Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C17orf76	Gene	0	5.36	4.70	18.24	3.65	1.01	13.46	3.74	6.95	8.58	21.71	2.98	9.24	4.21	7.73	10.95	12.25	24.58	8.45	6.06	11.79	7.47	8.72	3.28	49.68	8.82	10.49	2.52	3.43	17.70
2	325618	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	409083	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	470794	Transcript	0	2.86	0.00	21.88	0.00	0.00	7.31	2.86	5.75	4.93	12.00	0.71	4.68	1.93	8.11	8.57	9.03	27.77	6.94	4.05	8.68	7.14	10.96	1.11	27.49	8.68	11.80	0.00	3.44	12.12
5	409887	Transcript	0	2.94	0.59	3.04	0.17	0.24	2.67	1.02	2.31	1.46	2.15	0.43	2.12	1.06	0.92	4.24	3.14	2.78	1.00	1.30	2.77	0.94	1.21	0.48	5.51	0.98	0.95	0.32	1.46	3.45
6	IG28_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.46	0.80	0.00	0.00	0.58	0.57	0.12	0.88	2.05	0.50	0.96	0.30	0.96	1.87	2.46	4.27	0.27	0.55	0.00	1.21	0.00	0.46	3.05	2.37	1.01	1.56	1.39	3.38
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.81	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
10	ER1c	ExonRegion	0	2.94	1.64	4.09	0.00	0.00	3.51	0.75	0.37	0.30	6.46	0.61	0.80	0.70	1.93	1.17	3.58	5.73	4.64	0.68	2.86	2.24	3.00	1.16	6.82	1.04	3.14	0.34	0.61	3.75
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.90	0.00	7.18	0.00	0.00	9.09	0.00	0.00	1.64	19.97	1.30	1.54	1.62	3.35	7.57	0.00	26.27	9.25	0.00	7.11	3.29	4.96	4.14	19.98	5.19	3.99	0.00	0.00	14.03
12	E1a_E3b	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.20	0.82	0.92	0.00	0.31	0.38	0.48	0.00	0.42	0.00	0.38	0.77	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	2.17	0.48	1.32	0.00	0.00	0.56
14	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	1.34	1.18	0.47	0.81	1.11	2.57	0.91	0.21	2.86	2.13	0.81	2.10	4.48	2.90	2.35	2.42	3.64	1.44	1.81	8.11	2.99	1.23	1.13	5.01	1.14	1.52	2.49	1.57	4.21
16	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	2.72	2.04	2.33	0.91	3.72	1.74	1.28	0.00	0.93	3.30	1.21	1.25	3.12	2.30	1.39	1.89	3.41	2.48	1.22	5.26	2.17	1.83	1.15	3.55	2.54	2.99	0.23	2.07	2.46
17	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	1.50	0.00	4.19	0.72	0.49	0.96	1.41	0.18	0.79	2.03	1.07	1.98	2.88	4.26	1.39	1.99	2.53	1.35	0.64	4.11	1.29	1.63	1.63	5.68	1.29	1.26	3.30	1.47	1.28
18	I1_AR12	ActiveIntronRegion	0	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.20
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.06	0.00	0.00	0.00	2.49	0.80	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	1.24	0.00	0.76	0.00	0.00	0.21	0.00	2.86	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.90	0.00	1.20	0.00
20	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.23	0.00	0.63	0.00	0.38	0.44	0.25	0.00	0.00	1.07	0.75	0.51	0.41	1.24	1.27	0.31	0.54	0.73	0.13	0.43	0.36	0.00	0.00	0.81	0.54	0.12	0.46	0.50	0.17
21	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.76	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	0.00
22	ER2a	ExonRegion	0	5.22	4.74	10.64	0.00	0.00	9.88	3.52	2.83	2.53	15.36	1.20	8.24	3.07	6.50	10.94	11.46	27.72	9.25	4.88	12.16	4.04	7.69	3.99	24.90	5.67	15.40	0.72	0.33	12.43
23	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	1.04	7.97	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52
24	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	25.31	0.00	0.00	7.52	2.80	7.07	2.89	7.59	1.42	3.86	1.18	9.88	17.14	7.65	24.58	9.25	0.00	6.12	2.05	12.98	0.00	25.48	8.83	4.12	0.00	2.29	7.03
25	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.17	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
26	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	1.69	2.71	0.00	6.54	0.00	0.00
27	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.63	0.00	5.17	0.32	1.10	1.36	1.73	3.31	2.13	2.65	0.80	1.50	3.80	0.86	0.00	0.56	2.67	5.98	2.15	18.33	1.28	0.41	2.19	2.72	1.75	3.53	0.84	1.46	0.60
28	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.06	0.16	9.40	6.96	0.00	2.00	4.75	4.34	1.85	2.27	0.91	3.62	4.61	2.05	10.93	0.00	4.51	3.18	3.88	25.03	0.00	2.96	1.33	2.77	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
