Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C16orf55	Gene	0	16.16	7.56	10.96	5.70	8.59	16.03	14.73	5.01	11.34	15.32	9.44	14.51	8.72	19.79	17.82	14.84	16.53	16.39	29.03	4.02	23.92	8.79	23.74	10.81	10.65	23.76	12.85	13.96	12.19
2	301031	Transcript	0	1.50	0.11	0.85	6.56	6.53	2.12	6.95	2.40	0.66	1.21	0.76	1.52	4.47	0.57	0.00	2.31	0.00	6.61	0.00	0.00	0.00	1.54	2.68	1.65	0.00	1.06	7.73	0.00	1.26
3	453346	Transcript	0	3.45	0.00	2.35	1.33	0.00	0.46	2.62	0.63	0.73	0.00	0.00	1.90	0.87	0.74	0.00	2.56	1.01	4.90	2.45	0.00	0.48	0.61	3.07	0.64	0.00	2.62	1.94	0.43	0.00
4	457689	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.21	0.30	2.54	6.28	0.64	2.23	0.28	0.11	0.39	0.16	0.36	1.61	0.14	0.00	0.80	0.00	3.98	0.00	0.00	0.00	0.61	0.69	1.03	0.00	0.24	2.89	0.00	0.48
6	E1a_E3a	KnownJunction	0	3.01	0.00	1.40	10.57	6.78	3.61	11.67	4.53	1.22	2.04	1.36	2.68	7.32	1.00	0.00	3.82	0.00	9.25	0.00	0.00	0.00	2.48	4.68	2.27	0.00	1.89	12.57	0.00	2.05
7	ER2a	ExonRegion	0	4.37	0.00	2.08	0.00	0.00	0.00	5.24	1.25	1.47	0.00	0.00	1.37	0.88	0.00	0.00	5.06	0.00	7.86	0.66	0.00	0.97	1.23	6.15	0.00	0.00	5.24	3.88	0.72	0.00
8	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.09	0.00	1.64	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.43	7.01	2.16	0.00
9	ER2b	ExonRegion	0	0.00	1.46	0.41	0.00	0.00	1.53	2.07	1.23	1.50	0.08	0.00	1.61	0.65	1.79	0.00	0.35	0.11	1.52	11.82	0.00	1.03	0.00	1.31	0.24	0.00	5.72	2.29	0.82	0.00
10	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	4.56	0.00	0.00	0.00	1.96	5.15	2.54	1.52	0.00	0.00	0.00	1.50	2.26	0.00	0.00	0.00	4.62	16.18	0.00	2.05	0.00	2.51	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
11	I2	Intron	1	5.48	2.99	2.28	7.34	7.50	3.04	14.44	2.51	2.87	3.69	1.42	4.21	3.76	3.09	11.61	5.99	2.55	7.06	11.44	0.47	2.67	1.84	5.24	2.20	3.90	8.58	4.37	5.84	3.20
12	I2_AR1	ActiveIntronRegion	1	5.52	3.01	2.29	7.39	7.55	3.06	14.54	2.52	2.89	3.72	1.43	4.24	3.79	3.11	11.69	6.03	2.56	7.11	11.52	0.47	2.69	1.86	5.28	2.22	3.93	8.64	4.40	5.88	3.22
13	E3_Aa	NovelBoundary	0	30.50	4.85	2.89	0.00	0.00	1.42	7.67	12.19	6.40	1.52	7.66	1.27	3.25	14.69	9.17	3.82	12.09	9.12	0.00	3.97	3.41	6.81	2.51	8.49	12.46	7.47	0.00	0.00	1.49
14	ER3a	ExonRegion	0	23.42	9.18	6.15	3.78	6.47	12.93	26.40	6.91	4.13	11.66	3.77	11.32	15.74	13.46	19.22	17.53	19.16	25.32	34.44	0.81	7.53	5.19	15.83	9.59	7.39	17.60	10.47	6.15	7.27
15	E3_Da	KnownBoundary	0	4.60	0.00	1.54	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.37	0.00	0.00	3.11	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	27.43	9.60	6.85	0.00	6.04	13.35	18.31	2.54	5.60	11.94	7.37	4.04	12.07	10.15	25.11	3.67	18.93	18.49	32.37	0.00	5.62	8.56	23.64	8.61	1.70	23.22	20.62	0.00	4.59
17	ER3b	ExonRegion	0	2.53	0.00	2.62	2.66	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.43	0.86	1.48	0.00	0.07	2.02	1.95	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00
18	E3_Db	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	1.37	0.00	0.00	1.54	0.00	1.02	0.00	0.00	1.01	4.62	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	2.99	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00
19	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.15	0.63	0.33	2.11	0.48	2.29	0.00	2.16	2.80	1.98	1.16	3.68	0.83	2.17	1.53	1.94	4.24	5.19	4.69	0.54	1.82	0.00	0.18	1.90	0.28	0.77	1.25	1.12	0.00
20	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	2.57	1.80	1.45	3.81	1.58	2.47	0.13	1.22	1.86	1.06	0.55	3.57	1.98	1.64	0.31	0.94	2.58	2.33	1.27	0.18	0.47	0.24	0.12	2.57	1.52	0.73	0.37	1.29	0.09
21	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.94	1.80	0.34	0.00	0.14	4.18	3.67	3.73	4.09	1.17	2.17	4.50	5.12	2.33	6.13	2.87	5.74	7.41	7.11	2.79	0.31	0.36	1.83	6.09	1.74	5.41	4.08	2.35	1.62
22	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	1.67	0.00	4.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	I3_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	4.50	0.83	0.47	0.96	0.40	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	2.67	0.00	1.19	0.85	0.00
25	I3_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.00	0.00	0.00	1.00	2.73	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	4.40	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	1.09	0.00	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER4a	ExonRegion	0	17.54	8.45	12.73	6.46	9.70	18.48	15.44	5.47	13.49	17.79	11.27	16.65	9.19	23.05	20.22	16.46	18.56	17.34	32.25	4.87	28.68	10.28	27.50	12.34	12.45	27.34	14.55	16.57	14.32
28	IG47_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	2.69	3.91	0.68	2.90	0.97	2.63	0.41	0.00	0.96	2.68	0.72	1.44	0.35	1.96	5.69	1.15	2.60	4.35	3.39	0.56	0.95	0.08	0.37	0.87	2.02	0.95	0.37	3.71	0.17
29	IG47_SR6	SilentIntergenicRegion	0	1.59	2.29	0.40	5.10	0.00	2.68	0.00	0.00	0.76	0.97	0.56	1.24	0.21	2.64	4.27	1.59	5.02	3.39	9.66	1.31	0.75	1.19	1.72	0.51	0.68	0.75	0.00	4.15	0.76
30	IG47_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	0.52	1.13	1.76	0.00	1.75	8.85	0.00	3.24	1.15	0.00	1.67	3.25	2.73	8.59	8.42	4.36	7.45	5.25	19.10	1.94	1.75	0.63	2.54	3.78	4.52	1.66	0.64	5.17	0.94
31	IG47_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	9.74	3.80	2.42	2.96	8.07	4.83	6.24	0.38	1.62	7.45	0.98	4.21	4.82	5.52	6.26	3.07	4.62	10.87	9.89	5.12	2.65	2.23	14.56	1.33	1.48	3.89	4.16	12.79	0.28