Summary page for 'HMG20A' (ENSG00000140382) - Project: DLBCL_ABC_GCB
Basic Gene Stats
Species: Human
Gene Name: 'HMG20A' (HUGO: HMG20A)
ALEXA Gene ID: 8056 (ALEXA_hs_57_37b)
EnsEMBL Gene ID: ENSG00000140382
Entrez Gene Record(s): HMG20A
Ensembl Gene Record: ENSG00000140382
Evidence: Known Gene
Gene Type: protein_coding
Location: chr15 77712993-77777949 (+): 15q24
Size (bp): 64957
Description: high-mobility group 20A [Source:HGNC Symbol;Acc:5001]
Data links for each library (displays expression data in UCSC Genome Browser)
Comparison: HS0932_vs_HS1181
ABC_RG049 (HS0932) has 3,781 total reads for 'HMG20A'. UCSC data links: (C | P)
GCB_RG069 (HS1181) has 6,693 total reads for 'HMG20A'. UCSC data links: (C | P)
Link to other genes in the same chromosome region as 'HMG20A'
Features defined for this gene: 182
Gene: 1
Transcript: 3
ExonRegion: 15
Junction: 47
KnownJunction: 11
NovelJunction: 36
Boundary: 23
KnownBoundary: 3
NovelBoundary: 20
Intron: 10
ActiveIntronRegion: 18
SilentIntronRegion: 16
Intergenic: 2
ActiveIntergenicRegion: 26
SilentIntergenicRegion: 22
Summary of transcript specific features for 'HMG20A' (ENSG00000140382)
ENST00000435040: | NA |
ENST00000381714: | E1a_E2a, ER2a, E2a_E3a |
ENST00000336216: | ER1a, ER11c |
Summary of known expressed features
Expressed above background
Library | Exon Regions (Expressed/Total) | Known Junctions (Expressed/Total) |
ABC_RG012: | 14/15 | 9/11 |
ABC_RG016: | 13/15 | 10/11 |
ABC_RG015: | 11/15 | 9/11 |
ABC_RG046: | 13/15 | 10/11 |
ABC_RG047: | 13/15 | 10/11 |
ABC_RG048: | 14/15 | 11/11 |
ABC_RG049: | 13/15 | 11/11 |
ABC_RG058: | 14/15 | 10/11 |
ABC_RG059: | 13/15 | 9/11 |
ABC_RG061: | 14/15 | 11/11 |
ABC_RG073: | 14/15 | 11/11 |
ABC_RG074: | 13/15 | 10/11 |
ABC_RG086: | 12/15 | 9/11 |
GCB_RG003: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG005: | 12/15 | 9/11 |
GCB_RG006: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG007: | 13/15 | 9/11 |
GCB_RG010: | 13/15 | 11/11 |
GCB_RG014: | 13/15 | 9/11 |
GCB_RG045: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG050: | 15/15 | 10/11 |
GCB_RG055: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG062: | 13/15 | 11/11 |
GCB_RG063: | 14/15 | 10/11 |
GCB_RG064: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG071: | 13/15 | 10/11 |
GCB_RG072: | 13/15 | 9/11 |
GCB_RG069: | 14/15 | 11/11 |
GCB_RG085: | 14/15 | 11/11 |
Detected at any level above 0
Library | Exon Regions (Detected/Total) | Known Junctions (Detected/Total) |
ABC_RG012: | 15/15 | 9/11 |
ABC_RG016: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG015: | 14/15 | 10/11 |
ABC_RG046: | 15/15 | 10/11 |
ABC_RG047: | 14/15 | 10/11 |
ABC_RG048: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG049: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG058: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG059: | 15/15 | 9/11 |
ABC_RG061: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG073: | 14/15 | 11/11 |
ABC_RG074: | 15/15 | 11/11 |
ABC_RG086: | 15/15 | 9/11 |
GCB_RG003: | 15/15 | 11/11 |
GCB_RG005: | 14/15 | 9/11 |
GCB_RG006: | 14/15 | 10/11 |
GCB_RG007: | 15/15 | 11/11 |
GCB_RG010: | 15/15 | 11/11 |
GCB_RG014: | 14/15 | 9/11 |
GCB_RG045: | 15/15 | 10/11 |
GCB_RG050: | 15/15 | 11/11 |
GCB_RG055: | 14/15 | 10/11 |
GCB_RG062: | 15/15 | 11/11 |
GCB_RG063: | 15/15 | 10/11 |
GCB_RG064: | 14/15 | 10/11 |
GCB_RG071: | 14/15 | 11/11 |
GCB_RG072: | 15/15 | 9/11 |
GCB_RG069: | 14/15 | 11/11 |
GCB_RG085: | 15/15 | 11/11 |
Normalized expression data for each known or novel expressed feature of 'HMG20A'
The following table summarizes the expression values of all known features of the gene 'HMG20A' in each library. Known features (i.e. those that correspond to one or more EnsEMBL transcripts) are included regardless of their expression level. Novel features are only reported in this table if they are expressed above the level of intergenic background noise. The 'FID' column reports the unique Feature ID for the gene, transcript, exon region, exon junction, etc. The 'Name' column reports the Feature Name for the feature (e.g. E5a_E6a is the name of an exon junction corresponding to the connection of exons 5 and 6). The 'Type' column reports the type of the feature and may be one of the following: Gene, Transcript, Exon Region, Known Junction, Novel Junction, Known Boundary, Novel Boundary, Silent or Active Intronic Regions, and Silent or Active Intergenic Regions (see our manuscript for more details). The 'Base Count' column reports the number of nucleotide bases for the feature followed by the percent of these that do NOT correspond to repeats and the percent that are known to be protein coding in one or more EnsEMBL transcripts. The 'Supporting ESTs/mRNAs' column reports the number of ESTs and mRNAs that when aligned to the human genome support the expression of a feature (i.e. the sequence alignment coordinates match an exon junction or boundaries of an exon, retained intron, etc.). The 'Conserved Species' column reports the number of 'other' species for which there was at least 1 supporting EST/mRNA alignment. Finally, the remaining columns report the log2 expression value for each feature in each library. Bold values indicate expression above background. Each expression value is also a hyperlink to a view of the feature's corresponding genomic region in the UCSC genome browser. Expression data will automatically be loaded as custom GFF and wiggle tracks.
