Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	SPIRE2	Gene	0	2.90	2.07	2.34	1.19	1.32	1.82	1.00	1.08	2.19	2.04	0.57	1.22	0.60	5.35	9.12	4.57	4.04	3.01	1.64	3.58	2.32	1.06	1.09	5.28	4.86	6.18	1.08	6.06	5.59
2	393062	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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4	378247	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	443454	Transcript	0	0.01	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03
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7	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.46
9	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.46	1.30	0.00	0.00	0.00	0.82	0.46	1.16	1.70	0.00	0.49	0.81	0.00	0.36	0.46	0.00	0.96	2.17	1.14	0.00	3.45	4.43
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.70	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.21
12	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58
13	ER3a	ExonRegion	0	0.01	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03
14	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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16	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	4.52	0.00	3.06	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42
17	ER4a	ExonRegion	0	0.95	0.00	1.19	0.00	0.00	0.76	0.00	1.16	0.96	1.03	0.00	0.00	0.00	4.60	0.00	1.28	1.72	0.00	0.00	3.85	0.00	0.00	0.54	1.35	0.90	0.00	0.00	1.53	2.65
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.11	4.07	0.00	0.00	0.00	4.17	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	6.87
19	ER5a	ExonRegion	0	0.89	0.00	0.45	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	1.17	0.86	0.38	0.59	0.00	3.46	4.44	1.94	2.53	0.00	0.00	2.56	0.46	0.00	0.83	2.83	0.00	0.14	0.00	0.79	3.81
20	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E5b_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	0.00	0.00	4.41	0.00	0.00	4.64	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	2.31	2.57	0.00	2.19	0.00	0.00	3.30
22	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	3.63	0.00	0.00	4.84	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	1.81	6.09	0.00	1.57	0.00	0.00	2.68
23	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	1.24	0.00	1.08	0.00	3.01	1.80	0.00	2.56	1.13	0.00	1.55	0.00	0.00	0.33	2.00	0.00	0.56	1.07	1.46	8.15
24	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.89	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	2.04	0.00	0.00	0.00	1.99	7.77	0.00	0.00	0.00	0.00	3.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	6.87
25	ER7a	ExonRegion	0	0.81	0.00	0.18	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.68	0.31	0.00	0.51	0.00	1.11	0.63	2.49	1.39	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.57	0.00	0.76	6.21
26	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	2.16	3.17
27	ER8a	ExonRegion	0	0.52	0.00	1.50	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.71	0.39	2.48	3.03	2.40	2.17	1.16	0.00	0.96	0.44	0.00	0.54	1.29	0.43	1.00	0.00	1.66	3.41
28	E8a_E9a	KnownJunction	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	6.74	0.00	7.11	3.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.49	4.46
29	E9_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.75
30	ER9a	ExonRegion	0	0.16	0.05	2.07	0.00	3.93	0.00	0.42	0.49	0.60	0.00	0.00	0.48	0.70	3.29	5.66	2.14	1.82	0.00	0.86	0.81	1.30	0.48	0.49	2.38	0.77	0.79	0.00	2.10	2.10
31	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.49	0.00	12.97	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	1.09	7.97	6.66	5.13	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.49	5.02
32	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.96	1.59	0.00	0.00	0.62	0.20	0.83	0.51	0.22	0.00	0.42	0.00	2.22	4.06	0.63	2.93	0.00	1.44	0.00	0.87	1.04	0.00	0.86	2.05	2.92	0.00	2.32	7.74
33	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	2.19	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	1.45
34	I10_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.91	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.33	0.00	0.00	0.02	0.35	2.00	0.00	0.75	0.65	0.00	0.75	0.00	0.00	1.31	0.10	2.29	1.71	1.25	0.00	0.00	2.04
35	I10_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	3.63	0.00	0.00	1.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.29	0.00	0.00	0.00	0.00
36	I10_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.97	0.00	1.32	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I10_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00
