Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
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6	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix	Intron	0	1.71	3.56	1.23	5.08	1.58	1.26	0.83	1.52	5.21	2.68	1.86	1.14	1.24	2.16	3.36	2.63	2.73	1.16	2.17	1.13	1.39	0.00	0.43	3.11	1.26	0.46	0.27	0.77	1.01
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.27	3.28	2.45	3.55	2.42	0.23	1.01	1.37	7.22	0.71	1.37	1.64	2.62	4.09	5.15	2.46	4.03	1.07	1.05	1.24	1.66	0.00	0.90	5.53	2.72	0.52	1.21	1.12	2.08
11	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.79	4.93	1.12	0.00	0.00	0.00	2.02	1.84	10.67	0.48	0.00	4.95	5.63	3.93	0.00	0.00	4.01	2.73	0.00	0.00	1.43	0.00	0.90	8.60	2.86	0.00	0.00	1.63	2.01
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	6.16	4.31	0.14	0.00	0.00	0.00	3.78	1.84	11.59	2.71	0.00	4.17	6.66	1.76	1.05	1.42	4.01	5.97	0.00	1.58	2.59	0.00	1.81	3.63	2.86	0.00	0.00	2.65	1.34
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.49	3.61	0.98	5.53	1.44	1.52	0.74	1.56	4.65	3.14	2.01	0.97	0.83	1.73	3.00	2.71	2.42	1.11	2.47	1.10	1.31	0.00	0.30	2.54	0.91	0.46	0.07	0.66	0.76
14	Ix	Intron	0	1.50	3.72	1.24	13.93	0.61	3.75	2.58	9.28	10.86	3.46	4.97	2.11	0.19	2.60	3.19	6.03	4.62	3.02	3.83	0.59	3.36	0.37	0.07	2.84	1.48	0.26	0.00	4.44	1.71
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.97	1.03	17.59	1.50	5.93	4.04	9.66	17.11	3.11	7.16	1.43	0.20	2.16	4.38	5.52	1.61	4.40	6.40	1.58	5.71	0.28	0.00	4.64	0.88	0.00	0.00	0.75	3.20
16	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.06	4.01	1.33	12.62	0.28	2.96	2.06	9.18	8.61	3.60	4.18	2.37	0.18	2.77	2.76	6.25	5.75	2.51	2.90	0.22	2.51	0.41	0.10	2.19	1.70	0.36	0.00	5.81	1.18
17	Ix	Intron	0	2.28	7.65	3.48	8.39	0.25	7.56	1.52	9.18	5.62	8.02	3.80	3.27	1.59	3.05	3.08	8.52	5.98	3.36	6.97	2.16	2.99	0.77	0.37	2.48	1.33	0.40	0.38	3.14	1.12
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	1.69	1.50	4.08	1.21	8.67	2.22	0.00	0.74	4.23	1.86	1.92	6.02	3.33	0.00	0.03	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	1.47	2.28	0.00	0.00	0.33	0.18	1.02	0.51	0.79	0.54	0.99	0.00	0.09	0.65	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.10	7.96	3.71	9.34	0.10	7.22	1.63	10.29	6.01	8.29	3.91	3.06	1.73	3.04	3.47	8.88	5.73	3.59	7.70	2.11	3.32	0.81	0.42	2.57	1.49	0.50	0.47	3.44	1.13
21	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.44	8.61	2.99	5.91	0.72	12.94	1.49	5.53	5.50	9.58	2.91	5.71	1.43	4.11	1.63	10.03	10.25	2.00	5.30	3.15	2.38	1.02	0.27	2.87	1.02	0.00	0.00	2.64	1.62
22	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	4.76	12.14	2.71	12.19	4.98	11.84	0.00	11.46	3.28	10.43	8.43	3.40	2.02	5.69	0.00	10.40	5.26	10.46	4.15	4.53	1.27	0.15	0.00	1.73	0.12	0.00	0.00	3.12	0.93
23	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.46	0.12	1.68	0.00	2.49	2.60	0.00	2.04	0.92	3.66	4.63	2.30	0.60	2.33	0.00	4.88	1.29	0.58	4.20	3.71	0.00	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00
24	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.66	3.17	0.00	2.22	0.00	1.19	0.57	0.00	2.25	2.31	0.92	1.24	0.70	0.63	0.00	0.77	1.12	0.00	1.51	0.00	4.19	0.00	0.00	0.33	1.10	0.18	0.00	2.32	0.52
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.35	5.17	0.00	0.00	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00
26	Ix	Intron	0	6.84	4.64	2.93	8.58	0.39	5.96	3.06	6.61	8.41	6.07	4.08	5.15	3.51	6.87	5.41	5.52	5.40	4.70	2.80	3.93	4.17	0.48	0.29	3.66	1.82	2.84	0.49	6.02	1.00