FID | Name | Type | Base Count (% unmasked | % coding) | Supporting Human ESTs/mRNAs | Conserved Species | ABC_RG012 Log2 Expression | ABC_RG016 Log2 Expression | ABC_RG015 Log2 Expression | ABC_RG046 Log2 Expression | ABC_RG047 Log2 Expression | ABC_RG048 Log2 Expression | ABC_RG049 Log2 Expression | ABC_RG058 Log2 Expression | ABC_RG059 Log2 Expression | ABC_RG061 Log2 Expression | ABC_RG073 Log2 Expression | ABC_RG074 Log2 Expression | ABC_RG086 Log2 Expression | GCB_RG003 Log2 Expression | GCB_RG005 Log2 Expression | GCB_RG006 Log2 Expression | GCB_RG007 Log2 Expression | GCB_RG010 Log2 Expression | GCB_RG014 Log2 Expression | GCB_RG045 Log2 Expression | GCB_RG050 Log2 Expression | GCB_RG055 Log2 Expression | GCB_RG062 Log2 Expression | GCB_RG063 Log2 Expression | GCB_RG064 Log2 Expression | GCB_RG071 Log2 Expression | GCB_RG072 Log2 Expression | GCB_RG069 Log2 Expression | GCB_RG085 Log2 Expression |
G8056 | HMG20A | Gene | 4139 (95% | 25%) | N/A | N/A | 6.57 (C | P) | 7.06 (C | P) | 7.51 (C | P) | 7.63 (C | P) | 8.23 (C | P) | 7.60 (C | P) | 6.57 (C | P) | 6.83 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.95 (C | P) | 7.45 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.14 (C | P) | 6.66 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.30 (C | P) | 6.81 (C | P) | 6.08 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.43 (C | P) | 7.56 (C | P) | 7.47 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.87 (C | P) | 7.08 (C | P) | 6.81 (C | P) |
T46545 | ENST00000336216 | Transcript | 248 (100% | 0%) | N/A | N/A | 3.78 (C | P) | 3.81 (C | P) | 3.79 (C | P) | 5.53 (C | P) | 5.40 (C | P) | 5.44 (C | P) | 3.47 (C | P) | 3.36 (C | P) | 3.17 (C | P) | 4.93 (C | P) | 4.75 (C | P) | 3.31 (C | P) | 3.51 (C | P) | 4.04 (C | P) | 2.59 (C | P) | 4.29 (C | P) | 4.61 (C | P) | 4.48 (C | P) | 3.47 (C | P) | 3.20 (C | P) | 4.77 (C | P) | 3.13 (C | P) | 4.60 (C | P) | 4.46 (C | P) | 3.41 (C | P) | 3.24 (C | P) | 4.99 (C | P) | 3.47 (C | P) | 3.60 (C | P) |
T46547 | ENST00000435040 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T46546 | ENST00000381714 | Transcript | 217 (83% | 12%) | N/A | N/A | 0.86 (C | P) | 2.98 (C | P) | 1.76 (C | P) | 3.63 (C | P) | 2.97 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.71 (C | P) | 3.77 (C | P) | 0.39 (C | P) | 3.40 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.14 (C | P) | 0.33 (C | P) | 2.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.83 (C | P) | 2.09 (C | P) | 3.41 (C | P) | 0.51 (C | P) | 1.39 (C | P) | 3.24 (C | P) | 2.42 (C | P) | 3.03 (C | P) | 1.91 (C | P) | 1.07 (C | P) | 3.49 (C | P) | 0.14 (C | P) | 1.88 (C | P) | 2.17 (C | P) |
AIG19151 | IG34_AR4 | ActiveIntergenicRegion | 429 (55% | 0%) | 1 | 0 | 3.22 (C | P) | 3.19 (C | P) | 2.07 (C | P) | 2.84 (C | P) | 4.07 (C | P) | 3.68 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.74 (C | P) | 3.00 (C | P) | 4.36 (C | P) | 3.03 (C | P) | 3.31 (C | P) | 1.75 (C | P) | 2.40 (C | P) | 2.06 (C | P) | 3.24 (C | P) | 2.18 (C | P) | 4.38 (C | P) | 2.54 (C | P) | 1.75 (C | P) | 3.86 (C | P) | 1.58 (C | P) | 2.85 (C | P) | 3.65 (C | P) | 1.15 (C | P) | 2.75 (C | P) | 3.27 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.01 (C | P) |
AIG19155 | IG34_AR8 | ActiveIntergenicRegion | 11 (100% | 0%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.41 (C | P) | 2.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.23 (C | P) |
AIG19158 | IG34_AR11 | ActiveIntergenicRegion | 63 (100% | 0%) | 7 | 1 | 1.45 (C | P) | 1.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.77 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.29 (C | P) | 1.34 (C | P) | 1.91 (C | P) | 1.08 (C | P) | 3.14 (C | P) | 1.54 (C | P) | 2.32 (C | P) | 1.63 (C | P) | 1.68 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.88 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.02 (C | P) | 2.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.17 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 2.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.66 (C | P) |
AIG19161 | IG34_AR14 | ActiveIntergenicRegion | 7 (100% | 0%) | 2 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
AIG19163 | IG34_AR16 | ActiveIntergenicRegion | 22 (100% | 0%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 1.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.39 (C | P) | 0.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.37 (C | P) |
AIG19164 | IG34_AR17 | ActiveIntergenicRegion | 168 (83% | 0%) | 2 | 0 | 2.68 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.70 (C | P) | 2.65 (C | P) | 1.48 (C | P) | 3.46 (C | P) | 1.31 (C | P) | 1.08 (C | P) | 1.14 (C | P) | 3.06 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.45 (C | P) | 2.15 (C | P) | 2.38 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.05 (C | P) | 2.76 (C | P) | 4.17 (C | P) | 2.51 (C | P) | 2.25 (C | P) | 3.56 (C | P) | 1.21 (C | P) | 3.04 (C | P) | 3.49 (C | P) | 1.36 (C | P) | 2.16 (C | P) | 2.94 (C | P) | 1.97 (C | P) | 1.88 (C | P) |
ER82787 | ER1a | ExonRegion | 242 (100% | 0%) | 1 | 0 | 4.65 (C | P) | 4.46 (C | P) | 4.73 (C | P) | 6.43 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.33 (C | P) | 4.33 (C | P) | 4.19 (C | P) | 3.69 (C | P) | 5.82 (C | P) | 5.72 (C | P) | 4.03 (C | P) | 4.36 (C | P) | 4.86 (C | P) | 2.88 (C | P) | 5.26 (C | P) | 5.44 (C | P) | 5.15 (C | P) | 4.40 (C | P) | 4.04 (C | P) | 5.65 (C | P) | 4.05 (C | P) | 5.50 (C | P) | 5.30 (C | P) | 4.34 (C | P) | 4.16 (C | P) | 5.90 (C | P) | 4.40 (C | P) | 4.44 (C | P) |
EB260294 | E1_Ab | KnownBoundary | 62 (100% | 0%) | 47 | 3 | 4.44 (C | P) | 2.55 (C | P) | 2.48 (C | P) | 4.24 (C | P) | 4.50 (C | P) | 5.86 (C | P) | 3.27 (C | P) | 4.14 (C | P) | 2.51 (C | P) | 3.90 (C | P) | 4.08 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.58 (C | P) | 4.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.22 (C | P) | 3.19 (C | P) | 4.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.87 (C | P) | 3.91 (C | P) | 3.04 (C | P) | 5.16 (C | P) | 3.63 (C | P) | 2.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.86 (C | P) | 3.25 (C | P) |
