (C | P) | 7.94 (C | P) | 6.49 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.09 (C | P) | 7.64 (C | P) | 7.95 (C | P) | 5.43 (C | P) | 6.23 (C | P) | 6.89 (C | P) | 7.13 (C | P) | 7.72 (C | P) | 6.20 (C | P) |
EJ700388 | E1a_E3a | NovelJunction | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 3.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.72 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88811 | I1 | Intron | 68 (100% | 0%) | 1 | 1 | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.67 (C | P) | 6.47 (C | P) | 1.02 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.88 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.72 (C | P) | 0.98 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.85 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.89 (C | P) | 1.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.08 (C | P) | 1.75 (C | P) | 2.36 (C | P) | 1.79 (C | P) | 1.01 (C | P) |
AIN94406 | I1_AR1 | ActiveIntronRegion | 66 (100% | 0%) | 2 | 1 | 1.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.71 (C | P) | 6.52 (C | P) | 1.04 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.90 (C | P) | 2.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.75 (C | P) | 1.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.92 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.11 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.39 (C | P) | 1.82 (C | P) | 1.03 (C | P) |
EB112344 | E2_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 2 | 1 | 3.15 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.14 (C | P) | 3.56 (C | P) | 7.64 (C | P) | 1.57 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.32 (C | P) | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.12 (C | P) | 1.03 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.98 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.29 (C | P) | 1.42 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.62 (C | P) | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.72 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129232 | ER2a | ExonRegion | 125 (100% | 73%) | 113 | 4 | 6.46 (C | P) | 4.54 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.75 (C | P) | 8.97 (C | P) | 5.10 (C | P) | 5.79 (C | P) | 6.11 (C | P) | 5.34 (C | P) | 6.27 (C | P) | 5.61 (C | P) | 6.30 (C | P) | 6.46 (C | P) | 5.40 (C | P) | 4.32 (C | P) | 5.77 (C | P) | 6.43 (C | P) | 5.78 (C | P) | 3.97 (C | P) | 5.42 (C | P) | 4.93 (C | P) | 6.78 (C | P) | 6.91 (C | P) | 4.37 (C | P) | 5.04 (C | P) | 5.61 (C | P) | 5.96 (C | P) | 5.97 (C | P) | 5.28 (C | P) |
EJ700401 | E2a_E3a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 122 | 7 | 6.67 (C | P) | 4.93 (C | P) | 3.83 (C | P) | 5.62 (C | P) | 5.46 (C | P) | 4.37 (C | P) | 4.43 (C | P) | 5.47 (C | P) | 3.77 (C | P) | 4.85 (C | P) | 4.36 (C | P) | 3.74 (C | P) | 5.05 (C | P) | 4.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.55 (C | P) | 3.79 (C | P) | 5.27 (C | P) | 3.18 (C | P) | 5.65 (C | P) | 3.69 (C | P) | 6.14 (C | P) | 4.39 (C | P) | 5.34 (C | P) | 4.20 (C | P) | 4.34 (C | P) | 2.85 (C | P) | 3.53 (C | P) | 3.49 (C | P) |
EJ700402 | E2a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 4 | 7 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 2.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112346 | E3_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 2.55 (C | P) | 1.95 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.83 (C | P) | 2.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.13 (C | P) | 2.31 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) |
ER129233 | ER3a | ExonRegion | 36 (100% | 100%) | 112 | 8 | 7.31 (C | P) | 5.79 (C | P) | 4.47 (C | P) | 6.13 (C | P) | 6.84 (C | P) | 5.57 (C | P) | 5.77 (C | P) | 6.95 (C | P) | 5.53 (C | P) | 5.98 (C | P) | 4.64 (C | P) | 5.46 (C | P) | 6.21 (C | P) | 6.01 (C | P) | 5.14 (C | P) | 4.90 (C | P) | 4.56 (C | P) | 5.63 (C | P) | 3.75 (C | P) | 6.94 (C | P) | 5.19 (C | P) | 7.83 (C | P) | 4.79 (C | P) | 6.00 (C | P) | 5.51 (C | P) | 4.69 (C | P) | 4.53 (C | P) | 5.12 (C | P) | 3.96 (C | P) |
EB112347 | E3_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 15 | 1 | 5.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.02 (C | P) | 2.76 (C | P) | 2.48 (C | P) | 5.43 (C | P) | 2.34 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.08 (C | P) | 1.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.30 (C | P) | 3.46 (C | P) | 2.05 (C | P) | 3.66 (C | P) | 3.36 (C | P) | 3.18 (C | P) | 4.28 (C | P) | 2.27 (C | P) | 2.43 (C | P) | 1.52 (C | P) | 3.19 (C | P) | 3.78 (C | P) | 3.37 (C | P) | 3.72 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.08 (C | P) |
