Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C14orf64	Gene	0	1.80	4.65	3.05	0.62	0.33	9.83	3.10	0.64	12.37	14.99	2.31	0.98	1.49	3.17	3.75	7.28	10.04	1.74	2.13	0.98	3.23	11.24	2.59	5.22	1.42	5.32	0.71	1.17	3.32
2	499006	Transcript	0	0.11	2.67	6.17	0.12	0.00	5.25	2.86	0.03	10.91	4.74	2.39	0.43	0.33	0.67	0.67	5.80	2.21	3.41	0.49	0.18	2.13	15.26	1.34	5.70	0.52	2.24	0.19	0.00	1.43
3	502187	Transcript	0	2.11	5.87	4.61	0.05	0.09	16.46	4.42	1.68	18.05	28.32	2.04	1.43	1.93	5.64	6.36	8.22	11.27	0.90	6.05	0.79	4.02	23.00	2.96	4.37	4.46	3.76	0.24	0.58	4.32
4	501506	Transcript	0	0.69	0.71	1.81	0.34	0.14	1.10	0.32	0.33	1.82	1.24	0.56	0.33	0.83	0.67	0.89	3.84	3.75	0.40	0.60	0.32	0.85	4.23	0.55	1.18	0.39	2.00	0.17	0.94	1.10
5	IG23_AR10	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.30	2.36	1.35	0.00	2.84	1.72	0.00	2.42	6.73	0.11	0.58	0.00	1.92	2.50	0.47	4.32	0.00	0.00	1.29	1.21	9.65	1.68	2.83	0.00	1.92	0.17	0.00	1.13
6	IG23_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.15	0.65	0.00	0.00	3.42	1.18	0.00	1.64	2.65	0.48	0.00	0.00	0.54	3.61	0.72	1.67	0.00	0.00	0.00	0.69	4.15	0.50	2.29	0.00	0.61	0.00	0.00	0.78
7	IG23_SR8	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	3.45	0.00	1.41	1.25	0.83	0.00	0.00	0.25	1.99	2.14	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	3.48	0.21	0.00	0.00	1.36	0.00	0.00	0.00
8	IG23_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	0.49	1.47	2.68	0.00	0.00	2.52	4.15	0.00	1.15	2.31	0.27	0.00	0.44	0.83	4.62	1.70	2.37	0.44	0.00	0.63	0.65	8.66	0.00	1.97	0.00	6.40	0.42	0.00	1.23
9	IG23_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	1.32	4.14	0.00	0.00	2.83	3.67	0.00	1.08	2.08	0.44	0.51	0.00	1.55	1.90	1.90	4.10	0.00	0.00	0.00	1.62	10.95	0.00	1.60	0.00	4.20	0.93	0.00	2.60
10	ER1a	ExonRegion	0	0.00	3.07	1.42	0.00	0.00	0.00	4.84	0.00	2.92	2.21	2.22	1.07	0.00	0.00	0.00	5.23	2.80	0.00	0.00	0.00	3.80	9.25	1.33	2.15	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00
11	ER1b	ExonRegion	0	1.43	2.55	3.01	0.00	0.00	6.80	13.89	4.40	10.67	15.91	5.14	1.37	1.83	2.62	0.00	11.20	16.81	1.31	0.00	0.00	3.28	33.78	3.75	7.33	3.28	6.17	8.51	1.54	6.51
12	E1_Ac	KnownBoundary	0	2.77	0.00	4.43	0.00	0.00	19.49	10.70	5.97	18.42	35.19	4.11	1.36	2.87	4.99	0.00	13.85	34.51	4.62	0.00	0.00	0.00	38.12	9.21	5.80	3.45	23.30	12.23	0.00	19.15
13	ER1c	ExonRegion	0	9.23	12.85	26.22	9.26	3.15	40.32	18.35	1.14	79.49	44.81	10.09	6.86	5.33	12.38	26.02	68.81	60.69	5.32	6.19	3.06	10.24	98.65	17.97	15.66	3.29	45.20	3.64	4.21	32.76
14	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	9.27	0.00	1.96	2.92	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.95	0.00	12.06	0.00	0.00	4.91	0.00	4.18	32.61	16.50	7.40	2.86	1.88	2.73	7.57	10.94	32.23	0.00	0.00	3.72	5.62	34.47	5.02	2.39	0.00	6.09	0.00	0.00	7.79
16	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.65	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	6.40	13.39	4.78	0.00	0.00	16.53	2.79	6.63	28.19	27.97	2.04	1.79	3.05	6.76	2.80	16.22	15.04	0.00	3.02	0.54	4.79	67.30	3.57	18.01	6.95	3.41	0.00	0.00	2.32
19	E2_Ab	KnownBoundary	0	2.48	12.41	2.89	0.00	0.00	24.75	4.69	0.00	33.35	33.75	5.22	2.29	1.62	4.96	8.37	22.87	17.42	0.00	8.09	3.72	2.05	88.09	2.02	27.93	6.97	1.89	0.00	0.00	1.78