EB260295 | E1_Ac | KnownBoundary | 62 (100% | 0%) | 61 | 3 | 4.67 (C | P) | 5.47 (C | P) | 3.63 (C | P) | 4.31 (C | P) | 5.76 (C | P) | 6.77 (C | P) | 4.14 (C | P) | 3.82 (C | P) | 4.02 (C | P) | 6.34 (C | P) | 5.53 (C | P) | 4.34 (C | P) | 3.46 (C | P) | 5.71 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.42 (C | P) | 5.39 (C | P) | 5.12 (C | P) | 5.37 (C | P) | 4.29 (C | P) | 5.36 (C | P) | 4.54 (C | P) | 3.91 (C | P) | 5.43 (C | P) | 5.35 (C | P) | 5.20 (C | P) | 4.18 (C | P) | 4.50 (C | P) | 4.15 (C | P) |
ER82788 | ER1b | ExonRegion | 9 (100% | 0%) | 165 | 7 | 6.12 (C | P) | 5.55 (C | P) | 5.06 (C | P) | 6.38 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.53 (C | P) | 5.30 (C | P) | 5.39 (C | P) | 4.51 (C | P) | 6.95 (C | P) | 6.21 (C | P) | 5.59 (C | P) | 5.02 (C | P) | 6.35 (C | P) | 4.30 (C | P) | 6.42 (C | P) | 5.99 (C | P) | 6.85 (C | P) | 5.80 (C | P) | 5.42 (C | P) | 6.41 (C | P) | 5.55 (C | P) | 5.85 (C | P) | 6.25 (C | P) | 5.82 (C | P) | 5.81 (C | P) | 4.99 (C | P) | 5.28 (C | P) | 5.02 (C | P) |
ER82789 | ER1c | ExonRegion | 103 (100% | 0%) | 210 | 7 | 6.62 (C | P) | 6.75 (C | P) | 8.38 (C | P) | 9.09 (C | P) | 9.74 (C | P) | 8.57 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.93 (C | P) | 5.41 (C | P) | 8.30 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.60 (C | P) | 7.18 (C | P) | 6.10 (C | P) | 7.68 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.83 (C | P) | 6.91 (C | P) | 5.91 (C | P) | 7.60 (C | P) | 6.54 (C | P) | 8.09 (C | P) | 6.64 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.58 (C | P) | 8.06 (C | P) | 7.37 (C | P) | 6.79 (C | P) |
EB260293 | E1_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 1 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584554 | E1a_E2a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 3 | 0 | 0.00 (C | P) | 2.20 (C | P) | 1.78 (C | P) | 4.93 (C | P) | 3.82 (C | P) | 3.24 (C | P) | 2.65 (C | P) | 1.63 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.02 (C | P) | 2.08 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.44 (C | P) | 2.71 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.70 (C | P) | 1.32 (C | P) |
EJ1584555 | E1a_E3a | KnownJunction | 62 (100% | 44%) | 282 | 11 | 6.46 (C | P) | 5.90 (C | P) | 7.99 (C | P) | 7.07 (C | P) | 8.87 (C | P) | 6.22 (C | P) | 5.29 (C | P) | 5.56 (C | P) | 4.39 (C | P) | 6.57 (C | P) | 7.47 (C | P) | 6.32 (C | P) | 6.44 (C | P) | 6.31 (C | P) | 5.05 (C | P) | 6.31 (C | P) | 6.97 (C | P) | 6.88 (C | P) | 6.03 (C | P) | 4.90 (C | P) | 6.06 (C | P) | 6.75 (C | P) | 7.05 (C | P) | 6.42 (C | P) | 6.04 (C | P) | 5.86 (C | P) | 8.43 (C | P) | 6.24 (C | P) | 6.58 (C | P) |
AIN52514 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 84 (100% | 0%) | 2 | 1 | 0.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.75 (C | P) | 0.66 (C | P) | 1.08 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.34 (C | P) | 0.62 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.84 (C | P) | 0.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.66 (C | P) | 1.68 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.90 (C | P) | 0.96 (C | P) | 1.68 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.26 (C | P) | 1.84 (C | P) | 1.08 (C | P) |
AIN52515 | Ix_AR2 | ActiveIntronRegion | 286 (83% | 0%) | 2 | 0 | 0.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.04 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.95 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.69 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.52 (C | P) |
EB260296 | E2_Aa | NovelBoundary | 62 (65% | 0%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.80 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82790 | ER2a | ExonRegion | 93 (80% | 0%) | 4 | 0 | 1.79 (C | P) | 2.17 (C | P) | 2.52 (C | P) | 2.52 (C | P) | 3.07 (C | P) | 3.21 (C | P) | 2.74 (C | P) | 3.30 (C | P) | 0.96 (C | P) | 3.47 (C | P) | 1.62 (C | P) | 1.51 (C | P) | 0.82 (C | P) | 2.66 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.24 (C | P) | 2.75 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.79 (C | P) | 2.67 (C | P) | 2.29 (C | P) | 2.63 (C | P) | 1.90 (C | P) | 1.29 (C | P) | 2.53 (C | P) | 0.38 (C | P) | 1.51 (C | P) | 1.92 (C | P) |
EB260297 | E2_Da | NovelBoundary | 62 (34% | 0%) | 1 | 0 | 1.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.61 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584563 | E2a_E3a | KnownJunction | 62 (71% | 44%) | 3 | 0 | 0.00 (C | P) | 3.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.37 (C | P) | 2.75 (C | P) | 4.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.65 (C | P) | 1.37 (C | P) | 2.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.13 (C | P) | 2.50 (C | P) | 3.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.15 (C | P) | 3.34 (C | P) | 2.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 4.66 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.85 (C | P) |
AIN52516 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 109 (81% | 0%) | 2 | 0 | 1.77 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.05 (C | P) | 0.63 (C | P) | 0.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.86 (C | P) | 1.88 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.08 (C | P) | 0.00 (C | P) |
AIN52517 | Ix_AR2 | ActiveIntronRegion | 44 (100% | 0%) | 2 | 0 | 0.14 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 1.06 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.55 (C | P) | 0.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.00 (C | P) |
AIN52518 | Ix_AR3 | ActiveIntronRegion | 68 (100% | 0%) | 2 | 0 | 1.14 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB260298 | E3_Aa | NovelBoundary | 62 (85% | 44%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.44 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82791 | ER3a | ExonRegion | 93 (100% | 96%) | 259 | 13 | 6.54 (C | P) | 6.49 (C | P) | 7.13 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.59 (C | P) | 6.43 (C | P) | 6.66 (C | P) | 5.01 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.39 (C | P) | 6.50 (C | P) | 6.46 (C | P) | 7.08 (C | P) | 4.86 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.22 (C | P) | 6.31 (C | P) | 5.77 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.58 (C | P) | 7.09 (C | P) | 6.36 (C | P) | 6.38 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.42 (C | P) | 6.56 (C | P) | 6.29 (C | P) |
