Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC090772.3	Gene	0	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
2	400470	Transcript	0	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	Ix	Intron	0	0.56	0.28	1.45	0.00	0.00	1.91	1.05	0.32	2.14	2.63	0.72	1.61	0.45	0.24	2.08	0.00	6.23	0.00	0.56	0.00	4.96	0.78	0.79	0.75	0.87	1.23	0.32	1.13	0.23
5	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.56	0.28	1.46	0.00	0.00	1.92	1.06	0.32	2.16	2.65	0.73	1.62	0.45	0.24	2.09	0.00	6.27	0.00	0.56	0.00	4.99	0.79	0.79	0.75	0.88	1.24	0.32	1.14	0.23
6	Ix	Intron	0	0.00	2.15	2.24	1.20	0.00	2.53	0.00	0.00	0.19	2.66	0.20	1.75	0.00	0.38	2.46	1.24	3.99	0.38	1.07	0.00	2.86	0.00	0.00	1.08	0.48	1.31	2.45	0.00	1.56
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.17	2.25	1.21	0.00	2.55	0.00	0.00	0.19	2.67	0.20	1.76	0.00	0.38	2.48	1.25	4.02	0.38	1.08	0.00	2.88	0.00	0.00	1.09	0.48	1.32	2.47	0.00	1.57
8	ER2a	ExonRegion	0	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix	Intron	0	0.80	1.85	2.14	0.25	0.09	2.17	0.61	0.82	3.42	3.13	1.39	1.40	1.34	0.35	3.49	0.81	7.23	1.09	0.96	0.10	3.67	0.99	0.55	1.60	0.66	1.12	0.55	0.35	1.86
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.92	1.65	1.64	0.00	0.21	2.94	0.69	0.55	2.75	3.02	2.54	1.29	0.86	0.43	3.14	1.38	5.55	0.66	1.23	0.00	4.82	1.16	0.39	0.83	0.43	0.81	0.63	0.63	2.35
11	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.85	4.27	1.88	0.00	0.00	0.55	0.40	1.26	1.43	4.04	0.24	0.97	0.86	0.00	1.91	1.20	4.07	0.04	1.26	0.82	3.16	1.07	0.88	0.87	0.57	0.31	0.00	0.32	2.74
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.81	1.12	2.91	0.38	0.00	2.34	0.18	0.83	2.99	5.09	0.30	0.99	1.00	0.63	4.96	0.00	7.53	0.95	1.62	0.17	2.56	1.14	0.13	3.84	0.00	1.59	0.70	0.42	0.87
13	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.73	2.01	2.79	0.20	0.00	1.83	0.81	1.15	5.45	2.29	0.61	1.83	2.35	0.26	4.19	0.42	11.15	2.19	0.00	0.00	3.19	0.82	0.92	2.02	1.38	1.60	0.62	0.00	1.59
14	Ix	Intron	0	0.49	0.00	0.38	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	2.04	1.31	0.27	2.37	0.73	0.21	0.00	0.00	0.34	0.44	0.72	0.00	4.20	0.41	0.00	0.00	0.32	1.07	0.00	0.00	1.37
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.47	0.00	2.20	0.93	0.00	0.00	0.00	0.26	0.12	3.54	0.00	2.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61
16	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.63	0.00	0.49	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	2.39	1.54	0.35	2.41	0.67	0.27	0.00	0.00	0.34	0.46	0.00	0.00	4.77	0.53	0.00	0.00	0.42	1.39	0.00	0.00	1.57
17	Ix	Intron	0	0.13	1.16	0.31	0.00	0.30	0.59	1.11	0.00	2.10	1.86	0.95	0.42	0.16	0.08	1.29	0.61	2.39	0.12	0.78	0.00	2.89	0.22	0.00	0.92	0.09	0.29	0.67	0.00	0.41
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.13	1.16	0.31	0.00	0.30	0.59	1.12	0.00	2.11	1.87	0.95	0.42	0.16	0.08	1.30	0.61	2.39	0.12	0.79	0.00	2.90	0.22	0.00	0.93	0.09	0.29	0.68	0.00	0.41