20	ER2b	ExonRegion	0	6.80	23.46	11.16	0.00	1.19	48.55	23.79	1.06	70.91	75.13	16.14	5.63	6.90	16.14	23.85	44.77	52.95	5.46	7.14	6.75	13.54	76.64	14.82	27.31	8.23	22.30	2.37	3.24	22.29
21	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	3.41	1.88	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.42	4.17	7.03	0.00	0.00	20.49	2.92	4.98	14.98	26.32	2.72	3.25	0.00	8.60	16.74	13.46	14.65	0.00	16.18	0.00	1.64	32.38	5.02	2.99	6.52	5.11	0.00	2.16	5.58
23	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	2.94	0.00	0.00	10.51	2.92	1.89	2.80	12.74	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	9.79	6.17	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	2.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	7.34	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	6.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22
25	E2a_E6a	KnownJunction	0	0.00	3.59	15.47	0.00	0.00	13.97	2.75	0.00	24.42	9.31	4.52	0.00	0.00	1.22	0.00	10.71	1.28	9.25	0.00	0.00	2.05	32.33	2.22	14.06	1.44	4.12	0.00	0.00	3.73
26	I2	Intron	0	1.21	2.54	1.29	0.61	0.28	5.95	1.10	0.02	4.79	10.57	0.92	0.26	0.48	1.80	1.82	3.40	5.85	0.97	1.17	0.37	2.70	2.57	0.73	2.90	0.53	1.57	0.41	0.12	1.61
27	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	2.16	2.29	0.00	0.00	0.88	0.82	0.00	0.00	1.35	1.31	0.72	0.00	1.62	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	3.86	1.93	1.00	0.00	0.00	12.78	4.23	0.00	15.13	14.73	2.14	0.00	0.39	0.95	3.03	3.72	4.49	2.99	0.96	0.00	5.99	18.93	1.63	3.23	0.43	8.49	1.10	0.00	2.41
29	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	1.06	2.71	1.51	0.80	0.24	6.31	1.20	0.02	4.53	11.21	1.04	0.30	0.48	1.98	2.15	3.68	6.50	1.08	1.18	0.49	2.61	2.04	0.89	3.05	0.53	1.55	0.50	0.12	1.64
30	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.82	3.27	1.06	0.00	0.00	5.91	0.47	0.00	7.45	16.13	0.00	0.50	0.93	2.31	1.21	4.75	8.59	0.00	1.68	0.00	4.28	3.94	0.00	6.04	1.50	0.88	0.00	0.43	3.90
31	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	0.87	0.98	0.34	0.00	0.99	2.51	0.20	0.00	2.56	3.38	0.60	0.00	0.00	0.65	0.00	1.51	0.91	0.00	0.97	0.00	1.59	1.28	0.00	0.44	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00
32	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	5.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER3a	ExonRegion	0	1.66	4.58	5.52	0.00	0.10	21.07	12.38	1.64	24.71	37.36	3.46	1.91	3.68	6.33	6.03	9.78	17.92	1.34	6.22	2.72	9.37	28.72	4.35	8.98	4.77	6.50	0.47	0.18	6.07
34	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.91	2.23	0.00	6.24	15.06	0.00	0.00	1.21	3.23	0.00	14.76	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	6.86	1.92	3.05	0.00	0.00	0.00	2.11	1.82
35	E3a_E4a	KnownJunction	0	3.01	8.53	2.94	0.00	0.00	10.28	0.00	0.00	18.88	27.12	0.00	0.00	2.64	4.21	0.00	3.44	2.27	0.00	0.00	0.00	1.72	23.48	0.00	0.00	5.53	0.00	0.00	0.00	3.10
36	E3a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I3	Intron	0	0.74	2.39	0.58	0.83	0.00	4.60	3.02	0.00	4.14	9.83	2.33	0.43	0.30	1.78	0.53	3.85	3.79	0.48	1.11	0.32	0.66	3.12	1.04	3.47	0.49	1.27	0.00	0.00	1.31
38	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.75	2.40	0.58	0.83	0.00	4.62	3.04	0.00	4.16	9.87	2.35	0.43	0.30	1.78	0.53	3.86	3.81	0.48	1.11	0.32	0.66	3.13	1.05	3.49	0.50	1.28	0.00	0.00	1.32