27	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.15	4.68	2.50	8.15	0.54	6.16	2.97	5.23	8.55	5.85	3.88	5.02	2.89	6.24	6.08	5.38	5.63	5.19	2.23	4.14	4.48	0.38	0.07	3.84	1.52	1.73	0.34	5.02	0.88
28	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	9.67	4.09	2.82	6.74	0.00	4.85	3.59	9.78	6.56	5.69	3.29	4.80	5.24	7.73	4.59	5.26	3.56	3.20	4.14	2.36	3.37	0.62	0.84	3.52	2.34	6.19	0.28	9.17	1.13
29	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	7.03	5.28	6.26	14.89	0.00	6.46	2.77	11.17	10.63	8.30	6.93	6.71	5.04	9.96	2.08	6.99	6.90	3.74	4.69	5.14	3.37	0.99	0.89	2.63	3.12	5.10	1.93	7.91	1.60
30	Ix	Intron	0	1.34	1.01	0.52	5.97	0.51	1.57	3.99	5.37	11.31	3.01	1.24	2.24	3.30	0.80	7.93	0.77	0.93	0.60	1.33	0.21	1.63	0.38	0.56	3.13	1.34	1.15	0.00	0.51	1.67
31	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.15	0.00	0.92	0.24	0.00	0.82	0.54	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09
32	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.99	1.44	3.57	1.24	0.00	0.91	5.60	3.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	4.30	1.43	0.00	0.00	0.00	1.34
33	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.46	1.09	0.55	6.50	0.55	1.71	4.34	5.84	11.82	3.25	1.23	2.41	3.60	0.80	8.51	0.78	1.02	0.66	1.45	0.22	1.72	0.41	0.61	3.20	1.44	1.25	0.00	0.55	1.79
34	Ix	Intron	0	1.47	0.80	0.84	3.58	0.00	2.57	0.63	3.56	6.30	2.16	0.74	1.58	2.46	1.38	3.73	0.89	1.58	0.86	1.60	0.00	2.23	0.68	0.45	1.48	0.89	1.37	0.80	2.04	0.34
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.48	0.80	0.84	3.60	0.00	2.59	0.63	3.58	6.33	2.17	0.75	1.59	2.48	1.39	3.73	0.89	1.59	0.87	1.60	0.00	2.24	0.68	0.45	1.48	0.90	1.38	0.80	2.05	0.34
36	Ix	Intron	0	0.97	0.21	0.32	6.49	0.63	2.13	8.47	2.26	14.08	0.75	2.77	1.20	1.68	0.73	4.29	1.40	2.22	0.12	1.24	0.36	2.86	0.00	0.35	1.53	1.20	0.30	0.95	1.16	2.42
37	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.59	0.00	0.00	1.97	0.00	0.57	3.05	0.25	9.55	0.40	0.65	0.34	1.16	0.75	3.92	0.93	1.85	0.26	0.00	0.00	1.76	0.00	0.25	1.77	0.39	0.22	0.50	1.12	2.94
38	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.31	0.39	0.61	10.55	1.20	3.54	13.34	4.06	18.20	1.06	4.67	1.97	2.15	0.72	4.63	1.83	2.56	0.00	2.35	0.68	3.85	0.00	0.44	1.32	1.93	0.39	1.35	1.20	1.96
39	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.30	0.89	0.23	0.00	0.00	1.14	0.00	0.77	4.19	0.80	0.00	0.51	1.34	0.00	2.68	1.72	1.24	0.80	0.44	0.00	2.57	0.00	0.00	0.30	0.00	0.22	0.00	0.90	0.56
40	Ix	Intron	0	1.70	1.57	1.08	1.94	0.10	1.63	0.42	3.42	3.49	2.56	1.39	1.27	0.96	1.57	2.68	4.45	4.67	1.35	1.20	0.40	1.01	0.30	0.30	1.17	0.69	0.72	0.46	0.68	0.26
41	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.70	1.57	1.08	1.94	0.10	1.63	0.42	3.42	3.50	2.56	1.39	1.27	0.96	1.58	2.68	4.46	4.67	1.35	1.20	0.40	1.01	0.30	0.30	1.17	0.69	0.72	0.46	0.68	0.27
42	Ix	Intron	0	0.37	0.98	0.65	2.49	0.21	1.37	1.40	1.68	4.50	1.26	1.35	0.64	2.98	0.71	3.28	0.65	1.17	0.25	0.28	0.45	1.43	0.47	0.47	2.24	1.31	0.82	0.00	0.64	1.28
43	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.37	0.98	0.66	2.50	0.21	1.38	1.40	1.68	4.51	1.26	1.35	0.64	2.99	0.71	3.29	0.65	1.17	0.25	0.28	0.45	1.43	0.47	0.47	2.25	1.31	0.82	0.00	0.64	1.28
44	Ix	Intron	0	0.93	2.80	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	2.18	0.31	0.26	0.27	1.55	0.59	0.00	0.54	0.32	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.31	0.34	0.00	0.00	0.00
45	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.94	2.82	0.00	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	2.20	0.32	0.26	0.27	1.56	0.60	0.00	0.54	0.33	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.31	0.34	0.00	0.00	0.00