EJ700414 | E3a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 105 | 5 | 7.59 (C | P) | 6.07 (C | P) | 4.90 (C | P) | 6.34 (C | P) | 7.88 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.32 (C | P) | 7.78 (C | P) | 6.61 (C | P) | 6.51 (C | P) | 4.75 (C | P) | 5.88 (C | P) | 6.95 (C | P) | 6.48 (C | P) | 5.76 (C | P) | 5.77 (C | P) | 5.13 (C | P) | 6.33 (C | P) | 4.10 (C | P) | 7.67 (C | P) | 5.95 (C | P) | 8.54 (C | P) | 5.11 (C | P) | 6.17 (C | P) | 6.26 (C | P) | 5.38 (C | P) | 5.31 (C | P) | 5.62 (C | P) | 4.74 (C | P) |
EJ700415 | E3a_E5a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.72 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88813 | I3 | Intron | 308 (100% | 0%) | 14 | 0 | 4.63 (C | P) | 2.02 (C | P) | 3.34 (C | P) | 3.02 (C | P) | 4.66 (C | P) | 2.69 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.15 (C | P) | 2.66 (C | P) | 2.94 (C | P) | 1.83 (C | P) | 2.63 (C | P) | 1.06 (C | P) | 3.22 (C | P) | 3.16 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.25 (C | P) | 4.16 (C | P) | 3.16 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.11 (C | P) | 1.32 (C | P) | 1.32 (C | P) | 2.07 (C | P) | 2.52 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.48 (C | P) | 1.78 (C | P) |
AIN94407 | I3_AR1 | ActiveIntronRegion | 306 (100% | 0%) | 16 | 0 | 4.64 (C | P) | 2.03 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.03 (C | P) | 4.67 (C | P) | 2.70 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.16 (C | P) | 2.66 (C | P) | 2.95 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.64 (C | P) | 1.06 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.17 (C | P) | 3.29 (C | P) | 4.26 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.17 (C | P) | 3.29 (C | P) | 2.11 (C | P) | 1.32 (C | P) | 1.33 (C | P) | 2.08 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.49 (C | P) | 1.79 (C | P) |
EB112348 | E4_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 12 | 0 | 5.40 (C | P) | 3.86 (C | P) | 3.68 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.82 (C | P) | 3.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.36 (C | P) | 3.02 (C | P) | 3.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 4.96 (C | P) | 4.59 (C | P) | 3.18 (C | P) | 3.02 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.32 (C | P) | 2.71 (C | P) | 2.67 (C | P) | 2.38 (C | P) | 2.59 (C | P) | 4.10 (C | P) | 3.27 (C | P) |
ER129234 | ER4a | ExonRegion | 144 (100% | 100%) | 111 | 21 | 7.37 (C | P) | 6.10 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.64 (C | P) | 8.40 (C | P) | 6.34 (C | P) | 7.13 (C | P) | 7.66 (C | P) | 6.44 (C | P) | 7.58 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.85 (C | P) | 5.49 (C | P) | 6.64 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.20 (C | P) | 6.07 (C | P) | 7.27 (C | P) | 5.97 (C | P) | 7.19 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.13 (C | P) | 6.50 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.22 (C | P) |
EJ700426 | E4a_E5a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 109 | 47 | 7.79 (C | P) | 6.95 (C | P) | 8.63 (C | P) | 7.85 (C | P) | 10.03 (C | P) | 6.98 (C | P) | 6.79 (C | P) | 8.10 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.37 (C | P) | 6.87 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.08 (C | P) | 6.70 (C | P) | 6.65 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.86 (C | P) | 6.24 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.90 (C | P) | 6.86 (C | P) | 6.55 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.01 (C | P) | 6.31 (C | P) |
EJ700427 | E4a_E6a | KnownJunction | 62 (50% | 100%) | 2 | 0 | 2.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.98 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700428 | E4a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 3 | 12 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.88 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.21 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88814 | I4 | Intron | 141 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.54 (C | P) | 0.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.39 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.67 (C | P) | 0.00 (C | P) |
SIN127159 | I4_SR1 | SilentIntronRegion | 139 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.55 (C | P) | 0.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.68 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112350 | E5_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.85 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.76 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.62 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129235 | ER5a | ExonRegion | 63 (100% | 100%) | 103 | 61 | 7.27 (C | P) | 6.44 (C | P) | 8.62 (C | P) | 8.44 (C | P) | 9.70 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.69 (C | P) | 8.05 (C | P) | 6.42 (C | P) | 7.15 (C | P) | 6.50 (C | P) | 6.98 (C | P) | 7.47 (C | P) | 6.88 (C | P) | 5.94 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.93 (C | P) | 6.87 (C | P) | 5.80 (C | P) | 7.49 (C | P) | 5.61 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.00 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.56 (C | P) | 6.13 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.42 (C | P) | 5.93 (C | P) |