EB260299 | E3_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 1 | 0 | 2.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.72 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584571 | E3a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 299 | 12 | 7.34 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.12 (C | P) | 7.84 (C | P) | 7.52 (C | P) | 9.40 (C | P) | 7.93 (C | P) | 7.79 (C | P) | 6.03 (C | P) | 9.17 (C | P) | 7.85 (C | P) | 7.36 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.60 (C | P) | 6.50 (C | P) | 8.14 (C | P) | 7.42 (C | P) | 8.52 (C | P) | 8.07 (C | P) | 6.64 (C | P) | 8.12 (C | P) | 7.50 (C | P) | 8.27 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.38 (C | P) | 8.40 (C | P) | 7.10 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.11 (C | P) |
AIN52519 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 61 (100% | 0%) | 2 | 0 | 0.00 (C | P) | 1.88 (C | P) | 0.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.85 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.04 (C | P) | 1.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.62 (C | P) | 0.07 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.88 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.06 (C | P) | 0.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.73 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB260300 | E4_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.04 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.57 (C | P) | 2.36 (C | P) | 1.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.93 (C | P) | 4.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.23 (C | P) |
ER82792 | ER4a | ExonRegion | 148 (100% | 100%) | 282 | 12 | 7.27 (C | P) | 7.15 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.80 (C | P) | 7.77 (C | P) | 8.27 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.60 (C | P) | 5.85 (C | P) | 8.38 (C | P) | 8.03 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.59 (C | P) | 5.83 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.95 (C | P) | 7.13 (C | P) | 6.37 (C | P) | 7.30 (C | P) | 7.06 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.28 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.91 (C | P) | 7.55 (C | P) | 6.90 (C | P) |
EB260301 | E4_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 2 | 0 | 2.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.04 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.08 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.45 (C | P) | 2.89 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.11 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 3.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.64 (C | P) | 1.50 (C | P) |
EJ1584578 | E4a_E5a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 252 | 14 | 7.41 (C | P) | 7.44 (C | P) | 8.55 (C | P) | 8.56 (C | P) | 8.50 (C | P) | 7.41 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.00 (C | P) | 5.83 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.89 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.35 (C | P) | 5.46 (C | P) | 6.60 (C | P) | 7.26 (C | P) | 7.31 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.50 (C | P) | 6.06 (C | P) | 6.64 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.00 (C | P) | 7.97 (C | P) | 6.94 (C | P) | 6.44 (C | P) |
EJ1584579 | E4a_E6a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.15 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN46849 | Ix | Intron | 2707 (58% | 0%) | 0 | 0 | 1.97 (C | P) | 1.97 (C | P) | 0.86 (C | P) | 1.92 (C | P) | 2.00 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.04 (C | P) | 1.35 (C | P) | 1.66 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.33 (C | P) | 1.50 (C | P) | 0.58 (C | P) | 1.68 (C | P) | 1.90 (C | P) | 1.71 (C | P) | 2.08 (C | P) | 2.70 (C | P) | 2.50 (C | P) | 1.28 (C | P) | 2.08 (C | P) | 0.37 (C | P) | 0.50 (C | P) | 2.05 (C | P) | 1.29 (C | P) | 0.82 (C | P) | 0.38 (C | P) | 1.89 (C | P) | 1.09 (C | P) |
AIN52520 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 625 (84% | 0%) | 2 | 0 | 2.04 (C | P) | 1.48 (C | P) | 0.86 (C | P) | 2.16 (C | P) | 1.94 (C | P) | 2.20 (C | P) | 0.66 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.80 (C | P) | 1.92 (C | P) | 1.18 (C | P) | 1.65 (C | P) | 0.25 (C | P) | 1.12 (C | P) | 1.23 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.45 (C | P) | 2.24 (C | P) | 2.78 (C | P) | 0.85 (C | P) | 1.68 (C | P) | 0.23 (C | P) | 0.77 (C | P) | 1.29 (C | P) | 0.63 (C | P) | 0.93 (C | P) | 0.43 (C | P) | 1.94 (C | P) | 0.77 (C | P) |
AIN52521 | Ix_AR2 | ActiveIntronRegion | 463 (86% | 0%) | 2 | 0 | 0.87 (C | P) | 2.72 (C | P) | 0.90 (C | P) | 2.23 (C | P) | 2.43 (C | P) | 2.77 (C | P) | 1.62 (C | P) | 1.54 (C | P) | 1.33 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.46 (C | P) | 1.00 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.46 (C | P) | 1.89 (C | P) | 1.81 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.35 (C | P) | 1.65 (C | P) | 2.53 (C | P) | 0.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.20 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.77 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.60 (C | P) |
SIN69980 | Ix_SR2 | SilentIntronRegion | 348 (15% | 0%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 2.67 (C | P) | 0.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 1.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.91 (C | P) | 1.17 (C | P) | 0.24 (C | P) | 1.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.43 (C | P) | 2.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.41 (C | P) | 1.10 (C | P) | 2.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.16 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.91 (C | P) |