46	Ix	Intron	0	0.69	1.48	0.15	1.65	0.90	0.38	0.46	0.42	4.31	2.13	0.88	0.82	0.86	0.75	1.18	0.91	1.24	0.80	0.29	0.00	2.10	0.25	0.33	0.50	0.59	0.51	0.08	0.90	0.31
47	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.90	1.75	0.20	1.30	1.18	0.25	0.49	0.55	4.22	2.17	0.86	0.59	1.05	0.93	0.94	1.20	1.17	1.04	0.38	0.00	2.49	0.22	0.44	0.65	0.69	0.47	0.11	0.79	0.40
48	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.34	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	Ix	Intron	0	0.62	0.85	0.14	1.03	0.42	1.03	0.52	1.06	2.59	1.04	0.86	0.73	1.19	0.56	1.25	0.79	0.95	0.50	0.55	0.69	1.93	0.05	0.00	0.74	0.33	0.63	0.00	0.85	0.64
50	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.62	0.85	0.14	1.04	0.42	1.03	0.52	1.06	2.59	1.04	0.86	0.73	1.20	0.56	1.25	0.79	0.95	0.50	0.55	0.69	1.94	0.05	0.00	0.75	0.33	0.64	0.00	0.85	0.64
51	Ix	Intron	0	1.42	0.82	0.43	1.83	0.00	0.63	0.51	0.56	2.54	1.47	0.61	1.82	1.29	0.60	2.67	0.38	0.68	0.10	0.98	0.42	2.33	0.18	0.37	0.44	0.15	0.40	0.00	1.33	0.92
52	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.42	0.82	0.43	1.83	0.00	0.63	0.51	0.56	2.55	1.47	0.61	1.82	1.29	0.60	2.68	0.38	0.69	0.10	0.98	0.42	2.33	0.18	0.37	0.44	0.15	0.40	0.00	1.33	0.92
53	Ix	Intron	0	2.41	3.15	1.09	3.35	0.00	0.39	0.00	0.86	3.15	0.81	0.56	2.13	2.55	0.59	2.92	0.46	0.84	0.72	1.49	1.14	2.00	1.18	0.17	0.00	0.13	0.44	0.00	2.59	0.50
54	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.42	3.16	1.10	3.37	0.00	0.39	0.00	0.86	3.16	0.81	0.56	2.14	2.56	0.59	2.93	0.47	0.84	0.72	1.50	1.15	2.00	1.19	0.17	0.00	0.13	0.44	0.00	2.60	0.50
55	Ix	Intron	0	0.89	0.89	0.63	2.22	0.00	1.04	0.56	1.40	2.32	1.79	1.44	0.98	0.74	1.14	2.44	0.68	1.96	0.73	0.11	0.19	2.31	0.19	0.06	1.48	0.20	0.65	0.63	1.41	0.72
56	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.43	0.00	0.00	1.40	0.00	1.64	0.80	0.00	1.89	1.15	0.71	0.37	0.64	0.54	4.03	0.99	0.30	0.38	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00
57	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.81	1.59	0.76	5.44	0.00	1.28	0.45	2.99	3.43	2.46	1.88	1.60	0.74	1.26	3.25	0.94	2.34	2.49	0.00	0.00	2.06	0.34	0.34	0.84	0.27	0.60	0.00	2.16	0.16
58	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.85	2.17	0.54	2.85	0.00	1.11	1.13	1.25	2.75	3.16	2.51	1.52	1.93	1.73	2.62	0.49	4.66	0.84	0.63	0.00	1.24	0.72	0.00	2.96	0.28	1.25	1.09	2.26	1.56
59	Ix	Intron	0	2.04	1.57	0.76	2.97	0.61	1.74	0.58	2.18	3.52	1.99	1.38	1.69	1.06	2.07	2.32	0.67	2.64	1.87	1.50	1.06	1.79	0.27	0.20	1.81	0.67	1.26	0.15	1.64	0.78
60	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.77	0.74	0.38	2.07	0.48	1.83	0.59	0.86	4.43	1.61	1.28	1.83	0.61	1.60	2.84	0.65	2.90	1.14	0.63	0.45	1.78	0.30	0.18	2.29	0.84	1.26	0.06	0.93	0.81
61	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.09	1.12	0.00	1.08	0.00	1.62	1.03	1.11	4.28	3.13	0.64	2.61	1.07	1.67	1.40	0.95	3.17	1.72	0.81	1.65	2.36	0.00	0.23	1.51	0.19	0.52	0.93	1.35	1.28
62	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.63	3.24	1.62	4.75	1.24	2.07	0.60	3.52	3.03	1.90	1.46	1.51	2.00	2.79	2.61	0.50	2.10	2.88	2.74	1.47	1.93	0.46	0.15	1.68	0.79	1.60	0.08	2.24	0.94
63	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.89	0.61	0.50	2.99	0.00	0.85	0.19	3.85	1.43	2.48	2.04	1.02	0.26	2.14	0.88	0.95	2.67	1.88	1.77	1.50	1.11	0.00	0.34	0.93	0.28	1.05	0.00	2.58	0.00
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