Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	DLEU7	Gene	0	12.84	7.32	2.03	6.92	3.93	14.08	2.95	1.58	6.80	4.57	5.19	4.75	6.99	10.64	2.94	1.55	1.73	7.67	2.28	2.12	7.73	8.47	3.17	6.42	11.50	2.53	7.37	0.93	5.60
2	400393	Transcript	0	0.39	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
3	443723	Transcript	0	6.45	3.37	0.51	4.67	1.75	6.16	1.42	0.81	2.73	1.61	1.91	1.81	3.09	4.33	1.40	0.56	0.32	6.21	1.95	0.88	3.94	3.02	1.81	3.69	6.29	4.66	3.14	0.29	2.10
4	ER1a	ExonRegion	0	0.78	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
5	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.12	0.07	0.23	2.12	0.66	0.75	0.09	0.50	4.91	1.01	0.16	0.14	0.24	0.73	0.42	0.56	0.37	0.04	0.07	0.25	0.23	0.04	0.08	0.78	1.59	0.18	0.21	0.07	0.65
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.12	0.07	0.23	2.12	0.67	0.75	0.09	0.50	4.91	1.02	0.16	0.14	0.24	0.73	0.42	0.56	0.37	0.04	0.07	0.25	0.23	0.04	0.08	0.78	1.59	0.18	0.21	0.07	0.65
8	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.87	0.11	0.05	2.03	0.00	0.15	0.11	0.26	6.16	0.46	0.09	0.47	0.56	0.33	0.15	0.26	1.21	0.23	0.07	0.06	0.25	0.10	0.10	1.03	1.06	0.34	0.18	0.36	0.85
10	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	2.69	0.25	0.00	0.64	0.57	0.27	0.00	0.00	0.58	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.32
11	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.85	1.44	0.00	0.74	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29
12	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	1.20	0.43	0.25	2.25	0.58	1.02	0.32	0.29	4.01	1.22	0.30	0.95	0.81	1.46	0.45	0.11	1.34	0.79	0.31	0.22	0.70	0.53	0.32	0.72	1.49	0.25	0.98	0.22	0.41
15	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	13.33	1.89	0.48	8.24	0.00	3.30	3.54	1.08	9.00	4.28	0.94	1.24	6.94	6.25	5.41	3.52	2.12	3.39	1.92	3.23	0.84	5.28	0.00	6.38	5.80	1.84	7.24	0.00	2.75
16	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	24.22	0.81	2.09	28.64	11.04	14.13	5.54	9.71	21.87	5.73	5.07	6.81	6.65	11.24	6.21	5.61	3.00	2.90	3.21	5.34	3.23	6.32	1.36	5.40	23.97	2.76	20.25	0.00	9.74
17	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	1.78	1.23	0.00	3.67	0.00	0.61	0.75	0.33	2.79	1.23	0.46	3.48	2.15	2.48	0.00	0.58	0.70	2.01	0.00	0.35	0.00	0.23	0.00	0.55	1.39	0.40	0.00	0.00	1.28
18	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	2.68	1.08	0.00	0.00	0.00	2.19	0.03	2.34	1.98	2.88	1.59	2.98	0.34	1.61	0.00	0.90	0.58	1.56	0.00	0.32	0.00	0.30	0.00	0.00	1.40	0.09	0.00	0.42	2.08
19	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	1.92	2.44	0.00	1.62	0.00	2.01	0.45	1.60	3.99	1.99	0.27	6.37	2.84	2.25	0.62	1.75	1.35	1.30	1.08	0.85	0.48	1.81	0.41	0.73	1.20	0.12	0.00	1.00	0.11
20	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	5.80	0.00	1.11	0.00	0.00	4.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.72	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.80	0.00	1.11	0.00	0.00	4.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.00	0.72	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix	Intron	0	1.29	1.19	0.29	3.06	0.61	1.52	0.15	1.25	6.38	1.38	0.15	3.00	2.71	1.16	0.14	0.25	1.16	2.46	0.08	0.05	0.21	0.09	0.41	0.86	0.32	0.00	0.18	0.16	0.12
23	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.39	1.31	0.35	2.35	0.32	1.15	0.13	1.21	5.95	1.61	0.00	2.44	1.78	1.05	0.00	0.16	1.26	2.21	0.13	0.13	0.09	0.00	0.00	0.99	0.47	0.00	0.00	0.32	0.00