AIN52522 | Ix_AR3 | ActiveIntronRegion | 510 (93% | 0%) | 1 | 0 | 2.63 (C | P) | 1.62 (C | P) | 1.02 (C | P) | 1.73 (C | P) | 1.89 (C | P) | 2.88 (C | P) | 1.06 (C | P) | 1.25 (C | P) | 1.91 (C | P) | 2.99 (C | P) | 1.63 (C | P) | 1.49 (C | P) | 0.68 (C | P) | 2.15 (C | P) | 2.09 (C | P) | 1.88 (C | P) | 2.82 (C | P) | 3.30 (C | P) | 2.46 (C | P) | 1.51 (C | P) | 2.39 (C | P) | 0.04 (C | P) | 0.66 (C | P) | 2.68 (C | P) | 1.70 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.10 (C | P) | 1.66 (C | P) |
SIN69981 | Ix_SR3 | SilentIntronRegion | 122 (27% | 0%) | 0 | 0 | 1.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.96 (C | P) | 2.53 (C | P) | 0.87 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.43 (C | P) | 0.91 (C | P) | 2.19 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.89 (C | P) | 1.66 (C | P) | 2.39 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.14 (C | P) | 0.14 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.57 (C | P) | 2.21 (C | P) |
EB260302 | E5_Aa | NovelBoundary | 62 (53% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.24 (C | P) | 3.53 (C | P) | 3.98 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.76 (C | P) | 2.87 (C | P) | 2.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.57 (C | P) | 1.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.28 (C | P) | 3.18 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.74 (C | P) | 3.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.33 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82793 | ER5a | ExonRegion | 213 (100% | 100%) | 108 | 16 | 7.77 (C | P) | 7.42 (C | P) | 8.52 (C | P) | 8.74 (C | P) | 9.27 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.06 (C | P) | 7.84 (C | P) | 6.12 (C | P) | 8.47 (C | P) | 8.10 (C | P) | 7.42 (C | P) | 7.62 (C | P) | 7.90 (C | P) | 5.98 (C | P) | 7.26 (C | P) | 7.53 (C | P) | 8.00 (C | P) | 7.26 (C | P) | 6.86 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.36 (C | P) | 8.15 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.75 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.90 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.15 (C | P) |
EB260303 | E5_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 1.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.27 (C | P) | 1.22 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584584 | E5a_E6a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 70 | 24 | 7.85 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.93 (C | P) | 8.28 (C | P) | 8.36 (C | P) | 8.16 (C | P) | 7.64 (C | P) | 7.77 (C | P) | 6.19 (C | P) | 8.50 (C | P) | 8.17 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.69 (C | P) | 8.05 (C | P) | 6.26 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.73 (C | P) | 8.25 (C | P) | 7.61 (C | P) | 6.83 (C | P) | 7.08 (C | P) | 7.61 (C | P) | 8.18 (C | P) | 7.60 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.53 (C | P) | 8.10 (C | P) | 8.15 (C | P) | 7.05 (C | P) |
EB260304 | E6_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.21 (C | P) | 1.51 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82794 | ER6a | ExonRegion | 133 (100% | 100%) | 24 | 26 | 7.59 (C | P) | 7.13 (C | P) | 8.07 (C | P) | 8.04 (C | P) | 8.28 (C | P) | 7.93 (C | P) | 7.06 (C | P) | 7.79 (C | P) | 6.08 (C | P) | 8.37 (C | P) | 7.91 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.48 (C | P) | 7.88 (C | P) | 5.97 (C | P) | 7.25 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.21 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.32 (C | P) | 8.12 (C | P) | 7.35 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.66 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.06 (C | P) |
EB260305 | E6_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 1.94 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584589 | E6a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 26 | 9 | 7.46 (C | P) | 7.43 (C | P) | 8.20 (C | P) | 8.27 (C | P) | 8.36 (C | P) | 7.74 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.25 (C | P) | 8.53 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.04 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.68 (C | P) | 6.16 (C | P) | 7.02 (C | P) | 7.37 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.03 (C | P) | 6.82 (C | P) | 6.82 (C | P) | 7.26 (C | P) | 8.37 (C | P) | 7.15 (C | P) | 7.61 (C | P) | 7.50 (C | P) | 8.13 (C | P) | 7.96 (C | P) | 7.46 (C | P) |
EJ1584590 | E6a_E8a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 8 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EB260306 | E7_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 1.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82795 | ER7a | ExonRegion | 32 (100% | 100%) | 25 | 9 | 7.55 (C | P) | 6.99 (C | P) | 8.57 (C | P) | 8.20 (C | P) | 8.06 (C | P) | 7.71 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.49 (C | P) | 5.92 (C | P) | 8.33 (C | P) | 7.62 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.46 (C | P) | 7.82 (C | P) | 6.16 (C | P) | 7.05 (C | P) | 7.61 (C | P) | 7.90 (C | P) | 6.72 (C | P) | 6.80 (C | P) | 6.81 (C | P) | 7.29 (C | P) | 8.37 (C | P) | 7.33 (C | P) | 7.78 (C | P) | 7.57 (C | P) | 8.05 (C | P) | 7.79 (C | P) | 7.34 (C | P) |
EB260307 | E7_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 2.25 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 3.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.74 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.47 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584594 | E7a_E8a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 24 | 9 | 7.45 (C | P) | 6.45 (C | P) | 8.19 (C | P) | 8.03 (C | P) | 8.02 (C | P) | 7.62 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.36 (C | P) | 5.59 (C | P) | 8.06 (C | P) | 7.59 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.56 (C | P) | 5.95 (C | P) | 6.95 (C | P) | 7.15 (C | P) | 7.97 (C | P) | 6.73 (C | P) | 6.91 (C | P) | 6.85 (C | P) | 7.36 (C | P) | 8.23 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.62 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.88 (C | P) | 7.71 (C | P) | 6.96 (C | P) |