EB112351 | E5_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 2.75 (C | P) | 2.37 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 2.62 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.18 (C | P) | 3.11 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.81 (C | P) | 1.95 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700438 | E5a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 103 | 63 | 6.63 (C | P) | 6.14 (C | P) | 8.33 (C | P) | 8.51 (C | P) | 8.86 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.82 (C | P) | 7.48 (C | P) | 5.91 (C | P) | 6.93 (C | P) | 5.84 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.39 (C | P) | 6.64 (C | P) | 5.16 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.58 (C | P) | 6.87 (C | P) | 5.37 (C | P) | 6.31 (C | P) | 5.32 (C | P) | 6.61 (C | P) | 5.96 (C | P) | 6.24 (C | P) | 5.97 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.05 (C | P) | 6.20 (C | P) | 5.77 (C | P) |
IN88815 | I5 | Intron | 138 (38% | 0%) | 0 | 0 | 2.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) |
AIN94408 | I5_AR1 | ActiveIntronRegion | 104 (50% | 0%) | 1 | 0 | 2.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112352 | E6_Aa | NovelBoundary | 62 (0% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.51 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.19 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129236 | ER6a | ExonRegion | 118 (0% | 100%) | 2 | 0 | 2.70 (C | P) | 3.60 (C | P) | 2.09 (C | P) | 2.04 (C | P) | 1.64 (C | P) | 3.12 (C | P) | 2.60 (C | P) | 1.76 (C | P) | 3.30 (C | P) | 3.81 (C | P) | 2.35 (C | P) | 2.72 (C | P) | 1.08 (C | P) | 3.20 (C | P) | 4.67 (C | P) | 2.84 (C | P) | 2.50 (C | P) | 2.30 (C | P) | 3.45 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.96 (C | P) | 1.73 (C | P) | 2.20 (C | P) | 1.54 (C | P) | 1.82 (C | P) | 3.19 (C | P) | 1.37 (C | P) | 3.33 (C | P) | 2.22 (C | P) |
EB112353 | E6_Da | NovelBoundary | 62 (0% | 50%) | 0 | 0 | 5.15 (C | P) | 5.39 (C | P) | 3.15 (C | P) | 5.40 (C | P) | 3.92 (C | P) | 5.90 (C | P) | 4.61 (C | P) | 4.73 (C | P) | 5.55 (C | P) | 5.59 (C | P) | 4.21 (C | P) | 4.94 (C | P) | 4.01 (C | P) | 4.14 (C | P) | 5.71 (C | P) | 6.10 (C | P) | 3.44 (C | P) | 5.57 (C | P) | 5.06 (C | P) | 4.74 (C | P) | 4.90 (C | P) | 4.64 (C | P) | 4.66 (C | P) | 6.30 (C | P) | 4.92 (C | P) | 5.01 (C | P) | 4.40 (C | P) | 6.14 (C | P) | 4.62 (C | P) |
EJ700447 | E6a_E7a | KnownJunction | 62 (50% | 100%) | 2 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) |
IN88816 | I6 | Intron | 1048 (13% | 0%) | 0 | 0 | 2.09 (C | P) | 1.79 (C | P) | 1.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.34 (C | P) | 2.17 (C | P) | 1.04 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.93 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.70 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.68 (C | P) | 1.15 (C | P) | 1.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) |
AIN94409 | I6_AR1 | ActiveIntronRegion | 422 (31% | 0%) | 1 | 0 | 2.11 (C | P) | 1.80 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.36 (C | P) | 2.19 (C | P) | 1.06 (C | P) | 2.29 (C | P) | 0.94 (C | P) | 1.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.72 (C | P) | 1.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.45 (C | P) | 1.69 (C | P) | 1.16 (C | P) | 1.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112354 | E7_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 2.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.58 (C | P) | 1.21 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.01 (C | P) | 2.49 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.32 (C | P) | 1.23 (C | P) |
ER129237 | ER7a | ExonRegion | 171 (100% | 100%) | 52 | 95 | 7.52 (C | P) | 6.45 (C | P) | 7.52 (C | P) | 8.23 (C | P) | 8.86 (C | P) | 6.52 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.81 (C | P) | 6.68 (C | P) | 7.52 (C | P) | 6.87 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.64 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.25 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.67 (C | P) | 7.27 (C | P) | 6.58 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.18 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.28 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.74 (C | P) | 6.53 (C | P) | 6.22 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.26 (C | P) |
EB112355 | E7_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 1 | 1 | 3.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.76 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.69 (C | P) | 2.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.99 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.40 (C | P) | 3.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.52 (C | P) | 1.37 (C | P) |