24	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.88	1.14	0.28	1.40	0.95	0.88	0.00	1.43	4.94	1.41	0.23	0.91	1.77	1.20	0.00	0.97	0.61	2.56	0.24	0.00	0.28	0.00	0.00	0.84	0.56	0.00	1.43	0.00	0.00
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.21	0.31	0.48	3.44	0.47	0.79	0.39	1.41	7.90	0.69	0.34	4.37	3.41	1.52	0.53	0.24	1.14	2.09	0.00	0.00	0.55	0.17	1.04	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.61	2.04	0.00	4.76	1.08	3.34	0.00	1.02	6.20	1.76	0.13	3.55	4.00	0.90	0.00	0.00	1.32	3.27	0.00	0.00	0.00	0.20	0.60	1.19	0.32	0.00	0.00	0.18	0.00
27	Ix	Intron	0	3.44	2.52	1.19	13.20	0.65	2.92	0.57	2.54	9.09	3.26	0.41	7.52	6.45	1.88	0.69	1.42	2.06	5.96	0.57	0.78	1.88	1.12	1.15	1.02	2.02	0.82	0.92	0.34	1.11
28	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	2.55	0.55	0.00	4.93	0.00	1.81	0.00	0.81	3.79	0.63	0.15	1.12	0.36	1.39	0.00	0.16	0.56	2.11	0.00	0.00	0.98	0.00	0.11	0.13	0.72	0.00	0.00	0.20	0.42
29	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.84	3.69	1.09	5.46	1.26	2.66	0.52	2.61	9.01	4.32	0.15	6.04	7.92	1.18	0.00	3.08	1.85	6.30	0.00	0.00	1.87	1.16	1.63	2.78	0.28	0.00	0.00	0.00	2.11
30	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.87	0.85	0.78	8.34	0.00	1.95	0.61	1.19	7.54	2.72	0.05	5.75	5.28	1.16	0.24	0.53	1.05	5.35	0.69	0.59	1.89	0.31	0.78	0.83	0.71	0.07	1.26	0.21	0.19
31	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.39	5.81	2.59	29.57	0.61	4.91	0.87	4.30	15.11	5.75	1.25	15.02	11.01	3.46	1.98	2.93	4.77	8.75	1.12	1.89	2.97	2.67	1.76	1.39	4.97	2.17	0.46	0.46	2.29
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.21	4.46	2.85	23.17	5.97	5.43	1.49	10.04	15.11	4.78	0.59	15.77	16.12	2.99	2.27	2.34	3.37	12.92	1.03	2.06	1.14	3.97	4.11	0.81	6.21	4.49	6.27	1.79	2.55
33	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.37	0.00	4.93	9.49	0.00	0.00	0.00	9.36	6.06	1.52	0.00	23.58	12.96	3.99	0.00	0.00	5.22	23.12	0.00	0.00	2.05	4.86	2.51	0.00	3.86	0.00	0.00	9.75	0.00
34	ER2a	ExonRegion	0	2.25	0.11	0.14	12.61	0.00	0.00	0.00	1.62	1.12	1.44	0.00	1.41	1.14	0.72	0.00	0.00	0.00	6.63	2.81	0.00	1.08	0.00	0.31	1.89	1.80	4.12	0.00	0.00	0.00
35	E2_Da	NovelBoundary	0	3.01	9.11	7.65	10.57	0.00	0.00	0.00	11.94	12.76	1.72	1.61	12.02	14.39	4.45	0.00	0.00	8.13	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	4.88	0.00	8.87	0.00	0.00	3.55	0.00
36	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	1.52	0.00	2.02	0.00	5.27	7.42	0.00	0.00	0.00
37	Ix	Intron	0	0.44	1.32	0.34	17.62	0.00	0.56	0.00	1.13	2.99	6.80	0.00	3.53	2.38	0.00	0.00	0.00	0.92	6.84	0.00	0.00	1.17	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00
38	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.44	1.33	0.35	17.76	0.00	0.57	0.00	1.14	3.01	6.86	0.00	3.56	2.40	0.00	0.00	0.00	0.92	6.89	0.00	0.00	1.18	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00
39	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.29	21.57	0.00	0.00	0.00	7.07	13.31	14.82	0.00	19.73	3.12	0.00	0.00	0.00	2.27	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER3a	ExonRegion	0	20.00	7.70	5.56	27.10	4.41	16.73	2.49	5.05	12.79	11.86	8.96	14.31	10.87	20.54	2.57	2.82	5.47	15.54	2.37	2.89	11.51	15.48	6.49	5.49	22.06	4.94	9.37	2.02	9.37
41	E3_Da	KnownBoundary	0	34.62	0.00	3.36	47.45	0.00	19.34	11.96	2.54	12.76	17.26	19.01	22.02	22.51	28.45	0.00	3.67	7.77	28.38	0.00	3.80	11.87	18.57	10.79	7.36	14.24	1.59	0.00	0.00	20.44
42	ER3b	ExonRegion	0	14.67	9.99	1.41	1.40	5.25	18.47	4.27	0.80	7.08	3.38	5.74	2.86	8.14	10.91	4.20	1.67	0.97	7.36	3.03	2.64	9.21	9.05	3.10	9.17	11.81	2.43	9.43	0.88	6.31