IN46852 | Ix | Intron | 5740 (85% | 0%) | 0 | 0 | 2.13 (C | P) | 1.94 (C | P) | 0.91 (C | P) | 1.45 (C | P) | 1.95 (C | P) | 2.83 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.44 (C | P) | 2.70 (C | P) | 1.63 (C | P) | 1.67 (C | P) | 0.40 (C | P) | 1.40 (C | P) | 2.02 (C | P) | 2.03 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.10 (C | P) | 2.60 (C | P) | 1.40 (C | P) | 2.25 (C | P) | 0.15 (C | P) | 0.42 (C | P) | 1.91 (C | P) | 0.90 (C | P) | 0.52 (C | P) | 0.60 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.09 (C | P) |
SIN69984 | Ix_SR1 | SilentIntronRegion | 1610 (76% | 0%) | 0 | 0 | 1.84 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.28 (C | P) | 0.93 (C | P) | 1.01 (C | P) | 2.71 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.39 (C | P) | 1.26 (C | P) | 1.88 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.07 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.04 (C | P) | 2.04 (C | P) | 1.29 (C | P) | 2.37 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.96 (C | P) | 1.82 (C | P) | 2.01 (C | P) | 0.11 (C | P) | 0.20 (C | P) | 0.79 (C | P) | 0.38 (C | P) | 0.60 (C | P) | 0.30 (C | P) | 1.15 (C | P) | 0.56 (C | P) |
AIN52524 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 371 (98% | 0%) | 1 | 0 | 0.68 (C | P) | 2.34 (C | P) | 0.30 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.75 (C | P) | 2.49 (C | P) | 0.36 (C | P) | 0.33 (C | P) | 1.01 (C | P) | 2.53 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.66 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 0.72 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.91 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.77 (C | P) | 0.48 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.59 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.66 (C | P) | 0.53 (C | P) | 0.33 (C | P) | 0.76 (C | P) | 0.46 (C | P) |
AIN52525 | Ix_AR2 | ActiveIntronRegion | 655 (82% | 0%) | 1 | 0 | 1.79 (C | P) | 2.32 (C | P) | 1.18 (C | P) | 1.61 (C | P) | 2.09 (C | P) | 2.86 (C | P) | 1.10 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.81 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.17 (C | P) | 1.66 (C | P) | 0.70 (C | P) | 0.90 (C | P) | 1.51 (C | P) | 2.08 (C | P) | 2.80 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.78 (C | P) | 1.63 (C | P) | 2.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.76 (C | P) | 1.51 (C | P) | 0.75 (C | P) | 0.20 (C | P) | 0.77 (C | P) | 1.26 (C | P) | 0.77 (C | P) |
SIN69985 | Ix_SR2 | SilentIntronRegion | 2231 (84% | 0%) | 0 | 0 | 2.43 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.42 (C | P) | 2.74 (C | P) | 1.65 (C | P) | 1.91 (C | P) | 1.77 (C | P) | 2.98 (C | P) | 1.57 (C | P) | 1.88 (C | P) | 0.72 (C | P) | 1.76 (C | P) | 2.32 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.98 (C | P) | 2.16 (C | P) | 2.22 (C | P) | 0.88 (C | P) | 2.37 (C | P) | 0.07 (C | P) | 0.58 (C | P) | 2.27 (C | P) | 1.04 (C | P) | 0.63 (C | P) | 0.81 (C | P) | 1.84 (C | P) | 1.20 (C | P) |
AIN52526 | Ix_AR3 | ActiveIntronRegion | 869 (99% | 0%) | 1 | 0 | 2.36 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.96 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.96 (C | P) | 3.24 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.34 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.62 (C | P) | 1.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 1.92 (C | P) | 2.35 (C | P) | 2.85 (C | P) | 2.51 (C | P) | 2.99 (C | P) | 1.73 (C | P) | 2.48 (C | P) | 0.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.25 (C | P) | 1.33 (C | P) | 0.25 (C | P) | 0.52 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.71 (C | P) |
EB260308 | E8_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 1 | 2.62 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.78 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.11 (C | P) | 3.54 (C | P) | 3.36 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.71 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER82796 | ER8a | ExonRegion | 76 (100% | 100%) | 21 | 22 | 7.58 (C | P) | 7.31 (C | P) | 8.34 (C | P) | 8.18 (C | P) | 8.20 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.92 (C | P) | 6.08 (C | P) | 8.08 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.62 (C | P) | 7.29 (C | P) | 7.75 (C | P) | 6.08 (C | P) | 7.07 (C | P) | 7.53 (C | P) | 7.85 (C | P) | 7.22 (C | P) | 6.84 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.32 (C | P) | 8.34 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.65 (C | P) | 7.21 (C | P) | 8.10 (C | P) | 7.81 (C | P) | 6.90 (C | P) |
EB260309 | E8_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 2 | 3.15 (C | P) | 4.33 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.37 (C | P) | 1.66 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.16 (C | P) | 2.48 (C | P) | 1.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.87 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.19 (C | P) | 2.79 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.52 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.08 (C | P) |
EJ1584595 | E8a_E9a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 22 | 31 | 7.22 (C | P) | 6.76 (C | P) | 8.07 (C | P) | 8.15 (C | P) | 8.04 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.14 (C | P) | 7.70 (C | P) | 5.69 (C | P) | 8.00 (C | P) | 7.89 (C | P) | 7.61 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.58 (C | P) | 5.81 (C | P) | 6.93 (C | P) | 7.55 (C | P) | 8.04 (C | P) | 6.36 (C | P) | 6.81 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.27 (C | P) | 8.03 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.31 (C | P) | 6.80 (C | P) | 8.14 (C | P) | 7.76 (C | P) | 6.71 (C | P) |
IN46853 | Ix | Intron | 664 (71% | 0%) | 0 | 0 | 2.55 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.49 (C | P) | 2.28 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.79 (C | P) | 1.67 (C | P) | 2.20 (C | P) | 1.26 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.73 (C | P) | 1.71 (C | P) | 0.19 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.88 (C | P) | 1.93 (C | P) | 2.58 (C | P) | 2.32 (C | P) | 2.70 (C | P) | 1.48 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.66 (C | P) | 0.48 (C | P) | 1.92 (C | P) | 1.16 (C | P) | 0.23 (C | P) | 0.99 (C | P) | 1.37 (C | P) | 0.90 (C | P) |