EJ700456 | E7a_E8a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 36 | 90 | 7.13 (C | P) | 6.53 (C | P) | 8.00 (C | P) | 8.21 (C | P) | 8.11 (C | P) | 6.38 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.87 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.20 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.58 (C | P) | 6.69 (C | P) | 5.68 (C | P) | 6.31 (C | P) | 6.52 (C | P) | 7.02 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.23 (C | P) | 7.44 (C | P) | 7.34 (C | P) | 6.08 (C | P) | 6.64 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.66 (C | P) | 6.33 (C | P) | 6.09 (C | P) |
EJ700458 | E7a_E9b | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88817 | I7 | Intron | 479 (72% | 0%) | 0 | 0 | 3.35 (C | P) | 0.57 (C | P) | 1.99 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.41 (C | P) | 1.86 (C | P) | 1.13 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.70 (C | P) | 2.28 (C | P) | 1.46 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.37 (C | P) | 2.93 (C | P) | 1.24 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.70 (C | P) | 3.22 (C | P) | 1.94 (C | P) | 1.15 (C | P) | 2.70 (C | P) | 0.85 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.54 (C | P) | 1.54 (C | P) | 1.52 (C | P) | 0.34 (C | P) | 2.35 (C | P) | 1.13 (C | P) |
AIN94410 | I7_AR1 | ActiveIntronRegion | 384 (71% | 0%) | 1 | 0 | 3.47 (C | P) | 0.69 (C | P) | 2.26 (C | P) | 2.34 (C | P) | 2.49 (C | P) | 1.84 (C | P) | 1.33 (C | P) | 2.71 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.70 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.44 (C | P) | 3.13 (C | P) | 1.45 (C | P) | 1.93 (C | P) | 3.00 (C | P) | 3.23 (C | P) | 2.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 2.90 (C | P) | 0.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.66 (C | P) | 1.75 (C | P) | 0.42 (C | P) | 2.56 (C | P) | 1.33 (C | P) |
SIN127162 | I7_SR1 | SilentIntronRegion | 93 (77% | 0%) | 0 | 0 | 2.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.16 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.37 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.20 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.19 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 1.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.10 (C | P) | 0.00 (C | P) |
SIN127164 | I7_SR2 | SilentIntronRegion | 984 (18% | 0%) | 0 | 0 | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.98 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.39 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.46 (C | P) | 1.05 (C | P) | 0.71 (C | P) | 2.37 (C | P) | 1.44 (C | P) | 0.44 (C | P) | 0.46 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.23 (C | P) | 2.35 (C | P) | 1.85 (C | P) | 2.12 (C | P) | 0.95 (C | P) | 1.91 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.17 (C | P) | 0.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.56 (C | P) | 1.46 (C | P) |
EB112356 | E8_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 2.77 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.04 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.35 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.19 (C | P) | 4.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.17 (C | P) | 2.49 (C | P) | 4.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.97 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.09 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129238 | ER8a | ExonRegion | 130 (100% | 100%) | 25 | 80 | 7.48 (C | P) | 6.62 (C | P) | 8.50 (C | P) | 8.22 (C | P) | 9.06 (C | P) | 6.72 (C | P) | 7.67 (C | P) | 8.03 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.60 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.98 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.72 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.30 (C | P) | 6.33 (C | P) | 7.24 (C | P) | 6.37 (C | P) | 7.72 (C | P) | 7.66 (C | P) | 6.60 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.21 (C | P) | 6.78 (C | P) |
EJ700464 | E8a_E9a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 31 | 40 | 7.17 (C | P) | 6.73 (C | P) | 8.51 (C | P) | 8.52 (C | P) | 8.95 (C | P) | 6.91 (C | P) | 7.61 (C | P) | 8.17 (C | P) | 7.26 (C | P) | 7.78 (C | P) | 6.78 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.78 (C | P) | 6.79 (C | P) | 6.54 (C | P) | 6.47 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.04 (C | P) | 6.91 (C | P) | 6.41 (C | P) | 7.53 (C | P) | 7.34 (C | P) | 6.70 (C | P) | 6.89 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.70 (C | P) | 7.16 (C | P) | 6.53 (C | P) |
