Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-45B20.2	Gene	0	2.73	0.68	2.42	2.13	4.36	0.76	1.37	5.09	3.57	0.74	0.66	2.70	1.82	1.15	1.05	0.00	0.44	0.19	1.90	0.47	0.24	0.69	0.92	1.28	0.43	0.27	2.41	3.26	0.51
2	382133	Transcript	0	8.69	1.71	5.25	1.94	5.32	2.24	4.89	15.74	8.48	2.01	2.03	6.43	5.36	2.66	4.02	0.00	0.86	1.13	4.54	1.41	1.03	1.47	3.73	1.50	1.47	0.63	3.67	8.81	1.08
3	456456	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	1.52	0.00	1.58	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.82	2.29	0.00
4	417034	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	3.57	0.00	6.22	6.30	18.23	0.57	0.48	7.48	3.68	0.00	0.08	6.04	4.50	0.63	2.28	0.00	1.24	0.07	5.81	0.00	0.12	0.00	0.90	0.00	0.59	0.65	6.39	0.16	0.00
6	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.04	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	1.28	3.44	0.00	1.72	4.87	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	8.09	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.25	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	2.92	15.08	3.17	0.00	1.23	1.20	5.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	1.64	0.00	4.43	0.00	0.00	0.00	2.53	1.80	0.00
8	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.15	0.91	1.11	13.88	6.31	2.18	3.15	4.57	0.09	0.93	1.92	4.36	3.77	0.51	1.49	0.80	0.00	3.06	2.06	2.65	0.92	0.57	6.67	0.00	0.92	0.78	11.79	15.22	0.43
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	3.78	2.92	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	16.25	2.75	1.72	7.31	0.00	3.45	9.14	24.02	10.06	2.45	2.35	4.69	9.73	1.43	3.52	0.00	0.63	2.48	5.26	1.96	2.09	0.88	4.71	0.00	2.43	0.00	1.36	12.51	0.69
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	24.66	4.36	11.96	0.00	0.00	5.45	13.62	25.28	16.05	3.64	1.27	9.94	5.29	2.39	16.74	0.00	1.28	0.00	8.09	4.13	3.37	2.48	11.13	0.00	4.96	0.00	0.00	18.74	1.68
13	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	4.22	1.58
14	ER3a	ExonRegion	0	10.91	0.70	0.20	0.11	0.00	2.37	5.19	14.09	9.35	0.63	0.74	9.61	3.88	1.84	6.11	0.00	1.67	0.00	6.10	2.68	1.73	0.82	5.04	1.66	1.73	0.67	2.66	7.46	0.59
15	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	2.68	0.00	0.00	4.73	3.53	1.35	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	2.51	0.00	2.19	1.84	0.00	0.00
16	E3a_E3b	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	1.52	0.00	1.58	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.82	2.29	0.00
18	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	4.78	0.00	1.84	0.00	6.48	1.97	0.00	9.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	2.53	4.40	0.00
19	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	6.34	2.75	0.00	0.00	9.62	6.21	1.81	5.60	0.00	1.00	0.00	4.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	1.57	1.83	0.00	0.00
20	ER3c	ExonRegion	0	5.81	1.78	4.11	0.61	7.89	1.16	2.38	16.52	16.32	3.31	3.19	10.62	4.96	6.14	2.02	0.00	1.91	0.42	9.74	1.37	0.00	3.03	2.84	3.73	1.63	0.74	7.45	9.08	1.19
21	E3_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00
22	E3b_E4a	KnownJunction	0	11.09	4.85	14.28	0.00	19.01	3.49	8.07	32.00	23.66	7.95	9.30	13.52	6.56	12.36	0.00	0.00	1.87	5.39	0.00	3.80	0.00	6.95	4.92	10.53	1.86	2.19	13.57	25.21	5.18
23	E3b_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER4a	ExonRegion	0	2.04	1.08	3.57	2.89	4.93	0.89	1.38	4.03	3.22	1.01	0.81	1.64	1.10	1.35	0.48	0.00	0.20	0.17	0.40	0.41	0.15	1.05	0.34	1.69	0.20	0.26	2.69	4.49	0.93
25	ER4b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
26	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	ER5a	ExonRegion	0	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00