AIN52527 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 662 (71% | 0%) | 1 | 0 | 2.56 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.49 (C | P) | 2.29 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.80 (C | P) | 1.67 (C | P) | 2.20 (C | P) | 1.26 (C | P) | 2.43 (C | P) | 1.73 (C | P) | 1.71 (C | P) | 0.19 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.88 (C | P) | 1.93 (C | P) | 2.59 (C | P) | 2.32 (C | P) | 2.71 (C | P) | 1.48 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.67 (C | P) | 0.48 (C | P) | 1.93 (C | P) | 1.16 (C | P) | 0.23 (C | P) | 0.99 (C | P) | 1.37 (C | P) | 0.90 (C | P) |
EB260310 | E9_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 1 | 2 | 0.00 (C | P) | 2.17 (C | P) | 2.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.27 (C | P) | 2.69 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.13 (C | P) | 3.01 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.31 (C | P) | 1.34 (C | P) | 2.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.95 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.71 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.22 (C | P) |
ER82797 | ER9a | ExonRegion | 216 (100% | 100%) | 16 | 27 | 7.22 (C | P) | 6.87 (C | P) | 8.00 (C | P) | 7.66 (C | P) | 8.18 (C | P) | 7.57 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.69 (C | P) | 5.90 (C | P) | 8.10 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.36 (C | P) | 7.53 (C | P) | 6.03 (C | P) | 6.88 (C | P) | 7.48 (C | P) | 7.72 (C | P) | 6.57 (C | P) | 6.64 (C | P) | 7.05 (C | P) | 7.26 (C | P) | 8.06 (C | P) | 7.05 (C | P) | 7.23 (C | P) | 7.39 (C | P) | 7.65 (C | P) | 7.50 (C | P) | 6.83 (C | P) |
EB260311 | E9_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 1.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.29 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.64 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1584598 | E9a_E10a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 19 | 20 | 7.21 (C | P) | 6.74 (C | P) | 8.00 (C | P) | 7.30 (C | P) | 7.98 (C | P) | 7.68 (C | P) | 7.21 (C | P) | 7.39 (C | P) | 6.17 (C | P) | 8.36 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.34 (C | P) | 7.36 (C | P) | 7.51 (C | P) | 5.76 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.75 (C | P) | 7.51 (C | P) | 6.48 (C | P) | 6.49 (C | P) | 6.72 (C | P) | 7.28 (C | P) | 8.02 (C | P) | 7.03 (C | P) | 7.11 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.79 (C | P) | 7.67 (C | P) | 6.68 (C | P) |
SIN69987 | Ix_SR2 | SilentIntronRegion | 69 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.37 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.92 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.17 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.10 (C | P) |
ER82798 | ER10a | ExonRegion | 143 (100% | 96%) | 15 | 6 | 7.21 (C | P) | 7.27 (C | P) | 7.98 (C | P) | 8.03 (C | P) | 8.62 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.27 (C | P) | 7.36 (C | P) | 6.45 (C | P) | 8.46 (C | P) | 7.97 (C | P) | 7.73 (C | P) | 7.86 (C | P) | 7.85 (C | P) | 6.14 (C | P) | 7.17 (C | P) | 7.95 (C | P) | 7.84 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.70 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.14 (C | P) | 8.21 (C | P) | 7.58 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.47 (C | P) | 8.31 (C | P) | 7.64 (C | P) | 7.32 (C | P) |
EB260313 | E10_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 40%) | 1 | 2 | 5.00 (C | P) | 6.10 (C | P) | 5.44 (C | P) | 4.47 (C | P) | 5.36 (C | P) | 5.30 (C | P) | 4.51 (C | P) | 5.21 (C | P) | 4.84 (C | P) | 5.43 (C | P) | 5.89 (C | P) | 4.01 (C | P) | 5.18 (C | P) | 4.21 (C | P) | 3.43 (C | P) | 5.02 (C | P) | 5.25 (C | P) | 4.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.70 (C | P) | 4.00 (C | P) | 5.42 (C | P) | 3.55 (C | P) | 4.82 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.10 (C | P) | 4.68 (C | P) | 5.01 (C | P) | 4.58 (C | P) |
EJ1584600 | E10a_E11a | KnownJunction | 62 (100% | 42%) | 19 | 3 | 6.78 (C | P) | 6.20 (C | P) | 7.57 (C | P) | 8.17 (C | P) | 8.48 (C | P) | 6.68 (C | P) | 6.34 (C | P) | 6.51 (C | P) | 5.98 (C | P) | 7.28 (C | P) | 6.75 (C | P) | 7.48 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.83 (C | P) | 5.73 (C | P) | 6.55 (C | P) | 7.11 (C | P) | 7.52 (C | P) | 6.49 (C | P) | 6.75 (C | P) | 6.39 (C | P) | 6.96 (C | P) | 7.92 (C | P) | 7.15 (C | P) | 6.83 (C | P) | 6.79 (C | P) | 7.38 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.44 (C | P) |
IN46855 | Ix | Intron | 3648 (72% | 0%) | 0 | 0 | 3.00 (C | P) | 4.70 (C | P) | 3.56 (C | P) | 4.47 (C | P) | 3.97 (C | P) | 5.19 (C | P) | 4.13 (C | P) | 2.50 (C | P) | 3.99 (C | P) | 5.65 (C | P) | 5.93 (C | P) | 3.84 (C | P) | 3.12 (C | P) | 3.38 (C | P) | 2.55 (C | P) | 4.11 (C | P) | 4.52 (C | P) | 3.75 (C | P) | 3.83 (C | P) | 2.46 (C | P) | 4.20 (C | P) | 2.40 (C | P) | 3.11 (C | P) | 3.90 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.52 (C | P) | 4.25 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.39 (C | P) |
AIN52529 | Ix_AR1 | ActiveIntronRegion | 282 (66% | 0%) | 4 | 0 | 3.97 (C | P) | 5.42 (C | P) | 2.59 (C | P) | 5.11 (C | P) | 4.09 (C | P) | 5.23 (C | P) | 4.31 (C | P) | 4.18 (C | P) | 5.04 (C | P) | 5.68 (C | P) | 5.83 (C | P) | 3.94 (C | P) | 5.32 (C | P) | 3.65 (C | P) | 4.03 (C | P) | 4.17 (C | P) | 4.34 (C | P) | 4.19 (C | P) | 4.09 (C | P) | 3.80 (C | P) | 3.80 (C | P) | 3.79 (C | P) | 3.69 (C | P) | 4.87 (C | P) | 3.88 (C | P) | 2.81 (C | P) | 3.76 (C | P) | 3.98 (C | P) | 3.63 (C | P) |
SIN69988 | Ix_SR1 | SilentIntronRegion | 1398 (45% | 0%) | 0 | 0 | 2.20 (C | P) | 4.46 (C | P) | 3.12 (C | P) | 3.51 (C | P) | 3.89 (C | P) | 5.06 (C | P) | 3.95 (C | P) | 2.01 (C | P) | 3.18 (C | P) | 5.29 (C | P) | 5.61 (C | P) | 3.22 (C | P) | 2.17 (C | P) | 2.59 (C | P) | 1.96 (C | P) | 3.63 (C | P) | 4.17 (C | P) | 3.54 (C | P) | 3.62 (C | P) | 1.99 (C | P) | 3.99 (C | P) | 1.63 (C | P) | 2.57 (C | P) | 2.62 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.02 (C | P) | 3.03 (C | P) | 2.53 (C | P) | 1.55 (C | P) |