EJ700465 | E8a_E9b | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 1 | 0 | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.55 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.22 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.96 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129239 | ER9a | ExonRegion | 36 (100% | 100%) | 30 | 52 | 7.25 (C | P) | 6.62 (C | P) | 8.50 (C | P) | 8.35 (C | P) | 8.74 (C | P) | 6.73 (C | P) | 7.42 (C | P) | 8.30 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.71 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.85 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.20 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.71 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.67 (C | P) | 7.43 (C | P) | 6.83 (C | P) | 6.76 (C | P) | 7.11 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.76 (C | P) | 6.65 (C | P) |
EB112360 | E9_Ab | KnownBoundary | 62 (100% | 100%) | 30 | 49 | 7.43 (C | P) | 6.88 (C | P) | 8.49 (C | P) | 8.37 (C | P) | 8.82 (C | P) | 6.85 (C | P) | 7.58 (C | P) | 8.32 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.75 (C | P) | 7.27 (C | P) | 7.54 (C | P) | 7.92 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.60 (C | P) | 5.86 (C | P) | 6.85 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.73 (C | P) | 7.59 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.00 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.16 (C | P) | 7.47 (C | P) | 6.35 (C | P) | 6.75 (C | P) |
ER129240 | ER9b | ExonRegion | 181 (100% | 100%) | 23 | 21 | 7.30 (C | P) | 6.23 (C | P) | 8.41 (C | P) | 7.93 (C | P) | 8.81 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.97 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.54 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.58 (C | P) | 8.06 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.47 (C | P) | 6.55 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.22 (C | P) | 6.35 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.36 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.39 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.58 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.90 (C | P) | 6.90 (C | P) | 6.65 (C | P) |
EB112359 | E9_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 3.50 (C | P) | 2.42 (C | P) | 2.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.79 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.18 (C | P) | 3.69 (C | P) | 2.49 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.44 (C | P) | 1.42 (C | P) |
EJ700471 | E9a_E10a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 28 | 6.86 (C | P) | 4.63 (C | P) | 8.57 (C | P) | 7.87 (C | P) | 9.17 (C | P) | 6.48 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.51 (C | P) | 7.52 (C | P) | 7.71 (C | P) | 6.63 (C | P) | 7.33 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.01 (C | P) | 6.28 (C | P) | 5.97 (C | P) | 6.99 (C | P) | 6.69 (C | P) | 5.63 (C | P) | 6.95 (C | P) | 5.93 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.27 (C | P) | 6.54 (C | P) | 6.48 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.09 (C | P) | 6.90 (C | P) | 6.69 (C | P) |
EJ700472 | E9a_E11a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88820 | I9 | Intron | 488 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.87 (C | P) | 1.70 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.78 (C | P) | 3.93 (C | P) | 2.52 (C | P) | 3.27 (C | P) | 3.78 (C | P) | 2.81 (C | P) | 1.95 (C | P) | 0.45 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.62 (C | P) | 2.85 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.67 (C | P) | 3.52 (C | P) | 3.61 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.99 (C | P) | 1.43 (C | P) | 0.46 (C | P) | 1.23 (C | P) | 0.93 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 1.30 (C | P) |
SIN127166 | I9_SR1 | SilentIntronRegion | 486 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.88 (C | P) | 1.71 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.79 (C | P) | 3.94 (C | P) | 2.53 (C | P) | 3.27 (C | P) | 3.78 (C | P) | 2.82 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.45 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.63 (C | P) | 2.85 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.68 (C | P) | 3.52 (C | P) | 3.61 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.59 (C | P) | 2.00 (C | P) | 1.43 (C | P) | 0.46 (C | P) | 1.23 (C | P) | 0.93 (C | P) | 1.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 1.31 (C | P) |
EB112361 | E10_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 4.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 4.43 (C | P) | 5.55 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.86 (C | P) | 4.38 (C | P) | 3.90 (C | P) | 2.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.92 (C | P) | 3.19 (C | P) | 4.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.00 (C | P) |
