Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-346L13.1	Gene	0	0.30	0.68	0.35	0.00	0.00	0.68	0.14	0.64	0.91	0.40	0.08	0.39	0.18	1.02	0.77	1.00	2.20	0.40	1.12	0.00	1.90	0.13	0.13	0.60	0.40	0.77	0.13	0.91	0.14
2	458118	Transcript	0	0.43	0.27	0.14	0.00	0.00	0.70	0.29	0.73	0.90	0.51	0.03	0.27	0.34	1.10	1.05	0.69	1.85	0.19	0.45	0.00	0.87	0.04	0.04	0.34	0.23	0.71	0.04	0.41	0.08
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	2.04	1.06	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	2.05	0.45	0.38	0.90	0.00	0.32	1.74	2.36	3.86	1.22	4.05	0.00	5.01	0.57	0.57	0.68	0.00	0.49	0.58	2.58	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	5.41	2.80	7.22	6.97	1.96	0.00	3.19	0.00	2.33	0.00	3.82	14.83	0.00	8.09	0.00	3.97	0.00	0.00	5.02	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	1.81	0.00	0.51	0.00	0.38	1.93	2.07	0.00	0.81	5.34	0.00	1.17	0.00	0.00	0.90	0.60	0.00	0.00	0.68	0.00
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	1.84	0.00	0.52	0.00	0.39	1.96	2.07	0.00	0.82	5.39	0.00	1.19	0.00	0.00	0.91	0.61	0.00	0.00	0.69	0.00
8	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.19	4.49	1.40	5.99	0.00	2.72	0.00	1.54	4.71	0.28	0.48	3.23	1.26	1.77	4.10	3.07	4.50	2.15	5.76	0.00	2.08	0.00	0.00	7.35	1.20	0.44	3.06	4.54	0.56
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.78	4.28	0.00	1.73	2.95	1.82	0.98	0.67	2.86	0.57	0.65	3.44	1.11	2.01	6.33	4.43	3.65	0.47	7.54	0.33	4.80	0.00	0.22	4.61	0.52	0.00	4.01	1.00	0.73
10	ER2a	ExonRegion	0	1.09	0.00	0.04	0.00	0.00	2.50	0.86	2.78	4.75	1.54	0.00	0.73	0.89	4.04	2.30	2.70	5.55	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.60	0.47	3.09	0.00	1.34	0.00
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	5.18	2.92	4.38	6.24	4.03	0.00	0.00	3.25	5.30	9.97	2.75	7.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	14.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	1.19	1.24	0.00	1.69	0.00	2.36	10.02	0.00	5.93	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	3.26	1.34
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.02	0.26	3.38	0.00	0.36	0.00	1.16	0.26	0.91	0.00	0.00	0.20	0.80	1.77	0.00	3.43	0.00	1.50	0.00	1.31	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	5.43	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	3.82	7.88	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	0.55	0.00	1.06	0.00	0.00	0.74	0.65	2.64	0.50	1.65	0.00	0.17	1.00	3.85	1.80	0.68	5.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	1.50	2.72	0.00	0.02	0.71
17	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.50	4.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78
18	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	2.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	3.19	0.00	2.26	0.00	0.00	7.52	0.00	0.00	0.00	3.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	1.01	0.00	0.00	2.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.51
21	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.27	0.00	12.53	5.49	7.95	4.13	1.46	0.00	0.00	15.39	0.00	12.14	8.37	3.52	20.69	4.62	7.87	7.19	3.21	2.38	2.22	15.25	1.63	7.72	0.00	1.89	4.46
26	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00
27	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I6_SR2	SilentIntronRegion	0	0.72	0.00	0.28	1.20	0.82	0.00	1.01	0.00	2.06	0.24	0.20	2.78	0.65	0.60	0.77	1.96	1.75	0.00	0.53	0.00	0.95	0.00	0.00	0.36	0.48	0.00	0.00	1.09	0.67
29	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	2.68	0.00	1.09	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER7a	ExonRegion	0	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.20	0.00	1.58	2.63	0.00	3.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.83	0.00	0.00	1.45	0.00	1.17	0.00	3.82	3.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	I7_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.01	0.00	0.00	0.61	0.17	0.00	0.54	0.70	0.00	0.30	1.56	0.38	0.58	0.00	0.31	0.87	0.24	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59	0.46	1.02	0.00
34	E8_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.55	1.91
35	ER8a	ExonRegion	0	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	1.04	0.00