AIN52530 | Ix_AR2 | ActiveIntronRegion | 521 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.05 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.74 (C | P) | 4.68 (C | P) | 4.07 (C | P) | 5.17 (C | P) | 3.72 (C | P) | 2.77 (C | P) | 3.73 (C | P) | 5.83 (C | P) | 5.98 (C | P) | 3.70 (C | P) | 2.73 (C | P) | 3.61 (C | P) | 2.14 (C | P) | 4.24 (C | P) | 4.74 (C | P) | 3.63 (C | P) | 4.04 (C | P) | 1.70 (C | P) | 4.27 (C | P) | 2.51 (C | P) | 3.45 (C | P) | 3.17 (C | P) | 3.56 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.50 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.17 (C | P) |
SIN69989 | Ix_SR2 | SilentIntronRegion | 213 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.22 (C | P) | 4.76 (C | P) | 4.02 (C | P) | 4.71 (C | P) | 4.21 (C | P) | 5.33 (C | P) | 4.37 (C | P) | 1.95 (C | P) | 4.24 (C | P) | 5.74 (C | P) | 6.04 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.03 (C | P) | 3.67 (C | P) | 2.49 (C | P) | 4.37 (C | P) | 5.13 (C | P) | 4.15 (C | P) | 4.68 (C | P) | 2.97 (C | P) | 4.57 (C | P) | 2.07 (C | P) | 3.19 (C | P) | 3.83 (C | P) | 3.45 (C | P) | 1.98 (C | P) | 4.07 (C | P) | 3.28 (C | P) | 1.74 (C | P) |
AIN52531 | Ix_AR3 | ActiveIntronRegion | 1232 (87% | 0%) | 1 | 0 | 3.05 (C | P) | 4.76 (C | P) | 3.70 (C | P) | 4.58 (C | P) | 3.90 (C | P) | 5.22 (C | P) | 4.31 (C | P) | 2.07 (C | P) | 4.14 (C | P) | 5.72 (C | P) | 6.07 (C | P) | 4.13 (C | P) | 2.78 (C | P) | 3.51 (C | P) | 2.58 (C | P) | 4.23 (C | P) | 4.46 (C | P) | 3.74 (C | P) | 3.52 (C | P) | 2.49 (C | P) | 4.26 (C | P) | 2.34 (C | P) | 3.05 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.31 (C | P) | 2.64 (C | P) | 4.64 (C | P) | 3.13 (C | P) | 2.60 (C | P) |
EB260314 | E11_Aa | NovelBoundary | 62 (71% | 0%) | 2 | 0 | 3.45 (C | P) | 4.51 (C | P) | 4.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.91 (C | P) | 5.21 (C | P) | 5.09 (C | P) | 2.33 (C | P) | 4.67 (C | P) | 6.14 (C | P) | 6.22 (C | P) | 3.98 (C | P) | 3.41 (C | P) | 3.99 (C | P) | 4.21 (C | P) | 4.90 (C | P) | 5.32 (C | P) | 4.59 (C | P) | 4.10 (C | P) | 3.08 (C | P) | 3.34 (C | P) | 2.89 (C | P) | 4.01 (C | P) | 5.10 (C | P) | 3.71 (C | P) | 1.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.92 (C | P) | 2.80 (C | P) |
ER82799 | ER11a | ExonRegion | 733 (100% | 0%) | 5 | 0 | 7.02 (C | P) | 7.06 (C | P) | 7.91 (C | P) | 7.75 (C | P) | 8.47 (C | P) | 7.81 (C | P) | 7.01 (C | P) | 7.24 (C | P) | 6.50 (C | P) | 8.31 (C | P) | 7.75 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.54 (C | P) | 6.11 (C | P) | 6.99 (C | P) | 7.50 (C | P) | 7.72 (C | P) | 6.92 (C | P) | 6.52 (C | P) | 7.23 (C | P) | 6.89 (C | P) | 8.02 (C | P) | 7.70 (C | P) | 7.63 (C | P) | 7.03 (C | P) | 8.10 (C | P) | 7.38 (C | P) | 6.97 (C | P) |
EB260315 | E11_Da | KnownBoundary | 62 (100% | 0%) | 9 | 9 | 6.80 (C | P) | 6.71 (C | P) | 7.81 (C | P) | 8.32 (C | P) | 8.53 (C | P) | 7.41 (C | P) | 7.37 (C | P) | 7.56 (C | P) | 7.05 (C | P) | 8.03 (C | P) | 7.83 (C | P) | 7.49 (C | P) | 7.43 (C | P) | 7.35 (C | P) | 6.40 (C | P) | 6.94 (C | P) | 7.69 (C | P) | 7.27 (C | P) | 5.62 (C | P) | 6.57 (C | P) | 7.09 (C | P) | 7.08 (C | P) | 8.00 (C | P) | 8.17 (C | P) | 7.59 (C | P) | 7.35 (C | P) | 8.07 (C | P) | 7.47 (C | P) | 7.16 (C | P) |
ER82800 | ER11b | ExonRegion | 1899 (90% | 0%) | 3 | 0 | 5.76 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.07 (C | P) | 7.29 (C | P) | 8.04 (C | P) | 7.42 (C | P) | 6.19 (C | P) | 6.13 (C | P) | 6.92 (C | P) | 7.78 (C | P) | 7.22 (C | P) | 6.70 (C | P) | 7.19 (C | P) | 6.69 (C | P) | 6.46 (C | P) | 6.32 (C | P) | 7.12 (C | P) | 6.89 (C | P) | 6.87 (C | P) | 5.65 (C | P) | 6.92 (C | P) | 5.73 (C | P) | 7.12 (C | P) | 7.69 (C | P) | 6.70 (C | P) | 6.52 (C | P) | 7.98 (C | P) | 6.84 (C | P) | 6.87 (C | P) |
ER82801 | ER11c | ExonRegion | 6 (100% | 0%) | 0 | 1 | 1.28 (C | P) | 2.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.65 (C | P) | 1.01 (C | P) | 1.16 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.79 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.90 (C | P) | 2.24 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) | 3.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.96 (C | P) | 2.19 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.64 (C | P) | 2.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) |
AIG19172 | IG35_AR7 | ActiveIntergenicRegion | 473 (76% | 0%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.31 (C | P) | 6.51 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.48 (C | P) | 0.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.21 (C | P) | 0.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.23 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.59 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.25 (C | P) |
Figures displaying gene and feature expression levels in each library
The following figures illustrate the expression of the gene 'HMG20A' and its component features for each library. First, a simple gene model is depicted. In this model, features that are alternatively expressed in at least one comparison are marked red (see below for the actual expression levels of each feature). Next, the expression values are displayed for only the exons and known (or expressed novel) exon junctions. This first display consists of a single plot with one colored line per library (as indicated in the legend). Next, the expression of the gene relative to the distribution of all gene expression values is displayed as a histogram. In these figures (one for each library) the expression of the current gene is indicated by a dotted red line. Estimated cutoffs for background expression level corresponding to intergenic and intragenic noise are indicated by dotted black lines. The bar plots following these histograms display the expression level of all individual features. The color of the bars correspond to different feature types (enumerated as colored boxes in the legend). As in the histograms, the estimated cutoffs level for intergenic and intragenic noise are indicated as dotted lines. For genes with low expression values, these cutoffs converge to a single value. Features with significant alternative expression values are highlighted yellow in the line plot, and marked with a pink asterix below. *If you can not see the figure below, click here
Download gene data file (HMG20A): ENSG00000140382.txt