39	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.27	10.78	0.00	1.46	2.35	0.00	16.41	16.78	2.78	0.00	1.59	0.89	8.37	3.29	3.74	0.00	0.00	0.00	1.64	5.79	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25
40	ER4a	ExonRegion	0	1.36	6.22	2.97	0.19	0.26	13.99	2.39	0.10	13.63	22.45	1.98	0.54	1.39	3.42	2.66	6.20	10.24	2.25	1.81	0.45	3.36	7.41	2.48	5.51	1.02	3.43	0.50	0.00	2.52
41	E4_Da	NovelBoundary	0	2.95	4.85	0.00	0.00	0.00	17.96	0.00	0.00	14.10	12.46	2.47	0.00	1.62	4.05	0.00	3.60	10.62	4.62	0.00	0.00	1.72	1.80	2.36	2.63	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00
42	I4	Intron	0	0.48	2.99	1.52	0.18	0.17	5.98	0.53	0.01	9.34	8.56	0.75	0.37	0.54	1.38	1.46	3.98	6.02	0.58	0.85	0.25	2.08	1.69	0.70	2.70	0.56	1.38	0.30	0.24	1.62
43	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.79	3.67	2.77	0.44	0.00	9.84	0.49	0.00	7.41	12.77	0.88	0.81	0.97	2.21	0.85	4.81	6.05	0.91	0.88	0.17	3.46	2.27	1.17	2.58	1.10	1.25	0.96	0.65	2.61
44	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.20	4.95	2.13	0.00	0.00	15.87	0.73	0.00	15.46	19.85	3.08	0.56	1.74	1.80	1.00	3.92	6.82	0.91	1.45	0.50	4.81	1.97	0.56	3.32	0.39	2.72	1.17	0.59	2.50
45	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	0.79	7.89	3.00	0.24	0.41	12.49	1.08	0.03	26.73	18.09	2.01	0.67	1.25	2.68	3.59	6.51	12.25	0.72	1.98	0.09	3.63	4.05	1.32	6.56	1.27	3.29	0.71	0.52	3.69
46	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.01	1.82	0.79	0.00	0.92	11.62	0.76	0.17	17.44	14.07	1.68	0.58	0.37	3.07	2.59	9.75	7.16	1.95	0.60	0.52	4.66	2.04	1.02	4.66	0.94	1.18	0.52	0.00	2.51
47	I4_SR3	SilentIntronRegion	0	0.94	2.25	2.01	0.00	0.00	3.45	0.35	0.00	6.08	8.85	0.10	0.81	0.06	1.66	1.92	3.13	6.22	0.04	0.28	0.00	1.66	1.42	0.95	0.94	0.38	1.46	0.00	0.00	1.29
48	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.76	0.00	1.57	0.00	0.00	3.20	0.31	0.00	4.98	6.68	0.36	0.25	0.58	1.08	0.23	4.43	7.30	0.37	0.49	0.00	0.80	0.27	0.64	0.76	0.29	2.10	0.00	0.25	0.76
49	I4_SR4	SilentIntronRegion	0	0.40	1.94	2.09	0.34	0.00	4.29	0.90	0.00	7.23	7.52	0.14	0.35	0.17	1.48	2.09	4.56	7.71	0.87	1.16	0.32	1.24	1.78	0.58	3.82	0.54	0.98	0.09	0.31	1.24
50	I4_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.72	1.39	1.27	0.87	3.50	0.16	0.00	7.12	5.77	0.72	0.16	0.23	1.61	0.00	7.89	6.10	0.68	0.18	0.49	1.96	1.12	0.86	3.28	0.25	0.76	0.00	0.00	0.27
51	I4_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	2.50	0.00	0.00	3.11	2.43	0.00	0.50	0.50	0.12	0.00	0.68	2.88	0.26	0.87	0.00	1.24	0.79	0.49	1.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.99
52	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.24	7.51	0.00	0.00	1.97	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55
53	ER5a	ExonRegion	0	2.06	2.14	1.77	1.02	0.41	3.31	0.97	0.99	3.97	3.72	1.69	0.98	0.86	2.02	2.68	4.16	6.06	1.21	1.81	0.97	2.54	3.61	1.64	3.53	1.17	6.01	0.52	2.81	2.07
54	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
55	ER6a	ExonRegion	0	0.33	1.35	1.61	0.36	0.00	1.77	0.98	0.09	5.40	2.71	0.43	0.22	0.98	0.78	2.00	1.46	2.55	0.98	1.46	0.55	0.55	4.20	0.49	0.90	0.13	1.14	0.56	0.00	0.56
56	IG22_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00	2.62	0.85	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00