ER129241 | ER10a | ExonRegion | 104 (100% | 100%) | 23 | 110 | 7.45 (C | P) | 5.88 (C | P) | 8.70 (C | P) | 8.23 (C | P) | 9.01 (C | P) | 6.61 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.97 (C | P) | 7.13 (C | P) | 7.49 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.71 (C | P) | 8.24 (C | P) | 6.85 (C | P) | 6.76 (C | P) | 6.48 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.17 (C | P) | 6.15 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.31 (C | P) | 7.33 (C | P) | 7.39 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.51 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.99 (C | P) | 6.87 (C | P) |
EB112362 | E10_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.08 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700476 | E10a_E11a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 29 | 84 | 7.29 (C | P) | 6.29 (C | P) | 8.44 (C | P) | 8.57 (C | P) | 8.98 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.43 (C | P) | 8.46 (C | P) | 7.51 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.76 (C | P) | 7.83 (C | P) | 8.58 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.45 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.33 (C | P) | 5.85 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.05 (C | P) | 6.73 (C | P) | 6.64 (C | P) | 7.22 (C | P) | 7.26 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.88 (C | P) |
EJ700477 | E10a_E12a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 8 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.47 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.58 (C | P) | 2.43 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.67 (C | P) | 1.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112363 | E11_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.51 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129242 | ER11a | ExonRegion | 126 (100% | 100%) | 29 | 29 | 7.55 (C | P) | 6.09 (C | P) | 8.12 (C | P) | 8.30 (C | P) | 8.64 (C | P) | 6.76 (C | P) | 7.39 (C | P) | 8.13 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.67 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.49 (C | P) | 8.21 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.45 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.47 (C | P) | 7.24 (C | P) | 6.37 (C | P) | 7.59 (C | P) | 7.49 (C | P) | 6.58 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.17 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.95 (C | P) | 6.78 (C | P) |
EB112364 | E11_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 2 | 0 | 2.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 3.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.26 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.96 (C | P) | 1.90 (C | P) | 2.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.86 (C | P) | 3.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.95 (C | P) | 2.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 2.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.35 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700480 | E11a_E12a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 28 | 16 | 6.65 (C | P) | 6.11 (C | P) | 8.04 (C | P) | 8.28 (C | P) | 8.12 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.04 (C | P) | 8.09 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.34 (C | P) | 6.36 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.65 (C | P) | 6.85 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.07 (C | P) | 6.73 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.02 (C | P) | 6.21 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.01 (C | P) | 7.01 (C | P) | 6.59 (C | P) | 6.67 (C | P) | 6.63 (C | P) | 6.33 (C | P) | 6.00 (C | P) |
IN88822 | I11 | Intron | 274 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.23 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.22 (C | P) | 2.21 (C | P) | 2.11 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.38 (C | P) | 1.08 (C | P) | 1.67 (C | P) | 1.43 (C | P) | 2.04 (C | P) | 2.25 (C | P) | 1.99 (C | P) | 2.89 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.99 (C | P) | 1.83 (C | P) | 2.39 (C | P) | 0.74 (C | P) | 0.74 (C | P) | 2.54 (C | P) | 0.85 (C | P) | 0.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.14 (C | P) | 0.90 (C | P) |
AIN94411 | I11_AR1 | ActiveIntronRegion | 272 (100% | 0%) | 2 | 0 | 3.24 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.53 (C | P) | 1.23 (C | P) | 2.22 (C | P) | 2.12 (C | P) | 2.47 (C | P) | 2.78 (C | P) | 2.06 (C | P) | 1.39 (C | P) | 1.08 (C | P) | 1.68 (C | P) | 1.43 (C | P) | 2.05 (C | P) | 2.26 (C | P) | 2.00 (C | P) | 2.89 (C | P) | 2.31 (C | P) | 2.00 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.40 (C | P) | 0.75 (C | P) | 0.75 (C | P) | 2.55 (C | P) | 0.85 (C | P) | 0.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.15 (C | P) | 0.91 (C | P) |