29	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.78	0.94	4.85	2.85	1.55	2.55	2.76	3.80	1.04	2.01	0.88	1.48	2.86	2.04	1.84	1.13	3.63	3.56	1.27	14.54	2.61	1.22	2.15	4.13	1.48	1.75	0.15	2.33	1.28
30	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.42	0.00	1.54	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	6.58	9.99	4.62	0.00	7.19	5.58	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49
31	ER3a	ExonRegion	0	1.78	0.00	1.17	0.00	0.00	1.94	0.84	0.58	1.24	1.85	0.00	1.10	0.54	0.98	0.03	1.50	3.54	1.85	0.49	0.86	1.75	0.24	0.00	1.91	0.31	0.49	0.28	1.31	0.70
32	E3_Ab	KnownBoundary	0	3.01	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	2.83	1.84	0.00	3.40	1.46	1.99	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	2.93	1.82	0.00	0.00	1.98	2.05
33	ER3b	ExonRegion	0	1.83	4.28	19.83	0.00	0.00	10.72	1.35	5.19	3.78	13.22	0.35	5.66	1.29	5.24	4.04	10.14	33.88	10.18	3.11	7.41	6.19	5.49	2.19	27.42	4.28	7.43	0.00	3.02	12.52
34	E3_Da	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.11	0.00	0.00	1.14	0.00	1.37	0.00	3.67	4.88	0.00	0.00	0.00	0.00	4.96	2.51	4.73	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55
35	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00
36	E3a_E5a	KnownJunction	0	5.72	0.00	18.44	0.00	0.00	7.10	2.92	4.43	6.97	16.42	0.00	5.51	2.67	6.34	0.00	10.40	30.95	4.62	8.09	11.25	12.23	8.95	2.22	29.49	8.52	19.48	0.00	4.58	17.20
37	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.95	1.43	0.64	0.00	0.00	1.13	0.89	2.37	1.43	3.63	0.26	2.27	1.46	0.97	4.16	0.79	5.40	0.85	2.36	0.00	1.48	0.40	1.42	1.43	0.89	0.35	1.22	1.57	0.60
38	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	2.47	3.91	0.00	5.21	1.37	0.00	7.57	0.00	10.06	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	2.07	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98
39	ER4a	ExonRegion	0	0.72	1.08	2.80	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	1.09	2.43	1.20	1.77	1.56	0.30	6.41	5.69	4.46	0.65	1.07	0.92	1.44	0.00	0.61	4.34	1.92	0.92	0.00	3.83	4.86
40	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	1.99	0.00	0.00	0.00	3.07	6.37	1.04	6.98	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.41	0.00	0.00	3.95	0.00	2.29	1.39
41	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.51	0.00	0.00	3.38	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	6.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.31	0.00	0.00	0.00	0.00	3.57
42	Ix	Intron	0	2.29	2.34	0.37	0.79	0.00	1.77	0.59	1.02	2.93	2.71	0.66	1.50	2.79	2.11	4.20	0.55	4.67	1.48	1.88	0.10	1.79	0.93	0.47	1.82	0.58	1.22	0.47	1.92	2.69
43	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.29	2.34	0.37	0.79	0.00	1.77	0.59	1.02	2.94	2.71	0.66	1.50	2.79	2.12	4.20	0.55	4.68	1.48	1.88	0.10	1.79	0.93	0.47	1.82	0.58	1.22	0.47	1.92	2.69
44	E5_Aa	NovelBoundary	0	5.72	0.00	1.30	9.92	0.00	3.76	0.00	0.00	4.05	7.47	0.00	2.98	0.00	7.38	0.00	3.14	8.64	0.00	0.00	0.00	3.37	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	4.36	0.00
45	ER5a	ExonRegion	0	5.35	6.26	27.43	7.36	0.29	15.01	4.02	7.11	9.34	25.66	3.16	13.38	5.49	10.44	15.09	14.27	32.36	10.15	4.28	17.63	8.50	10.78	4.60	52.51	8.69	14.28	2.64	4.62	20.59
46	E5_Da	KnownBoundary	0	11.27	17.55	37.80	19.20	0.00	35.34	4.41	12.04	31.73	39.27	7.85	19.25	4.68	13.69	43.05	31.52	55.06	28.77	16.18	47.30	27.84	19.64	4.78	124.12	12.81	14.85	0.00	14.51	44.80
47	ER5b	ExonRegion	0	5.95	7.57	28.95	5.41	2.38	24.35	5.95	10.85	17.13	39.34	5.89	15.55	6.64	12.62	14.30	21.79	39.68	13.68	12.11	15.60	13.52	14.35	4.98	98.76	17.71	17.39	4.96	4.96	31.37
48	E5_Db	KnownBoundary	0	24.30	26.18	0.00	107.63	46.86	77.23	107.74	36.58	26.52	18.30	18.63	4.46	4.33	13.09	211.08	42.00	2.43	0.00	0.00	154.90	10.99	8.85	20.34	22.37	10.53	13.78	34.29	52.08	16.57
49	ER5c	ExonRegion	0	12.21	1.85	4.71	0.84	1.20	4.91	4.27	10.97	2.06	6.49	0.93	1.46	3.22	3.33	14.74	1.90	5.88	2.49	4.93	12.05	1.49	5.83	1.81	13.01	2.66	1.43	1.31	2.14	8.11