19	ER3a	ExonRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix	Intron	0	1.12	1.68	1.00	0.00	0.00	3.38	1.05	0.41	5.60	2.26	3.19	1.84	0.97	1.01	5.62	0.92	8.35	0.86	0.24	0.00	8.19	0.27	0.54	2.25	0.64	1.29	0.41	0.00	2.74
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.12	1.68	1.00	0.00	0.00	3.38	1.05	0.41	5.60	2.26	3.19	1.84	0.97	1.01	5.62	0.92	8.35	0.86	0.24	0.00	8.19	0.27	0.54	2.25	0.64	1.29	0.41	0.00	2.74
22	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.72	9.30	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	2.51	3.05	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00
23	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E4_Da	NovelBoundary	0	8.32	4.46	16.59	9.71	20.04	23.71	10.99	16.32	49.58	30.96	10.12	32.05	23.02	16.42	0.00	7.11	61.11	0.00	0.00	8.19	17.17	20.86	9.55	5.50	10.27	20.60	0.00	14.83	21.29
25	Ix	Intron	0	0.17	4.32	0.53	0.00	0.00	0.98	0.80	1.32	4.10	1.72	0.28	0.59	0.82	0.58	1.97	0.99	4.51	0.00	0.76	0.00	3.17	0.72	0.43	1.37	0.00	0.87	1.60	0.00	0.85
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.26	1.17	0.00	0.00	1.29	0.47	0.00	1.97	1.01	0.28	0.00	0.45	1.06	1.28	1.74	1.75	0.00	0.00	0.00	2.67	0.42	0.42	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.26	5.39	0.20	0.00	0.00	0.83	0.97	2.00	5.21	2.09	0.29	0.89	1.01	0.33	2.33	0.60	5.94	0.00	1.16	0.00	3.44	0.87	0.44	1.56	0.00	1.33	2.43	0.00	1.29
28	Ix	Intron	0	0.55	3.37	1.29	1.11	0.50	3.11	1.76	0.85	6.90	3.79	1.65	1.84	1.96	0.37	7.48	2.52	6.68	0.40	1.48	0.00	4.11	0.28	0.56	2.44	1.10	0.24	4.34	0.50	1.62
29	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.55	3.39	1.30	1.11	0.51	3.13	1.77	0.86	6.94	3.81	1.66	1.85	1.98	0.37	7.53	2.53	6.72	0.40	1.49	0.00	4.14	0.28	0.56	2.45	1.11	0.24	4.36	0.51	1.62
30	Ix	Intron	0	1.43	2.90	1.28	0.68	0.00	1.83	3.84	2.28	5.34	2.34	1.02	2.24	2.47	0.22	10.01	2.13	5.98	0.55	0.61	0.26	4.22	1.37	0.52	2.05	0.55	0.30	2.97	0.16	1.47
31	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.42	3.17	1.55	0.95	0.00	2.18	2.66	2.43	5.18	1.91	1.10	1.71	3.08	0.18	9.26	2.95	5.33	0.51	0.42	0.36	3.96	0.71	0.24	2.27	0.76	0.21	2.90	0.22	1.59
32	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.49	2.23	0.58	0.00	0.00	0.95	6.99	1.92	5.84	3.51	0.83	3.63	0.90	0.31	12.12	0.00	7.77	0.67	1.11	0.00	4.95	3.13	1.25	1.49	0.00	0.55	3.18	0.00	1.17
33	Ix	Intron	0	2.13	2.96	1.06	0.00	0.44	3.98	1.64	0.33	4.51	3.92	0.97	1.89	0.76	0.29	12.39	6.06	8.77	0.17	2.02	1.11	5.55	1.14	0.33	2.72	0.39	1.42	1.82	0.00	1.21
34	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.02	2.34	1.30	0.00	0.75	2.82	1.31	0.28	5.28	4.01	1.02	1.53	0.63	0.37	12.40	5.91	7.88	0.30	2.94	1.46	5.54	0.83	0.56	3.46	0.22	0.48	2.25	0.00	0.41
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.88	3.89	0.72	0.00	0.00	5.71	2.14	0.41	3.45	3.83	0.90	2.45	0.96	0.16	12.55	6.34	10.19	0.00	0.71	0.61	5.62	1.61	0.00	1.69	0.64	2.80	1.22	0.00	2.37
36	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00