38	E11_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	5.89	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.36
39	ER11a	ExonRegion	0	2.43	0.88	1.86	0.00	3.69	1.56	1.08	1.27	0.85	1.45	0.00	1.34	1.22	6.40	11.16	0.11	1.08	0.00	1.21	0.04	4.03	1.86	0.03	3.25	3.00	1.25	0.69	0.92	9.33
40	E11_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	2.77
41	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	0.00	5.72	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.43	7.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.47	0.00	0.00	0.00	5.64	4.16	0.00	3.95	7.79
42	E12_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	7.65	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	0.00
43	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	4.04	4.09	0.00	2.04	0.89	2.14	0.00	2.97	0.00	0.00	0.00	5.51	7.82	1.64	0.22	0.00	0.00	1.98	4.03	0.00	1.30	0.98	1.37	3.10	0.00	1.85	12.89
44	E12_Da	NovelBoundary	0	5.90	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.56	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.16	9.27	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	4.34	9.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.85	0.00	0.00	6.67
46	E12a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	I12_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.85	0.00	1.52	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	1.92
48	I12_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.34
49	I12_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.77	3.41	1.61	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	2.20	0.46	0.76	0.40	0.62	1.16	7.57	3.58	4.38	1.44	3.07	0.00	1.78	0.58	0.58	1.76	1.29	2.26	0.00	1.57	4.81
50	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.89	0.00	14.30	0.00	0.00	0.00	1.55	1.96	0.00	4.25	1.69	0.84	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	11.72	1.67	0.00	6.26	0.00	5.15
51	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	5.09	3.13	6.76	0.05	0.00	1.84	0.96	2.37	0.00	2.12	1.02	3.92	5.60	0.00	1.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	8.99	0.66	5.33	2.16	0.00	7.96
52	I13	Intron	0	0.25	0.57	0.59	0.00	0.29	1.05	0.00	0.22	0.66	0.93	0.14	0.22	0.00	2.18	4.60	2.19	2.20	1.36	0.56	2.11	2.10	0.00	0.32	2.78	2.77	1.85	0.86	0.67	1.50
53	I13_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.31	0.46	1.19	0.00	0.70	0.59	0.00	0.00	0.80	0.62	0.34	0.53	0.00	3.06	8.92	3.18	2.34	1.37	0.46	2.36	1.61	0.00	0.26	2.45	4.07	2.91	1.04	0.70	2.48
54	I13_SR1	SilentIntronRegion	0	0.22	0.65	0.17	0.00	0.00	1.38	0.00	0.37	0.57	1.16	0.00	0.00	0.00	1.57	1.57	1.50	2.10	1.36	0.63	1.94	2.45	0.00	0.36	3.03	1.87	1.11	0.74	0.66	0.81
55	E14_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.72	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	17.74	0.00	8.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	1.70	1.67	0.00	0.00	11.46
56	ER14a	ExonRegion	0	1.88	0.00	4.73	0.00	6.87	0.28	0.89	2.54	1.96	2.13	0.00	2.20	1.14	11.03	18.54	1.85	5.41	0.00	2.89	4.85	4.44	0.00	1.75	6.97	5.93	6.21	5.12	2.77	13.82
57	E14_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	8.37	0.00	3.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	1.74	2.19	0.00	0.00	0.00
58	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	1.96	0.00	7.32	3.11	0.00	0.00	0.00	1.88	9.97	16.74	3.52	1.80	0.00	0.00	0.00	3.85	0.00	2.02	9.15	1.78	2.06	0.00	10.51	18.52
59	I14	Intron	0	2.38	0.32	1.16	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.78	1.20	0.00	0.43	0.27	1.63	5.98	5.76	6.22	1.12	1.78	1.15	2.18	0.00	0.75	2.69	2.78	3.93	1.54	1.59	3.63
60	I14_SR1	SilentIntronRegion	0	2.40	0.32	1.17	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	0.79	1.21	0.00	0.43	0.27	1.65	6.03	5.81	6.27	1.12	1.79	1.16	2.20	0.00	0.76	2.71	2.80	3.96	1.55	1.60	3.66
61	E15_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	3.75	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	7.65	6.84	9.25	7.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.28	1.99	1.93	1.52
62	ER15a	ExonRegion	0	6.71	5.35	3.96	2.88	1.58	4.39	2.35	2.07	4.85	4.47	1.43	2.23	1.17	9.54	17.79	10.13	8.05	7.79	3.56	7.96	4.69	2.46	2.09	11.12	11.50	14.74	2.21	14.54	8.00
63	IG51	Intergenic	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.92	0.64	3.27	1.76	0.00	0.00	2.26	1.95	2.02	0.00	0.00	0.00	3.04	4.45	0.00	0.00	0.00
64	IG51_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.95	0.66	3.28	1.77	0.00	0.00	2.33	2.01	2.08	0.00	0.00	0.00	3.10	4.58	0.00	0.00	0.00