EB112365 | E12_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 1 | 1 | 3.86 (C | P) | 2.55 (C | P) | 1.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.99 (C | P) | 3.07 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.43 (C | P) | 2.96 (C | P) | 2.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.21 (C | P) | 2.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.02 (C | P) | 3.64 (C | P) | 3.97 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.48 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.81 (C | P) | 2.08 (C | P) | 1.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.47 (C | P) | 1.84 (C | P) |
ER129243 | ER12a | ExonRegion | 161 (100% | 100%) | 26 | 70 | 7.27 (C | P) | 6.60 (C | P) | 8.48 (C | P) | 8.16 (C | P) | 9.01 (C | P) | 6.76 (C | P) | 7.44 (C | P) | 8.05 (C | P) | 7.42 (C | P) | 7.62 (C | P) | 6.79 (C | P) | 7.55 (C | P) | 8.31 (C | P) | 7.08 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.77 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.37 (C | P) | 7.60 (C | P) | 7.44 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.66 (C | P) | 7.07 (C | P) | 7.04 (C | P) | 6.84 (C | P) | 6.76 (C | P) |
EB112366 | E12_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 3.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.92 (C | P) | 2.73 (C | P) | 1.93 (C | P) | 3.04 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.98 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.27 (C | P) | 3.95 (C | P) | 2.49 (C | P) | 3.18 (C | P) | 2.26 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 1.70 (C | P) | 3.16 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ700483 | E12a_E13a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 104 | 6.94 (C | P) | 6.73 (C | P) | 8.45 (C | P) | 8.85 (C | P) | 9.07 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.37 (C | P) | 8.39 (C | P) | 7.91 (C | P) | 8.28 (C | P) | 7.12 (C | P) | 7.68 (C | P) | 8.00 (C | P) | 6.79 (C | P) | 7.61 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.87 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.19 (C | P) | 7.28 (C | P) | 5.89 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.65 (C | P) | 6.62 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.67 (C | P) | 7.08 (C | P) | 6.84 (C | P) |
EJ700484 | E12a_E13b | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 3.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.53 (C | P) | 1.43 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.25 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.26 (C | P) | 2.75 (C | P) | 5.22 (C | P) | 3.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.52 (C | P) | 2.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.73 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.97 (C | P) | 1.79 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.50 (C | P) | 1.67 (C | P) | 3.73 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.50 (C | P) |
IN88823 | I12 | Intron | 922 (62% | 0%) | 0 | 0 | 2.94 (C | P) | 1.44 (C | P) | 1.13 (C | P) | 1.18 (C | P) | 3.40 (C | P) | 0.89 (C | P) | 1.66 (C | P) | 1.86 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.19 (C | P) | 1.04 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.30 (C | P) | 1.06 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.42 (C | P) | 3.47 (C | P) | 2.24 (C | P) | 1.83 (C | P) | 2.02 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.97 (C | P) | 0.40 (C | P) | 2.15 (C | P) | 1.33 (C | P) | 1.69 (C | P) | 1.10 (C | P) | 1.45 (C | P) | 0.72 (C | P) |
AIN94412 | I12_AR1 | ActiveIntronRegion | 585 (84% | 0%) | 1 | 0 | 2.97 (C | P) | 1.48 (C | P) | 1.26 (C | P) | 1.32 (C | P) | 3.41 (C | P) | 1.00 (C | P) | 1.70 (C | P) | 1.98 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.34 (C | P) | 1.07 (C | P) | 2.19 (C | P) | 2.50 (C | P) | 3.63 (C | P) | 2.18 (C | P) | 2.00 (C | P) | 2.19 (C | P) | 1.93 (C | P) | 1.08 (C | P) | 0.28 (C | P) | 2.32 (C | P) | 1.35 (C | P) | 1.85 (C | P) | 1.19 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.82 (C | P) |
SIN127169 | I12_SR2 | SilentIntronRegion | 194 (25% | 0%) | 0 | 0 | 3.41 (C | P) | 1.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.05 (C | P) | 0.04 (C | P) | 1.88 (C | P) | 1.16 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 1.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.44 (C | P) | 1.40 (C | P) | 2.44 (C | P) | 2.43 (C | P) | 3.19 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.45 (C | P) | 0.44 (C | P) | 1.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN88824 | Ix | Intron | 82 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.17 (C | P) | 2.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.45 (C | P) | 2.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.93 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.31 (C | P) | 0.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.64 (C | P) | 1.95 (C | P) | 2.03 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.58 (C | P) | 1.44 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.08 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) |
SIN127170 | Ix_SR1 | SilentIntronRegion | 79 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.22 (C | P) | 2.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.49 (C | P) | 2.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.96 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.85 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.67 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.54 (C | P) | 1.12 (C | P) | 1.61 (C | P) | 1.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.11 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 0.94 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB112367 | E13_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 2 | 4.09 (C | P) | 2.31 (C | P) | 1.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.92 (C | P) | 1.57 (C | P) | 1.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.89 (C | P) | 3.94 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.29 (C | P) | 2.02 (C | P) | 2.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.59 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.46 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.29 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.40 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER129244 | ER13a | ExonRegion | 233 (100% | 32%) | 13 | 0 | 7.02 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.93 (C | P) | 7.77 (C | P) | 8.34 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.27 (C | P) | 8.06 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.80 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.20 (C | P) | 7.90 (C | P) | 6.96 (C | P) | 6.84 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.79 (C | P) | 6.92 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.32 (C | P) | 6.15 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.35 (C | P) | 6.98 (C | P) | 6.99 (C | P) | 6.47 (C | P) | 7.24 (C | P) | 6.65 (C | P) | 6.92 (C | P) |
EB112368 | E13_Ab | KnownBoundary | 62 (100% | 50%) | 12 | 5 | 7.55 (C | P) | 6.40 (C | P) | 6.70 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.33 (C | P) | 6.55 (C | P) | 6.86 (C | P) | 8.01 (C | P) | 8.69 (C | P) | 7.57 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.90 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.26 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.84 (C | P) | 2.46 (C | P) | 5.63 (C | P) | 7.74 (C | P) | 6.57 (C | P) | 7.27 (C | P) | 6.87 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.47 (C | P) | 7.39 (C | P) | 5.85 (C | P) | 6.99 (C | P) |
ER129245 | ER13b | ExonRegion | 268 (100% | 16%) | 3 | 1 | 6.43 (C | P) | 6.11 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.80 (C | P) | 7.91 (C | P) | 5.90 (C | P) | 6.51 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.65 (C | P) | 6.79 (C | P) | 6.06 (C | P) | 6.28 (C | P) | 7.46 (C | P) | 6.31 (C | P) | 6.59 (C | P) | 5.62 (C | P) | 5.95 (C | P) | 5.97 (C | P) | 5.83 (C | P) | 6.50 (C | P) | 5.70 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.45 (C | P) | 6.33 (C | P) | 5.30 (C | P) | 6.37 (C | P) | 5.66 (C | P) | 6.52 (C | P) |
Figures displaying gene and feature expression levels in each library
The following figures illustrate the expression of the gene 'GCDH' and its component features for each library. First, a simple gene model is depicted. In this model, features that are alternatively expressed in at least one comparison are marked red (see below for the actual expression levels of each feature). Next, the expression values are displayed for only the exons and known (or expressed novel) exon junctions. This first display consists of a single plot with one colored line per library (as indicated in the legend). Next, the expression of the gene relative to the distribution of all gene expression values is displayed as a histogram. In these figures (one for each library) the expression of the current gene is indicated by a dotted red line. Estimated cutoffs for background expression level corresponding to intergenic and intragenic noise are indicated by dotted black lines. The bar plots following these histograms display the expression level of all individual features. The color of the bars correspond to different feature types (enumerated as colored boxes in the legend). As in the histograms, the estimated cutoffs level for intergenic and intragenic noise are indicated as dotted lines. For genes with low expression values, these cutoffs converge to a single value. Features with significant alternative expression values are highlighted yellow in the line plot, and marked with a pink asterix below. *If you can not see the figure below, click here
Download gene data file (GCDH): ENSG00000105607.txt